Lineage for Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2685877Class a: All alpha proteins [46456] (290 folds)
  3. 2735969Fold a.177: Sigma2 domain of RNA polymerase sigma factors [88945] (1 superfamily)
    multihelical; consists of a conserved 4-helical core and a variable insert subdomain
  4. 2735970Superfamily a.177.1: Sigma2 domain of RNA polymerase sigma factors [88946] (2 families) (S)
  5. 2735971Family a.177.1.1: Sigma2 domain of RNA polymerase sigma factors [88947] (6 proteins)
  6. 2735987Protein Sigma70 [88948] (2 species)
  7. 2735992Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [88949] (11 PDB entries)
    Uniprot Q9WX78

PDB entries in Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]:

  1. Domain(s) for 1iw7:
    1. 2736003Domain d1iw7f3: 1iw7 F:74-257 [83088]
      Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2
      complexed with mg, pb
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2736004Domain d1iw7p3: 1iw7 P:74-257 [83091]
      Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p1, d1iw7p2
      complexed with mg, pb
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  2. Domain(s) for 1smy:
    1. 2735993Domain d1smyf3: 1smy F:74-257 [105783]
      Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2
      complexed with g4p, mg, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2735994Domain d1smyp3: 1smy P:74-257 [105793]
      Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp1, d1smyp2
      complexed with g4p, mg, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  3. Domain(s) for 2a68:
    1. 2735999Domain d2a68f3: 2a68 F:74-257 [126200]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68c_, d2a68d_, d2a68e_, d2a68f1, d2a68f2, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68m_, d2a68n_, d2a68o_, d2a68p1, d2a68p2
      automated match to d1smyf3
      protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2736000Domain d2a68p3: 2a68 P:74-257 [126210]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68c_, d2a68d_, d2a68e_, d2a68f1, d2a68f2, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68m_, d2a68n_, d2a68o_, d2a68p1, d2a68p2
      automated match to d1smyf3
      protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  4. Domain(s) for 2a69:
    1. 2736001Domain d2a69f3: 2a69 F:74-257 [126220]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69c_, d2a69d_, d2a69e_, d2a69f1, d2a69f2, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69m_, d2a69n_, d2a69o_, d2a69p1, d2a69p2
      automated match to d1smyf3
      protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2736002Domain d2a69p3: 2a69 P:74-257 [126230]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69c_, d2a69d_, d2a69e_, d2a69f1, d2a69f2, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69m_, d2a69n_, d2a69o_, d2a69p1, d2a69p2
      automated match to d1smyf3
      protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  5. Domain(s) for 2a6e:
    1. 2736007Domain d2a6ef3: 2a6e F:74-257 [126249]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ec_, d2a6ed_, d2a6ee_, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6em_, d2a6en_, d2a6eo_, d2a6ep1, d2a6ep2
      automated match to d1smyf3
      complexed with mg, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2736008Domain d2a6ep3: 2a6e P:74-257 [126259]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ec_, d2a6ed_, d2a6ee_, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6em_, d2a6en_, d2a6eo_, d2a6ep1, d2a6ep2
      automated match to d1smyf3
      complexed with mg, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  6. Domain(s) for 2a6h:
    1. 2735995Domain d2a6hf3: 2a6h F:74-257 [126269]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hc_, d2a6hd_, d2a6he_, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hm_, d2a6hn_, d2a6ho_, d2a6hp1, d2a6hp2
      automated match to d1smyf3
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2735996Domain d2a6hp3: 2a6h P:74-257 [126279]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hc_, d2a6hd_, d2a6he_, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hm_, d2a6hn_, d2a6ho_, d2a6hp1, d2a6hp2
      automated match to d1smyf3
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  7. Domain(s) for 2be5:
    1. 2735997Domain d2be5f3: 2be5 F:74-257 [128360]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5c_, d2be5d_, d2be5e_, d2be5f1, d2be5f2, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5m_, d2be5n_, d2be5o_, d2be5p1, d2be5p2
      automated match to d1smyf3
      protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2735998Domain d2be5p3: 2be5 P:74-257 [128370]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5c_, d2be5d_, d2be5e_, d2be5f1, d2be5f2, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5m_, d2be5n_, d2be5o_, d2be5p1, d2be5p2
      automated match to d1smyf3
      protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  8. Domain(s) for 2cw0:
    1. 2736011Domain d2cw0f3: 2cw0 F:74-257 [130907]
      Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2
      automatically matched to d1iw7f3
      complexed with mg, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2736012Domain d2cw0p3: 2cw0 P:74-257 [130917]
      Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p1, d2cw0p2
      automatically matched to d1iw7f3
      complexed with mg, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  9. Domain(s) for 3eql:
    1. 2736005Domain d3eqlf1: 3eql F:74-257 [199363]
      Other proteins in same PDB: d3eqla1, d3eqla2, d3eqlb1, d3eqlb2, d3eqlc_, d3eqld_, d3eqle_, d3eqlf2, d3eqlf3, d3eqlk1, d3eqlk2, d3eqll1, d3eqll2, d3eqlm_, d3eqln_, d3eqlo_, d3eqlp2, d3eqlp3
      automated match to d1smyf3
      protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
    2. 2736006Domain d3eqlp1: 3eql P:74-257 [199371]
      Other proteins in same PDB: d3eqla1, d3eqla2, d3eqlb1, d3eqlb2, d3eqlc_, d3eqld_, d3eqle_, d3eqlf2, d3eqlf3, d3eqlk1, d3eqlk2, d3eqll1, d3eqll2, d3eqlm_, d3eqln_, d3eqlo_, d3eqlp2, d3eqlp3
      automated match to d1smyf3
      protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
      has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  10. Domain(s) for 5tmc:
  11. Domain(s) for 6cuu:

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