Class a: All alpha proteins [46456] (284 folds) |
Fold a.16: S15/NS1 RNA-binding domain [47059] (1 superfamily) 3 helices; irregular array |
Superfamily a.16.1: S15/NS1 RNA-binding domain [47060] (3 families) |
Family a.16.1.2: Ribosomal protein S15 [47064] (1 protein) contains additional N-terminal helix that forms a separate unit |
Protein Ribosomal protein S15 [47065] (3 species) |
Bacillus stearothermophilus [TaxId:1422] [47066] (1 PDB entry) |
Domain d1a32a_: 1a32 A: [16384] |
Escherichia coli [TaxId:562] [158383] (10 PDB entries) Uniprot Q8X9M2 2-89 |
Domain d1vs5o1: 1vs5 O:1-88 [144449] Other proteins in same PDB: d1vs5b1, d1vs5c1, d1vs5c2, d1vs5d1, d1vs5e1, d1vs5e2, d1vs5f1, d1vs5g1, d1vs5h1, d1vs5i1, d1vs5j1, d1vs5k1, d1vs5l1, d1vs5m1, d1vs5n1, d1vs5p1, d1vs5q1, d1vs5r1, d1vs5s1, d1vs5t1, d1vs5u1 automatically matched to 2AVY O:1-88 complexed with ksg, mg |
Domain d1vs7o1: 1vs7 O:1-88 [144490] Other proteins in same PDB: d1vs7b1, d1vs7c1, d1vs7c2, d1vs7d1, d1vs7e1, d1vs7e2, d1vs7f1, d1vs7g1, d1vs7h1, d1vs7i1, d1vs7j1, d1vs7k1, d1vs7l1, d1vs7m1, d1vs7n1, d1vs7p1, d1vs7q1, d1vs7r1, d1vs7s1, d1vs7t1, d1vs7u1 automatically matched to 2AVY O:1-88 complexed with ksg, mg |
Domain d2avyo1: 2avy O:1-88 [144856] Other proteins in same PDB: d2avyb1, d2avyc1, d2avyc2, d2avyd1, d2avye1, d2avye2, d2avyf1, d2avyg1, d2avyh1, d2avyi1, d2avyj1, d2avyk1, d2avyl1, d2avym1, d2avyn1, d2avyp1, d2avyq1, d2avyr1, d2avys1, d2avyt1, d2avyu1 Representative structure protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2aw7o1: 2aw7 O:1-88 [144899] Other proteins in same PDB: d2aw7b1, d2aw7c1, d2aw7c2, d2aw7d1, d2aw7e1, d2aw7e2, d2aw7f1, d2aw7g1, d2aw7h1, d2aw7i1, d2aw7j1, d2aw7k1, d2aw7l1, d2aw7m1, d2aw7n1, d2aw7p1, d2aw7q1, d2aw7r1, d2aw7s1, d2aw7t1, d2aw7u1 automatically matched to 2AVY O:1-88 protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2i2po1: 2i2p O:1-88 [145434] Other proteins in same PDB: d2i2pb1, d2i2pc1, d2i2pc2, d2i2pd1, d2i2pe1, d2i2pe2, d2i2pf1, d2i2pg1, d2i2ph1, d2i2pi1, d2i2pj1, d2i2pk1, d2i2pl1, d2i2pm1, d2i2pn1, d2i2pp1, d2i2pq1, d2i2pr1, d2i2ps1, d2i2pt1, d2i2pu1 automatically matched to 2AVY O:1-88 protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2i2uo1: 2i2u O:1-88 [145476] Other proteins in same PDB: d2i2ub1, d2i2uc1, d2i2uc2, d2i2ud1, d2i2ue1, d2i2ue2, d2i2uf1, d2i2ug1, d2i2uh1, d2i2ui1, d2i2uj1, d2i2uk1, d2i2ul1, d2i2um1, d2i2un1, d2i2up1, d2i2uq1, d2i2ur1, d2i2us1, d2i2ut1, d2i2uu1 automatically matched to 2AVY O:1-88 protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2vhoo1: 2vho O:1-88 [153137] Other proteins in same PDB: d2vhob1, d2vhoc1, d2vhoc2, d2vhod1, d2vhoe1, d2vhoe2, d2vhof1, d2vhog1, d2vhoh1, d2vhoi1, d2vhoj1, d2vhok1, d2vhol1, d2vhom1, d2vhon1, d2vhop1, d2vhoq1, d2vhor1, d2vhos1, d2vhot1, d2vhou1 automatically matched to 2AVY O:1-88 protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2vhpo1: 2vhp O:1-88 [153159] Other proteins in same PDB: d2vhpb1, d2vhpc1, d2vhpc2, d2vhpd1, d2vhpe1, d2vhpe2, d2vhpf1, d2vhpg1, d2vhph1, d2vhpi1, d2vhpj1, d2vhpk1, d2vhpl1, d2vhpm1, d2vhpn1, d2vhpp1, d2vhpq1, d2vhpr1, d2vhps1, d2vhpt1, d2vhpu1 automatically matched to 2AVY O:1-88 protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d3df1o1: 3df1 O:1-88 [157617] Other proteins in same PDB: d3df1b1, d3df1c1, d3df1c2, d3df1d1, d3df1e1, d3df1e2, d3df1f1, d3df1g1, d3df1h1, d3df1i1, d3df1j1, d3df1k1, d3df1l1, d3df1m1, d3df1n1, d3df1p1, d3df1q1, d3df1r1, d3df1s1, d3df1t1, d3df1u1 automatically matched to 2AVY O:1-88 protein/RNA complex; complexed with hyg, mg |
Domain d3df3o1: 3df3 O:1-88 [157671] Other proteins in same PDB: d3df3b1, d3df3c1, d3df3c2, d3df3d1, d3df3e1, d3df3e2, d3df3f1, d3df3g1, d3df3h1, d3df3i1, d3df3j1, d3df3k1, d3df3l1, d3df3m1, d3df3n1, d3df3p1, d3df3q1, d3df3r1, d3df3s1, d3df3t1, d3df3u1 automatically matched to 2AVY O:1-88 protein/RNA complex; complexed with hyg, mg |
Thermus thermophilus [TaxId:274] [47067] (42 PDB entries) Uniprot P80378 |
Domain d1ab3a_: 1ab3 A: [16395] |
Domain d1dk1a_: 1dk1 A: [16385] complex with an rRNA fragment protein/RNA complex; complexed with k, mg, na |
Domain d1f7ya_: 1f7y A: [16386] complex with an rRNA fragment complexed with k, mg, na |
Domain d1g1xb_: 1g1x B: [16393] Other proteins in same PDB: d1g1xa_, d1g1xc_, d1g1xf_, d1g1xh_ |
Domain d1g1xg_: 1g1x G: [16394] Other proteins in same PDB: d1g1xa_, d1g1xc_, d1g1xf_, d1g1xh_ |
Domain d1kuqa_: 1kuq A: [84470] complex with an rRNA fragment protein/RNA complex; complexed with so4; mutant |
Domain d2b64o1: 2b64 O:2-89 [127947] Other proteins in same PDB: d2b64b1, d2b64c1, d2b64c2, d2b64d1, d2b64e1, d2b64e2, d2b64f1, d2b64g1, d2b64h1, d2b64i1, d2b64j1, d2b64k1, d2b64l1, d2b64m1, d2b64n1, d2b64p1, d2b64q1, d2b64r1, d2b64s1, d2b64t1, d2b64u1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex |
Domain d2b9mo1: 2b9m O:2-89 [128140] Other proteins in same PDB: d2b9mb1, d2b9mc1, d2b9mc2, d2b9md1, d2b9me1, d2b9me2, d2b9mf1, d2b9mg1, d2b9mh1, d2b9mi1, d2b9mj1, d2b9mk1, d2b9ml1, d2b9mm1, d2b9mn1, d2b9mp1, d2b9mq1, d2b9mr1, d2b9ms1, d2b9mt1, d2b9mu1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex |
Domain d2b9oo1: 2b9o O:2-89 [128177] Other proteins in same PDB: d2b9ob1, d2b9oc1, d2b9oc2, d2b9od1, d2b9oe1, d2b9oe2, d2b9of1, d2b9og1, d2b9oh1, d2b9oi1, d2b9oj1, d2b9ok1, d2b9ol1, d2b9om1, d2b9on1, d2b9op1, d2b9oq1, d2b9or1, d2b9os1, d2b9ot1, d2b9ou1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex |
Domain d2f4vo1: 2f4v O:2-89 [132952] Other proteins in same PDB: d2f4vb1, d2f4vc1, d2f4vc2, d2f4vd1, d2f4ve1, d2f4ve2, d2f4vf1, d2f4vg1, d2f4vh1, d2f4vi1, d2f4vj1, d2f4vk1, d2f4vl1, d2f4vm1, d2f4vn1, d2f4vp1, d2f4vq1, d2f4vr1, d2f4vs1, d2f4vt1 automatically matched to d1ab3__ complexed with ab9, d2c, k, mg, zn |
Domain d2fkxa1: 2fkx A:1-88 [133685] automatically matched to d1ab3__ |
Domain d2hhho1: 2hhh O:2-89 [136491] Other proteins in same PDB: d2hhhb1, d2hhhc1, d2hhhc2, d2hhhd1, d2hhhe1, d2hhhe2, d2hhhf1, d2hhhg1, d2hhhh1, d2hhhi1, d2hhhj1, d2hhhk1, d2hhhl1, d2hhhm1, d2hhhn1, d2hhhp1, d2hhhq1, d2hhhr1, d2hhhs1, d2hhht1, d2hhhu1 automatically matched to d1ab3__ complexed with ksg |
Domain d2j00o1: 2j00 O:2-89 [137853] Other proteins in same PDB: d2j00b1, d2j00c1, d2j00c2, d2j00d1, d2j00e1, d2j00e2, d2j00f1, d2j00g1, d2j00h1, d2j00i1, d2j00j1, d2j00k1, d2j00l1, d2j00m1, d2j00n1, d2j00p1, d2j00q1, d2j00r1, d2j00s1, d2j00t1, d2j00u1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex; complexed with mg, par, zn |
Domain d2j02o1: 2j02 O:2-89 [137880] Other proteins in same PDB: d2j02b1, d2j02c1, d2j02c2, d2j02d1, d2j02e1, d2j02e2, d2j02f1, d2j02g1, d2j02h1, d2j02i1, d2j02j1, d2j02k1, d2j02l1, d2j02m1, d2j02n1, d2j02p1, d2j02q1, d2j02r1, d2j02s1, d2j02t1, d2j02u1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex; complexed with mg, par, zn |
Domain d2ow8p1: 2ow8 p:2-89 [139413] Other proteins in same PDB: d2ow8c1, d2ow8d1, d2ow8d2, d2ow8e1, d2ow8f1, d2ow8f2, d2ow8g1, d2ow8h1, d2ow8i1, d2ow8j1, d2ow8k1, d2ow8l1, d2ow8m1, d2ow8n1, d2ow8o1, d2ow8q1, d2ow8r1, d2ow8s1, d2ow8t1, d2ow8u1, d2ow8v1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex |
Domain d2uu9o1: 2uu9 O:2-89 [139906] Other proteins in same PDB: d2uu9b1, d2uu9c1, d2uu9c2, d2uu9d1, d2uu9e1, d2uu9e2, d2uu9f1, d2uu9g1, d2uu9h1, d2uu9j1, d2uu9k1, d2uu9l1, d2uu9m1, d2uu9n1, d2uu9p1, d2uu9q1, d2uu9r1, d2uu9s1, d2uu9t1, d2uu9u1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Domain d2uuao1: 2uua O:2-89 [139926] Other proteins in same PDB: d2uuab1, d2uuac1, d2uuac2, d2uuad1, d2uuae1, d2uuae2, d2uuaf1, d2uuag1, d2uuah1, d2uuaj1, d2uuak1, d2uual1, d2uuam1, d2uuan1, d2uuap1, d2uuaq1, d2uuar1, d2uuas1, d2uuat1, d2uuau1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Domain d2uubo1: 2uub O:2-89 [139946] Other proteins in same PDB: d2uubb1, d2uubc1, d2uubc2, d2uubd1, d2uube1, d2uube2, d2uubf1, d2uubg1, d2uubh1, d2uubj1, d2uubk1, d2uubl1, d2uubm1, d2uubn1, d2uubp1, d2uubq1, d2uubr1, d2uubs1, d2uubt1, d2uubu1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Domain d2uuco1: 2uuc O:2-89 [139966] Other proteins in same PDB: d2uucb1, d2uucc1, d2uucc2, d2uucd1, d2uuce1, d2uuce2, d2uucf1, d2uucg1, d2uuch1, d2uucj1, d2uuck1, d2uucl1, d2uucm1, d2uucn1, d2uucp1, d2uucq1, d2uucr1, d2uucs1, d2uuct1, d2uucu1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Domain d2uxco1: 2uxc O:2-89 [140018] Other proteins in same PDB: d2uxcb1, d2uxcc1, d2uxcc2, d2uxcd1, d2uxce1, d2uxce2, d2uxcf1, d2uxcg1, d2uxch1, d2uxci1, d2uxcj1, d2uxck1, d2uxcl1, d2uxcm1, d2uxcn1, d2uxcp1, d2uxcq1, d2uxcr1, d2uxcs1, d2uxct1, d2uxcu1 automatically matched to d1ab3__ protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Timeline for Protein Ribosomal protein S15 from a.16.1.2: Ribosomal protein S15: