Lineage for Protein: Phycocyanin beta subunit

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 1976409Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
  3. 1976410Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
    core: 6 helices; folded leaf, partly opened
  4. 1976411Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (5 families) (S)
  5. 1978832Family a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins [46532] (7 protein domains)
    oligomers of two different types of globin-like subunits containing two extra helices at the N-terminus
    binds a bilin chromophore
    automatically mapped to Pfam PF00502
  6. 1978928Protein Phycocyanin beta subunit [88940] (8 species)

Species:

  1. 1978929Fremyella diplosiphon [TaxId:1197] [88943] (1 PDB entry)
  2. 1978932Red alga (Cyanidium caldarium) [TaxId:2771] [88941] (1 PDB entry)
  3. 1978934Red alga (Polysiphonia urceolata) [TaxId:65404] [88942] (1 PDB entry)
  4. 1978938Spirulina platensis [TaxId:118562] [88952] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1gh0:
      1. 1978951Domain d1gh0b_: 1gh0 B: [60492]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      2. 1978952Domain d1gh0d_: 1gh0 D: [60494]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      3. 1978953Domain d1gh0f_: 1gh0 F: [60496]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      4. 1978954Domain d1gh0h_: 1gh0 H: [60498]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      5. 1978955Domain d1gh0j_: 1gh0 J: [60500]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      6. 1978956Domain d1gh0l_: 1gh0 L: [60502]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      7. 1978957Domain d1gh0n_: 1gh0 N: [60504]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      8. 1978958Domain d1gh0p_: 1gh0 P: [60506]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      9. 1978959Domain d1gh0r_: 1gh0 R: [60508]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      10. 1978960Domain d1gh0t_: 1gh0 T: [60510]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      11. 1978961Domain d1gh0v_: 1gh0 V: [60512]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
      12. 1978962Domain d1gh0x_: 1gh0 X: [60514]
        Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
        complexed with cyc
    2. Domains for 1ha7:
      1. 1978939Domain d1ha7b_: 1ha7 B: [70936]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      2. 1978940Domain d1ha7d_: 1ha7 D: [70938]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      3. 1978941Domain d1ha7f_: 1ha7 F: [70940]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      4. 1978942Domain d1ha7h_: 1ha7 H: [70942]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      5. 1978943Domain d1ha7j_: 1ha7 J: [70944]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      6. 1978944Domain d1ha7l_: 1ha7 L: [70946]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      7. 1978945Domain d1ha7n_: 1ha7 N: [70948]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      8. 1978946Domain d1ha7p_: 1ha7 P: [70950]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      9. 1978947Domain d1ha7r_: 1ha7 R: [70952]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      10. 1978948Domain d1ha7t_: 1ha7 T: [70954]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      11. 1978949Domain d1ha7v_: 1ha7 V: [70956]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
      12. 1978950Domain d1ha7x_: 1ha7 X: [70958]
        Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
        complexed with cyc
  5. 1978963Synechococcus elongatus [TaxId:32046] [88968] (1 PDB entry)
  6. 1978965Synechococcus vulcanus [TaxId:32053] [88944] (6 PDB entries)
    1. Domain for 1i7y:
    2. Domain for 1ktp:
    3. Domain for 1on7:
    4. Domain for 3o18:
    5. Domain for 3o2c:
    6. Domain for 4n6s:
  7. 1978972Thermosynechococcus elongatus [TaxId:197221] [189583] (9 PDB entries)
    1. Domain for 3l0f:
    2. Domain for 4q70:
    3. Domain for 4z8k:
    4. Domain for 4ziz:
    5. Domain for 5mjm:
    6. Domain for 5mjp:
    7. Domain for 5mjq:
    8. Domain for 5o7m:
    9. Domain for 5uvk:
  8. 1978977Thermosynechococcus vulcanus [TaxId:32053] [193917] (2 PDB entries)
    1. Domain for 4gxe:
    2. Domain for 4gy3:

More info for Protein Phycocyanin beta subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins

Timeline for Protein Phycocyanin beta subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins: