Lineage for Protein: automated matches
- Root: SCOPe 2.05
Class a: All alpha proteins [46456] (286 folds) Fold a.24: Four-helical up-and-down bundle [47161] (28 superfamilies)
core: 4 helices; bundle, closed or partly opened, left-handed twist; up-and-down
Superfamily a.24.8: Proteasome activator [47216] (1 family) 
Family a.24.8.1: Proteasome activator [47217] (3 proteins) Protein automated matches [190828] (1 species)
not a true protein
Species:
Trypanosome (Trypanosoma brucei) [TaxId:5691] [188131] (5 PDB entries) - Domains for 1ya7:
Domain d1ya7p_: 1ya7 P: [144609]
Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1ya7q_: 1ya7 Q: [144610]
Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1ya7r_: 1ya7 R: [144611]
Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1ya7s_: 1ya7 S: [144612]
Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1ya7t_: 1ya7 T: [144613]
Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1ya7u_: 1ya7 U: [144614]
Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
- Domains for 1yar:
Domain d1yaro_: 1yar O: [144615]
Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4; mutant
Domain d1yarp_: 1yar P: [144616]
Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4; mutant
Domain d1yarq_: 1yar Q: [144617]
Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4; mutant
Domain d1yarr_: 1yar R: [144618]
Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4; mutant
Domain d1yars_: 1yar S: [144619]
Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4; mutant
Domain d1yart_: 1yar T: [144620]
Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4; mutant
Domain d1yaru_: 1yar U: [144621]
Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4; mutant
- Domains for 1yau:
Domain d1yauo_: 1yau O: [144622]
Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1yaup_: 1yau P: [144623]
Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1yauq_: 1yau Q: [144624]
Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1yaur_: 1yau R: [144625]
Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1yaus_: 1yau S: [144626]
Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1yaut_: 1yau T: [144627]
Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
Domain d1yauu_: 1yau U: [144628]
Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
automated match to d1ya7o1
complexed with gol, so4
- Domains for 3jrm:
Domain d3jrmo_: 3jrm O: [178738]
Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jrmp_: 3jrm P: [178739]
Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jrmq_: 3jrm Q: [178740]
Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jrmr_: 3jrm R: [178741]
Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jrms_: 3jrm S: [178742]
Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jrmt_: 3jrm T: [178743]
Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jrmu_: 3jrm U: [178744]
Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
automated match to d1ya7o1
- Domains for 3jse:
Domain d3jseo_: 3jse O: [178772]
Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jsep_: 3jse P: [178773]
Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jseq_: 3jse Q: [178774]
Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jser_: 3jse R: [178775]
Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jses_: 3jse S: [178776]
Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jset_: 3jse T: [178777]
Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
automated match to d1ya7o1
Domain d3jseu_: 3jse U: [178778]
Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
automated match to d1ya7o1
- Domains for 1ya7:
More info for Protein automated matches from a.24.8.1: Proteasome activator
Timeline for Protein automated matches from a.24.8.1: Proteasome activator:
- Protein automated matches from a.24.8.1: Proteasome activator first appeared in SCOPe 2.01
- Protein automated matches from a.24.8.1: Proteasome activator appears in SCOPe 2.04
- Protein automated matches from a.24.8.1: Proteasome activator appears in SCOPe 2.06
- Protein automated matches from a.24.8.1: Proteasome activator appears in the current release, SCOPe 2.08