Lineage for Protein: N-terminal, heterodimerisation domain of RBP7 (RpoE)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2170735Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2240281Fold d.230: Dodecin subunit-like [88797] (6 superfamilies)
    beta-alpha-beta(2); 2 layers: alpha/beta; antiparallel beta-sheet: order 132
  4. 2240282Superfamily d.230.1: N-terminal, heterodimerisation domain of RBP7 (RpoE) [88798] (1 family) (S)
    automatically mapped to Pfam PF03876
  5. 2240283Family d.230.1.1: N-terminal, heterodimerisation domain of RBP7 (RpoE) [88799] (1 protein)
  6. 2240284Protein N-terminal, heterodimerisation domain of RBP7 (RpoE) [88800] (3 species)

Species:

  1. 2240285Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [117777] (6 PDB entries)
    Uniprot P34087
    1. Domains for 1y14:
      1. 2240286Domain d1y14b2: 1y14 B:1-80 [116324]
        Other proteins in same PDB: d1y14a_, d1y14b1, d1y14c_, d1y14d1
      2. 2240287Domain d1y14d2: 1y14 D:1-80 [116327]
        Other proteins in same PDB: d1y14a_, d1y14b1, d1y14c_, d1y14d1
    2. Domain for 2b8k:
    3. Domain for 2ja5:
    4. Domain for 2ja6:
    5. Domains for 2ja7:
      1. 2240289Domain d2ja7g2: 2ja7 G:1-80 [138199]
        Other proteins in same PDB: d2ja7a1, d2ja7b1, d2ja7c1, d2ja7c2, d2ja7d1, d2ja7e1, d2ja7e2, d2ja7f1, d2ja7g1, d2ja7h1, d2ja7i1, d2ja7i2, d2ja7j1, d2ja7k1, d2ja7l1, d2ja7m1, d2ja7n1, d2ja7o1, d2ja7o2, d2ja7p1, d2ja7q1, d2ja7q2, d2ja7r1, d2ja7s1, d2ja7t1, d2ja7u1, d2ja7u2, d2ja7v1, d2ja7w1, d2ja7x1
        automatically matched to d1y14b2
        protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn
      2. 2240290Domain d2ja7s2: 2ja7 S:1-80 [138215]
        Other proteins in same PDB: d2ja7a1, d2ja7b1, d2ja7c1, d2ja7c2, d2ja7d1, d2ja7e1, d2ja7e2, d2ja7f1, d2ja7g1, d2ja7h1, d2ja7i1, d2ja7i2, d2ja7j1, d2ja7k1, d2ja7l1, d2ja7m1, d2ja7n1, d2ja7o1, d2ja7o2, d2ja7p1, d2ja7q1, d2ja7q2, d2ja7r1, d2ja7s1, d2ja7t1, d2ja7u1, d2ja7u2, d2ja7v1, d2ja7w1, d2ja7x1
        automatically matched to d1y14b2
        protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn
    6. Domain for 2ja8:
  2. 2240294Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [142891] (1 PDB entry)
    Uniprot P62487 1-77
  3. 2240299Methanococcus jannaschii [TaxId:2190] [88801] (1 PDB entry)

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