SCOPe 2.06: Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]

Lineage for Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]

Root: SCOPe 2.06
Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (33 superfamilies)
sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
some members of the fold have additional strands
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families)
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 proteins)
Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain [88625] (6 species)
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] [88628] (41 PDB entries)
Uniprot P04229 30-219
probably orthologous to the mouse I-E group

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]:

Domain(s) for 1a6a:
- Domain d1a6ab1: 1a6a B:93-191 [21616]
  Other proteins in same PDB: d1a6aa1, d1a6aa2, d1a6ab2
  complexed with nag
Domain(s) for 1aqd:
1. Domain d1aqdb1: 1aqd B:93-190 [21586]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
2. Domain d1aqde1: 1aqd E:93-190 [21588]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
3. Domain d1aqdh1: 1aqd H:93-190 [21590]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
4. Domain d1aqdk1: 1aqd K:93-191 [21592]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
Domain(s) for 1bx2:
1. Domain d1bx2b1: 1bx2 B:93-193 [21610]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d1, d1bx2d2, d1bx2e2
  complexed with nag
2. Domain d1bx2e1: 1bx2 E:93-191 [21612]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d1, d1bx2d2, d1bx2e2
  complexed with nag
Domain(s) for 1d5m:
- Domain d1d5mb1: 1d5m B:93-190 [21618]
  Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5ma2, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2
  complexed with nag
Domain(s) for 1d5x:
- Domain d1d5xb1: 1d5x B:93-190 [21624]
  Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xa2, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2
Domain(s) for 1d5z:
- Domain d1d5zb1: 1d5z B:93-190 [21620]
  Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5za2, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2
Domain(s) for 1d6e:
- Domain d1d6eb1: 1d6e B:93-190 [21622]
  Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6ea2, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2
Domain(s) for 1dlh:
1. Domain d1dlhb1: 1dlh B:93-190 [21598]
  Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhd2, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
2. Domain d1dlhe1: 1dlh E:93-190 [21600]
  Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhd2, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
Domain(s) for 1fv1:
1. Domain d1fv1b1: 1fv1 B:93-190 [21606]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d1, d1fv1d2, d1fv1e2
  complexed with gol, so4
2. Domain d1fv1e1: 1fv1 E:93-190 [21608]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d1, d1fv1d2, d1fv1e2
  complexed with gol, so4
Domain(s) for 1fyt:
- Domain d1fytb1: 1fyt B:93-190 [21596]
  Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fyta2, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
  complexed with nag
Domain(s) for 1h15:
1. Domain d1h15b1: 1h15 B:93-190 [76456]
  Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b2, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e2
  protein/DNA complex; complexed with nag
2. Domain d1h15e1: 1h15 E:93-190 [76460]
  Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b2, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e2
  protein/DNA complex; complexed with nag
Domain(s) for 1hqr:
- Domain d1hqrb1: 1hqr B:293-390 [21614]
  Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqra2, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2
  complexed with zn
Domain(s) for 1hxy:
- Domain d1hxyb1: 1hxy B:93-190 [61388]
  Other proteins in same PDB: d1hxya1, d1hxya2, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2
  complexed with zn
Domain(s) for 1j8h:
- Domain d1j8hb1: 1j8h B:93-190 [71604]
  Other proteins in same PDB: d1j8ha1, d1j8ha2, d1j8hb2, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
  complexed with nag, ndg
Domain(s) for 1jwm:
- Domain d1jwmb1: 1jwm B:93-190 [84238]
  Other proteins in same PDB: d1jwma1, d1jwma2, d1jwmb2, d1jwmd1, d1jwmd2
Domain(s) for 1jws:
- Domain d1jwsb1: 1jws B:93-190 [84244]
  Other proteins in same PDB: d1jwsa1, d1jwsa2, d1jwsb2, d1jwsd1, d1jwsd2
Domain(s) for 1jwu:
- Domain d1jwub1: 1jwu B:93-190 [84250]
  Other proteins in same PDB: d1jwua1, d1jwua2, d1jwub2, d1jwud1, d1jwud2
Domain(s) for 1kg0:
- Domain d1kg0b1: 1kg0 B:93-190 [72443]
  Other proteins in same PDB: d1kg0a1, d1kg0a2, d1kg0b2, d1kg0c_
Domain(s) for 1klg:
- Domain d1klgb1: 1klg B:93-190 [72716]
  Other proteins in same PDB: d1klga1, d1klga2, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2
  mutant
Domain(s) for 1klu:
- Domain d1klub1: 1klu B:93-190 [72726]
  Other proteins in same PDB: d1klua1, d1klua2, d1klub2, d1klud1, d1klud2
Domain(s) for 1lo5:
- Domain d1lo5b1: 1lo5 B:93-190 [78118]
  Other proteins in same PDB: d1lo5a1, d1lo5a2, d1lo5b2, d1lo5d1, d1lo5d2
Domain(s) for 1pyw:
- Domain d1pywb1: 1pyw B:93-190 [95379]
  Other proteins in same PDB: d1pywa1, d1pywa2, d1pywb2, d1pywd1, d1pywd2
Domain(s) for 1r5i:
1. Domain d1r5ib1: 1r5i B:93-190 [97089]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib2, d1r5id1, d1r5id2, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if2, d1r5ih1, d1r5ih2
  complexed with po4
2. Domain d1r5if1: 1r5i F:93-190 [97094]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib2, d1r5id1, d1r5id2, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if2, d1r5ih1, d1r5ih2
  complexed with po4
Domain(s) for 1seb:
1. Domain d1sebb1: 1seb B:93-192 [21602]
  Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
2. Domain d1sebf1: 1seb F:93-192 [21604]
  Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
Domain(s) for 1sje:
- Domain d1sjeb1: 1sje B:93-190 [105642]
  Other proteins in same PDB: d1sjea1, d1sjea2, d1sjeb2, d1sjed1, d1sjed2
Domain(s) for 1sjh:
- Domain d1sjhb1: 1sjh B:93-190 [105650]
  Other proteins in same PDB: d1sjha1, d1sjha2, d1sjhb2, d1sjhd1, d1sjhd2
Domain(s) for 1t5w:
1. Domain d1t5wb1: 1t5w B:93-190 [106483]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wa2, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5wd2, d1t5we2
2. Domain d1t5we1: 1t5w E:93-190 [106487]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wa2, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5wd2, d1t5we2
Domain(s) for 1t5x:
- Domain d1t5xb1: 1t5x B:93-190 [106491]
  Other proteins in same PDB: d1t5xa1, d1t5xa2, d1t5xb2, d1t5xd1, d1t5xd2
Domain(s) for 1ymm:
- Domain d1ymmb1: 1ymm B:93-189 [123703]
  Other proteins in same PDB: d1ymma1, d1ymma2, d1ymmb2, d1ymmd1, d1ymme1, d1ymme2
  automatically matched to d1bx2b1
  complexed with nag

Domain(s) for 1zgl:

Domain d1zglb1: 1zgl B:93-189 [125033]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1fv1b1

Domain d1zgle1: 1zgl E:93-189 [125037]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1fv1b1

Domain d1zglh1: 1zgl H:93-189 [125041]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1fv1b1

Domain d1zglk1: 1zgl K:93-189 [125045]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1fv1b1

Domain(s) for 2g9h:
- Domain d2g9hb1: 2g9h B:93-190 [134804]
  Other proteins in same PDB: d2g9ha1, d2g9ha2, d2g9hb2, d2g9hd1, d2g9hd2
  automatically matched to d1d5xb1
  complexed with dio, epe, so4, zn
Domain(s) for 2iam:
- Domain d2iamb1: 2iam B:93-190 [137160]
  Other proteins in same PDB: d2iama1, d2iama2, d2iamb2, d2iamc1, d2iamc2, d2iamd1, d2iamd2
  automated match to d1klub1
  mutant

Domain(s) for 2ian:

Domain d2ianb1: 2ian B:93-190 [137164]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub1
mutant

Domain d2iang1: 2ian G:93-190 [137168]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub1
mutant

Domain d2ianl1: 2ian L:93-190 [137172]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub1
mutant

Domain d2ianq1: 2ian Q:93-190 [137176]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub1
mutant

Domain(s) for 2icw:

Domain d2icwb1: 2icw B:93-190 [137245]
Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb2, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
automatically matched to d1d5xb1

Domain d2icwe1: 2icw E:93-190 [137249]
Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb2, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
automatically matched to d1d5xb1

Domain(s) for 2ipk:
- Domain d2ipkb1: 2ipk B:93-190 [137579]
  Other proteins in same PDB: d2ipka1, d2ipka2, d2ipkb2, d2ipkd1, d2ipkd2
  automatically matched to d1d5xb1
Domain(s) for 2nna:
- Domain d2nnab1: 2nna B:93-190 [148315]
  Other proteins in same PDB: d2nnab2, d2nnab3
  automatically matched to d1bx2b1
Domain(s) for 2oje:
1. Domain d2ojeb1: 2oje B:93-190 [139105]
  Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef2, d2ojeh1
  automatically matched to d1d5xb1
  complexed with po4
2. Domain d2ojef1: 2oje F:93-190 [139110]
  Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef2, d2ojeh1
  automatically matched to d1d5xb1
  complexed with po4
Domain(s) for 2seb:
- Domain d2sebb1: 2seb B:93-190 [21594]
  Other proteins in same PDB: d2seba1, d2seba2, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
  complexed with nag

Domain(s) for 4e41:

Domain d4e41b2: 4e41 B:93-190 [220251]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41a2, d4e41b1, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41f2, d4e41g1, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1klub1
complexed with na; mutant

Domain d4e41g2: 4e41 G:93-190 [220259]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41a2, d4e41b1, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41f2, d4e41g1, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1klub1
complexed with na; mutant

Domain(s) for 4i5b:
1. Domain d4i5bb2: 4i5b B:93-193 [234813]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5ba2, d4i5bb1, d4i5bd1, d4i5bd2, d4i5be1
  automated match to d4i5be2
2. Domain d4i5be2: 4i5b E:93-191 [229428]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5ba2, d4i5bb1, d4i5bd1, d4i5bd2, d4i5be1
  automated match to d1sebb1
Domain(s) for 5lax:
1. Domain d5laxb2: 5lax B:93-190 [327023]
  Other proteins in same PDB: d5laxa1, d5laxa2, d5laxa3, d5laxb1, d5laxb3, d5laxc1, d5laxc2, d5laxd1, d5laxd3
  automated match to d1sebb1
  complexed with mla
2. Domain d5laxd2: 5lax D:93-190 [327005]
  Other proteins in same PDB: d5laxa1, d5laxa2, d5laxa3, d5laxb1, d5laxb3, d5laxc1, d5laxc2, d5laxd1, d5laxd3
  automated match to d1sebb1
  complexed with mla

More info for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC beta chain, C-terminal domain

Timeline for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC beta chain, C-terminal domain:

Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC beta chain, C-terminal domain first appeared in SCOP 1.65
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC beta chain, C-terminal domain appears in SCOPe 2.05
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC beta chain, C-terminal domain appears in SCOPe 2.07
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC beta chain, C-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08