Lineage for Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]
- Root: SCOPe 2.08
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds) 
Fold d.325: L28p-like [143799] (1 superfamily)
unusual fold consisting of three beta-hairpins, that form a paper clip-like structure, and two helices; could have evolved from a glucocorticoid receptor-like zinc finger domain (57715)Superfamily d.325.1: L28p-like [143800] (2 families) 
In early ribosomal structures, L28p has been misinterpreted as L31p. in the Ribosomal protein L28p family, there are sequences containing two CxxC pairs. Threading these sequences into this fold brings the four cysteines in a similar site to the zinc-binding site of glucocorticoid receptor-like zinc fingers. In the Ribosomal protein L31p, there are also members with two CxxC pairs. However, these won't form a putative zinc-binding site in this fold. The L31p family are classified here temporarily, until its true fold is known
Family d.325.1.2: Ribosomal protein L31p [143804] (1 protein)
Pfam PF01197Protein Ribosomal protein L31p [143805] (2 species) Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [160711] (7 PDB entries)
Uniprot Q5SJE1 1-50
PDB entries in Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]:
- Domain(s) for 2hgj:
Domain d2hgj31: 2hgj 3:1-50 [145299]
Other proteins in same PDB: d2hgj11, d2hgj21, d2hgj41, d2hgj51, d2hgj61, d2hgj71, d2hgj81, d2hgjc1, d2hgjd1, d2hgjd2, d2hgje1, d2hgjf1, d2hgjg1, d2hgjh1, d2hgjh2, d2hgjk1, d2hgjk2, d2hgjl1, d2hgjl2, d2hgjm1, d2hgjn1, d2hgjo1, d2hgjp1, d2hgjq1, d2hgjr1, d2hgjt1, d2hgju1, d2hgjv1, d2hgjw1, d2hgjx1, d2hgjy1
- Domain(s) for 2hgq:
Domain d2hgq31: 2hgq 3:1-50 [145331]
Other proteins in same PDB: d2hgq11, d2hgq21, d2hgq41, d2hgq51, d2hgq61, d2hgq71, d2hgq81, d2hgqc1, d2hgqd1, d2hgqd2, d2hgqe1, d2hgqf1, d2hgqg1, d2hgqh1, d2hgqh2, d2hgqk1, d2hgqk2, d2hgql1, d2hgql2, d2hgqm1, d2hgqn1, d2hgqo1, d2hgqp1, d2hgqq1, d2hgqr1, d2hgqt1, d2hgqu1, d2hgqv1, d2hgqw1, d2hgqx1, d2hgqy1
- Domain(s) for 2hgu:
Domain d2hgu31: 2hgu 3:1-50 [145363]
Other proteins in same PDB: d2hgu11, d2hgu21, d2hgu41, d2hgu51, d2hgu61, d2hgu71, d2hgu81, d2hguc1, d2hgud1, d2hgud2, d2hgue1, d2hguf1, d2hgug1, d2hguh1, d2hguh2, d2hguk1, d2hguk2, d2hgul1, d2hgul2, d2hgum1, d2hgun1, d2hguo1, d2hgup1, d2hguq1, d2hgur1, d2hgut1, d2hguu1, d2hguv1, d2hguw1, d2hgux1, d2hguy1
protein/RNA complex
protein/RNA complex
- Domain(s) for 2j01:
Domain d2j0141: 2j01 4:1-50 [145559]
Other proteins in same PDB: d2j0111, d2j0121, d2j0131, d2j0151, d2j0161, d2j0171, d2j0181, d2j01c1, d2j01d1, d2j01d2, d2j01e1, d2j01f1, d2j01g1, d2j01h1, d2j01h2, d2j01i1, d2j01i2, d2j01n1, d2j01o1, d2j01p1, d2j01q1, d2j01r1, d2j01s1, d2j01t1, d2j01u1, d2j01v1, d2j01w1, d2j01x1, d2j01y1, d2j01z1
putative assignment of L31 location in the ribosome structure; the protein shows no ordered structure
protein/RNA complex
protein/RNA complex
- Domain(s) for 2j03:
Domain d2j0341: 2j03 4:1-50 [145586]
Other proteins in same PDB: d2j0311, d2j0321, d2j0331, d2j0351, d2j0361, d2j0371, d2j0381, d2j03c1, d2j03d1, d2j03d2, d2j03e1, d2j03f1, d2j03g1, d2j03h1, d2j03h2, d2j03i1, d2j03i2, d2j03n1, d2j03o1, d2j03p1, d2j03q1, d2j03r1, d2j03s1, d2j03t1, d2j03u1, d2j03v1, d2j03w1, d2j03x1, d2j03y1, d2j03z1
protein/RNA complex
protein/RNA complex
- Domain(s) for 2v47:
- Domain(s) for 2v49:
More info for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p
Timeline for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p:
- Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p first appeared in SCOP 1.75
- Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p appears in SCOPe 2.07