Lineage for Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2170735Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2224590Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 2224591Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (8 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 2224775Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (4 proteins)
  6. 2228394Protein automated matches [190144] (11 species)
    not a true protein
  7. 2230420Species Thermoplasma acidophilum [TaxId:2303] [186869] (7 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]:

  1. Domain(s) for 1ya7:
    1. 2230435Domain d1ya7a_: 1ya7 A: [122790]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    2. 2230436Domain d1ya7b_: 1ya7 B: [122791]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    3. 2230437Domain d1ya7c_: 1ya7 C: [122792]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    4. 2230438Domain d1ya7d_: 1ya7 D: [122793]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    5. 2230439Domain d1ya7e_: 1ya7 E: [122794]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    6. 2230440Domain d1ya7f_: 1ya7 F: [122795]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    7. 2230441Domain d1ya7g_: 1ya7 G: [122796]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    8. 2230442Domain d1ya7h_: 1ya7 H: [122797]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    9. 2230443Domain d1ya7i_: 1ya7 I: [122798]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    10. 2230444Domain d1ya7j_: 1ya7 J: [122799]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    11. 2230445Domain d1ya7k_: 1ya7 K: [122800]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    12. 2230446Domain d1ya7l_: 1ya7 L: [122801]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    13. 2230447Domain d1ya7m_: 1ya7 M: [122802]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    14. 2230448Domain d1ya7n_: 1ya7 N: [122803]
      Other proteins in same PDB: d1ya7o1, d1ya7p_, d1ya7q_, d1ya7r_, d1ya7s_, d1ya7t_, d1ya7u_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
  2. Domain(s) for 1yar:
    1. 2230421Domain d1yara_: 1yar A: [122837]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4; mutant
    2. 2230422Domain d1yarb_: 1yar B: [122838]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4; mutant
    3. 2230423Domain d1yarc_: 1yar C: [122839]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4; mutant
    4. 2230424Domain d1yard_: 1yar D: [122840]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4; mutant
    5. 2230425Domain d1yare_: 1yar E: [122841]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4; mutant
    6. 2230426Domain d1yarf_: 1yar F: [122842]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4; mutant
    7. 2230427Domain d1yarg_: 1yar G: [122843]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4; mutant
    8. 2230428Domain d1yarh_: 1yar H: [122844]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    9. 2230429Domain d1yari_: 1yar I: [122845]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    10. 2230430Domain d1yarj_: 1yar J: [122846]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    11. 2230431Domain d1yark_: 1yar K: [122847]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    12. 2230432Domain d1yarl_: 1yar L: [122848]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    13. 2230433Domain d1yarm_: 1yar M: [122849]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
    14. 2230434Domain d1yarn_: 1yar N: [122850]
      Other proteins in same PDB: d1yaro_, d1yarp_, d1yarq_, d1yarr_, d1yars_, d1yart_, d1yaru_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4; mutant
  3. Domain(s) for 1yau:
    1. 2230449Domain d1yaua_: 1yau A: [122851]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    2. 2230450Domain d1yaub_: 1yau B: [122852]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    3. 2230451Domain d1yauc_: 1yau C: [122853]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    4. 2230452Domain d1yaud_: 1yau D: [122854]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    5. 2230453Domain d1yaue_: 1yau E: [122855]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    6. 2230454Domain d1yauf_: 1yau F: [122856]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    7. 2230455Domain d1yaug_: 1yau G: [122857]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pmaa_
      complexed with gol, so4
    8. 2230456Domain d1yauh_: 1yau H: [122858]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    9. 2230457Domain d1yaui_: 1yau I: [122859]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    10. 2230458Domain d1yauj_: 1yau J: [122860]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    11. 2230459Domain d1yauk_: 1yau K: [122861]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    12. 2230460Domain d1yaul_: 1yau L: [122862]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    13. 2230461Domain d1yaum_: 1yau M: [122863]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
    14. 2230462Domain d1yaun_: 1yau N: [122864]
      Other proteins in same PDB: d1yauo_, d1yaup_, d1yauq_, d1yaur_, d1yaus_, d1yaut_, d1yauu_
      automated match to d1pma1_
      complexed with gol, so4
  4. Domain(s) for 2ku1:
    1. 2230477Domain d2ku1a1: 2ku1 A:1-233 [242650]
      Other proteins in same PDB: d2ku1a2, d2ku1b2, d2ku1c2, d2ku1d2, d2ku1e2, d2ku1f2, d2ku1g2
      automated match to d1ya7a_
    2. 2230478Domain d2ku1b1: 2ku1 B:1-233 [242651]
      Other proteins in same PDB: d2ku1a2, d2ku1b2, d2ku1c2, d2ku1d2, d2ku1e2, d2ku1f2, d2ku1g2
      automated match to d1ya7a_
    3. 2230479Domain d2ku1c1: 2ku1 C:1-233 [242652]
      Other proteins in same PDB: d2ku1a2, d2ku1b2, d2ku1c2, d2ku1d2, d2ku1e2, d2ku1f2, d2ku1g2
      automated match to d1ya7a_
    4. 2230480Domain d2ku1d1: 2ku1 D:1-233 [242653]
      Other proteins in same PDB: d2ku1a2, d2ku1b2, d2ku1c2, d2ku1d2, d2ku1e2, d2ku1f2, d2ku1g2
      automated match to d1ya7a_
    5. 2230481Domain d2ku1e1: 2ku1 E:1-233 [242654]
      Other proteins in same PDB: d2ku1a2, d2ku1b2, d2ku1c2, d2ku1d2, d2ku1e2, d2ku1f2, d2ku1g2
      automated match to d1ya7a_
    6. 2230482Domain d2ku1f1: 2ku1 F:1-233 [242655]
      Other proteins in same PDB: d2ku1a2, d2ku1b2, d2ku1c2, d2ku1d2, d2ku1e2, d2ku1f2, d2ku1g2
      automated match to d1ya7a_
    7. 2230483Domain d2ku1g1: 2ku1 G:1-233 [242656]
      Other proteins in same PDB: d2ku1a2, d2ku1b2, d2ku1c2, d2ku1d2, d2ku1e2, d2ku1f2, d2ku1g2
      automated match to d1ya7a_
  5. Domain(s) for 2ku2:
    1. 2230484Domain d2ku2a1: 2ku2 A:1-233 [242657]
      Other proteins in same PDB: d2ku2a2, d2ku2b2, d2ku2c2, d2ku2d2, d2ku2e2, d2ku2f2, d2ku2g2
      automated match to d1yaua_
    2. 2230485Domain d2ku2b1: 2ku2 B:1-233 [242658]
      Other proteins in same PDB: d2ku2a2, d2ku2b2, d2ku2c2, d2ku2d2, d2ku2e2, d2ku2f2, d2ku2g2
      automated match to d1yaua_
    3. 2230486Domain d2ku2c1: 2ku2 C:1-233 [242659]
      Other proteins in same PDB: d2ku2a2, d2ku2b2, d2ku2c2, d2ku2d2, d2ku2e2, d2ku2f2, d2ku2g2
      automated match to d1yaua_
    4. 2230487Domain d2ku2d1: 2ku2 D:1-233 [242660]
      Other proteins in same PDB: d2ku2a2, d2ku2b2, d2ku2c2, d2ku2d2, d2ku2e2, d2ku2f2, d2ku2g2
      automated match to d1yaua_
    5. 2230488Domain d2ku2e1: 2ku2 E:1-233 [242661]
      Other proteins in same PDB: d2ku2a2, d2ku2b2, d2ku2c2, d2ku2d2, d2ku2e2, d2ku2f2, d2ku2g2
      automated match to d1yaua_
    6. 2230489Domain d2ku2f1: 2ku2 F:1-233 [242662]
      Other proteins in same PDB: d2ku2a2, d2ku2b2, d2ku2c2, d2ku2d2, d2ku2e2, d2ku2f2, d2ku2g2
      automated match to d1yaua_
    7. 2230490Domain d2ku2g1: 2ku2 G:1-233 [242663]
      Other proteins in same PDB: d2ku2a2, d2ku2b2, d2ku2c2, d2ku2d2, d2ku2e2, d2ku2f2, d2ku2g2
      automated match to d1yaua_
  6. Domain(s) for 3jrm:
    1. 2230463Domain d3jrma_: 3jrm A: [178724]
      Other proteins in same PDB: d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
      automated match to d1pmaa_
    2. 2230464Domain d3jrmb_: 3jrm B: [178725]
      Other proteins in same PDB: d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
      automated match to d1pmaa_
    3. 2230465Domain d3jrmc_: 3jrm C: [178726]
      Other proteins in same PDB: d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
      automated match to d1pmaa_
    4. 2230466Domain d3jrmd_: 3jrm D: [178727]
      Other proteins in same PDB: d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
      automated match to d1pmaa_
    5. 2230467Domain d3jrme_: 3jrm E: [178728]
      Other proteins in same PDB: d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
      automated match to d1pmaa_
    6. 2230468Domain d3jrmf_: 3jrm F: [178729]
      Other proteins in same PDB: d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
      automated match to d1pmaa_
    7. 2230469Domain d3jrmg_: 3jrm G: [178730]
      Other proteins in same PDB: d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_, d3jrmo_, d3jrmp_, d3jrmq_, d3jrmr_, d3jrms_, d3jrmt_, d3jrmu_
      automated match to d1pmaa_
  7. Domain(s) for 3jse:
    1. 2230470Domain d3jsea_: 3jse A: [178758]
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      automated match to d1pmaa_
    2. 2230471Domain d3jseb_: 3jse B: [178759]
      Other proteins in same PDB: d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
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    3. 2230472Domain d3jsec_: 3jse C: [178760]
      Other proteins in same PDB: d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_, d3jseo_, d3jsep_, d3jseq_, d3jser_, d3jses_, d3jset_, d3jseu_
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    4. 2230473Domain d3jsed_: 3jse D: [178761]
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    5. 2230474Domain d3jsee_: 3jse E: [178762]
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    6. 2230475Domain d3jsef_: 3jse F: [178763]
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    7. 2230476Domain d3jseg_: 3jse G: [178764]
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