Lineage for Protein: F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1

  1. Root: SCOP 1.67
  2. 362614Class b: All beta proteins [48724] (141 folds)
  3. 377221Fold b.49: Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like [50614] (3 superfamilies)
    barrel, closed; n=6, S=8; greek-key
  4. 377222Superfamily b.49.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase [50615] (1 family) (S)
  5. 377223Family b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase [50616] (2 proteins)
    6 domains form a ring structure which contains a barrel, closed; n=24, S=24(?)
  6. 377224Protein F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1 [88672] (4 species)

Species:

  1. 377225Bacillus sp., strain ps3 [TaxId:1409] [88675] (1 PDB entry)
  2. 377227Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [88673] (10 PDB entries)
    1. Domains for 1bmf:
      1. 377237Domain d1bmfa2: 1bmf A:24-94 [26446]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
      2. 377238Domain d1bmfb2: 1bmf B:24-94 [26447]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
      3. 377239Domain d1bmfc2: 1bmf C:19-94 [26448]
        Other proteins in same PDB: d1bmfa1, d1bmfa3, d1bmfb1, d1bmfb3, d1bmfc1, d1bmfc3, d1bmfd1, d1bmfd2, d1bmfd3, d1bmfe1, d1bmfe2, d1bmfe3, d1bmff1, d1bmff2, d1bmff3, d1bmfg_
        complexed with adp, anp, mg
    2. Domains for 1cow:
      1. 377255Domain d1cowa2: 1cow A:24-94 [26470]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
      2. 377256Domain d1cowb2: 1cow B:24-94 [26471]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
      3. 377257Domain d1cowc2: 1cow C:19-94 [26472]
        Other proteins in same PDB: d1cowa1, d1cowa3, d1cowb1, d1cowb3, d1cowc1, d1cowc3, d1cowd1, d1cowd2, d1cowd3, d1cowe1, d1cowe2, d1cowe3, d1cowf1, d1cowf2, d1cowf3, d1cowg_
        complexed with adp, anp, aur, mg
    3. Domains for 1e1q:
      1. 377249Domain d1e1qa2: 1e1q A:24-94 [26458]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
      2. 377250Domain d1e1qb2: 1e1q B:24-94 [26459]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
      3. 377251Domain d1e1qc2: 1e1q C:19-94 [26460]
        Other proteins in same PDB: d1e1qa1, d1e1qa3, d1e1qb1, d1e1qb3, d1e1qc1, d1e1qc3, d1e1qd1, d1e1qd2, d1e1qd3, d1e1qe1, d1e1qe2, d1e1qe3, d1e1qf1, d1e1qf2, d1e1qf3, d1e1qg_
        complexed with adp, anp, mg, po4
    4. Domains for 1e1r:
      1. 377234Domain d1e1ra2: 1e1r A:24-94 [26440]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
      2. 377235Domain d1e1rb2: 1e1r B:24-94 [26441]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
      3. 377236Domain d1e1rc2: 1e1r C:19-94 [26442]
        Other proteins in same PDB: d1e1ra1, d1e1ra3, d1e1rb1, d1e1rb3, d1e1rc1, d1e1rc3, d1e1rd1, d1e1rd2, d1e1rd3, d1e1re1, d1e1re2, d1e1re3, d1e1rf1, d1e1rf2, d1e1rf3, d1e1rg_
        complexed with adp, af3, anp, mg, po4
    5. Domains for 1e79:
      1. 377228Domain d1e79a2: 1e79 A:19-94 [26434]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      2. 377229Domain d1e79b2: 1e79 B:19-94 [26435]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
      3. 377230Domain d1e79c2: 1e79 C:19-94 [26436]
        Other proteins in same PDB: d1e79a1, d1e79a3, d1e79b1, d1e79b3, d1e79c1, d1e79c3, d1e79d1, d1e79d2, d1e79d3, d1e79e1, d1e79e2, d1e79e3, d1e79f1, d1e79f2, d1e79f3, d1e79g_, d1e79h1, d1e79h2, d1e79i_
        complexed with adp, atp, cry, glh, mg, so4
    6. Domains for 1efr:
      1. 377243Domain d1efra2: 1efr A:24-94 [26464]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
      2. 377244Domain d1efrb2: 1efr B:24-94 [26465]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
      3. 377245Domain d1efrc2: 1efr C:19-94 [26466]
        Other proteins in same PDB: d1efra1, d1efra3, d1efrb1, d1efrb3, d1efrc1, d1efrc3, d1efrd1, d1efrd2, d1efrd3, d1efre1, d1efre2, d1efre3, d1efrf1, d1efrf2, d1efrf3, d1efrg_
        complexed with adp, anp, app, bal, cpi, mg, tlx
    7. Domains for 1h8e:
      1. 377231Domain d1h8ea2: 1h8e A:19-94 [60739]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      2. 377232Domain d1h8eb2: 1h8e B:24-94 [60742]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
      3. 377233Domain d1h8ec2: 1h8e C:19-94 [60745]
        Other proteins in same PDB: d1h8ea1, d1h8ea3, d1h8eb1, d1h8eb3, d1h8ec1, d1h8ec3, d1h8ed1, d1h8ed2, d1h8ed3, d1h8ee1, d1h8ee2, d1h8ee3, d1h8ef1, d1h8ef2, d1h8ef3, d1h8eg_, d1h8eh_, d1h8ei_
        complexed with adp, alf, gol, mg, so4
    8. Domains for 1h8h:
      1. 377246Domain d1h8ha2: 1h8h A:24-94 [60760]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
      2. 377247Domain d1h8hb2: 1h8h B:24-94 [60763]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
      3. 377248Domain d1h8hc2: 1h8h C:19-94 [60766]
        Other proteins in same PDB: d1h8ha1, d1h8ha3, d1h8hb1, d1h8hb3, d1h8hc1, d1h8hc3, d1h8hd1, d1h8hd2, d1h8hd3, d1h8he1, d1h8he2, d1h8he3, d1h8hf1, d1h8hf2, d1h8hf3, d1h8hg_
        complexed with adp, atp, gol, mg, po4
    9. Domains for 1nbm:
      1. 377240Domain d1nbma2: 1nbm A:24-94 [26452]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
      2. 377241Domain d1nbmb2: 1nbm B:24-94 [26453]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
      3. 377242Domain d1nbmc2: 1nbm C:19-94 [26454]
        Other proteins in same PDB: d1nbma1, d1nbma3, d1nbmb1, d1nbmb3, d1nbmc1, d1nbmc3, d1nbmd1, d1nbmd2, d1nbmd3, d1nbme1, d1nbme2, d1nbme3, d1nbmf1, d1nbmf2, d1nbmf3, d1nbmg_
        complexed with adp, atp, mg, po4, tyn
    10. Domains for 1ohh:
      1. 377252Domain d1ohha2: 1ohh A:24-94 [87016]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha3, d1ohhb1, d1ohhb3, d1ohhc1, d1ohhc3, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
      2. 377253Domain d1ohhb2: 1ohh B:24-94 [87019]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha3, d1ohhb1, d1ohhb3, d1ohhc1, d1ohhc3, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
      3. 377254Domain d1ohhc2: 1ohh C:19-94 [87022]
        Other proteins in same PDB: d1ohha1, d1ohha3, d1ohhb1, d1ohhb3, d1ohhc1, d1ohhc3, d1ohhd1, d1ohhd2, d1ohhd3, d1ohhe1, d1ohhe2, d1ohhe3, d1ohhf1, d1ohhf2, d1ohhf3, d1ohhg_, d1ohhh_
        complexed with anp, mg
  3. 377258Rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [88674] (1 PDB entry)
  4. 377260Spinach (Spinacia oleracea), chloroplast [TaxId:3562] [88676] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1fx0:
    2. Domain for 1kmh:

More info for Protein F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1 from b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase

Timeline for Protein F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1 from b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase:

  • Protein F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1 from b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase first appeared in SCOP 1.65
  • Protein F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1 from b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase appears in SCOP 1.69
  • Protein F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1 from b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase appears in the current release, SCOPe 2.08