Lineage for Protein: Transglutaminase N-terminal domain

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 929298Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
  3. 929299Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 937486Superfamily b.1.18: E set domains [81296] (24 families) (S)
    "Early" Ig-like fold families possibly related to the immunoglobulin and/or fibronectin type III superfamilies
  5. 938010Family b.1.18.9: Transglutaminase N-terminal domain [81289] (1 protein)
  6. 938011Protein Transglutaminase N-terminal domain [49235] (4 species)
    elaborated with many loop insertions in the common fold

Species:

  1. 938012Human (Homo sapiens), blood isozyme [TaxId:9606] [49236] (8 PDB entries)
    Coagulation factor XIII
    1. Domains for 1evu:
      1. 938017Domain d1evua1: 1evu A:1-190 [21883]
        Other proteins in same PDB: d1evua2, d1evua3, d1evua4, d1evub2, d1evub3, d1evub4
        complexed with ca, pgo
      2. 938018Domain d1evub1: 1evu B:8-190 [21884]
        Other proteins in same PDB: d1evua2, d1evua3, d1evua4, d1evub2, d1evub3, d1evub4
        complexed with ca, pgo
    2. Domains for 1ex0:
      1. 938013Domain d1ex0a1: 1ex0 A:7-190 [90465]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a2, d1ex0a3, d1ex0a4, d1ex0b2, d1ex0b3, d1ex0b4
        complexed with ca, pgo, po4; mutant
      2. 938014Domain d1ex0b1: 1ex0 B:5-190 [90469]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a2, d1ex0a3, d1ex0a4, d1ex0b2, d1ex0b3, d1ex0b4
        complexed with ca, pgo, po4; mutant
    3. Domains for 1f13:
      1. 938015Domain d1f13a1: 1f13 A:5-190 [21877]
        Other proteins in same PDB: d1f13a2, d1f13a3, d1f13a4, d1f13b2, d1f13b3, d1f13b4
      2. 938016Domain d1f13b1: 1f13 B:6-190 [21878]
        Other proteins in same PDB: d1f13a2, d1f13a3, d1f13a4, d1f13b2, d1f13b3, d1f13b4
    4. Domains for 1fie:
      1. 938023Domain d1fiea1: 1fie A:9-190 [21879]
        Other proteins in same PDB: d1fiea2, d1fiea3, d1fiea4, d1fieb2, d1fieb3, d1fieb4
      2. 938024Domain d1fieb1: 1fie B:10-190 [21880]
        Other proteins in same PDB: d1fiea2, d1fiea3, d1fiea4, d1fieb2, d1fieb3, d1fieb4
    5. Domains for 1ggt:
      1. 938027Domain d1ggta1: 1ggt A:8-190 [21881]
        Other proteins in same PDB: d1ggta2, d1ggta3, d1ggta4, d1ggtb2, d1ggtb3, d1ggtb4
      2. 938028Domain d1ggtb1: 1ggt B:8-190 [21882]
        Other proteins in same PDB: d1ggta2, d1ggta3, d1ggta4, d1ggtb2, d1ggtb3, d1ggtb4
    6. Domains for 1ggu:
      1. 938019Domain d1ggua1: 1ggu A:8-190 [21885]
        Other proteins in same PDB: d1ggua2, d1ggua3, d1ggua4, d1ggub2, d1ggub3, d1ggub4
        complexed with ca
      2. 938020Domain d1ggub1: 1ggu B:8-190 [21886]
        Other proteins in same PDB: d1ggua2, d1ggua3, d1ggua4, d1ggub2, d1ggub3, d1ggub4
        complexed with ca
    7. Domains for 1ggy:
      1. 938025Domain d1ggya1: 1ggy A:8-190 [21887]
        Other proteins in same PDB: d1ggya2, d1ggya3, d1ggya4, d1ggyb2, d1ggyb3, d1ggyb4
        complexed with yb
      2. 938026Domain d1ggyb1: 1ggy B:8-190 [21888]
        Other proteins in same PDB: d1ggya2, d1ggya3, d1ggya4, d1ggyb2, d1ggyb3, d1ggyb4
        complexed with yb
    8. Domains for 1qrk:
      1. 938021Domain d1qrka1: 1qrk A:9-190 [21889]
        Other proteins in same PDB: d1qrka2, d1qrka3, d1qrka4, d1qrkb2, d1qrkb3, d1qrkb4
        complexed with sr
      2. 938022Domain d1qrkb1: 1qrk B:10-190 [21890]
        Other proteins in same PDB: d1qrka2, d1qrka3, d1qrka4, d1qrkb2, d1qrkb3, d1qrkb4
        complexed with sr
  2. 938029Human (Homo sapiens), TGase E3 [TaxId:9606] [74845] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1l9m:
      1. 938032Domain d1l9ma1: 1l9m A:1-140 [73732]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma2, d1l9ma3, d1l9ma4, d1l9mb2, d1l9mb3, d1l9mb4
        complexed with br, ca, cl
      2. 938033Domain d1l9mb1: 1l9m B:1-140 [73736]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma2, d1l9ma3, d1l9ma4, d1l9mb2, d1l9mb3, d1l9mb4
        complexed with br, ca, cl
    2. Domains for 1l9n:
      1. 938030Domain d1l9na1: 1l9n A:1-140 [73740]
        Other proteins in same PDB: d1l9na2, d1l9na3, d1l9na4, d1l9nb2, d1l9nb3, d1l9nb4
        complexed with bgl, ca, cl
      2. 938031Domain d1l9nb1: 1l9n B:1-140 [73744]
        Other proteins in same PDB: d1l9na2, d1l9na3, d1l9na4, d1l9nb2, d1l9nb3, d1l9nb4
        complexed with bgl, ca, cl
    3. Domains for 1nud:
      1. 938037Domain d1nuda1: 1nud A:1-140 [86174]
        Other proteins in same PDB: d1nuda2, d1nuda3, d1nuda4, d1nudb2, d1nudb3, d1nudb4
        complexed with br, ca, cl
      2. 938038Domain d1nudb1: 1nud B:1-140 [86178]
        Other proteins in same PDB: d1nuda2, d1nuda3, d1nuda4, d1nudb2, d1nudb3, d1nudb4
        complexed with br, ca, cl
    4. Domain for 1nuf:
    5. Domains for 1nug:
      1. 938034Domain d1nuga1: 1nug A:1-140 [86186]
        Other proteins in same PDB: d1nuga2, d1nuga3, d1nuga4, d1nugb2, d1nugb3, d1nugb4
        complexed with ca, cl, mg
      2. 938035Domain d1nugb1: 1nug B:1-140 [86190]
        Other proteins in same PDB: d1nuga2, d1nuga3, d1nuga4, d1nugb2, d1nugb3, d1nugb4
        complexed with ca, cl, mg
  3. 938039Human (Homo sapiens), tissue isozyme [TaxId:9606] [74844] (2 PDB entries)
    GDP-binding protein
    1. Domains for 1kv3:
      1. 938041Domain d1kv3a1: 1kv3 A:15-145 [73027]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3a4, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3b4, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3c4, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3d4, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3e4, d1kv3f2, d1kv3f3, d1kv3f4
        complexed with gdp
      2. 938042Domain d1kv3b1: 1kv3 B:15-145 [73031]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3a4, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3b4, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3c4, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3d4, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3e4, d1kv3f2, d1kv3f3, d1kv3f4
        complexed with gdp
      3. 938043Domain d1kv3c1: 1kv3 C:15-145 [73035]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3a4, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3b4, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3c4, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3d4, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3e4, d1kv3f2, d1kv3f3, d1kv3f4
        complexed with gdp
      4. 938044Domain d1kv3d1: 1kv3 D:15-145 [73039]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3a4, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3b4, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3c4, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3d4, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3e4, d1kv3f2, d1kv3f3, d1kv3f4
        complexed with gdp
      5. 938045Domain d1kv3e1: 1kv3 E:15-145 [73043]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3a4, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3b4, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3c4, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3d4, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3e4, d1kv3f2, d1kv3f3, d1kv3f4
        complexed with gdp
      6. 938046Domain d1kv3f1: 1kv3 F:15-145 [73047]
        Other proteins in same PDB: d1kv3a2, d1kv3a3, d1kv3a4, d1kv3b2, d1kv3b3, d1kv3b4, d1kv3c2, d1kv3c3, d1kv3c4, d1kv3d2, d1kv3d3, d1kv3d4, d1kv3e2, d1kv3e3, d1kv3e4, d1kv3f2, d1kv3f3, d1kv3f4
        complexed with gdp
    2. Domain for 2q3z:
  4. 938047Red sea bream (Chrysophrys major) [TaxId:143350] [63667] (1 PDB entry)

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