Lineage for Species: Methanococcus maripaludis

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 546417Class b: All beta proteins [48724] (149 folds)
  3. 561274Fold b.44: Elongation factor/aminomethyltransferase common domain [50464] (2 superfamilies)
    barrel, closed; n=6, S=10; greek-key
  4. 561275Superfamily b.44.1: EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain [50465] (1 family) (S)
    probably related to the second domain and its superfamiy by a circular permutation
  5. 561276Family b.44.1.1: EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C-terminal domain [50466] (5 proteins)
  6. 561288Protein Elongation factor SelB, domain 3 [117223] (1 species)
  7. 561289Species Methanococcus maripaludis [TaxId:39152] [117224] (3 PDB entries)

PDB entries in Species: Methanococcus maripaludis:

  1. Domain(s) for 1wb1:
    1. 561290Domain d1wb1a3: 1wb1 A:272-387 [114438]
      Other proteins in same PDB: d1wb1a1, d1wb1a2, d1wb1a4, d1wb1b1, d1wb1b3, d1wb1c1, d1wb1c2, d1wb1c4, d1wb1d1, d1wb1d3
    2. 561291Domain d1wb1b2: 1wb1 B:272-387 [114441]
      Other proteins in same PDB: d1wb1a1, d1wb1a2, d1wb1a4, d1wb1b1, d1wb1b3, d1wb1c1, d1wb1c2, d1wb1c4, d1wb1d1, d1wb1d3
    3. 561292Domain d1wb1c3: 1wb1 C:272-387 [114445]
      Other proteins in same PDB: d1wb1a1, d1wb1a2, d1wb1a4, d1wb1b1, d1wb1b3, d1wb1c1, d1wb1c2, d1wb1c4, d1wb1d1, d1wb1d3
    4. 561293Domain d1wb1d2: 1wb1 D:272-387 [114448]
      Other proteins in same PDB: d1wb1a1, d1wb1a2, d1wb1a4, d1wb1b1, d1wb1b3, d1wb1c1, d1wb1c2, d1wb1c4, d1wb1d1, d1wb1d3
      complexed with cmh, dxc, gdp, mg, so4
  2. Domain(s) for 1wb2:
    1. 561294Domain d1wb2a3: 1wb2 A:272-387 [114452]
      Other proteins in same PDB: d1wb2a1, d1wb2a2, d1wb2a4, d1wb2b1, d1wb2b3, d1wb2c1, d1wb2c2, d1wb2c4, d1wb2d1, d1wb2d3
    2. 561295Domain d1wb2b2: 1wb2 B:272-387 [114455]
      Other proteins in same PDB: d1wb2a1, d1wb2a2, d1wb2a4, d1wb2b1, d1wb2b3, d1wb2c1, d1wb2c2, d1wb2c4, d1wb2d1, d1wb2d3
    3. 561296Domain d1wb2c3: 1wb2 C:272-387 [114459]
      Other proteins in same PDB: d1wb2a1, d1wb2a2, d1wb2a4, d1wb2b1, d1wb2b3, d1wb2c1, d1wb2c2, d1wb2c4, d1wb2d1, d1wb2d3
    4. 561297Domain d1wb2d2: 1wb2 D:272-387 [114462]
      Other proteins in same PDB: d1wb2a1, d1wb2a2, d1wb2a4, d1wb2b1, d1wb2b3, d1wb2c1, d1wb2c2, d1wb2c4, d1wb2d1, d1wb2d3
      complexed with cmh, dxc, so4
  3. Domain(s) for 1wb3:
    1. 561298Domain d1wb3a3: 1wb3 A:272-387 [114466]
      Other proteins in same PDB: d1wb3a1, d1wb3a2, d1wb3a4, d1wb3b1, d1wb3b3, d1wb3c1, d1wb3c2, d1wb3c4, d1wb3d1, d1wb3d3
    2. 561299Domain d1wb3b2: 1wb3 B:272-387 [114469]
      Other proteins in same PDB: d1wb3a1, d1wb3a2, d1wb3a4, d1wb3b1, d1wb3b3, d1wb3c1, d1wb3c2, d1wb3c4, d1wb3d1, d1wb3d3
    3. 561300Domain d1wb3c3: 1wb3 C:272-387 [114473]
      Other proteins in same PDB: d1wb3a1, d1wb3a2, d1wb3a4, d1wb3b1, d1wb3b3, d1wb3c1, d1wb3c2, d1wb3c4, d1wb3d1, d1wb3d3
    4. 561301Domain d1wb3d2: 1wb3 D:272-387 [114476]
      Other proteins in same PDB: d1wb3a1, d1wb3a2, d1wb3a4, d1wb3b1, d1wb3b3, d1wb3c1, d1wb3c2, d1wb3c4, d1wb3d1, d1wb3d3
      complexed with cmh, dxc, gnp, mg, so4

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