Lineage for Species: Common earthworm (Lumbricus terrestris) [TaxId: 6398]

  1. Root: SCOP 1.75
  2. 758332Class a: All alpha proteins [46456] (284 folds)
  3. 758333Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
    core: 6 helices; folded leaf, partly opened
  4. 758334Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (4 families) (S)
  5. 758373Family a.1.1.2: Globins [46463] (26 proteins)
    Heme-binding protein
  6. 758420Protein Extracellular dodecameric hemoglobin (erythrocruorin), subunit D1 [116758] (1 species)
  7. 758421Species Common earthworm (Lumbricus terrestris) [TaxId:6398] [116759] (2 PDB entries)
    Uniprot O61233 19-158

PDB entries in Species: Common earthworm (Lumbricus terrestris) [TaxId: 6398]:

  1. Domain(s) for 1x9f:
    1. 758422Domain d1x9fd_: 1x9f D: [114986]
      Other proteins in same PDB: d1x9fa_, d1x9fb_, d1x9fc_, d1x9fe_, d1x9ff_, d1x9fg_, d1x9fi_, d1x9fj_, d1x9fk_
    2. 758423Domain d1x9fh_: 1x9f H: [114990]
      Other proteins in same PDB: d1x9fa_, d1x9fb_, d1x9fc_, d1x9fe_, d1x9ff_, d1x9fg_, d1x9fi_, d1x9fj_, d1x9fk_
    3. 758424Domain d1x9fl_: 1x9f L: [114994]
      Other proteins in same PDB: d1x9fa_, d1x9fb_, d1x9fc_, d1x9fe_, d1x9ff_, d1x9fg_, d1x9fi_, d1x9fj_, d1x9fk_
      complexed with cmo, hem, po4
  2. Domain(s) for 2gtl:
    1. 758425Domain d2gtld1: 2gtl D:8-147 [135658]
      Other proteins in same PDB: d2gtla1, d2gtlb1, d2gtlc1, d2gtle1, d2gtlf1, d2gtlg1, d2gtli1, d2gtlj1, d2gtlk1, d2gtlm1, d2gtlm2, d2gtlm3, d2gtln1, d2gtln2, d2gtln3, d2gtlo1, d2gtlo2, d2gtlo3
      automatically matched to d1x9fd_
      complexed with ca, cmo, hem, zn
    2. 758426Domain d2gtlh1: 2gtl H:8-147 [135662]
      Other proteins in same PDB: d2gtla1, d2gtlb1, d2gtlc1, d2gtle1, d2gtlf1, d2gtlg1, d2gtli1, d2gtlj1, d2gtlk1, d2gtlm1, d2gtlm2, d2gtlm3, d2gtln1, d2gtln2, d2gtln3, d2gtlo1, d2gtlo2, d2gtlo3
      automatically matched to d1x9fd_
      complexed with ca, cmo, hem, zn
    3. 758427Domain d2gtll1: 2gtl L:8-147 [135666]
      Other proteins in same PDB: d2gtla1, d2gtlb1, d2gtlc1, d2gtle1, d2gtlf1, d2gtlg1, d2gtli1, d2gtlj1, d2gtlk1, d2gtlm1, d2gtlm2, d2gtlm3, d2gtln1, d2gtln2, d2gtln3, d2gtlo1, d2gtlo2, d2gtlo3
      automatically matched to d1x9fd_
      complexed with ca, cmo, hem, zn

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Timeline for Species Common earthworm (Lumbricus terrestris) [TaxId:6398] from a.1.1.2 Extracellular dodecameric hemoglobin (erythrocruorin), subunit D1: