Lineage for d2fugy1 (2fug Y:26-179)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2170735Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2192663Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (59 superfamilies)
    alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
  4. 2192664Superfamily d.58.1: 4Fe-4S ferredoxins [54862] (7 families) (S)
  5. 2192801Family d.58.1.5: Ferredoxin domains from multidomain proteins [54884] (14 proteins)
    members of this "family" may be more closely related to other ferredoxins than to each other
  6. 2192902Protein NADH-quinone oxidoreductase chain 9, Nqo9 [143252] (1 species)
  7. 2192903Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [143253] (1 PDB entry)
    Uniprot Q56224 26-179
  8. 2192907Domain d2fugy1: 2fug Y:26-179 [134171]
    Other proteins in same PDB: d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugz1
    automatically matched to 2FUG 9:26-179
    complexed with fes, fmn, sf4

Details for d2fugy1

PDB Entry: 2fug (more details), 3.3 Å

PDB Description: crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
PDB Compounds: (Y:) NADH-quinone oxidoreductase chain 9

SCOPe Domain Sequences for d2fugy1:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2fugy1 d.58.1.5 (Y:26-179) NADH-quinone oxidoreductase chain 9, Nqo9 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
ypdapvalkprfhgrhvltrhpnglekcigcslcaaacpayaiyvepaendpenpvsage
ryakvyeinmlrcifcglceeacptgaivlgydfemadyeysdlvygkedmlvdvvgtkp
qrreakrtgkpvkvgyvvpyvrpelegfkapteg

SCOPe Domain Coordinates for d2fugy1:

Click to download the PDB-style file with coordinates for d2fugy1.
(The format of our PDB-style files is described here.)

Timeline for d2fugy1:

View in 3D
Domains from other chains:
(mouse over for more information)
d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugz1