SCOPe 2.08: Species: Human adenovirus type 5 [TaxId: 28285]

Lineage for Species: Human adenovirus type 5 [TaxId: 28285]

Root: SCOPe 2.08
Class b: All beta proteins [48724] (180 folds)

Fold b.121: Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins) [88632] (7 superfamilies)
sandwich; 8 strands in 2 sheets; jelly-roll; some members can have additional 1-2 strands
characteristic interaction between the domains of this fold allows the formation of five-fold and pseudo six-fold assemblies

Superfamily b.121.2: Group II dsDNA viruses VP [49749] (4 families)

duplication: consists of two domains of this fold packed together like the nucleoplasmin subunits
trimeric; in the trimers, the domains are arranged around pseudo six-fold axis

Family b.121.2.2: Adenovirus hexon [49753] (3 proteins)
each domain is heavily decorated with many insertions
Protein Adenovirus hexon, C-terminal domain [418931] (2 species)
Species Human adenovirus type 5 [TaxId:28285] [419365] (3 PDB entries)

PDB entries in Species: Human adenovirus type 5 [TaxId: 28285]:

Domain(s) for 1p30:
- Domain d1p30a2: 1p30 A:637-946 [93965]
  Other proteins in same PDB: d1p30a1
Domain(s) for 2bvi:
1. Domain d2bvif2: 2bvi F:637-946 [129259]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
2. Domain d2bvig2: 2bvi G:637-946 [129261]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
3. Domain d2bvih2: 2bvi H:637-946 [129263]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
4. Domain d2bvii2: 2bvi I:637-946 [129265]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
5. Domain d2bvij2: 2bvi J:637-946 [129267]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
6. Domain d2bvik2: 2bvi K:637-946 [129269]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
7. Domain d2bvil2: 2bvi L:637-946 [129271]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
8. Domain d2bvim2: 2bvi M:637-946 [129273]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
9. Domain d2bvin2: 2bvi N:637-946 [129275]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
10. Domain d2bvio2: 2bvi O:637-946 [129277]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
11. Domain d2bvip2: 2bvi P:637-946 [129279]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
12. Domain d2bviq2: 2bvi Q:637-946 [129281]
  Other proteins in same PDB: d2bvif1, d2bvig1, d2bvih1, d2bvii1, d2bvij1, d2bvik1, d2bvil1, d2bvim1, d2bvin1, d2bvio1, d2bvip1, d2bviq1
Domain(s) for 3tg7:
- Domain d3tg7a2: 3tg7 A:637-946 [216810]
  Other proteins in same PDB: d3tg7a1
  automated match to d1p30a2

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Species Human adenovirus type 5 [TaxId:28285] from b.121.2.2 Adenovirus hexon, C-terminal domain is new in SCOPe 2.08-stable