Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), alpha-chain

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 546417Class b: All beta proteins [48724] (149 folds)
  3. 546418Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (25 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 546419Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 546420Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (28 proteins)
  6. 548189Protein T-cell antigen receptor [48933] (6 species)
    sequences may differ within each classified species
  7. 548226Species Mouse (Mus musculus), alpha-chain [TaxId:10090] [48934] (16 PDB entries)

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), alpha-chain:

  1. Domain(s) for 1ac6:
    1. 548233Domain d1ac6a_: 1ac6 A: [20606]
    2. 548234Domain d1ac6b_: 1ac6 B: [20607]
      mutant
  2. Domain(s) for 1b88:
    1. 548236Domain d1b88a_: 1b88 A: [20608]
    2. 548237Domain d1b88b_: 1b88 B: [20609]
  3. Domain(s) for 1bwm:
    • 548254Domain d1bwma1: 1bwm A:301-417 [20620]
      single-chain construct of beta and alpha N-domains connected by a 27-residue linker
      mutant
  4. Domain(s) for 1d9k:
    1. 548252Domain d1d9ka_: 1d9k A: [20618]
      Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
    2. 548253Domain d1d9ke_: 1d9k E: [20619]
      Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
  5. Domain(s) for 1fo0:
  6. Domain(s) for 1g6r:
    1. 548250Domain d1g6ra1: 1g6r A:1-117 [20616]
      Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
    2. 548251Domain d1g6rc1: 1g6r C:1-117 [20617]
      Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
  7. Domain(s) for 1h5b:
    1. 548227Domain d1h5ba_: 1h5b A: [60638]
    2. 548228Domain d1h5bb_: 1h5b B: [60639]
    3. 548229Domain d1h5bc_: 1h5b C: [60640]
    4. 548230Domain d1h5bd_: 1h5b D: [60641]
      AV11S5-AJ17
      complexed with cl, gol
  8. Domain(s) for 1i9e:
  9. Domain(s) for 1kb5:
  10. Domain(s) for 1kj2:
    1. 548240Domain d1kj2a_: 1kj2 A: [72559]
      Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
    2. 548241Domain d1kj2d_: 1kj2 D: [72561]
      Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
      complexed with gal, man, nag, sia
  11. Domain(s) for 1lp9:
    1. 548231Domain d1lp9e1: 1lp9 E:0-117 [91086]
      Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
    2. 548232Domain d1lp9l1: 1lp9 L:0-117 [91093]
      Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
  12. Domain(s) for 1mwa:
    1. 548243Domain d1mwaa1: 1mwa A:1-117 [79558]
      Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
    2. 548244Domain d1mwac1: 1mwa C:1-117 [79562]
      Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
      complexed with acy, gol, man, nag
  13. Domain(s) for 1nam:
  14. Domain(s) for 1nfd:
    1. 548246Domain d1nfda1: 1nfd A:1-117 [20612]
      Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
    2. 548247Domain d1nfdc1: 1nfd C:1-117 [20613]
      Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
      complexed with nag
  15. Domain(s) for 1tcr:
  16. Domain(s) for 2ckb:
    1. 548248Domain d2ckba1: 2ckb A:1-117 [20614]
      Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
    2. 548249Domain d2ckbc1: 2ckb C:1-117 [20615]
      Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_

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