Lineage for Protein: Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase

  1. Root: SCOPe 2.04
  2. 1565955Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 1593542Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 1593543Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (25 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 1596277Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (18 proteins)
    core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
  6. 1596333Protein Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase [88774] (4 species)

Species:

  1. 1596334Bacillus sp., strain ps3 [TaxId:1409] [88777] (1 PDB entry)
  2. 1596336Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [88775] (15 PDB entries)
    Uniprot P19483
    1. Domains for 1bmf:
      1. 1596361Domain d1bmfa3: 1bmf A:95-379 [32326]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
      2. 1596362Domain d1bmfb3: 1bmf B:95-379 [32327]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
      3. 1596363Domain d1bmfc3: 1bmf C:95-379 [32328]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa2, d1bmfb1, d1bmfb2, d1bmfc1, d1bmfc2, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
    2. Domains for 1cow:
      1. 1596379Domain d1cowa3: 1cow A:95-379 [32350]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
      2. 1596380Domain d1cowb3: 1cow B:95-379 [32351]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
      3. 1596381Domain d1cowc3: 1cow C:95-379 [32352]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa2, d1cowb1, d1cowb2, d1cowc1, d1cowc2, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
    3. Domains for 1e1q:
      1. 1596367Domain d1e1qa3: 1e1q A:95-379 [32338]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
      2. 1596368Domain d1e1qb3: 1e1q B:95-379 [32339]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
      3. 1596369Domain d1e1qc3: 1e1q C:95-379 [32340]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa2, d1e1qb1, d1e1qb2, d1e1qc1, d1e1qc2, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
    4. Domains for 1e1r:
      1. 1596358Domain d1e1ra3: 1e1r A:95-379 [32320]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
      2. 1596359Domain d1e1rb3: 1e1r B:95-379 [32321]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
      3. 1596360Domain d1e1rc3: 1e1r C:95-379 [32322]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra2, d1e1rb1, d1e1rb2, d1e1rc1, d1e1rc2, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
    5. Domains for 1e79:
      1. 1596349Domain d1e79a3: 1e79 A:95-379 [32314]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, dcw, gol, mg, so4
      2. 1596350Domain d1e79b3: 1e79 B:95-379 [32315]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, dcw, gol, mg, so4
      3. 1596351Domain d1e79c3: 1e79 C:95-379 [32316]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a2, d1e79b1, d1e79b2, d1e79c1, d1e79c2, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, dcw, gol, mg, so4
    6. Domains for 1efr:
      1. 1596370Domain d1efra3: 1efr A:95-379 [32344]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
        complexed with adp, anp, mg
      2. 1596371Domain d1efrb3: 1efr B:95-379 [32345]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
        complexed with adp, anp, mg
      3. 1596372Domain d1efrc3: 1efr C:95-379 [32346]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra2, d1efrb1, d1efrb2, d1efrc1, d1efrc2, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
        complexed with adp, anp, mg
    7. Domains for 1h8e:
      1. 1596355Domain d1h8ea3: 1h8e A:95-379 [60740]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
      2. 1596356Domain d1h8eb3: 1h8e B:95-379 [60743]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
      3. 1596357Domain d1h8ec3: 1h8e C:95-379 [60746]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea2, d1h8eb1, d1h8eb2, d1h8ec1, d1h8ec2, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
    8. Domains for 1h8h:
      1. 1596376Domain d1h8ha3: 1h8h A:95-379 [60761]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
      2. 1596377Domain d1h8hb3: 1h8h B:95-379 [60764]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
      3. 1596378Domain d1h8hc3: 1h8h C:95-379 [60767]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha2, d1h8hb1, d1h8hb2, d1h8hc1, d1h8hc2, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
    9. Domains for 1nbm:
      1. 1596364Domain d1nbma3: 1nbm A:95-379 [32332]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4
      2. 1596365Domain d1nbmb3: 1nbm B:95-379 [32333]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4
      3. 1596366Domain d1nbmc3: 1nbm C:95-379 [32334]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma2, d1nbmb1, d1nbmb2, d1nbmc1, d1nbmc2, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4
    10. Domains for 1ohh:
      1. 1596373Domain d1ohha3: 1ohh A:95-379 [87017]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
        complexed with anp, mg
      2. 1596374Domain d1ohhb3: 1ohh B:95-379 [87020]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
        complexed with anp, mg
      3. 1596375Domain d1ohhc3: 1ohh C:95-379 [87023]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha2, d1ohhb1, d1ohhb2, d1ohhc1, d1ohhc2, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
        complexed with anp, mg
    11. Domains for 1w0j:
      1. 1596343Domain d1w0ja3: 1w0j A:95-379 [108991]
        Other proteins in same PDB: d1w0ja1, d1w0ja2, d1w0jb1, d1w0jb2, d1w0jc1, d1w0jc2, d1w0jd1, d1w0jd2, d1w0jd3, d1w0je1, d1w0je2, d1w0je3, d1w0jf1, d1w0jf2, d1w0jf3, d1w0jg_
        complexed with adp, bef, gol, mg, po4
      2. 1596344Domain d1w0jb3: 1w0j B:95-379 [108994]
        Other proteins in same PDB: d1w0ja1, d1w0ja2, d1w0jb1, d1w0jb2, d1w0jc1, d1w0jc2, d1w0jd1, d1w0jd2, d1w0jd3, d1w0je1, d1w0je2, d1w0je3, d1w0jf1, d1w0jf2, d1w0jf3, d1w0jg_
        complexed with adp, bef, gol, mg, po4
      3. 1596345Domain d1w0jc3: 1w0j C:95-379 [108997]
        Other proteins in same PDB: d1w0ja1, d1w0ja2, d1w0jb1, d1w0jb2, d1w0jc1, d1w0jc2, d1w0jd1, d1w0jd2, d1w0jd3, d1w0je1, d1w0je2, d1w0je3, d1w0jf1, d1w0jf2, d1w0jf3, d1w0jg_
        complexed with adp, bef, gol, mg, po4
    12. Domains for 1w0k:
      1. 1596352Domain d1w0ka3: 1w0k A:95-379 [109010]
        Other proteins in same PDB: d1w0ka1, d1w0ka2, d1w0kb1, d1w0kb2, d1w0kc1, d1w0kc2, d1w0kd1, d1w0kd2, d1w0kd3, d1w0ke1, d1w0ke2, d1w0ke3, d1w0kf1, d1w0kf2, d1w0kf3, d1w0kg_
        complexed with adp, gol, mg, po4
      2. 1596353Domain d1w0kb3: 1w0k B:95-379 [109013]
        Other proteins in same PDB: d1w0ka1, d1w0ka2, d1w0kb1, d1w0kb2, d1w0kc1, d1w0kc2, d1w0kd1, d1w0kd2, d1w0kd3, d1w0ke1, d1w0ke2, d1w0ke3, d1w0kf1, d1w0kf2, d1w0kf3, d1w0kg_
        complexed with adp, gol, mg, po4
      3. 1596354Domain d1w0kc3: 1w0k C:95-379 [109016]
        Other proteins in same PDB: d1w0ka1, d1w0ka2, d1w0kb1, d1w0kb2, d1w0kc1, d1w0kc2, d1w0kd1, d1w0kd2, d1w0kd3, d1w0ke1, d1w0ke2, d1w0ke3, d1w0kf1, d1w0kf2, d1w0kf3, d1w0kg_
        complexed with adp, gol, mg, po4
    13. Domains for 2ck3:
      1. 1596340Domain d2ck3a3: 2ck3 A:95-379 [145035]
        Other proteins in same PDB: d2ck3a1, d2ck3a2, d2ck3b1, d2ck3b2, d2ck3c1, d2ck3c2, d2ck3d1, d2ck3d2, d2ck3d3, d2ck3e1, d2ck3e2, d2ck3e3, d2ck3f1, d2ck3f2, d2ck3f3, d2ck3g_, d2ck3h1, d2ck3h2, d2ck3i_
        automated match to d1w0ja3
        complexed with adp, anp, azi, mg, po4
      2. 1596341Domain d2ck3b3: 2ck3 B:95-379 [145038]
        Other proteins in same PDB: d2ck3a1, d2ck3a2, d2ck3b1, d2ck3b2, d2ck3c1, d2ck3c2, d2ck3d1, d2ck3d2, d2ck3d3, d2ck3e1, d2ck3e2, d2ck3e3, d2ck3f1, d2ck3f2, d2ck3f3, d2ck3g_, d2ck3h1, d2ck3h2, d2ck3i_
        automated match to d1e79a3
        complexed with adp, anp, azi, mg, po4
      3. 1596342Domain d2ck3c3: 2ck3 C:95-379 [145041]
        Other proteins in same PDB: d2ck3a1, d2ck3a2, d2ck3b1, d2ck3b2, d2ck3c1, d2ck3c2, d2ck3d1, d2ck3d2, d2ck3d3, d2ck3e1, d2ck3e2, d2ck3e3, d2ck3f1, d2ck3f2, d2ck3f3, d2ck3g_, d2ck3h1, d2ck3h2, d2ck3i_
        automated match to d1e79a3
        complexed with adp, anp, azi, mg, po4
    14. Domains for 2jdi:
      1. 1596337Domain d2jdia3: 2jdi A:95-379 [145685]
        Other proteins in same PDB: d2jdia1, d2jdia2, d2jdib1, d2jdib2, d2jdic1, d2jdic2, d2jdid1, d2jdid2, d2jdid3, d2jdie1, d2jdie2, d2jdie3, d2jdif1, d2jdif2, d2jdif3, d2jdig_, d2jdih1, d2jdih2, d2jdii_
        automated match to d1w0ja3
        complexed with anp, mg
      2. 1596338Domain d2jdib3: 2jdi B:95-379 [145688]
        Other proteins in same PDB: d2jdia1, d2jdia2, d2jdib1, d2jdib2, d2jdic1, d2jdic2, d2jdid1, d2jdid2, d2jdid3, d2jdie1, d2jdie2, d2jdie3, d2jdif1, d2jdif2, d2jdif3, d2jdig_, d2jdih1, d2jdih2, d2jdii_
        automated match to d1e79a3
        complexed with anp, mg
      3. 1596339Domain d2jdic3: 2jdi C:95-379 [145691]
        Other proteins in same PDB: d2jdia1, d2jdia2, d2jdib1, d2jdib2, d2jdic1, d2jdic2, d2jdid1, d2jdid2, d2jdid3, d2jdie1, d2jdie2, d2jdie3, d2jdif1, d2jdif2, d2jdif3, d2jdig_, d2jdih1, d2jdih2, d2jdii_
        automated match to d1w0ja3
        complexed with anp, mg
    15. Domains for 4asu:
      1. 1596346Domain d4asua2: 4asu A:95-379 [201514]
        Other proteins in same PDB: d4asua1, d4asua3, d4asub1, d4asub3, d4asuc1, d4asuc3, d4asud1, d4asud2, d4asud3, d4asue1, d4asue2, d4asue3, d4asuf1, d4asuf2, d4asuf3, d4asug_, d4asui_
        automated match to d1w0ja3
        complexed with adp, mg
      2. 1596347Domain d4asub2: 4asu B:95-379 [201517]
        Other proteins in same PDB: d4asua1, d4asua3, d4asub1, d4asub3, d4asuc1, d4asuc3, d4asud1, d4asud2, d4asud3, d4asue1, d4asue2, d4asue3, d4asuf1, d4asuf2, d4asuf3, d4asug_, d4asui_
        automated match to d1e79a3
        complexed with adp, mg
      3. 1596348Domain d4asuc2: 4asu C:95-379 [201520]
        Other proteins in same PDB: d4asua1, d4asua3, d4asub1, d4asub3, d4asuc1, d4asuc3, d4asud1, d4asud2, d4asud3, d4asue1, d4asue2, d4asue3, d4asuf1, d4asuf2, d4asuf3, d4asug_, d4asui_
        automated match to d1w0ja3
        complexed with adp, mg
  3. 1596382Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [88776] (1 PDB entry)
  4. 1596384Spinach (Spinacia oleracea), chloroplast [TaxId:3562] [88778] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1fx0:
    2. Domain for 1kmh:

More info for Protein Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain)

Timeline for Protein Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain):