Lineage for Protein: Cytochrome c oxidase

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 218896Class b: All beta proteins [48724] (119 folds)
  3. 224388Fold b.6: Cupredoxin-like [49502] (2 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets, greek-key
    variations: some members have additional 1-2 strands
  4. 224389Superfamily b.6.1: Cupredoxins [49503] (5 families) (S)
    contains copper-binding site
  5. 224664Family b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II [49541] (2 proteins)
  6. 224665Protein Cytochrome c oxidase [49544] (4 species)

Species:

  1. 224666Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [49545] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1occ:
      1. 224671Domain d1occb1: 1occ B:91-227 [23031]
        Other proteins in same PDB: d1occa_, d1occb2, d1occc_, d1occd_, d1occe_, d1occf_, d1occg_, d1occh_, d1occi_, d1occj_, d1occk_, d1occl_, d1occm_, d1occn_, d1occo2, d1occp_, d1occq_, d1occr_, d1occs_, d1occt_, d1occu_, d1occv_, d1occw_, d1occx_, d1occy_, d1occz_
      2. 224672Domain d1occo1: 1occ O:91-227 [23032]
        Other proteins in same PDB: d1occa_, d1occb2, d1occc_, d1occd_, d1occe_, d1occf_, d1occg_, d1occh_, d1occi_, d1occj_, d1occk_, d1occl_, d1occm_, d1occn_, d1occo2, d1occp_, d1occq_, d1occr_, d1occs_, d1occt_, d1occu_, d1occv_, d1occw_, d1occx_, d1occy_, d1occz_
        complexed with cu, hea, mg, zn
    2. Domains for 1oco:
      1. 224675Domain d1ocob1: 1oco B:91-227 [23035]
        Other proteins in same PDB: d1ocoa_, d1ocob2, d1ococ_, d1ocod_, d1ocoe_, d1ocof_, d1ocog_, d1ocoh_, d1ocoi_, d1ocoj_, d1ocok_, d1ocol_, d1ocom_, d1ocon_, d1ocoo2, d1ocop_, d1ocoq_, d1ocor_, d1ocos_, d1ocot_, d1ocou_, d1ocov_, d1ocow_, d1ocox_, d1ocoy_, d1ocoz_
      2. 224676Domain d1ocoo1: 1oco O:91-227 [23036]
        Other proteins in same PDB: d1ocoa_, d1ocob2, d1ococ_, d1ocod_, d1ocoe_, d1ocof_, d1ocog_, d1ocoh_, d1ocoi_, d1ocoj_, d1ocok_, d1ocol_, d1ocom_, d1ocon_, d1ocoo2, d1ocop_, d1ocoq_, d1ocor_, d1ocos_, d1ocot_, d1ocou_, d1ocov_, d1ocow_, d1ocox_, d1ocoy_, d1ocoz_
        complexed with cmo, cu, hea, mg, na, zn
    3. Domains for 1ocr:
      1. 224667Domain d1ocrb1: 1ocr B:91-227 [23029]
        Other proteins in same PDB: d1ocra_, d1ocrb2, d1ocrc_, d1ocrd_, d1ocre_, d1ocrf_, d1ocrg_, d1ocrh_, d1ocri_, d1ocrj_, d1ocrk_, d1ocrl_, d1ocrm_, d1ocrn_, d1ocro2, d1ocrp_, d1ocrq_, d1ocrr_, d1ocrs_, d1ocrt_, d1ocru_, d1ocrv_, d1ocrw_, d1ocrx_, d1ocry_, d1ocrz_
      2. 224668Domain d1ocro1: 1ocr O:91-227 [23030]
        Other proteins in same PDB: d1ocra_, d1ocrb2, d1ocrc_, d1ocrd_, d1ocre_, d1ocrf_, d1ocrg_, d1ocrh_, d1ocri_, d1ocrj_, d1ocrk_, d1ocrl_, d1ocrm_, d1ocrn_, d1ocro2, d1ocrp_, d1ocrq_, d1ocrr_, d1ocrs_, d1ocrt_, d1ocru_, d1ocrv_, d1ocrw_, d1ocrx_, d1ocry_, d1ocrz_
        complexed with cu, hea, mg, na, zn
    4. Domains for 1ocz:
      1. 224673Domain d1oczb1: 1ocz B:91-227 [23033]
        Other proteins in same PDB: d1ocza_, d1oczb2, d1oczc_, d1oczd_, d1ocze_, d1oczf_, d1oczg_, d1oczh_, d1oczi_, d1oczj_, d1oczk_, d1oczl_, d1oczm_, d1oczn_, d1oczo2, d1oczp_, d1oczq_, d1oczr_, d1oczs_, d1oczt_, d1oczu_, d1oczv_, d1oczw_, d1oczx_, d1oczy_, d1oczz_
      2. 224674Domain d1oczo1: 1ocz O:91-227 [23034]
        Other proteins in same PDB: d1ocza_, d1oczb2, d1oczc_, d1oczd_, d1ocze_, d1oczf_, d1oczg_, d1oczh_, d1oczi_, d1oczj_, d1oczk_, d1oczl_, d1oczm_, d1oczn_, d1oczo2, d1oczp_, d1oczq_, d1oczr_, d1oczs_, d1oczt_, d1oczu_, d1oczv_, d1oczw_, d1oczx_, d1oczy_, d1oczz_
        complexed with azi, cu, hea, mg, na, zn
    5. Domains for 2occ:
      1. 224669Domain d2occb1: 2occ B:91-227 [23027]
        Other proteins in same PDB: d2occa_, d2occb2, d2occc_, d2occd_, d2occe_, d2occf_, d2occg_, d2occh_, d2occi_, d2occj_, d2occk_, d2occl_, d2occm_, d2occn_, d2occo2, d2occp_, d2occq_, d2occr_, d2occs_, d2occt_, d2occu_, d2occv_, d2occw_, d2occx_, d2occy_, d2occz_
      2. 224670Domain d2occo1: 2occ O:91-227 [23028]
        Other proteins in same PDB: d2occa_, d2occb2, d2occc_, d2occd_, d2occe_, d2occf_, d2occg_, d2occh_, d2occi_, d2occj_, d2occk_, d2occl_, d2occm_, d2occn_, d2occo2, d2occp_, d2occq_, d2occr_, d2occs_, d2occt_, d2occu_, d2occv_, d2occw_, d2occx_, d2occy_, d2occz_
        complexed with cu, hea, mg, na, per, zn
  2. 224677Paracoccus denitrificans [TaxId:266] [49546] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1ar1:
    2. Domain for 1qle:
  3. 224680Rhodobacter sphaeroides [TaxId:1063] [74870] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1m56:
      1. 224681Domain d1m56b1: 1m56 B:130-289 [74472]
        Other proteins in same PDB: d1m56a_, d1m56b2, d1m56c_, d1m56d_, d1m56g_, d1m56h2, d1m56i_, d1m56j_
      2. 224682Domain d1m56h1: 1m56 H:130-289 [74477]
        Other proteins in same PDB: d1m56a_, d1m56b2, d1m56c_, d1m56d_, d1m56g_, d1m56h2, d1m56i_, d1m56j_
        complexed with ca, cu, hea, mg, peh
    2. Domains for 1m57:
      1. 224683Domain d1m57b1: 1m57 B:130-289 [74482]
        Other proteins in same PDB: d1m57a_, d1m57b2, d1m57c_, d1m57d_, d1m57g_, d1m57h2, d1m57i_, d1m57j_
      2. 224684Domain d1m57h1: 1m57 H:130-289 [74487]
        Other proteins in same PDB: d1m57a_, d1m57b2, d1m57c_, d1m57d_, d1m57g_, d1m57h2, d1m57i_, d1m57j_
        complexed with ca, cu, hea, mg, peh; mutant
  4. 224685Thermus thermophilus, ba3 type [TaxId:274] [49547] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1ehk:
    2. Domains for 2cua:
      1. 224686Domain d2cuaa_: 2cua A: [23039]
      2. 224687Domain d2cuab_: 2cua B: [23040]
        complexed with cua, zn

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