Lineage for Species: Deinococcus radiodurans [TaxId: 1299]
- Root: SCOPe 2.04
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (380 folds) 
Fold d.77: RL5-like [55281] (1 superfamily)
beta-alpha-beta(2)-alpha-beta(3)-alpha; 2 layers, alpha/beta; antiparallel beta-sheet: order 231654Superfamily d.77.1: RL5-like [55282] (3 families) 
Family d.77.1.1: Ribosomal protein L5 [55283] (1 protein) Protein Ribosomal protein L5 [55284] (5 species)
synonym: 50S ribosomal protein L5p, HMAL5, HL13
Species Deinococcus radiodurans [TaxId:1299] [160487] (6 PDB entries)
Uniprot Q9RXJ0 3-179
PDB entries in Species: Deinococcus radiodurans [TaxId: 1299]:
- Domain(s) for 1xbp:
Domain d1xbpd1: 1xbp D:3-179 [145869]
Other proteins in same PDB: d1xbp11, d1xbp21, d1xbp31, d1xbp41, d1xbpa1, d1xbpa2, d1xbpb1, d1xbpc1, d1xbpe1, d1xbpe2, d1xbpg1, d1xbpg2, d1xbph1, d1xbpi1, d1xbpj1, d1xbpl1, d1xbpm1, d1xbpn1, d1xbpo1, d1xbpp1, d1xbpq1, d1xbpr1, d1xbps1, d1xbpt1, d1xbpu1, d1xbpw1, d1xbpx1, d1xbpz1
automatically matched to 2ZJR D:3-179
complexed with mul
- Domain(s) for 2zjp:
Domain d2zjpd1: 2zjp D:3-179 [154494]
Other proteins in same PDB: d2zjp11, d2zjp21, d2zjp31, d2zjp41, d2zjpa1, d2zjpa2, d2zjpb1, d2zjpc1, d2zjpe1, d2zjpe2, d2zjpf1, d2zjpf2, d2zjpg1, d2zjph1, d2zjpi1, d2zjpj1, d2zjpk1, d2zjpl1, d2zjpm1, d2zjpn1, d2zjpo1, d2zjpp1, d2zjpq1, d2zjpr1, d2zjps1, d2zjpt1, d2zjpu1, d2zjpv1, d2zjpw1, d2zjpy1
automatically matched to 2ZJR D:3-179
protein/RNA complex; complexed with mg, no1, zn
- Domain(s) for 2zjq:
Domain d2zjqd1: 2zjq D:3-179 [154526]
Other proteins in same PDB: d2zjq11, d2zjq21, d2zjq31, d2zjq41, d2zjq51, d2zjqa1, d2zjqa2, d2zjqb1, d2zjqc1, d2zjqe1, d2zjqe2, d2zjqf1, d2zjqf2, d2zjqg1, d2zjqh1, d2zjqi1, d2zjqj1, d2zjqk1, d2zjql1, d2zjqm1, d2zjqn1, d2zjqo1, d2zjqp1, d2zjqq1, d2zjqr1, d2zjqs1, d2zjqt1, d2zjqu1, d2zjqv1, d2zjqw1, d2zjqz1
automatically matched to 2ZJR D:3-179
protein/RNA complex
- Domain(s) for 2zjr:
Domain d2zjrd1: 2zjr D:3-179 [154557]
Other proteins in same PDB: d2zjr11, d2zjr21, d2zjr31, d2zjr41, d2zjra1, d2zjra2, d2zjrb1, d2zjrc1, d2zjre1, d2zjre2, d2zjrg1, d2zjrh1, d2zjri1, d2zjrj1, d2zjrk1, d2zjrl1, d2zjrm1, d2zjrn1, d2zjro1, d2zjrp1, d2zjrq1, d2zjrr1, d2zjrs1, d2zjrt1, d2zjru1, d2zjrv1, d2zjrw1, d2zjrz1
Representative structure
complexed with mg
- Domain(s) for 3cf5:
Domain d3cf5d1: 3cf5 D:3-179 [156542]
Other proteins in same PDB: d3cf511, d3cf521, d3cf531, d3cf541, d3cf5a1, d3cf5a2, d3cf5b1, d3cf5c1, d3cf5e1, d3cf5e2, d3cf5f1, d3cf5f2, d3cf5g1, d3cf5h1, d3cf5i1, d3cf5j1, d3cf5k1, d3cf5l1, d3cf5m1, d3cf5n1, d3cf5o1, d3cf5p1, d3cf5q1, d3cf5r1, d3cf5s1, d3cf5t1, d3cf5u1, d3cf5v1, d3cf5w1, d3cf5y1
automatically matched to 2ZJR D:3-179
protein/RNA complex; complexed with mg
- Domain(s) for 3dll:
Domain d3dlld1: 3dll D:3-179 [157781]
Other proteins in same PDB: d3dll11, d3dll21, d3dll31, d3dll41, d3dllb1, d3dllc1, d3dlle1, d3dlle2, d3dllg1, d3dllh1, d3dlli1, d3dllj1, d3dllk1, d3dlll1, d3dllm1, d3dlln1, d3dllo1, d3dllp1, d3dllq1, d3dllr1, d3dlls1, d3dllt1, d3dllu1, d3dllv1, d3dllw1, d3dlly1
automatically matched to 2ZJR D:3-179
complexed with mg, zld, zn
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Timeline for Species Deinococcus radiodurans [TaxId:1299] from d.77.1.1 Ribosomal protein L5:
- Species Deinococcus radiodurans [TaxId:1299] from d.77.1.1 Ribosomal protein L5 first appeared in SCOP 1.75
- Species Deinococcus radiodurans [TaxId:1299] from d.77.1.1 Ribosomal protein L5 appears in SCOPe 2.03
- Species Deinococcus radiodurans [TaxId:1299] from d.77.1.1 Ribosomal protein L5 appears in SCOPe 2.05
- Species Deinococcus radiodurans [TaxId:1299] from d.77.1.1 Ribosomal protein L5 appears in the current release, SCOPe 2.08