SCOPe 2.06: Protein: Phycocyanin alpha subunit

Lineage for Protein: Phycocyanin alpha subunit

Root: SCOPe 2.06
Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
core: 6 helices; folded leaf, partly opened
Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (5 families)

Family a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins [46532] (7 proteins)
oligomers of two different types of globin-like subunits containing two extra helices at the N-terminus
binds a bilin chromophore
automatically mapped to Pfam PF00502

Protein Phycocyanin alpha subunit [88933] (9 species)

Species:

Fremyella diplosiphon [TaxId:1197] [88937] (1 PDB entry)
- Domains for 1cpc:
  1. Domain d1cpca_: 1cpc A: [15643]
    Other proteins in same PDB: d1cpcb_, d1cpcl_
    complexed with cyc
  2. Domain d1cpck_: 1cpc K: [15645]
    Other proteins in same PDB: d1cpcb_, d1cpcl_
    complexed with cyc
Leptolyngbya sp. [TaxId:574115] [256952] (1 PDB entry)
- Domains for 4l1e:
  1. Domain d4l1ea_: 4l1e A: [256953]
    Other proteins in same PDB: d4l1eb_, d4l1ed_, d4l1ef_, d4l1eh_, d4l1ej_, d4l1el_
    automated match to d1gh0a_
    complexed with bla, cyc
  2. Domain d4l1ec_: 4l1e C: [256956]
    Other proteins in same PDB: d4l1eb_, d4l1ed_, d4l1ef_, d4l1eh_, d4l1ej_, d4l1el_
    automated match to d1gh0a_
    complexed with bla, cyc
  3. Domain d4l1ee_: 4l1e E: [256957]
    Other proteins in same PDB: d4l1eb_, d4l1ed_, d4l1ef_, d4l1eh_, d4l1ej_, d4l1el_
    automated match to d1gh0a_
    complexed with bla, cyc
  4. Domain d4l1eg_: 4l1e G: [256958]
    Other proteins in same PDB: d4l1eb_, d4l1ed_, d4l1ef_, d4l1eh_, d4l1ej_, d4l1el_
    automated match to d1gh0a_
    complexed with bla, cyc
  5. Domain d4l1ei_: 4l1e I: [256959]
    Other proteins in same PDB: d4l1eb_, d4l1ed_, d4l1ef_, d4l1eh_, d4l1ej_, d4l1el_
    automated match to d1gh0a_
    complexed with bla, cyc
  6. Domain d4l1ek_: 4l1e K: [256960]
    Other proteins in same PDB: d4l1eb_, d4l1ed_, d4l1ef_, d4l1eh_, d4l1ej_, d4l1el_
    automated match to d1gh0a_
    complexed with bla, cyc
Red alga (Cyanidium caldarium) [TaxId:2771] [88934] (1 PDB entry)
- Domain for 1phn:
  - Domain d1phna_: 1phn A: [15641]
    Other proteins in same PDB: d1phnb_
    complexed with cyc, peb
Red alga (Polysiphonia urceolata) [TaxId:65404] [88936] (1 PDB entry)
- Domains for 1f99:
  1. Domain d1f99a_: 1f99 A: [59722]
    Other proteins in same PDB: d1f99b_, d1f99l_, d1f99n_
    complexed with bla, cyc, peb
  2. Domain d1f99k_: 1f99 K: [59724]
    Other proteins in same PDB: d1f99b_, d1f99l_, d1f99n_
    complexed with bla, cyc, peb
  3. Domain d1f99m_: 1f99 M: [59726]
    Other proteins in same PDB: d1f99b_, d1f99l_, d1f99n_
    complexed with bla, cyc, peb
Spirulina platensis [TaxId:118562] [88939] (2 PDB entries)
1. Domains for 1gh0:
  1. Domain d1gh0a_: 1gh0 A: [60491]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  2. Domain d1gh0c_: 1gh0 C: [60493]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  3. Domain d1gh0e_: 1gh0 E: [60495]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  4. Domain d1gh0g_: 1gh0 G: [60497]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  5. Domain d1gh0i_: 1gh0 I: [60499]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  6. Domain d1gh0k_: 1gh0 K: [60501]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  7. Domain d1gh0m_: 1gh0 M: [60503]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  8. Domain d1gh0o_: 1gh0 O: [60505]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  9. Domain d1gh0q_: 1gh0 Q: [60507]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  10. Domain d1gh0s_: 1gh0 S: [60509]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  11. Domain d1gh0u_: 1gh0 U: [60511]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
  12. Domain d1gh0w_: 1gh0 W: [60513]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
2. Domains for 1ha7:
  1. Domain d1ha7a_: 1ha7 A: [70935]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  2. Domain d1ha7c_: 1ha7 C: [70937]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  3. Domain d1ha7e_: 1ha7 E: [70939]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  4. Domain d1ha7g_: 1ha7 G: [70941]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  5. Domain d1ha7i_: 1ha7 I: [70943]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  6. Domain d1ha7k_: 1ha7 K: [70945]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  7. Domain d1ha7m_: 1ha7 M: [70947]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  8. Domain d1ha7o_: 1ha7 O: [70949]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  9. Domain d1ha7q_: 1ha7 Q: [70951]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  10. Domain d1ha7s_: 1ha7 S: [70953]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  11. Domain d1ha7u_: 1ha7 U: [70955]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc
  12. Domain d1ha7w_: 1ha7 W: [70957]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc

Spirulina sp. [TaxId:1157] [158219] (1 PDB entry)

Domains for 2uum:

Domain d2uuma_: 2uum A: [152185]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumc_: 2uum C: [152186]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uume_: 2uum E: [152187]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumg_: 2uum G: [152188]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumi_: 2uum I: [152189]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumk_: 2uum K: [152190]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumm_: 2uum M: [152191]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumo_: 2uum O: [152192]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumq_: 2uum Q: [152193]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uums_: 2uum S: [152194]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumu_: 2uum U: [152195]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Domain d2uumw_: 2uum W: [152196]
Other proteins in same PDB: d2uumb_, d2uumd_, d2uumf_, d2uumh_, d2uumj_, d2uuml_, d2uumn_, d2uump_, d2uumr_, d2uumt_, d2uumv_, d2uumx_
automated match to d1gh0a_
complexed with bla, cyc

Synechococcus elongatus [TaxId:32046] [88967] (1 PDB entry)
- Domain for 1jbo:
  - Domain d1jboa_: 1jbo A: [84150]
    Other proteins in same PDB: d1jbob_
    complexed with cyc
Synechococcus vulcanus [TaxId:32053] [88938] (8 PDB entries)
1. Domain for 1i7y:
  - Domain d1i7ya_: 1i7y A: [61917]
    Other proteins in same PDB: d1i7yb_
    complexed with cyc, men
2. Domain for 1ktp:
  - Domain d1ktpa_: 1ktp A: [72990]
    Other proteins in same PDB: d1ktpb_
    complexed with bla, cyc
3. Domain for 1on7:
  - Domain d1on7a_: 1on7 A: [87121]
    Other proteins in same PDB: d1on7b_
    complexed with cyc
4. Domain for 3o18:
  - Domain d3o18a_: 3o18 A: [182724]
    Other proteins in same PDB: d3o18b_
    automated match to d1i7ya_
    complexed with cyc
5. Domain for 3o2c:
  - Domain d3o2ca_: 3o2c A: [182752]
    Other proteins in same PDB: d3o2cb_
    automated match to d1i7ya_
    complexed with cyc
6. Domain for 4gxe:
  - Domain d4gxea_: 4gxe A: [252347]
    Other proteins in same PDB: d4gxeb_
    automated match to d3o18a_
    complexed with cyc, ure
7. Domain for 4gy3:
  - Domain d4gy3a_: 4gy3 A: [193919]
    Other proteins in same PDB: d4gy3b_
    automated match to d3o18a_
    complexed with cyc, ure
8. Domain for 4n6s:
  - Domain d4n6sa_: 4n6s A: [236224]
    Other proteins in same PDB: d4n6sb_
    automated match to d1ktpa_
    complexed with cyc
Thermosynechococcus elongatus [TaxId:197221] [189582] (9 PDB entries)
1. Domain for 3l0f:
  - Domain d3l0fa_: 3l0f A: [179840]
    Other proteins in same PDB: d3l0fb_
    automated match to d1jboa_
    complexed with cyc
2. Domain for 4q70:
  - Domain d4q70a_: 4q70 A: [272366]
    Other proteins in same PDB: d4q70b_
    automated match to d1jboa_
    complexed with cyc
3. Domain for 4z8k:
  - Domain d4z8ka_: 4z8k A: [276082]
    Other proteins in same PDB: d4z8kb_
    automated match to d1ktpa_
    complexed with cyc
4. Domain for 4ziz:
  - Domain d4ziza_: 4ziz A: [276212]
    Other proteins in same PDB: d4zizb_
    automated match to d1jboa_
    complexed with cyc
5. Domain for 5mjm:
  - Domain d5mjma_: 5mjm A: [341514]
    Other proteins in same PDB: d5mjmb_
    automated match to d1jboa_
    complexed with cyc
6. Domain for 5mjp:
  - Domain d5mjpa_: 5mjp A: [341531]
    Other proteins in same PDB: d5mjpb_
    automated match to d1jboa_
    complexed with cyc
7. Domain for 5mjq:
  - Domain d5mjqa_: 5mjq A: [341615]
    Other proteins in same PDB: d5mjqb_
    automated match to d1jboa_
    complexed with cyc
8. Domain for 5o7m:
  - Domain d5o7ma_: 5o7m A: [341569]
    Other proteins in same PDB: d5o7mb_
    automated match to d1jboa_
    complexed with cyc
9. Domain for 5uvk:
  - Domain d5uvka_: 5uvk A: [334649]
    Other proteins in same PDB: d5uvkb_
    automated match to d1jboa_
    complexed with cyc

More info for Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins

Timeline for Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins:

Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins first appeared in SCOP 1.65
Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins appears in SCOPe 2.05
Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins appears in SCOPe 2.07
Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins appears in the current release, SCOPe 2.08