Lineage for Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2685877Class a: All alpha proteins [46456] (290 folds)
  3. 2691777Fold a.4: DNA/RNA-binding 3-helical bundle [46688] (14 superfamilies)
    core: 3-helices; bundle, closed or partly opened, right-handed twist; up-and down
  4. 2695832Superfamily a.4.13: Sigma3 and sigma4 domains of RNA polymerase sigma factors [88659] (4 families) (S)
  5. 2695833Family a.4.13.1: Sigma3 domain [88660] (3 proteins)
  6. 2695845Protein Sigma70 [88661] (2 species)
  7. 2695849Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [88662] (11 PDB entries)
    Uniprot Q9WX78

PDB entries in Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]:

  1. Domain(s) for 1iw7:
    1. 2695860Domain d1iw7f1: 1iw7 F:258-318 [83086]
      Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p2, d1iw7p3
      complexed with mg, pb
    2. 2695861Domain d1iw7p1: 1iw7 P:258-318 [83089]
      Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7e_, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7o_, d1iw7p2, d1iw7p3
      complexed with mg, pb
  2. Domain(s) for 1smy:
    1. 2695850Domain d1smyf1: 1smy F:258-318 [105781]
      Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp2, d1smyp3
      complexed with g4p, mg, zn
    2. 2695851Domain d1smyp1: 1smy P:258-318 [105791]
      Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smye_, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyo_, d1smyp2, d1smyp3
      complexed with g4p, mg, zn
  3. Domain(s) for 2a68:
    1. 2695856Domain d2a68f1: 2a68 F:258-318 [126198]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68c_, d2a68d_, d2a68e_, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68m_, d2a68n_, d2a68o_, d2a68p2, d2a68p3
      automated match to d1smyf1
      protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
    2. 2695857Domain d2a68p1: 2a68 P:258-318 [126208]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68c_, d2a68d_, d2a68e_, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68m_, d2a68n_, d2a68o_, d2a68p2, d2a68p3
      automated match to d1smyf1
      protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
  4. Domain(s) for 2a69:
    1. 2695858Domain d2a69f1: 2a69 F:258-318 [126218]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69c_, d2a69d_, d2a69e_, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69m_, d2a69n_, d2a69o_, d2a69p2, d2a69p3
      automated match to d1smyf1
      protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
    2. 2695859Domain d2a69p1: 2a69 P:258-318 [126228]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69c_, d2a69d_, d2a69e_, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69m_, d2a69n_, d2a69o_, d2a69p2, d2a69p3
      automated match to d1smyf1
      protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
  5. Domain(s) for 2a6e:
    1. 2695864Domain d2a6ef1: 2a6e F:258-318 [126247]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ec_, d2a6ed_, d2a6ee_, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6em_, d2a6en_, d2a6eo_, d2a6ep2, d2a6ep3
      automated match to d1smyf1
      complexed with mg, zn
    2. 2695865Domain d2a6ep1: 2a6e P:258-318 [126257]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ec_, d2a6ed_, d2a6ee_, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6em_, d2a6en_, d2a6eo_, d2a6ep2, d2a6ep3
      automated match to d1smyf1
      complexed with mg, zn
  6. Domain(s) for 2a6h:
    1. 2695852Domain d2a6hf1: 2a6h F:258-318 [126267]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hc_, d2a6hd_, d2a6he_, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hm_, d2a6hn_, d2a6ho_, d2a6hp2, d2a6hp3
      automated match to d1smyf1
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
    2. 2695853Domain d2a6hp1: 2a6h P:258-318 [126277]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hc_, d2a6hd_, d2a6he_, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hm_, d2a6hn_, d2a6ho_, d2a6hp2, d2a6hp3
      automated match to d1smyf1
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
  7. Domain(s) for 2be5:
    1. 2695854Domain d2be5f1: 2be5 F:258-318 [128358]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5c_, d2be5d_, d2be5e_, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5m_, d2be5n_, d2be5o_, d2be5p2, d2be5p3
      automated match to d1smyf1
      protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
    2. 2695855Domain d2be5p1: 2be5 P:258-318 [128368]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5c_, d2be5d_, d2be5e_, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5m_, d2be5n_, d2be5o_, d2be5p2, d2be5p3
      automated match to d1smyf1
      protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
  8. Domain(s) for 2cw0:
    1. 2695868Domain d2cw0f1: 2cw0 F:258-318 [130905]
      Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p2, d2cw0p3
      automatically matched to d1iw7f1
      complexed with mg, zn
    2. 2695869Domain d2cw0p1: 2cw0 P:258-318 [130915]
      Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0e1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0o1, d2cw0p2, d2cw0p3
      automatically matched to d1iw7f1
      complexed with mg, zn
  9. Domain(s) for 3eql:
    1. 2695862Domain d3eqlf2: 3eql F:258-318 [199364]
      Other proteins in same PDB: d3eqla1, d3eqla2, d3eqlb1, d3eqlb2, d3eqlc_, d3eqld_, d3eqle_, d3eqlf1, d3eqlf3, d3eqlk1, d3eqlk2, d3eqll1, d3eqll2, d3eqlm_, d3eqln_, d3eqlo_, d3eqlp1, d3eqlp3
      automated match to d1smyf1
      protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
    2. 2695863Domain d3eqlp2: 3eql P:258-318 [199372]
      Other proteins in same PDB: d3eqla1, d3eqla2, d3eqlb1, d3eqlb2, d3eqlc_, d3eqld_, d3eqle_, d3eqlf1, d3eqlf3, d3eqlk1, d3eqlk2, d3eqll1, d3eqll2, d3eqlm_, d3eqln_, d3eqlo_, d3eqlp1, d3eqlp3
      automated match to d1smyf1
      protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
  10. Domain(s) for 5tmc:
  11. Domain(s) for 6cuu:

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