Lineage for Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2017114Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2017115Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (33 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 2017116Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families) (S)
  5. 2020524Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 protein domains)
  6. 2022117Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain [88625] (6 species)
  7. 2022125Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] [88628] (41 PDB entries)
    Uniprot P04229 30-219
    probably orthologous to the mouse I-E group

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]:

  1. Domain(s) for 1a6a:
  2. Domain(s) for 1aqd:
    1. 2022142Domain d1aqdb1: 1aqd B:93-190 [21586]
      Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
    2. 2022143Domain d1aqde1: 1aqd E:93-190 [21588]
      Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
    3. 2022144Domain d1aqdh1: 1aqd H:93-190 [21590]
      Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
    4. 2022145Domain d1aqdk1: 1aqd K:93-191 [21592]
      Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
  3. Domain(s) for 1bx2:
    1. 2022170Domain d1bx2b1: 1bx2 B:93-193 [21610]
      Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d1, d1bx2d2, d1bx2e2
      complexed with nag
    2. 2022171Domain d1bx2e1: 1bx2 E:93-191 [21612]
      Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d1, d1bx2d2, d1bx2e2
      complexed with nag
  4. Domain(s) for 1d5m:
  5. Domain(s) for 1d5x:
  6. Domain(s) for 1d5z:
  7. Domain(s) for 1d6e:
  8. Domain(s) for 1dlh:
    1. 2022168Domain d1dlhb1: 1dlh B:93-190 [21598]
      Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhd2, d1dlhe2
      complexed with nag, ndg
    2. 2022169Domain d1dlhe1: 1dlh E:93-190 [21600]
      Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhd2, d1dlhe2
      complexed with nag, ndg
  9. Domain(s) for 1fv1:
    1. 2022127Domain d1fv1b1: 1fv1 B:93-190 [21606]
      Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d1, d1fv1d2, d1fv1e2
      complexed with gol, so4
    2. 2022128Domain d1fv1e1: 1fv1 E:93-190 [21608]
      Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d1, d1fv1d2, d1fv1e2
      complexed with gol, so4
  10. Domain(s) for 1fyt:
  11. Domain(s) for 1h15:
    1. 2022177Domain d1h15b1: 1h15 B:93-190 [76456]
      Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b2, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e2
      protein/DNA complex; complexed with nag
    2. 2022178Domain d1h15e1: 1h15 E:93-190 [76460]
      Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b2, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e2
      protein/DNA complex; complexed with nag
  12. Domain(s) for 1hqr:
  13. Domain(s) for 1hxy:
  14. Domain(s) for 1j8h:
  15. Domain(s) for 1jwm:
  16. Domain(s) for 1jws:
  17. Domain(s) for 1jwu:
  18. Domain(s) for 1kg0:
  19. Domain(s) for 1klg:
  20. Domain(s) for 1klu:
  21. Domain(s) for 1lo5:
  22. Domain(s) for 1pyw:
  23. Domain(s) for 1r5i:
    1. 2022161Domain d1r5ib1: 1r5i B:93-190 [97089]
      Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib2, d1r5id1, d1r5id2, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if2, d1r5ih1, d1r5ih2
      complexed with po4
    2. 2022162Domain d1r5if1: 1r5i F:93-190 [97094]
      Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib2, d1r5id1, d1r5id2, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if2, d1r5ih1, d1r5ih2
      complexed with po4
  24. Domain(s) for 1seb:
    1. 2022175Domain d1sebb1: 1seb B:93-192 [21602]
      Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
    2. 2022176Domain d1sebf1: 1seb F:93-192 [21604]
      Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
  25. Domain(s) for 1sje:
  26. Domain(s) for 1sjh:
  27. Domain(s) for 1t5w:
    1. 2022146Domain d1t5wb1: 1t5w B:93-190 [106483]
      Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wa2, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5wd2, d1t5we2
    2. 2022147Domain d1t5we1: 1t5w E:93-190 [106487]
      Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wa2, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5wd2, d1t5we2
  28. Domain(s) for 1t5x:
  29. Domain(s) for 1ymm:
  30. Domain(s) for 1zgl:
    1. 2022181Domain d1zglb1: 1zgl B:93-189 [125033]
      Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1fv1b1
    2. 2022182Domain d1zgle1: 1zgl E:93-189 [125037]
      Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1fv1b1
    3. 2022183Domain d1zglh1: 1zgl H:93-189 [125041]
      Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1fv1b1
    4. 2022184Domain d1zglk1: 1zgl K:93-189 [125045]
      Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1fv1b1
  31. Domain(s) for 2g9h:
  32. Domain(s) for 2iam:
  33. Domain(s) for 2ian:
    1. 2022164Domain d2ianb1: 2ian B:93-190 [137164]
      Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
      automated match to d1klub1
      mutant
    2. 2022165Domain d2iang1: 2ian G:93-190 [137168]
      Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
      automated match to d1klub1
      mutant
    3. 2022166Domain d2ianl1: 2ian L:93-190 [137172]
      Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
      automated match to d1klub1
      mutant
    4. 2022167Domain d2ianq1: 2ian Q:93-190 [137176]
      Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
      automated match to d1klub1
      mutant
  34. Domain(s) for 2icw:
    1. 2022154Domain d2icwb1: 2icw B:93-190 [137245]
      Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb2, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
      automatically matched to d1d5xb1
    2. 2022155Domain d2icwe1: 2icw E:93-190 [137249]
      Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb2, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
      automatically matched to d1d5xb1
  35. Domain(s) for 2ipk:
  36. Domain(s) for 2nna:
  37. Domain(s) for 2oje:
    1. 2022172Domain d2ojeb1: 2oje B:93-190 [139105]
      Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef2, d2ojeh1
      automatically matched to d1d5xb1
      complexed with po4
    2. 2022173Domain d2ojef1: 2oje F:93-190 [139110]
      Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef2, d2ojeh1
      automatically matched to d1d5xb1
      complexed with po4
  38. Domain(s) for 2seb:
  39. Domain(s) for 4e41:
    1. 2022150Domain d4e41b2: 4e41 B:93-190 [220251]
      Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41a2, d4e41b1, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41f2, d4e41g1, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
      automated match to d1klub1
      complexed with na; mutant
    2. 2022151Domain d4e41g2: 4e41 G:93-190 [220259]
      Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41a2, d4e41b1, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41f2, d4e41g1, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
      automated match to d1klub1
      complexed with na; mutant
  40. Domain(s) for 4i5b:
    1. 2022156Domain d4i5bb2: 4i5b B:93-193 [234813]
      Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5ba2, d4i5bb1, d4i5bd1, d4i5bd2, d4i5be1
      automated match to d4i5be2
    2. 2022157Domain d4i5be2: 4i5b E:93-191 [229428]
      Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5ba2, d4i5bb1, d4i5bd1, d4i5bd2, d4i5be1
      automated match to d1sebb1
  41. Domain(s) for 5lax:
    1. 2283704Domain d5laxd2: 5lax D:93-190 [327005]
      Other proteins in same PDB: d5laxa1, d5laxa2, d5laxa3, d5laxb1, d5laxb3, d5laxc1, d5laxc2, d5laxd1, d5laxd3
      automated match to d1sebb1
      complexed with mla
    2. 2283722Domain d5laxb2: 5lax B:93-190 [327023]
      Other proteins in same PDB: d5laxa1, d5laxa2, d5laxa3, d5laxb1, d5laxb3, d5laxc1, d5laxc2, d5laxd1, d5laxd3
      automated match to d1sebb1
      complexed with mla

More info for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC beta chain, C-terminal domain

Timeline for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC beta chain, C-terminal domain: