SCOP 1.73: Domain d1q7yf_: 1q7y F:

Lineage for d1q7yf_ (1q7y F:)

1. Root: SCOP 1.73

2. Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (334 folds)

3. Fold d.77: Ribosomal protein L5 [55281] (1 superfamily)
   beta-alpha-beta(2)-alpha-beta(3)-alpha; 2 layers, alpha/beta; antiparallel beta-sheet: order 231654

4. Superfamily d.77.1: Ribosomal protein L5 [55282] (1 family)

5. Family d.77.1.1: Ribosomal protein L5 [55283] (1 protein)

6. Protein Ribosomal protein L5 [55284] (3 species)
   synonym: 50S ribosomal protein L5p, HMAL5, HL13

7. Species Archaeon Haloarcula marismortui [TaxId:2238] [55285] (40 PDB entries)

8. Domain d1q7yf_: 1q7y F: [96068]
   Other proteins in same PDB: d1q7y1_, d1q7y2_, d1q7y3_, d1q7y4_, d1q7yc1, d1q7yc2, d1q7yd_, d1q7ye_, d1q7yg1, d1q7yg2, d1q7yh_, d1q7yi_, d1q7yj_, d1q7yk_, d1q7yl_, d1q7ym_, d1q7yn_, d1q7yo_, d1q7yp_, d1q7yq_, d1q7yr_, d1q7ys_, d1q7yt_, d1q7yu_, d1q7yv_, d1q7yw_, d1q7yx_, d1q7yy_, d1q7yz_
   complexed with cd, cl, k, mg, na, po4, puy

Details for d1q7yf_

PDB Entry: 1q7y, 3.2 Å

PDB Description: crystal structure of ccdap-puromycin bound at the peptidyl transferase center of the 50s ribosomal subunit

PDB Compounds: (F:) 50S ribosomal protein L5P

SCOP Domain Sequences for d1q7yf_:

Sequence, based on SEQRES records:

>d1q7yf_ d.77.1.1 (F:) Ribosomal protein L5 {Archaeon Haloarcula marismortui [TaxId: 2238]}
fhemrepriekvvvhmgighggrdlanaedilgeitgqmpvrtkakrtvgefdiregdpi
gakvtlrdemaeeflqtalplaelatsqfddtgnfsfgveehtefpsqeydpsigiygld
vtvnlvrpgyrvakrdkasrsiptkhrlnpadavafiestydvev

Sequence, based on observed residues (ATOM records):

>d1q7yf_ d.77.1.1 (F:) Ribosomal protein L5 {Archaeon Haloarcula marismortui [TaxId: 2238]}
fhemrepriekvvvhmgighanaedilgeitgqmpvrtkakrtvgefdiregdpigakvt
lrdemaeeflqtalplaelatsqfddtgnfsfgldvtvnlvrpgyrvakrdkasrsiptk
hrlnpadavafiestydvev

Timeline for d1q7yf_:

• d1q7yf_ first appeared in SCOP 1.67
  
• d1q7yf_ appears in SCOP 1.71
  
• d1q7yf_ appears in SCOP 1.75
  
• d1q7yf_ appears in the current release, SCOPe 2.08