Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2826024Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2865683Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 2865684Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (27 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 2869423Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (22 proteins)
    core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
  6. 2869938Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain [89676] (1 species)
  7. 2869939Species Escherichia coli [TaxId:562] [89677] (5 PDB entries)
    Uniprot P03002

PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:

  1. Domain(s) for 1pv4:
    1. 2869952Domain d1pv4a3: 1pv4 A:129-417 [88297]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
      protein/DNA complex
    2. 2869953Domain d1pv4b2: 1pv4 B:129-417 [88299]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
      protein/DNA complex
    3. 2869954Domain d1pv4c3: 1pv4 C:129-417 [88302]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
      protein/DNA complex
    4. 2869955Domain d1pv4d3: 1pv4 D:129-417 [88305]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
      protein/DNA complex
    5. 2869956Domain d1pv4e3: 1pv4 E:129-417 [88308]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
      protein/DNA complex
    6. 2869957Domain d1pv4f3: 1pv4 F:129-417 [88311]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
      protein/DNA complex
  2. Domain(s) for 1pvo:
    1. 2869958Domain d1pvoa3: 1pvo A:129-417 [88318]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
      protein/RNA complex; complexed with anp
    2. 2869959Domain d1pvob2: 1pvo B:129-417 [88320]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
      protein/RNA complex; complexed with anp
    3. 2869960Domain d1pvoc3: 1pvo C:129-417 [88323]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
      protein/RNA complex; complexed with anp
    4. 2869961Domain d1pvod3: 1pvo D:129-417 [88326]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
      protein/RNA complex; complexed with anp
    5. 2869962Domain d1pvoe3: 1pvo E:129-417 [88329]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
      protein/RNA complex; complexed with anp
    6. 2869963Domain d1pvof3: 1pvo F:129-417 [88332]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
      protein/RNA complex; complexed with anp
  3. Domain(s) for 1xpo:
    1. 2869964Domain d1xpoa3: 1xpo A:130-417 [122214]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
      automatically matched to d1pv4a3
      protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg
    2. 2869965Domain d1xpob3: 1xpo B:130-417 [122217]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
      automatically matched to d1pv4a3
      protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg
    3. 2869966Domain d1xpoc3: 1xpo C:130-417 [122220]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
      automatically matched to d1pv4a3
      protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg
    4. 2869967Domain d1xpod3: 1xpo D:130-417 [122223]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
      automatically matched to d1pv4a3
      protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg
    5. 2869968Domain d1xpoe3: 1xpo E:130-417 [122226]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
      automatically matched to d1pv4a3
      protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg
    6. 2869969Domain d1xpof3: 1xpo F:130-417 [122229]
      Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
      automatically matched to d1pv4a3
      protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg
  4. Domain(s) for 1xpr:
    1. 2869946Domain d1xpra3: 1xpr A:129-417 [115774]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg
    2. 2869947Domain d1xprb3: 1xpr B:129-417 [115777]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg
    3. 2869948Domain d1xprc3: 1xpr C:129-417 [115780]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg
    4. 2869949Domain d1xprd3: 1xpr D:129-417 [115783]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg
    5. 2869950Domain d1xpre3: 1xpr E:129-417 [115786]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg
    6. 2869951Domain d1xprf3: 1xpr F:129-417 [115789]
      Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg
  5. Domain(s) for 1xpu:
    1. 2869940Domain d1xpua3: 1xpu A:129-417 [115792]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg
    2. 2869941Domain d1xpub3: 1xpu B:129-417 [115795]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg
    3. 2869942Domain d1xpuc3: 1xpu C:129-417 [115798]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg
    4. 2869943Domain d1xpud3: 1xpu D:129-417 [115801]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg
    5. 2869944Domain d1xpue3: 1xpu E:129-417 [115804]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg
    6. 2869945Domain d1xpuf3: 1xpu F:129-417 [115807]
      Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
      protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

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