SCOPe 2.08: Protein: beta-hexosaminidase B, N-terminal domain

Lineage for Protein: beta-hexosaminidase B, N-terminal domain

Root: SCOPe 2.08
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds)
Fold d.92: Zincin-like [55485] (2 superfamilies)
contains mixed beta sheet with connection over free side of the sheet
Superfamily d.92.2: beta-N-acetylhexosaminidase-like domain [55545] (4 families)
contains similar fold but lacks its catalytic centre
Family d.92.2.1: beta-N-acetylhexosaminidase domain [55546] (4 proteins)
family GH20
Protein beta-hexosaminidase B, N-terminal domain [89992] (1 species)

Species:

Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [89993] (6 PDB entries)

Domains for 1nou:
1. Domain d1noua2: 1nou A:55-199 [85933]
  Other proteins in same PDB: d1noua1, d1noub1
  complexed with gol, so4
2. Domain d1noub2: 1nou B:55-199 [85935]
  Other proteins in same PDB: d1noua1, d1noub1
  complexed with gol, so4
Domains for 1now:
1. Domain d1nowa2: 1now A:55-199 [85937]
  Other proteins in same PDB: d1nowa1, d1nowb1
  complexed with gol, ifg, so4
2. Domain d1nowb2: 1now B:55-199 [85939]
  Other proteins in same PDB: d1nowa1, d1nowb1
  complexed with gol, ifg, so4
Domains for 1np0:
1. Domain d1np0.1: 1np0 A:,C:122-199 [343542]
  Other proteins in same PDB: d1np0.3, d1np0.4
  complexed with gol, ngt, so4
2. Domain d1np0.2: 1np0 B:,E:122-199 [343543]
  Other proteins in same PDB: d1np0.3, d1np0.4
  complexed with gol, ngt, so4
Domains for 1o7a:
1. Domain d1o7aa2: 1o7a A:54-199 [92609]
  Other proteins in same PDB: d1o7aa1, d1o7ab1, d1o7ac1, d1o7ad1, d1o7ae1, d1o7af1
  complexed with edo, gdl, nag
2. Domain d1o7ab2: 1o7a B:54-199 [92611]
  Other proteins in same PDB: d1o7aa1, d1o7ab1, d1o7ac1, d1o7ad1, d1o7ae1, d1o7af1
  complexed with edo, gdl, nag
3. Domain d1o7ac2: 1o7a C:54-199 [92613]
  Other proteins in same PDB: d1o7aa1, d1o7ab1, d1o7ac1, d1o7ad1, d1o7ae1, d1o7af1
  complexed with edo, gdl, nag
4. Domain d1o7ad2: 1o7a D:54-199 [92615]
  Other proteins in same PDB: d1o7aa1, d1o7ab1, d1o7ac1, d1o7ad1, d1o7ae1, d1o7af1
  complexed with edo, gdl, nag
5. Domain d1o7ae2: 1o7a E:54-199 [92617]
  Other proteins in same PDB: d1o7aa1, d1o7ab1, d1o7ac1, d1o7ad1, d1o7ae1, d1o7af1
  complexed with edo, gdl, nag
6. Domain d1o7af2: 1o7a F:54-199 [92619]
  Other proteins in same PDB: d1o7aa1, d1o7ab1, d1o7ac1, d1o7ad1, d1o7ae1, d1o7af1
  complexed with edo, gdl, nag

Domains for 2gjx:

Domain d2gjxb2: 2gjx B:54-199 [135312]
Other proteins in same PDB: d2gjxa1, d2gjxa2, d2gjxb1, d2gjxc1, d2gjxd1, d2gjxd2, d2gjxe1, d2gjxe2, d2gjxf1, d2gjxg1, d2gjxh1, d2gjxh2
automated match to d1np0a2
complexed with nag, so4

Domain d2gjxc2: 2gjx C:54-199 [135314]
Other proteins in same PDB: d2gjxa1, d2gjxa2, d2gjxb1, d2gjxc1, d2gjxd1, d2gjxd2, d2gjxe1, d2gjxe2, d2gjxf1, d2gjxg1, d2gjxh1, d2gjxh2
automated match to d1np0a2
complexed with nag, so4

Domain d2gjxf2: 2gjx F:54-199 [135316]
Other proteins in same PDB: d2gjxa1, d2gjxa2, d2gjxb1, d2gjxc1, d2gjxd1, d2gjxd2, d2gjxe1, d2gjxe2, d2gjxf1, d2gjxg1, d2gjxh1, d2gjxh2
automated match to d1np0a2
complexed with nag, so4

Domain d2gjxg2: 2gjx G:54-199 [135318]
Other proteins in same PDB: d2gjxa1, d2gjxa2, d2gjxb1, d2gjxc1, d2gjxd1, d2gjxd2, d2gjxe1, d2gjxe2, d2gjxf1, d2gjxg1, d2gjxh1, d2gjxh2
automated match to d1np0a2
complexed with nag, so4

Domains for 2gk1:

Domain d2gk1.5: 2gk1 B:,M:122-199 [343662]
Other proteins in same PDB: d2gk1.1, d2gk1.2, d2gk1.3, d2gk1.4, d2gk1.9, d2gk1.a, d2gk1.b, d2gk1.c, d2gk1i1, d2gk1j1, d2gk1k1, d2gk1l1
automatically matched to d1o7aa2
complexed with ngt

Domain d2gk1.6: 2gk1 D:,O:122-199 [343663]
Other proteins in same PDB: d2gk1.1, d2gk1.2, d2gk1.3, d2gk1.4, d2gk1.9, d2gk1.a, d2gk1.b, d2gk1.c, d2gk1i1, d2gk1j1, d2gk1k1, d2gk1l1
automatically matched to d1o7aa2
complexed with ngt

Domain d2gk1.7: 2gk1 F:,Q:122-199 [343664]
Other proteins in same PDB: d2gk1.1, d2gk1.2, d2gk1.3, d2gk1.4, d2gk1.9, d2gk1.a, d2gk1.b, d2gk1.c, d2gk1i1, d2gk1j1, d2gk1k1, d2gk1l1
automatically matched to d1o7aa2
complexed with ngt

Domain d2gk1.8: 2gk1 H:,S:122-199 [343665]
Other proteins in same PDB: d2gk1.1, d2gk1.2, d2gk1.3, d2gk1.4, d2gk1.9, d2gk1.a, d2gk1.b, d2gk1.c, d2gk1i1, d2gk1j1, d2gk1k1, d2gk1l1
automatically matched to d1o7aa2
complexed with ngt

More info for Protein beta-hexosaminidase B, N-terminal domain from d.92.2.1: beta-N-acetylhexosaminidase domain

Timeline for Protein beta-hexosaminidase B, N-terminal domain from d.92.2.1: beta-N-acetylhexosaminidase domain:

Protein beta-hexosaminidase B, N-terminal domain from d.92.2.1: beta-N-acetylhexosaminidase domain first appeared in SCOP 1.65
Protein beta-hexosaminidase B, N-terminal domain from d.92.2.1: beta-N-acetylhexosaminidase domain appears in SCOPe 2.07