Lineage for Protein: Elongation factor Tu (EF-Tu), domain 2

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 287094Class b: All beta proteins [48724] (126 folds)
  3. 298343Fold b.43: Reductase/isomerase/elongation factor common domain [50412] (4 superfamilies)
    barrel, closed; n=6, S=10; greek-key
  4. 298354Superfamily b.43.3: Translation proteins [50447] (2 families) (S)
  5. 298355Family b.43.3.1: Elongation factors [50448] (6 proteins)
  6. 298377Protein Elongation factor Tu (EF-Tu), domain 2 [50449] (4 species)
    N-terminal domain is related to G proteins; C-terminal domain is (6,10) barrel of circularly permuted topology

Species:

  1. 298378Cow (Bos taurus), mitochondrial [TaxId:9913] [50453] (1 PDB entry)
  2. 298383Escherichia coli [TaxId:562] [50450] (4 PDB entries)
    1. Domains for 1d8t:
      1. 298386Domain d1d8ta1: 1d8t A:205-296 [25686]
        Other proteins in same PDB: d1d8ta2, d1d8ta3, d1d8tb2, d1d8tb3
      2. 298387Domain d1d8tb1: 1d8t B:205-296 [25687]
        Other proteins in same PDB: d1d8ta2, d1d8ta3, d1d8tb2, d1d8tb3
        complexed with ace, gdp, gea, mg
    2. Domains for 1dg1:
      1. 298388Domain d1dg1g1: 1dg1 G:205-296 [25684]
        Other proteins in same PDB: d1dg1g2, d1dg1g3, d1dg1h2, d1dg1h3
      2. 298389Domain d1dg1h1: 1dg1 H:205-296 [25685]
        Other proteins in same PDB: d1dg1g2, d1dg1g3, d1dg1h2, d1dg1h3
    3. Domains for 1efc:
      1. 298384Domain d1efca1: 1efc A:205-296 [25680]
        Other proteins in same PDB: d1efca2, d1efca3, d1efcb2, d1efcb3
      2. 298385Domain d1efcb1: 1efc B:205-296 [25681]
        Other proteins in same PDB: d1efca2, d1efca3, d1efcb2, d1efcb3
        complexed with gdp, mg
    4. Domains for 1efu:
      1. 298390Domain d1efua1: 1efu A:205-296 [25682]
        Other proteins in same PDB: d1efua2, d1efua3, d1efub2, d1efub3, d1efub4, d1efuc2, d1efuc3, d1efud2, d1efud3, d1efud4
      2. 298391Domain d1efuc1: 1efu C:205-296 [25683]
        Other proteins in same PDB: d1efua2, d1efua3, d1efub2, d1efub3, d1efub4, d1efuc2, d1efuc3, d1efud2, d1efud3, d1efud4
  3. 298392Thermus aquaticus [TaxId:271] [50451] (4 PDB entries)
    1. Domain for 1b23:
    2. Domain for 1eft:
    3. Domains for 1ttt:
      1. 298395Domain d1ttta1: 1ttt A:213-313 [25690]
        Other proteins in same PDB: d1ttta2, d1ttta3, d1tttb2, d1tttb3, d1tttc2, d1tttc3
      2. 298396Domain d1tttb1: 1ttt B:213-312 [25691]
        Other proteins in same PDB: d1ttta2, d1ttta3, d1tttb2, d1tttb3, d1tttc2, d1tttc3
      3. 298397Domain d1tttc1: 1ttt C:213-312 [25692]
        Other proteins in same PDB: d1ttta2, d1ttta3, d1tttb2, d1tttb3, d1tttc2, d1tttc3
        protein/tRNA complex; complexed with 1ma, 2mg, 5mc, 5mu, 7mg, gnp, h2u, m2g, mg, omc, omg, psu, yg
    4. Domains for 1tui:
      1. 298398Domain d1tuia1: 1tui A:213-313 [25693]
        Other proteins in same PDB: d1tuia2, d1tuia3, d1tuib2, d1tuib3, d1tuic2, d1tuic3
      2. 298399Domain d1tuib1: 1tui B:213-312 [25694]
        Other proteins in same PDB: d1tuia2, d1tuia3, d1tuib2, d1tuib3, d1tuic2, d1tuic3
      3. 298400Domain d1tuic1: 1tui C:213-312 [25695]
        Other proteins in same PDB: d1tuia2, d1tuia3, d1tuib2, d1tuib3, d1tuic2, d1tuic3
        complexed with gdp, mg
  4. 298401Thermus thermophilus [TaxId:274] [50452] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1aip:
      1. 298405Domain d1aipa1: 1aip A:213-312 [25697]
        Other proteins in same PDB: d1aipa2, d1aipa3, d1aipb2, d1aipb3, d1aipc1, d1aipc2, d1aipd1, d1aipd2, d1aipe2, d1aipe3, d1aipf2, d1aipf3, d1aipg1, d1aipg2, d1aiph1, d1aiph2
      2. 298406Domain d1aipb1: 1aip B:213-312 [25698]
        Other proteins in same PDB: d1aipa2, d1aipa3, d1aipb2, d1aipb3, d1aipc1, d1aipc2, d1aipd1, d1aipd2, d1aipe2, d1aipe3, d1aipf2, d1aipf3, d1aipg1, d1aipg2, d1aiph1, d1aiph2
      3. 298407Domain d1aipe1: 1aip E:213-312 [25699]
        Other proteins in same PDB: d1aipa2, d1aipa3, d1aipb2, d1aipb3, d1aipc1, d1aipc2, d1aipd1, d1aipd2, d1aipe2, d1aipe3, d1aipf2, d1aipf3, d1aipg1, d1aipg2, d1aiph1, d1aiph2
      4. 298408Domain d1aipf1: 1aip F:213-312 [25700]
        Other proteins in same PDB: d1aipa2, d1aipa3, d1aipb2, d1aipb3, d1aipc1, d1aipc2, d1aipd1, d1aipd2, d1aipe2, d1aipe3, d1aipf2, d1aipf3, d1aipg1, d1aipg2, d1aiph1, d1aiph2
    2. Domain for 1exm:
    3. Domains for 1ha3:
      1. 298403Domain d1ha3a1: 1ha3 A:213-312 [60869]
        Other proteins in same PDB: d1ha3a2, d1ha3a3, d1ha3b2, d1ha3b3
      2. 298404Domain d1ha3b1: 1ha3 B:213-312 [60872]
        Other proteins in same PDB: d1ha3a2, d1ha3a3, d1ha3b2, d1ha3b3
        complexed with bme, gdp, mau, mg

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