SCOPe 2.08: Protein: Papillomavirus large T antigen helicase domain

Lineage for Protein: Papillomavirus large T antigen helicase domain

Root: SCOPe 2.08
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (27 families)
division into families based on beta-sheet topologies
Family c.37.1.20: Extended AAA-ATPase domain [81269] (43 proteins)
fold is similar to that of RecA, but lacks the last two strands, followed by a family-specific Arg-finger domain
Protein Papillomavirus large T antigen helicase domain [89688] (1 species)

Species:

Simian virus 40 [TaxId:10633] [89689] (5 PDB entries)
Uniprot P03070 265-627

Domains for 1n25:
1. Domain d1n25a_: 1n25 A: [85264]
  complexed with zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
2. Domain d1n25b_: 1n25 B: [85265]
  complexed with zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
Domains for 1svl:
1. Domain d1svla_: 1svl A: [112123]
  complexed with adp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
2. Domain d1svlb_: 1svl B: [112124]
  complexed with adp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
3. Domain d1svlc_: 1svl C: [112125]
  complexed with adp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
Domains for 1svm:
1. Domain d1svma_: 1svm A: [112126]
  complexed with atp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
2. Domain d1svmb_: 1svm B: [112127]
  complexed with atp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
3. Domain d1svmc_: 1svm C: [112128]
  complexed with atp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
4. Domain d1svmd_: 1svm D: [112129]
  complexed with atp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
5. Domain d1svme_: 1svm E: [112130]
  complexed with atp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
6. Domain d1svmf_: 1svm F: [112131]
  complexed with atp, mg, zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
Domains for 1svo:
1. Domain d1svoa_: 1svo A: [112132]
  complexed with zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain
2. Domain d1svob_: 1svo B: [112133]
  complexed with zn
  has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domains for 2h1l:

Domain d2h1la_: 2h1l A: [135947]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1lb_: 2h1l B: [135948]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1lc_: 2h1l C: [135949]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1ld_: 2h1l D: [135950]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1le_: 2h1l E: [135951]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1lf_: 2h1l F: [135952]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
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complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1lg_: 2h1l G: [135953]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1lh_: 2h1l H: [135954]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1li_: 2h1l I: [135955]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1lj_: 2h1l J: [135956]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1lk_: 2h1l K: [135957]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

Domain d2h1ll_: 2h1l L: [135958]
Other proteins in same PDB: d2h1lm2, d2h1lm3, d2h1ln2, d2h1ln3, d2h1lo2, d2h1lo3, d2h1lp2, d2h1lp3, d2h1lq2, d2h1lq3, d2h1lr2, d2h1lr3, d2h1ls2, d2h1ls3, d2h1lt2, d2h1lt3, d2h1lu2, d2h1lu3, d2h1lv2, d2h1lv3, d2h1lw2, d2h1lw3, d2h1lx2, d2h1lx3
automated match to d1svmc_
complexed with zn
has additional subdomain(s) that are not in the common domain

More info for Protein Papillomavirus large T antigen helicase domain from c.37.1.20: Extended AAA-ATPase domain

Timeline for Protein Papillomavirus large T antigen helicase domain from c.37.1.20: Extended AAA-ATPase domain:

Protein Papillomavirus large T antigen helicase domain from c.37.1.20: Extended AAA-ATPase domain first appeared in SCOP 1.65
Protein Papillomavirus large T antigen helicase domain from c.37.1.20: Extended AAA-ATPase domain appears in SCOPe 2.07