Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds) |
Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies) contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites |
Superfamily c.1.14: RuBisCo, C-terminal domain [51649] (2 families) automatically mapped to Pfam PF00016 |
Family c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain [51650] (2 proteins) N-terminal domain is alpha+beta |
Protein automated matches [226984] (5 species) not a true protein |
Species Thermosynechococcus elongatus [TaxId:197221] [226344] (2 PDB entries) |
Domain d2ybva2: 2ybv A:151-459 [207522] Other proteins in same PDB: d2ybva1, d2ybvb_, d2ybvc1, d2ybvd_, d2ybve1, d2ybvf_, d2ybvg1, d2ybvh_, d2ybvi1, d2ybvj_, d2ybvk1, d2ybvl_, d2ybvm1, d2ybvn_, d2ybvo1, d2ybvp_ automated match to d1wdda1 complexed with cl |
Domain d2ybvc2: 2ybv C:151-459 [207525] Other proteins in same PDB: d2ybva1, d2ybvb_, d2ybvc1, d2ybvd_, d2ybve1, d2ybvf_, d2ybvg1, d2ybvh_, d2ybvi1, d2ybvj_, d2ybvk1, d2ybvl_, d2ybvm1, d2ybvn_, d2ybvo1, d2ybvp_ automated match to d1wdda1 complexed with cl |
Domain d2ybve2: 2ybv E:151-459 [207528] Other proteins in same PDB: d2ybva1, d2ybvb_, d2ybvc1, d2ybvd_, d2ybve1, d2ybvf_, d2ybvg1, d2ybvh_, d2ybvi1, d2ybvj_, d2ybvk1, d2ybvl_, d2ybvm1, d2ybvn_, d2ybvo1, d2ybvp_ automated match to d1wdda1 complexed with cl |
Domain d2ybvg2: 2ybv G:151-459 [207531] Other proteins in same PDB: d2ybva1, d2ybvb_, d2ybvc1, d2ybvd_, d2ybve1, d2ybvf_, d2ybvg1, d2ybvh_, d2ybvi1, d2ybvj_, d2ybvk1, d2ybvl_, d2ybvm1, d2ybvn_, d2ybvo1, d2ybvp_ automated match to d1wdda1 complexed with cl |
Domain d2ybvi2: 2ybv I:151-459 [207534] Other proteins in same PDB: d2ybva1, d2ybvb_, d2ybvc1, d2ybvd_, d2ybve1, d2ybvf_, d2ybvg1, d2ybvh_, d2ybvi1, d2ybvj_, d2ybvk1, d2ybvl_, d2ybvm1, d2ybvn_, d2ybvo1, d2ybvp_ automated match to d1wdda1 complexed with cl |
Domain d2ybvk2: 2ybv K:151-459 [207537] Other proteins in same PDB: d2ybva1, d2ybvb_, d2ybvc1, d2ybvd_, d2ybve1, d2ybvf_, d2ybvg1, d2ybvh_, d2ybvi1, d2ybvj_, d2ybvk1, d2ybvl_, d2ybvm1, d2ybvn_, d2ybvo1, d2ybvp_ automated match to d1wdda1 complexed with cl |
Domain d2ybvm2: 2ybv M:151-459 [207540] Other proteins in same PDB: d2ybva1, d2ybvb_, d2ybvc1, d2ybvd_, d2ybve1, d2ybvf_, d2ybvg1, d2ybvh_, d2ybvi1, d2ybvj_, d2ybvk1, d2ybvl_, d2ybvm1, d2ybvn_, d2ybvo1, d2ybvp_ automated match to d1wdda1 complexed with cl |
Domain d2ybvo2: 2ybv O:151-459 [207543] Other proteins in same PDB: d2ybva1, d2ybvb_, d2ybvc1, d2ybvd_, d2ybve1, d2ybvf_, d2ybvg1, d2ybvh_, d2ybvi1, d2ybvj_, d2ybvk1, d2ybvl_, d2ybvm1, d2ybvn_, d2ybvo1, d2ybvp_ automated match to d1wdda1 complexed with cl |
Domain d3zxwa2: 3zxw A:151-475 [201381] Other proteins in same PDB: d3zxwa1, d3zxwb_, d3zxwc1, d3zxwd_, d3zxwe1, d3zxwf_, d3zxwg1, d3zxwh_ automated match to d1wdda1 complexed with cap, gol, mg |
Domain d3zxwc2: 3zxw C:151-475 [201384] Other proteins in same PDB: d3zxwa1, d3zxwb_, d3zxwc1, d3zxwd_, d3zxwe1, d3zxwf_, d3zxwg1, d3zxwh_ automated match to d1wdda1 complexed with cap, gol, mg |
Domain d3zxwe2: 3zxw E:151-475 [201386] Other proteins in same PDB: d3zxwa1, d3zxwb_, d3zxwc1, d3zxwd_, d3zxwe1, d3zxwf_, d3zxwg1, d3zxwh_ automated match to d1wdda1 complexed with cap, gol, mg |
Domain d3zxwg2: 3zxw G:151-475 [201389] Other proteins in same PDB: d3zxwa1, d3zxwb_, d3zxwc1, d3zxwd_, d3zxwe1, d3zxwf_, d3zxwg1, d3zxwh_ automated match to d1wdda1 complexed with cap, gol, mg |
Timeline for Species Thermosynechococcus elongatus [TaxId:197221] from c.1.14.1 automated matches: