Lineage for Protein: Transglutaminase N-terminal domain

  1. Root: SCOP 1.69
  2. 450777Class b: All beta proteins [48724] (144 folds)
  3. 450778Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (23 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 456110Superfamily b.1.18: E set domains [81296] (18 families) (S)
    "Early" Ig-like fold families possibly related to the immunoglobulin and/or fibronectin type III superfamilies
  5. 456484Family b.1.18.9: Transglutaminase N-terminal domain [81289] (1 protein)
  6. 456485Protein Transglutaminase N-terminal domain [49235] (4 species)
    elaborated with many loop insertions in the common fold

Species:

  1. 456486Human (Homo sapiens), blood isozyme [TaxId:9606] [49236] (8 PDB entries)
    Coagulation factor XIII
    1. Domains for 1evu:
      1. 456491Domain d1evua1: 1evu A:1-190 [21883]
        Other proteins in same PDB: d1evua2, d1evua3, d1evua4, d1evub2, d1evub3, d1evub4
      2. 456492Domain d1evub1: 1evu B:8-190 [21884]
        Other proteins in same PDB: d1evua2, d1evua3, d1evua4, d1evub2, d1evub3, d1evub4
    2. Domains for 1ex0:
      1. 456487Domain d1ex0a1: 1ex0 A:7-190 [90465]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a2, d1ex0a3, d1ex0a4, d1ex0b2, d1ex0b3, d1ex0b4
      2. 456488Domain d1ex0b1: 1ex0 B:5-190 [90469]
        Other proteins in same PDB: d1ex0a2, d1ex0a3, d1ex0a4, d1ex0b2, d1ex0b3, d1ex0b4
    3. Domains for 1f13:
      1. 456489Domain d1f13a1: 1f13 A:5-190 [21877]
        Other proteins in same PDB: d1f13a2, d1f13a3, d1f13a4, d1f13b2, d1f13b3, d1f13b4
      2. 456490Domain d1f13b1: 1f13 B:6-190 [21878]
        Other proteins in same PDB: d1f13a2, d1f13a3, d1f13a4, d1f13b2, d1f13b3, d1f13b4
    4. Domains for 1fie:
      1. 456495Domain d1fiea1: 1fie A:9-190 [21879]
        Other proteins in same PDB: d1fiea2, d1fiea3, d1fiea4, d1fieb2, d1fieb3, d1fieb4
      2. 456496Domain d1fieb1: 1fie B:10-190 [21880]
        Other proteins in same PDB: d1fiea2, d1fiea3, d1fiea4, d1fieb2, d1fieb3, d1fieb4
    5. Domains for 1ggt:
      1. 456501Domain d1ggta1: 1ggt A:8-190 [21881]
        Other proteins in same PDB: d1ggta2, d1ggta3, d1ggta4, d1ggtb2, d1ggtb3, d1ggtb4
      2. 456502Domain d1ggtb1: 1ggt B:8-190 [21882]
        Other proteins in same PDB: d1ggta2, d1ggta3, d1ggta4, d1ggtb2, d1ggtb3, d1ggtb4
    6. Domains for 1ggu:
      1. 456493Domain d1ggua1: 1ggu A:8-190 [21885]
        Other proteins in same PDB: d1ggua2, d1ggua3, d1ggua4, d1ggub2, d1ggub3, d1ggub4
      2. 456494Domain d1ggub1: 1ggu B:8-190 [21886]
        Other proteins in same PDB: d1ggua2, d1ggua3, d1ggua4, d1ggub2, d1ggub3, d1ggub4
    7. Domains for 1ggy:
      1. 456499Domain d1ggya1: 1ggy A:8-190 [21887]
        Other proteins in same PDB: d1ggya2, d1ggya3, d1ggya4, d1ggyb2, d1ggyb3, d1ggyb4
      2. 456500Domain d1ggyb1: 1ggy B:8-190 [21888]
        Other proteins in same PDB: d1ggya2, d1ggya3, d1ggya4, d1ggyb2, d1ggyb3, d1ggyb4
    8. Domains for 1qrk:
      1. 456497Domain d1qrka1: 1qrk A:9-190 [21889]
        Other proteins in same PDB: d1qrka2, d1qrka3, d1qrka4, d1qrkb2, d1qrkb3, d1qrkb4
      2. 456498Domain d1qrkb1: 1qrk B:10-190 [21890]
        Other proteins in same PDB: d1qrka2, d1qrka3, d1qrka4, d1qrkb2, d1qrkb3, d1qrkb4
  2. 456503Human (Homo sapiens), TGase E3 [TaxId:9606] [74845] (8 PDB entries)
    1. Domains for 1l9m:
      1. 456512Domain d1l9ma1: 1l9m A:1-140 [73732]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma2, d1l9ma3, d1l9ma4, d1l9mb2, d1l9mb3, d1l9mb4
      2. 456513Domain d1l9mb1: 1l9m B:1-140 [73736]
        Other proteins in same PDB: d1l9ma2, d1l9ma3, d1l9ma4, d1l9mb2, d1l9mb3, d1l9mb4
    2. Domains for 1l9n:
      1. 456514Domain d1l9na1: 1l9n A:1-140 [73740]
        Other proteins in same PDB: d1l9na2, d1l9na3, d1l9na4, d1l9nb2, d1l9nb3, d1l9nb4
      2. 456515Domain d1l9nb1: 1l9n B:1-140 [73744]
        Other proteins in same PDB: d1l9na2, d1l9na3, d1l9na4, d1l9nb2, d1l9nb3, d1l9nb4
    3. Domains for 1nud:
      1. 456517Domain d1nuda1: 1nud A:1-140 [86174]
        Other proteins in same PDB: d1nuda2, d1nuda3, d1nuda4, d1nudb2, d1nudb3, d1nudb4
      2. 456518Domain d1nudb1: 1nud B:1-140 [86178]
        Other proteins in same PDB: d1nuda2, d1nuda3, d1nuda4, d1nudb2, d1nudb3, d1nudb4
    4. Domain for 1nuf:
    5. Domains for 1nug:
      1. 456510Domain d1nuga1: 1nug A:1-140 [86186]
        Other proteins in same PDB: d1nuga2, d1nuga3, d1nuga4, d1nugb2, d1nugb3, d1nugb4
      2. 456511Domain d1nugb1: 1nug B:1-140 [86190]
        Other proteins in same PDB: d1nuga2, d1nuga3, d1nuga4, d1nugb2, d1nugb3, d1nugb4
    6. Domains for 1rle:
      1. 456508Domain d1rlea1: 1rle A:1-140 [97638]
        Other proteins in same PDB: d1rlea2, d1rlea3, d1rlea4, d1rleb2, d1rleb3, d1rleb4
      2. 456509Domain d1rleb1: 1rle B:1-140 [97642]
        Other proteins in same PDB: d1rlea2, d1rlea3, d1rlea4, d1rleb2, d1rleb3, d1rleb4
    7. Domains for 1sgx:
      1. 456506Domain d1sgxa1: 1sgx A:1-140 [98862]
        Other proteins in same PDB: d1sgxa2, d1sgxa3, d1sgxa4, d1sgxb2, d1sgxb3, d1sgxb4
      2. 456507Domain d1sgxb1: 1sgx B:1-140 [98866]
        Other proteins in same PDB: d1sgxa2, d1sgxa3, d1sgxa4, d1sgxb2, d1sgxb3, d1sgxb4
    8. Domains for 1vjj:
      1. 456504Domain d1vjja1: 1vjj A:1-140 [100814]
        Other proteins in same PDB: d1vjja2, d1vjja3, d1vjja4, d1vjjb2, d1vjjb3, d1vjjb4
      2. 456505Domain d1vjjb1: 1vjj B:1-140 [100818]
        Other proteins in same PDB: d1vjja2, d1vjja3, d1vjja4, d1vjjb2, d1vjjb3, d1vjjb4
  3. 456519Human (Homo sapiens), tissue isozyme [TaxId:9606] [74844] (1 PDB entry)
    GDP-binding protein
  4. 456526Red sea bream (Chrysophrys major) [TaxId:143350] [63667] (1 PDB entry)

More info for Protein Transglutaminase N-terminal domain from b.1.18.9: Transglutaminase N-terminal domain

Timeline for Protein Transglutaminase N-terminal domain from b.1.18.9: Transglutaminase N-terminal domain: