Lineage for Protein: Transglutaminase, two C-terminal domains

  1. Root: SCOPe 2.03
  2. 1287432Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
  3. 1287433Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 1298226Superfamily b.1.5: Transglutaminase, two C-terminal domains [49309] (1 family) (S)
    automatically mapped to Pfam PF00927
  5. 1298227Family b.1.5.1: Transglutaminase, two C-terminal domains [49310] (1 protein)
  6. 1298228Protein Transglutaminase, two C-terminal domains [49311] (4 species)
    duplication

Species:

  1. 1298229Human (Homo sapiens), blood isozyme [TaxId:9606] [49312] (8 PDB entries)
    Coagulation factor XIII,
    1. Domains for 1evu:
      1. 1298238Domain d1evua2: 1evu A:516-627 [22175]
        Other proteins in same PDB: d1evua1, d1evua4, d1evub1, d1evub4
        complexed with ca, pgo
      2. 1298239Domain d1evua3: 1evu A:628-727 [22176]
        Other proteins in same PDB: d1evua1, d1evua4, d1evub1, d1evub4
        complexed with ca, pgo
      3. 1298240Domain d1evub2: 1evu B:515-627 [22177]
        Other proteins in same PDB: d1evua1, d1evua4, d1evub1, d1evub4
        complexed with ca, pgo
      4. 1298241Domain d1evub3: 1evu B:628-727 [22178]
        Other proteins in same PDB: d1evua1, d1evua4, d1evub1, d1evub4
        complexed with ca, pgo
    2. Domains for 1ex0:
      1. 1298230Domain d1ex0a2: 1ex0 A:516-627 [90466]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a1, d1ex0a4, d1ex0b1, d1ex0b4
        complexed with ca, pgo, po4; mutant
      2. 1298231Domain d1ex0a3: 1ex0 A:628-727 [90467]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a1, d1ex0a4, d1ex0b1, d1ex0b4
        complexed with ca, pgo, po4; mutant
      3. 1298232Domain d1ex0b2: 1ex0 B:517-627 [90470]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a1, d1ex0a4, d1ex0b1, d1ex0b4
        complexed with ca, pgo, po4; mutant
      4. 1298233Domain d1ex0b3: 1ex0 B:628-730 [90471]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a1, d1ex0a4, d1ex0b1, d1ex0b4
        complexed with ca, pgo, po4; mutant
    3. Domains for 1f13:
      1. 1298234Domain d1f13a2: 1f13 A:516-627 [22163]
        Other proteins in same PDB: d1f13a1, d1f13a4, d1f13b1, d1f13b4
      2. 1298235Domain d1f13a3: 1f13 A:628-728 [22164]
        Other proteins in same PDB: d1f13a1, d1f13a4, d1f13b1, d1f13b4
      3. 1298236Domain d1f13b2: 1f13 B:516-627 [22165]
        Other proteins in same PDB: d1f13a1, d1f13a4, d1f13b1, d1f13b4
      4. 1298237Domain d1f13b3: 1f13 B:628-728 [22166]
        Other proteins in same PDB: d1f13a1, d1f13a4, d1f13b1, d1f13b4
    4. Domains for 1fie:
      1. 1298250Domain d1fiea2: 1fie A:516-627 [22167]
        Other proteins in same PDB: d1fiea1, d1fiea4, d1fieb1, d1fieb4
      2. 1298251Domain d1fiea3: 1fie A:628-727 [22168]
        Other proteins in same PDB: d1fiea1, d1fiea4, d1fieb1, d1fieb4
      3. 1298252Domain d1fieb2: 1fie B:516-627 [22169]
        Other proteins in same PDB: d1fiea1, d1fiea4, d1fieb1, d1fieb4
      4. 1298253Domain d1fieb3: 1fie B:628-727 [22170]
        Other proteins in same PDB: d1fiea1, d1fiea4, d1fieb1, d1fieb4
    5. Domains for 1ggt:
      1. 1298258Domain d1ggta2: 1ggt A:516-627 [22171]
        Other proteins in same PDB: d1ggta1, d1ggta4, d1ggtb1, d1ggtb4
      2. 1298259Domain d1ggta3: 1ggt A:628-729 [22172]
        Other proteins in same PDB: d1ggta1, d1ggta4, d1ggtb1, d1ggtb4
      3. 1298260Domain d1ggtb2: 1ggt B:516-627 [22173]
        Other proteins in same PDB: d1ggta1, d1ggta4, d1ggtb1, d1ggtb4
      4. 1298261Domain d1ggtb3: 1ggt B:628-727 [22174]
        Other proteins in same PDB: d1ggta1, d1ggta4, d1ggtb1, d1ggtb4
    6. Domains for 1ggu:
      1. 1298242Domain d1ggua2: 1ggu A:516-627 [22179]
        Other proteins in same PDB: d1ggua1, d1ggua4, d1ggub1, d1ggub4
        complexed with ca
      2. 1298243Domain d1ggua3: 1ggu A:628-727 [22180]
        Other proteins in same PDB: d1ggua1, d1ggua4, d1ggub1, d1ggub4
        complexed with ca
      3. 1298244Domain d1ggub2: 1ggu B:516-627 [22181]
        Other proteins in same PDB: d1ggua1, d1ggua4, d1ggub1, d1ggub4
        complexed with ca
      4. 1298245Domain d1ggub3: 1ggu B:628-727 [22182]
        Other proteins in same PDB: d1ggua1, d1ggua4, d1ggub1, d1ggub4
        complexed with ca
    7. Domains for 1ggy:
      1. 1298254Domain d1ggya2: 1ggy A:516-627 [22183]
        Other proteins in same PDB: d1ggya1, d1ggya4, d1ggyb1, d1ggyb4
        complexed with yb
      2. 1298255Domain d1ggya3: 1ggy A:628-727 [22184]
        Other proteins in same PDB: d1ggya1, d1ggya4, d1ggyb1, d1ggyb4
        complexed with yb
      3. 1298256Domain d1ggyb2: 1ggy B:516-627 [22185]
        Other proteins in same PDB: d1ggya1, d1ggya4, d1ggyb1, d1ggyb4
        complexed with yb
      4. 1298257Domain d1ggyb3: 1ggy B:628-727 [22186]
        Other proteins in same PDB: d1ggya1, d1ggya4, d1ggyb1, d1ggyb4
        complexed with yb
    8. Domains for 1qrk:
      1. 1298246Domain d1qrka2: 1qrk A:517-627 [22187]
        Other proteins in same PDB: d1qrka1, d1qrka4, d1qrkb1, d1qrkb4
        complexed with sr
      2. 1298247Domain d1qrka3: 1qrk A:628-727 [22188]
        Other proteins in same PDB: d1qrka1, d1qrka4, d1qrkb1, d1qrkb4
        complexed with sr
      3. 1298248Domain d1qrkb2: 1qrk B:516-627 [22189]
        Other proteins in same PDB: d1qrka1, d1qrka4, d1qrkb1, d1qrkb4
        complexed with sr
      4. 1298249Domain d1qrkb3: 1qrk B:628-727 [22190]
        Other proteins in same PDB: d1qrka1, d1qrka4, d1qrkb1, d1qrkb4
        complexed with sr
  2. 1298262Human (Homo sapiens), TGase E3 [TaxId:9606] [74850] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1l9m:
      1. 1298267Domain d1l9ma2: 1l9m A:479-593 [73733]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma1, d1l9ma4, d1l9mb1, d1l9mb4
        complexed with br, ca, cl
      2. 1298268Domain d1l9ma3: 1l9m A:594-692 [73734]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma1, d1l9ma4, d1l9mb1, d1l9mb4
        complexed with br, ca, cl
      3. 1298269Domain d1l9mb2: 1l9m B:472-593 [73737]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma1, d1l9ma4, d1l9mb1, d1l9mb4
        complexed with br, ca, cl
      4. 1298270Domain d1l9mb3: 1l9m B:594-692 [73738]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma1, d1l9ma4, d1l9mb1, d1l9mb4
        complexed with br, ca, cl
    2. Domains for 1l9n:
      1. 1298263Domain d1l9na2: 1l9n A:480-593 [73741]
        Other proteins in same PDB: d1l9na1, d1l9na4, d1l9nb1, d1l9nb4
        complexed with bgl, ca, cl
      2. 1298264Domain d1l9na3: 1l9n A:594-692 [73742]
        Other proteins in same PDB: d1l9na1, d1l9na4, d1l9nb1, d1l9nb4
        complexed with bgl, ca, cl
      3. 1298265Domain d1l9nb2: 1l9n B:480-593 [73745]
        Other proteins in same PDB: d1l9na1, d1l9na4, d1l9nb1, d1l9nb4
        complexed with bgl, ca, cl
      4. 1298266Domain d1l9nb3: 1l9n B:594-692 [73746]
        Other proteins in same PDB: d1l9na1, d1l9na4, d1l9nb1, d1l9nb4
        complexed with bgl, ca, cl
    3. Domains for 1nud:
      1. 1298277Domain d1nuda2: 1nud A:480-593 [86175]
        Other proteins in same PDB: d1nuda1, d1nuda4, d1nudb1, d1nudb4
        complexed with br, ca, cl
      2. 1298278Domain d1nuda3: 1nud A:594-692 [86176]
        Other proteins in same PDB: d1nuda1, d1nuda4, d1nudb1, d1nudb4
        complexed with br, ca, cl
      3. 1298279Domain d1nudb2: 1nud B:480-593 [86179]
        Other proteins in same PDB: d1nuda1, d1nuda4, d1nudb1, d1nudb4
        complexed with br, ca, cl
      4. 1298280Domain d1nudb3: 1nud B:594-692 [86180]
        Other proteins in same PDB: d1nuda1, d1nuda4, d1nudb1, d1nudb4
        complexed with br, ca, cl
    4. Domains for 1nuf:
      1. 1298275Domain d1nufa2: 1nuf A:479-593 [86183]
        Other proteins in same PDB: d1nufa1, d1nufa4
        complexed with br, ca, cl
      2. 1298276Domain d1nufa3: 1nuf A:594-692 [86184]
        Other proteins in same PDB: d1nufa1, d1nufa4
        complexed with br, ca, cl
    5. Domains for 1nug:
      1. 1298271Domain d1nuga2: 1nug A:479-593 [86187]
        Other proteins in same PDB: d1nuga1, d1nuga4, d1nugb1, d1nugb4
        complexed with ca, cl, mg
      2. 1298272Domain d1nuga3: 1nug A:594-692 [86188]
        Other proteins in same PDB: d1nuga1, d1nuga4, d1nugb1, d1nugb4
        complexed with ca, cl, mg
      3. 1298273Domain d1nugb2: 1nug B:473-593 [86191]
        Other proteins in same PDB: d1nuga1, d1nuga4, d1nugb1, d1nugb4
        complexed with ca, cl, mg
      4. 1298274Domain d1nugb3: 1nug B:594-692 [86192]
        Other proteins in same PDB: d1nuga1, d1nuga4, d1nugb1, d1nugb4
        complexed with ca, cl, mg
  3. 1298281Human (Homo sapiens), tissue isozyme [TaxId:9606] [74849] (2 PDB entries)
    GDP-binding protein
    1. Domains for 1kv3:
      1. 1298284Domain d1kv3a2: 1kv3 A:469-585 [73028]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      2. 1298285Domain d1kv3a3: 1kv3 A:586-687 [73029]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      3. 1298286Domain d1kv3b2: 1kv3 B:469-585 [73032]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      4. 1298287Domain d1kv3b3: 1kv3 B:586-687 [73033]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      5. 1298288Domain d1kv3c2: 1kv3 C:469-585 [73036]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      6. 1298289Domain d1kv3c3: 1kv3 C:586-687 [73037]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      7. 1298290Domain d1kv3d2: 1kv3 D:469-585 [73040]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      8. 1298291Domain d1kv3d3: 1kv3 D:586-687 [73041]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      9. 1298292Domain d1kv3e2: 1kv3 E:469-585 [73044]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      10. 1298293Domain d1kv3e3: 1kv3 E:586-687 [73045]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      11. 1298294Domain d1kv3f2: 1kv3 F:469-585 [73048]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
      12. 1298295Domain d1kv3f3: 1kv3 F:586-687 [73049]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a1, d1kv3a4, d1kv3b1, d1kv3b4, d1kv3c1, d1kv3c4, d1kv3d1, d1kv3d4, d1kv3e1, d1kv3e4, d1kv3f1, d1kv3f4
        complexed with gdp
    2. Domains for 2q3z:
      1. 1298282Domain d2q3za2: 2q3z A:472-585 [150038]
        Other proteins in same PDB: d2q3za1, d2q3za4
        automatically matched to d1kv3a2
        complexed with so4
      2. 1298283Domain d2q3za3: 2q3z A:586-683 [150039]
        Other proteins in same PDB: d2q3za1, d2q3za4
        automatically matched to d1kv3a3
        complexed with so4
  4. 1298296Red sea bream (Chrysophrys major) [TaxId:143350] [63674] (1 PDB entry)

More info for Protein Transglutaminase, two C-terminal domains from b.1.5.1: Transglutaminase, two C-terminal domains

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