SCOP 1.65: Protein: Phycocyanin beta subunit

Lineage for Protein: Phycocyanin beta subunit

Root: SCOP 1.65
Class a: All alpha proteins [46456] (179 folds)
Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
core: 6 helices; folded leaf, partly opened
Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (4 families)

Family a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins [46532] (6 proteins)
oligomers of two different types of globin-like subunits containing two extra helices at the N-terminus
binds a bilin chromophore

Protein Phycocyanin beta subunit [88940] (6 species)

Species:

Cyanobacterium (Fremyella diplosiphon) [TaxId:1197] [88943] (1 PDB entry)
- Domains for 1cpc:
  1. Domain d1cpcb_: 1cpc B: [15644]
    Other proteins in same PDB: d1cpca_, d1cpck_
  2. Domain d1cpcl_: 1cpc L: [15646]
    Other proteins in same PDB: d1cpca_, d1cpck_
    complexed with cyc, nma
Red alga (Cyanidium caldarium) [TaxId:2771] [88941] (1 PDB entry)
- Domain for 1phn:
  - Domain d1phnb_: 1phn B: [15642]
    Other proteins in same PDB: d1phna_
    complexed with cyc
Red alga (Polysiphonia urceolata) [TaxId:65404] [88942] (1 PDB entry)
- Domains for 1f99:
  1. Domain d1f99b_: 1f99 B: [59723]
    Other proteins in same PDB: d1f99a_, d1f99k_, d1f99m_
  2. Domain d1f99l_: 1f99 L: [59725]
    Other proteins in same PDB: d1f99a_, d1f99k_, d1f99m_
  3. Domain d1f99n_: 1f99 N: [59727]
    Other proteins in same PDB: d1f99a_, d1f99k_, d1f99m_
    complexed with cyc, peb
Spirulina platensis [TaxId:118562] [88952] (2 PDB entries)
1. Domains for 1gh0:
  1. Domain d1gh0b_: 1gh0 B: [60492]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  2. Domain d1gh0d_: 1gh0 D: [60494]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  3. Domain d1gh0f_: 1gh0 F: [60496]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  4. Domain d1gh0h_: 1gh0 H: [60498]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  5. Domain d1gh0j_: 1gh0 J: [60500]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  6. Domain d1gh0l_: 1gh0 L: [60502]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  7. Domain d1gh0n_: 1gh0 N: [60504]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  8. Domain d1gh0p_: 1gh0 P: [60506]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  9. Domain d1gh0r_: 1gh0 R: [60508]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  10. Domain d1gh0t_: 1gh0 T: [60510]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  11. Domain d1gh0v_: 1gh0 V: [60512]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  12. Domain d1gh0x_: 1gh0 X: [60514]
    Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
    complexed with cyc
2. Domains for 1ha7:
  1. Domain d1ha7b_: 1ha7 B: [70936]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  2. Domain d1ha7d_: 1ha7 D: [70938]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  3. Domain d1ha7f_: 1ha7 F: [70940]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  4. Domain d1ha7h_: 1ha7 H: [70942]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  5. Domain d1ha7j_: 1ha7 J: [70944]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  6. Domain d1ha7l_: 1ha7 L: [70946]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  7. Domain d1ha7n_: 1ha7 N: [70948]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  8. Domain d1ha7p_: 1ha7 P: [70950]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  9. Domain d1ha7r_: 1ha7 R: [70952]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  10. Domain d1ha7t_: 1ha7 T: [70954]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  11. Domain d1ha7v_: 1ha7 V: [70956]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  12. Domain d1ha7x_: 1ha7 X: [70958]
    Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
    complexed with cyc, men
Synechococcus elongatus [TaxId:32046] [88968] (1 PDB entry)
- Domain for 1jbo:
  - Domain d1jbob_: 1jbo B: [84151]
    Other proteins in same PDB: d1jboa_
    complexed with cyc, men
Synechococcus vulcanus [TaxId:32053] [88944] (3 PDB entries)
1. Domain for 1i7y:
  - Domain d1i7yb_: 1i7y B: [61918]
    complexed with cyc
2. Domain for 1ktp:
  - Domain d1ktpb_: 1ktp B: [72991]
    Other proteins in same PDB: d1ktpa_
    complexed with cyc, men
3. Domain for 1on7:
  - Domain d1on7b_: 1on7 B: [87122]
    Other proteins in same PDB: d1on7a_
    complexed with cyc

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Timeline for Protein Phycocyanin beta subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins:

Protein Phycocyanin beta subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins is new in SCOP 1.65
Protein Phycocyanin beta subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins appears in SCOP 1.67
Protein Phycocyanin beta subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins appears in the current release, SCOPe 2.08