Lineage for Protein: Fibrinogen alpha chain

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 344849Class h: Coiled coil proteins [57942] (6 folds)
  3. 344850Fold h.1: Parallel coiled-coil [57943] (26 superfamilies)
    this is not a true fold; includes oligomers of shorter identical helices
  4. 345233Superfamily h.1.8: Fibrinogen coiled-coil and central regions [58010] (1 family) (S)
  5. 345234Family h.1.8.1: Fibrinogen coiled-coil and central regions [58011] (3 proteins)
    in the central region two tripple coiled-coils are stacked end-to-end and interlock with N-terminal tails
  6. 345235Protein Fibrinogen alpha chain [88887] (4 species)

Species:

  1. 345236Chicken (Gallus gallus) [TaxId:9031] [88888] (1 PDB entry)
  2. 345239Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [88890] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1jy2:
      1. 345240Domain d1jy2n_: 1jy2 N: [67440]
        Other proteins in same PDB: d1jy2o_, d1jy2p_, d1jy2r_, d1jy2s_
      2. 345241Domain d1jy2q_: 1jy2 Q: [67443]
        Other proteins in same PDB: d1jy2o_, d1jy2p_, d1jy2r_, d1jy2s_
        central region only (e5 fragment)
    2. Domains for 1jy3:
      1. 345242Domain d1jy3n_: 1jy3 N: [67446]
        Other proteins in same PDB: d1jy3o_, d1jy3p_, d1jy3r_, d1jy3s_
      2. 345243Domain d1jy3q_: 1jy3 Q: [67449]
        Other proteins in same PDB: d1jy3o_, d1jy3p_, d1jy3r_, d1jy3s_
        central region only (e5 fragment)
  3. 345244Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [88889] (10 PDB entries)
    1. Domains for 1fza:
      1. 345261Domain d1fzaa_: 1fza A: [45620]
        Other proteins in same PDB: d1fzab1, d1fzab2, d1fzac1, d1fzac2, d1fzae1, d1fzae2, d1fzaf1, d1fzaf2
      2. 345262Domain d1fzad_: 1fza D: [45623]
        Other proteins in same PDB: d1fzab1, d1fzab2, d1fzac1, d1fzac2, d1fzae1, d1fzae2, d1fzaf1, d1fzaf2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, nag
    2. Domains for 1fzb:
      1. 345255Domain d1fzba_: 1fzb A: [45608]
        Other proteins in same PDB: d1fzbb1, d1fzbb2, d1fzbc1, d1fzbc2, d1fzbe1, d1fzbe2, d1fzbf1, d1fzbf2
      2. 345256Domain d1fzbd_: 1fzb D: [45611]
        Other proteins in same PDB: d1fzbb1, d1fzbb2, d1fzbc1, d1fzbc2, d1fzbe1, d1fzbe2, d1fzbf1, d1fzbf2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, nag
    3. Domains for 1fzc:
      1. 345245Domain d1fzca_: 1fzc A: [45590]
        Other proteins in same PDB: d1fzcb1, d1fzcb2, d1fzcc1, d1fzcc2, d1fzce1, d1fzce2, d1fzcf1, d1fzcf2
      2. 345246Domain d1fzcd_: 1fzc D: [45593]
        Other proteins in same PDB: d1fzcb1, d1fzcb2, d1fzcc1, d1fzcc2, d1fzce1, d1fzce2, d1fzcf1, d1fzcf2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, man, nag
    4. Domains for 1fze:
      1. 345257Domain d1fzea_: 1fze A: [45614]
        Other proteins in same PDB: d1fzeb1, d1fzeb2, d1fzec1, d1fzec2, d1fzee1, d1fzee2, d1fzef1, d1fzef2
      2. 345258Domain d1fzed_: 1fze D: [45617]
        Other proteins in same PDB: d1fzeb1, d1fzeb2, d1fzec1, d1fzec2, d1fzee1, d1fzee2, d1fzef1, d1fzef2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, nag
    5. Domains for 1fzf:
      1. 345249Domain d1fzfa_: 1fzf A: [45596]
        Other proteins in same PDB: d1fzfb1, d1fzfb2, d1fzfc1, d1fzfc2, d1fzfe1, d1fzfe2, d1fzff1, d1fzff2
      2. 345250Domain d1fzfd_: 1fzf D: [45599]
        Other proteins in same PDB: d1fzfb1, d1fzfb2, d1fzfc1, d1fzfc2, d1fzfe1, d1fzfe2, d1fzff1, d1fzff2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, nag
    6. Domains for 1fzg:
      1. 345251Domain d1fzga_: 1fzg A: [45602]
        Other proteins in same PDB: d1fzgb1, d1fzgb2, d1fzgc1, d1fzgc2, d1fzge1, d1fzge2, d1fzgf1, d1fzgf2
      2. 345252Domain d1fzgd_: 1fzg D: [45605]
        Other proteins in same PDB: d1fzgb1, d1fzgb2, d1fzgc1, d1fzgc2, d1fzge1, d1fzge2, d1fzgf1, d1fzgf2
        complexed with ca, nag
    7. Domains for 1lt9:
      1. 345253Domain d1lt9a_: 1lt9 A: [78188]
        Other proteins in same PDB: d1lt9b1, d1lt9b2, d1lt9c1, d1lt9c2, d1lt9e1, d1lt9e2, d1lt9f1, d1lt9f2
      2. 345254Domain d1lt9d_: 1lt9 D: [78193]
        Other proteins in same PDB: d1lt9b1, d1lt9b2, d1lt9c1, d1lt9c2, d1lt9e1, d1lt9e2, d1lt9f1, d1lt9f2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, nag
    8. Domains for 1ltj:
      1. 345247Domain d1ltja_: 1ltj A: [78198]
        Other proteins in same PDB: d1ltjb1, d1ltjb2, d1ltjc1, d1ltjc2, d1ltje1, d1ltje2, d1ltjf1, d1ltjf2
      2. 345248Domain d1ltjd_: 1ltj D: [78203]
        Other proteins in same PDB: d1ltjb1, d1ltjb2, d1ltjc1, d1ltjc2, d1ltje1, d1ltje2, d1ltjf1, d1ltjf2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, fuc, nag
    9. Domains for 1n86:
      1. 345259Domain d1n86a_: 1n86 A: [80277]
        Other proteins in same PDB: d1n86b1, d1n86b2, d1n86c1, d1n86c2, d1n86e1, d1n86e2, d1n86f1, d1n86f2
      2. 345260Domain d1n86d_: 1n86 D: [80282]
        Other proteins in same PDB: d1n86b1, d1n86b2, d1n86c1, d1n86c2, d1n86e1, d1n86e2, d1n86f1, d1n86f2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, man, nag
    10. Domains for 1n8e:
      1. 345263Domain d1n8ea_: 1n8e A: [80287]
        Other proteins in same PDB: d1n8eb1, d1n8eb2, d1n8ec1, d1n8ec2, d1n8ee1, d1n8ee2, d1n8ef1, d1n8ef2
      2. 345264Domain d1n8ed_: 1n8e D: [80292]
        Other proteins in same PDB: d1n8eb1, d1n8eb2, d1n8ec1, d1n8ec2, d1n8ee1, d1n8ee2, d1n8ef1, d1n8ef2
        coiled-coil region only
  4. 345265Sea lamprey (Petromyzon marinus) [TaxId:7757] [88891] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1lwu:
      1. 345266Domain d1lwua_: 1lwu A: [74309]
        Other proteins in same PDB: d1lwub1, d1lwub2, d1lwuc1, d1lwuc2, d1lwue1, d1lwue2, d1lwuf1, d1lwuf2, d1lwuh1, d1lwuh2, d1lwui1, d1lwui2, d1lwuk1, d1lwuk2, d1lwul1, d1lwul2
      2. 345267Domain d1lwud_: 1lwu D: [74314]
        Other proteins in same PDB: d1lwub1, d1lwub2, d1lwuc1, d1lwuc2, d1lwue1, d1lwue2, d1lwuf1, d1lwuf2, d1lwuh1, d1lwuh2, d1lwui1, d1lwui2, d1lwuk1, d1lwuk2, d1lwul1, d1lwul2
      3. 345268Domain d1lwug_: 1lwu G: [74319]
        Other proteins in same PDB: d1lwub1, d1lwub2, d1lwuc1, d1lwuc2, d1lwue1, d1lwue2, d1lwuf1, d1lwuf2, d1lwuh1, d1lwuh2, d1lwui1, d1lwui2, d1lwuk1, d1lwuk2, d1lwul1, d1lwul2
      4. 345269Domain d1lwuj_: 1lwu J: [74324]
        Other proteins in same PDB: d1lwub1, d1lwub2, d1lwuc1, d1lwuc2, d1lwue1, d1lwue2, d1lwuf1, d1lwuf2, d1lwuh1, d1lwuh2, d1lwui1, d1lwui2, d1lwuk1, d1lwuk2, d1lwul1, d1lwul2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, gal, man, nag, nh2
    2. Domains for 1n73:
      1. 345270Domain d1n73a_: 1n73 A: [80214]
        Other proteins in same PDB: d1n73b1, d1n73b2, d1n73c1, d1n73c2, d1n73e1, d1n73e2, d1n73f1, d1n73f2
      2. 345271Domain d1n73d_: 1n73 D: [80219]
        Other proteins in same PDB: d1n73b1, d1n73b2, d1n73c1, d1n73c2, d1n73e1, d1n73e2, d1n73f1, d1n73f2
        coiled-coil region only
        complexed with ca, nag

More info for Protein Fibrinogen alpha chain from h.1.8.1: Fibrinogen coiled-coil and central regions

Timeline for Protein Fibrinogen alpha chain from h.1.8.1: Fibrinogen coiled-coil and central regions:

  • Protein Fibrinogen alpha chain from h.1.8.1: Fibrinogen coiled-coil and central regions is new in SCOP 1.65
  • Protein Fibrinogen alpha chain from h.1.8.1: Fibrinogen coiled-coil and central regions appears in SCOP 1.67
  • Protein Fibrinogen alpha chain from h.1.8.1: Fibrinogen coiled-coil and central regions appears in the current release, SCOPe 2.08