Class b: All beta proteins [48724] (119 folds) |
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (20 superfamilies) sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key some members of the fold have additional strands |
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) |
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (9 proteins) |
Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains [49132] (12 species) |
Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [49133] (1 PDB entry) |
Domain d1hdma1: 1hdm A:94-196 [21583] Other proteins in same PDB: d1hdma2, d1hdmb2 |
Domain d1hdmb1: 1hdm B:88-185 [21584] Other proteins in same PDB: d1hdma2, d1hdmb2 |
Human (Homo sapiens), HLA-DQ8 [TaxId:9606] [63663] (1 PDB entry) |
Domain d1jk8a1: 1jk8 A:85-181 [63145] Other proteins in same PDB: d1jk8a2, d1jk8b2 |
Domain d1jk8b1: 1jk8 B:95-192 [63147] Other proteins in same PDB: d1jk8a2, d1jk8b2 complexed with a human insulin peptide complexed with nag |
Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [49134] (11 PDB entries) |
Domain d1aqda1: 1aqd A:82-181 [21585] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2 |
Domain d1aqdb1: 1aqd B:93-190 [21586] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2 |
Domain d1aqdd1: 1aqd D:82-179 [21587] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2 |
Domain d1aqde1: 1aqd E:93-190 [21588] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2 |
Domain d1aqdg1: 1aqd G:82-179 [21589] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2 |
Domain d1aqdh1: 1aqd H:93-190 [21590] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2 |
Domain d1aqdj1: 1aqd J:82-179 [21591] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2 |
Domain d1aqdk1: 1aqd K:93-191 [21592] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2 |
Domain d1dlha1: 1dlh A:82-182 [21597] Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2 |
Domain d1dlhb1: 1dlh B:93-190 [21598] Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2 |
Domain d1dlhd1: 1dlh D:82-182 [21599] Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2 |
Domain d1dlhe1: 1dlh E:93-190 [21600] Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2 complexed with nag |
Domain d1h15a1: 1h15 A:82-182 [76454] Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e2 |
Domain d1h15b1: 1h15 B:93-190 [76456] Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e2 |
Domain d1h15d1: 1h15 D:82-182 [76458] Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e2 |
Domain d1h15e1: 1h15 E:93-190 [76460] Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e2 complexed with nag, ndg |
Domain d1hxya1: 1hxy A:82-182 [61386] Other proteins in same PDB: d1hxya2, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2 |
Domain d1hxyb1: 1hxy B:93-190 [61388] Other proteins in same PDB: d1hxya2, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2 complexed with zn |
Domain d1kg0a1: 1kg0 A:82-182 [72441] Other proteins in same PDB: d1kg0a2, d1kg0b2, d1kg0c_ |
Domain d1kg0b1: 1kg0 B:93-190 [72443] Other proteins in same PDB: d1kg0a2, d1kg0b2, d1kg0c_ |
Domain d1klga1: 1klg A:82-180 [72714] Other proteins in same PDB: d1klga2, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2 |
Domain d1klgb1: 1klg B:93-190 [72716] Other proteins in same PDB: d1klga2, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2 mutant |
Domain d1klua1: 1klu A:82-182 [72724] Other proteins in same PDB: d1klua2, d1klub2, d1klud1, d1klud2 |
Domain d1klub1: 1klu B:93-190 [72726] Other proteins in same PDB: d1klua2, d1klub2, d1klud1, d1klud2 |
Domain d1lo5a1: 1lo5 A:82-182 [78116] Other proteins in same PDB: d1lo5a2, d1lo5b2, d1lo5d1, d1lo5d2 |
Domain d1lo5b1: 1lo5 B:93-190 [78118] Other proteins in same PDB: d1lo5a2, d1lo5b2, d1lo5d1, d1lo5d2 mutant |
Domain d1seba1: 1seb A:82-181 [21601] Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2 |
Domain d1sebb1: 1seb B:93-192 [21602] Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2 |
Domain d1sebe1: 1seb E:82-181 [21603] Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2 |
Domain d1sebf1: 1seb F:93-192 [21604] Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2 |
Domain d2seba1: 2seb A:82-180 [21593] Other proteins in same PDB: d2seba2, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2 |
Domain d2sebb1: 2seb B:93-190 [21594] Other proteins in same PDB: d2seba2, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2 complexed with nag |
Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [49135] (3 PDB entries) |
Domain d1bx2a1: 1bx2 A:82-181 [21609] Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2 |
Domain d1bx2b1: 1bx2 B:93-193 [21610] Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2 |
Domain d1bx2d1: 1bx2 D:82-181 [21611] Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2 |
Domain d1bx2e1: 1bx2 E:93-191 [21612] Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2 complexed with nag |
Domain d1fv1a1: 1fv1 A:82-181 [21605] Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2 |
Domain d1fv1b1: 1fv1 B:93-190 [21606] Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2 |
Domain d1fv1d1: 1fv1 D:82-181 [21607] Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2 |
Domain d1fv1e1: 1fv1 E:93-190 [21608] Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2 complexed with cry, so4 |
Domain d1hqra1: 1hqr A:82-181 [21613] Other proteins in same PDB: d1hqra2, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2 |
Domain d1hqrb1: 1hqr B:293-390 [21614] Other proteins in same PDB: d1hqra2, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2 complexed with zn |
Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [49136] (1 PDB entry) |
Domain d1a6aa1: 1a6a A:82-180 [21615] Other proteins in same PDB: d1a6aa2, d1a6ab2 |
Domain d1a6ab1: 1a6a B:93-191 [21616] Other proteins in same PDB: d1a6aa2, d1a6ab2 complexed with nag |
Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [49137] (5 PDB entries) |
Domain d1d5ma1: 1d5m A:82-181 [21617] Other proteins in same PDB: d1d5ma2, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2 |
Domain d1d5mb1: 1d5m B:93-190 [21618] Other proteins in same PDB: d1d5ma2, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2 complexed with ace, nag |
Domain d1d5xa1: 1d5x A:82-181 [21623] Other proteins in same PDB: d1d5xa2, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2 |
Domain d1d5xb1: 1d5x B:93-190 [21624] Other proteins in same PDB: d1d5xa2, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2 complexed with ace, haq |
Domain d1d5za1: 1d5z A:82-180 [21619] Other proteins in same PDB: d1d5za2, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2 |
Domain d1d5zb1: 1d5z B:93-190 [21620] Other proteins in same PDB: d1d5za2, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2 complexed with ace, oda |
Domain d1d6ea1: 1d6e A:82-180 [21621] Other proteins in same PDB: d1d6ea2, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2 |
Domain d1d6eb1: 1d6e B:93-190 [21622] Other proteins in same PDB: d1d6ea2, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2 complexed with ace |
Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [69157] (1 PDB entry) |
Domain d1k8ia1: 1k8i A:93-191 [68301] Other proteins in same PDB: d1k8ia2, d1k8ib2 |
Domain d1k8ib1: 1k8i B:95-190 [68303] Other proteins in same PDB: d1k8ia2, d1k8ib2 complexed with nag |
Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [49141] (2 PDB entries) |
Domain d1es0a1: 1es0 A:83-180 [21643] Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0b2 |
Domain d1es0b1: 1es0 B:94-189 [21644] Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0b2 contains covalently bound peptides |
Domain d1f3ja1: 1f3j A:83-181 [21645] Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2 |
Domain d1f3jb1: 1f3j B:94-191 [21646] Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2 |
Domain d1f3jd1: 1f3j D:83-181 [21647] Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2 |
Domain d1f3je1: 1f3j E:94-191 [21648] Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2 complexed with nag |
Mouse (Mus musculus), I-AB [TaxId:10090] [74839] (2 PDB entries) |
Domain d1lnua1: 1lnu A:84-182 [74097] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh2 |
Domain d1lnub1: 1lnu B:121-217 [74099] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh2 |
Domain d1lnuc1: 1lnu C:84-182 [74101] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh2 |
Domain d1lnud1: 1lnu D:121-217 [74103] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh2 |
Domain d1lnue1: 1lnu E:84-182 [74105] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh2 |
Domain d1lnuf1: 1lnu F:121-217 [74107] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh2 |
Domain d1lnug1: 1lnu G:84-182 [74109] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh2 |
Domain d1lnuh1: 1lnu H:121-217 [74111] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh2 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag |
Domain d1muja1: 1muj A:84-183 [79488] Other proteins in same PDB: d1muja2, d1mujb2 |
Domain d1mujb1: 1muj B:94-192 [79490] Other proteins in same PDB: d1muja2, d1mujb2 complexed with nag |
Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [49140] (2 PDB entries) |
Domain d1iaoa1: 1iao A:83-178 [21641] Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob2 |
Domain d1iaob1: 1iao B:94-188 [21642] Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob2 complexed with nag |
Domain d2iada1: 2iad A:83-186 [21639] Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iadb2 |
Domain d2iadb1: 2iad B:94-190 [21640] Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iadb2 contains covalently bound peptides |
Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [49138] (3 PDB entries) |
Domain d1d9kc1: 1d9k C:82-182 [21627] Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2 |
Domain d1d9kd1: 1d9k D:93-190 [21628] Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2 |
Domain d1d9kg1: 1d9k G:82-182 [21629] Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2 |
Domain d1d9kh1: 1d9k H:93-190 [21630] Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2 |
Domain d1iaka1: 1iak A:82-181 [21625] Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb2 |
Domain d1iakb1: 1iak B:93-190 [21626] Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb2 complexed with nag |
Domain d1jl4a1: 1jl4 A:82-181 [63157] Other proteins in same PDB: d1jl4a2, d1jl4b2, d1jl4d1, d1jl4d2 |
Domain d1jl4b1: 1jl4 B:93-190 [63159] Other proteins in same PDB: d1jl4a2, d1jl4b2, d1jl4d1, d1jl4d2 |
Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [49139] (7 PDB entries) |
Domain d1fnea1: 1fne A:82-182 [59896] Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb2, d1fnec2, d1fned2 |
Domain d1fneb1: 1fne B:93-188 [59898] Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb2, d1fnec2, d1fned2 |
Domain d1fnec1: 1fne C:82-182 [59900] Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb2, d1fnec2, d1fned2 |
Domain d1fned1: 1fne D:93-188 [59902] Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb2, d1fnec2, d1fned2 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag; mutant |
Domain d1fnga1: 1fng A:82-182 [59904] Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd2 |
Domain d1fngb1: 1fng B:93-188 [59906] Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd2 |
Domain d1fngc1: 1fng C:82-182 [59908] Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd2 |
Domain d1fngd1: 1fng D:93-188 [59910] Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd2 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1i3ra1: 1i3r A:82-182 [61620] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2 |
Domain d1i3rb1: 1i3r B:121-216 [61622] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2 |
Domain d1i3rc1: 1i3r C:82-182 [61624] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2 |
Domain d1i3rd1: 1i3r D:121-216 [61626] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2 |
Domain d1i3re1: 1i3r E:82-182 [61628] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2 |
Domain d1i3rf1: 1i3r F:121-216 [61630] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2 |
Domain d1i3rg1: 1i3r G:82-182 [61632] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2 |
Domain d1i3rh1: 1i3r H:121-216 [61634] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H complexed with nag; mutant |
Domain d1ieaa1: 1iea A:82-182 [21631] Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2 |
Domain d1ieab1: 1iea B:93-188 [21632] Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2 |
Domain d1ieac1: 1iea C:82-182 [21633] Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2 |
Domain d1iead1: 1iea D:93-188 [21634] Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1ieba1: 1ieb A:82-182 [21635] Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2 |
Domain d1iebb1: 1ieb B:93-188 [21636] Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2 |
Domain d1iebc1: 1ieb C:82-182 [21637] Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2 |
Domain d1iebd1: 1ieb D:93-188 [21638] Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag, so4 |
Domain d1kt2a1: 1kt2 A:82-182 [72951] Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d2 |
Domain d1kt2b1: 1kt2 B:121-215 [72953] Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d2 |
Domain d1kt2c1: 1kt2 C:82-182 [72955] Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d2 |
Domain d1kt2d1: 1kt2 D:121-215 [72957] Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d2 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag |
Domain d1ktda1: 1ktd A:82-182 [72964] Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd2 |
Domain d1ktdb1: 1ktd B:121-215 [72966] Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd2 |
Domain d1ktdc1: 1ktd C:82-182 [72968] Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd2 |
Domain d1ktdd1: 1ktd D:121-215 [72970] Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd2 contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D complexed with nag, so4; mutant |
Timeline for Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like):