SCOPe 2.08: Species: Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId: 10090]

Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId: 10090]

Root: SCOPe 2.08
Class b: All beta proteins [48724] (180 folds)
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (33 superfamilies)
sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
some members of the fold have additional strands
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families)
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 proteins)
Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain [88618] (7 species)
Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] [88624] (32 PDB entries)
probably orthologous to the human HLA-DQ group

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId: 10090]:

Domain(s) for 1d9k:
1. Domain d1d9kc1: 1d9k C:82-182 [21627]
  Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
  complexed with nag
2. Domain d1d9kg1: 1d9k G:82-182 [21629]
  Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
  complexed with nag
Domain(s) for 1es0:
- Domain d1es0a1: 1es0 A:83-178 [21643]
  Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0a3, d1es0b1, d1es0b2, d1es0b3
  contains covalently bound peptides
Domain(s) for 1f3j:
1. Domain d1f3ja1: 1f3j A:83-181 [21645]
  Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je1, d1f3je2
  complexed with nag
2. Domain d1f3jd1: 1f3j D:83-181 [21647]
  Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je1, d1f3je2
  complexed with nag
Domain(s) for 1iak:
- Domain d1iaka1: 1iak A:82-181 [21625]
  Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb1, d1iakb2
  complexed with nag
Domain(s) for 1iao:
- Domain d1iaoa1: 1iao A:83-178 [21641]
  Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob1, d1iaob2, d1iaob3
  complexed with nag
Domain(s) for 1jl4:
- Domain d1jl4a1: 1jl4 A:82-181 [63157]
  Other proteins in same PDB: d1jl4a2, d1jl4b1, d1jl4b2, d1jl4b3, d1jl4d1, d1jl4d2
Domain(s) for 1k2d:
- Domain d1k2da1: 1k2d A:82-181 [84291]
  Other proteins in same PDB: d1k2da2, d1k2da3, d1k2db1, d1k2db2
  complexed with nag
Domain(s) for 1lnu:
1. Domain d1lnua1: 1lnu A:84-182 [74097]
  Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
  complexed with nag
2. Domain d1lnuc1: 1lnu C:84-182 [74101]
  Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
  complexed with nag
3. Domain d1lnue1: 1lnu E:84-182 [74105]
  Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
  complexed with nag
4. Domain d1lnug1: 1lnu G:84-182 [74109]
  Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
  complexed with nag
Domain(s) for 1muj:
- Domain d1muja1: 1muj A:84-178 [79488]
  Other proteins in same PDB: d1muja2, d1muja3, d1mujb1, d1mujb2, d1mujb3
  complexed with nag
Domain(s) for 1u3h:
1. Domain d1u3hc1: 1u3h C:82-181 [119510]
  Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc2, d1u3hc3, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg2, d1u3hg3, d1u3hh1, d1u3hh2
  automated match to d2p24a1
2. Domain d1u3hg1: 1u3h G:82-181 [119514]
  Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc2, d1u3hc3, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg2, d1u3hg3, d1u3hh1, d1u3hh2
  automated match to d2p24a1
Domain(s) for 1ymm:
- Domain d1ymma1: 1ymm A:83-179 [123701]
  Other proteins in same PDB: d1ymma2, d1ymmb1, d1ymmb2, d1ymmd1, d1ymme1, d1ymme2
  automatically matched to d1k2da1
  complexed with nag

Domain(s) for 1zgl:

Domain d1zgla1: 1zgl A:83-179 [125031]
Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1k2da1

Domain d1zgld1: 1zgl D:83-179 [125035]
Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1k2da1

Domain d1zglg1: 1zgl G:83-179 [125039]
Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1k2da1

Domain d1zglj1: 1zgl J:83-179 [125043]
Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1k2da1

Domain(s) for 2g9h:
- Domain d2g9ha1: 2g9h A:83-179 [134802]
  Other proteins in same PDB: d2g9ha2, d2g9ha3, d2g9hb1, d2g9hb2, d2g9hd1, d2g9hd2
  automatically matched to d1k2da1
  complexed with dio, epe, so4, zn
Domain(s) for 2iad:
- Domain d2iada1: 2iad A:83-178 [21639]
  Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iada3, d2iadb1, d2iadb2
  contains covalently bound peptides

Domain(s) for 2icw:

Domain d2icwa1: 2icw A:83-179 [137243]
Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
automatically matched to d1k2da1

Domain d2icwd1: 2icw D:83-179 [137247]
Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
automatically matched to d1k2da1

Domain(s) for 2ipk:
- Domain d2ipka1: 2ipk A:83-179 [137577]
  Other proteins in same PDB: d2ipka2, d2ipkb1, d2ipkb2, d2ipkd1, d2ipkd2
  automatically matched to d1k2da1
Domain(s) for 2oje:
1. Domain d2ojea1: 2oje A:83-179 [139103]
  Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1
  automatically matched to d1k2da1
  complexed with po4
2. Domain d2ojee1: 2oje E:83-179 [139108]
  Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1
  automatically matched to d1k2da1
  complexed with po4
Domain(s) for 2p24:
- Domain d2p24a1: 2p24 A:82-181 [149169]
  Other proteins in same PDB: d2p24a2, d2p24a3
  automated match to d1d9kc1
Domain(s) for 2pxy:
- Domain d2pxyc1: 2pxy C:82-180 [149922]
  Other proteins in same PDB: d2pxya_, d2pxyb_, d2pxyc2, d2pxyc3, d2pxyd1, d2pxyd2
  automatically matched to d1k2da1
Domain(s) for 2z31:
- Domain d2z31c1: 2z31 C:82-180 [153951]
  Other proteins in same PDB: d2z31a_, d2z31b_, d2z31c2, d2z31c3, d2z31d1, d2z31d2
  automatically matched to d1k2da1

Domain(s) for 3c5z:

Domain d3c5zc1: 3c5z C:84-182 [155953]
Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5zd2, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg2, d3c5zh1, d3c5zh2
automated match to d1lnua1

Domain d3c5zg1: 3c5z G:84-182 [155957]
Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5zd2, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg2, d3c5zh1, d3c5zh2
automated match to d1lnua1

Domain(s) for 3c60:

Domain d3c60c1: 3c60 C:83-182 [155961]
Other proteins in same PDB: d3c60a1, d3c60a2, d3c60b1, d3c60b2, d3c60c2, d3c60d1, d3c60d2, d3c60e1, d3c60e2, d3c60f1, d3c60f2, d3c60g2, d3c60h1, d3c60h2
automated match to d1k2da1

Domain d3c60g1: 3c60 G:83-182 [155965]
Other proteins in same PDB: d3c60a1, d3c60a2, d3c60b1, d3c60b2, d3c60c2, d3c60d1, d3c60d2, d3c60e1, d3c60e2, d3c60f1, d3c60f2, d3c60g2, d3c60h1, d3c60h2
automated match to d1k2da1

Domain(s) for 3c6l:

Domain d3c6lc1: 3c6l C:83-182 [155979]
Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6ld2, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg2, d3c6lh1, d3c6lh2
automatically matched to d1k2da1
complexed with ca

Domain d3c6lg1: 3c6l G:83-182 [155985]
Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6ld2, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg2, d3c6lh1, d3c6lh2
automatically matched to d1k2da1
complexed with ca

Domain(s) for 3cup:
- Domain d3cupa2: 3cup A:84-178 [245562]
  Other proteins in same PDB: d3cupa1, d3cupa3
  automated match to d1muja1
  complexed with epe, nag
Domain(s) for 4p46:
- Domain d4p46c2: 4p46 C:82-178 [257418]
  Other proteins in same PDB: d4p46a1, d4p46a2, d4p46b1, d4p46b2, d4p46c1, d4p46d1, d4p46d2
  automated match to d1k2da1
Domain(s) for 6blq:
- Domain d6blqa2: 6blq A:83-180 [342999]
  Other proteins in same PDB: d6blqa1
  automated match to d1f3ja1
  complexed with edo, ipa, nag
Domain(s) for 6blx:
- Domain d6blxa2: 6blx A:85-182 [342994]
  Other proteins in same PDB: d6blxa1
  automated match to d1f3ja1
  complexed with edo, fmt, nag
Domain(s) for 6dfs:
- Domain d6dfsc2: 6dfs C:84-182 [367790]
  Other proteins in same PDB: d6dfsa1, d6dfsa2, d6dfsb1, d6dfsb2, d6dfsc1
  automated match to d5ujta2
  complexed with nag
Domain(s) for 6mng:
- Domain d6mngc2: 6mng C:82-178 [370693]
  Other proteins in same PDB: d6mnga1, d6mnga2, d6mngb1, d6mngb2, d6mngc1
  automated match to d1d9kc1
Domain(s) for 6mnm:
- Domain d6mnmc2: 6mnm C:82-178 [370680]
  Other proteins in same PDB: d6mnma1, d6mnma2, d6mnmb1, d6mnmb2, d6mnmc1, d6mnmc3
  automated match to d1d9kc1
Domain(s) for 6mnn:
- Domain d6mnnc2: 6mnn C:82-178 [370670]
  Other proteins in same PDB: d6mnna1, d6mnna2, d6mnnb1, d6mnnb2, d6mnnc1
  automated match to d1d9kc1
Domain(s) for 6mno:
- Domain d6mnoc2: 6mno C:82-178 [370623]
  Other proteins in same PDB: d6mnoa1, d6mnoa2, d6mnob1, d6mnob2, d6mnoc1
  automated match to d1d9kc1

More info for Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain

Timeline for Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain:

Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain first appeared in SCOP 1.65
Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain appears in SCOPe 2.07