Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId: 10090]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2017114Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2017115Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (33 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 2017116Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families) (S)
  5. 2020524Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 protein domains)
  6. 2021990Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain [88618] (6 species)
  7. 2022056Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] [88624] (25 PDB entries)
    probably orthologous to the human HLA-DQ group

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId: 10090]:

  1. Domain(s) for 1d9k:
    1. 2022092Domain d1d9kc1: 1d9k C:82-182 [21627]
      Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
      complexed with ndg
    2. 2022093Domain d1d9kg1: 1d9k G:82-182 [21629]
      Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
      complexed with ndg
  2. Domain(s) for 1es0:
  3. Domain(s) for 1f3j:
    1. 2022082Domain d1f3ja1: 1f3j A:83-181 [21645]
      Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je1, d1f3je2
      complexed with nag
    2. 2022083Domain d1f3jd1: 1f3j D:83-181 [21647]
      Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je1, d1f3je2
      complexed with nag
  4. Domain(s) for 1iak:
  5. Domain(s) for 1iao:
  6. Domain(s) for 1jl4:
  7. Domain(s) for 1k2d:
  8. Domain(s) for 1lnu:
    1. 2022069Domain d1lnua1: 1lnu A:84-182 [74097]
      Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
      complexed with nag, ndg
    2. 2022070Domain d1lnuc1: 1lnu C:84-182 [74101]
      Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
      complexed with nag, ndg
    3. 2022071Domain d1lnue1: 1lnu E:84-182 [74105]
      Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
      complexed with nag, ndg
    4. 2022072Domain d1lnug1: 1lnu G:84-182 [74109]
      Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
      complexed with nag, ndg
  9. Domain(s) for 1muj:
  10. Domain(s) for 1u3h:
    1. 2022065Domain d1u3hc1: 1u3h C:82-181 [119510]
      Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc2, d1u3hc3, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg2, d1u3hg3, d1u3hh1, d1u3hh2
      automated match to d2p24a1
    2. 2022066Domain d1u3hg1: 1u3h G:82-181 [119514]
      Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc2, d1u3hc3, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg2, d1u3hg3, d1u3hh1, d1u3hh2
      automated match to d2p24a1
  11. Domain(s) for 1ymm:
  12. Domain(s) for 1zgl:
    1. 2022086Domain d1zgla1: 1zgl A:83-179 [125031]
      Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1k2da1
    2. 2022087Domain d1zgld1: 1zgl D:83-179 [125035]
      Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1k2da1
    3. 2022088Domain d1zglg1: 1zgl G:83-179 [125039]
      Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1k2da1
    4. 2022089Domain d1zglj1: 1zgl J:83-179 [125043]
      Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1k2da1
  13. Domain(s) for 2g9h:
  14. Domain(s) for 2iad:
  15. Domain(s) for 2icw:
    1. 2022067Domain d2icwa1: 2icw A:83-179 [137243]
      Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
      automatically matched to d1k2da1
    2. 2022068Domain d2icwd1: 2icw D:83-179 [137247]
      Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
      automatically matched to d1k2da1
  16. Domain(s) for 2ipk:
  17. Domain(s) for 2oje:
    1. 2022076Domain d2ojea1: 2oje A:83-179 [139103]
      Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1
      automatically matched to d1k2da1
      complexed with po4
    2. 2022077Domain d2ojee1: 2oje E:83-179 [139108]
      Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1
      automatically matched to d1k2da1
      complexed with po4
  18. Domain(s) for 2p24:
  19. Domain(s) for 2pxy:
  20. Domain(s) for 2z31:
  21. Domain(s) for 3c5z:
    1. 2022073Domain d3c5zc1: 3c5z C:84-182 [155953]
      Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5zd2, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg2, d3c5zh1, d3c5zh2
      automated match to d1lnua1
    2. 2022074Domain d3c5zg1: 3c5z G:84-182 [155957]
      Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5zd2, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg2, d3c5zh1, d3c5zh2
      automated match to d1lnua1
  22. Domain(s) for 3c60:
    1. 2022084Domain d3c60c1: 3c60 C:83-182 [155961]
      Other proteins in same PDB: d3c60a1, d3c60a2, d3c60b1, d3c60b2, d3c60c2, d3c60d1, d3c60d2, d3c60e1, d3c60e2, d3c60f1, d3c60f2, d3c60g2, d3c60h1, d3c60h2
      automated match to d1k2da1
    2. 2022085Domain d3c60g1: 3c60 G:83-182 [155965]
      Other proteins in same PDB: d3c60a1, d3c60a2, d3c60b1, d3c60b2, d3c60c2, d3c60d1, d3c60d2, d3c60e1, d3c60e2, d3c60f1, d3c60f2, d3c60g2, d3c60h1, d3c60h2
      automated match to d1k2da1
  23. Domain(s) for 3c6l:
    1. 2022090Domain d3c6lc1: 3c6l C:83-182 [155979]
      Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6ld2, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg2, d3c6lh1, d3c6lh2
      automatically matched to d1k2da1
      complexed with ca
    2. 2022091Domain d3c6lg1: 3c6l G:83-182 [155985]
      Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6ld2, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg2, d3c6lh1, d3c6lh2
      automatically matched to d1k2da1
      complexed with ca
  24. Domain(s) for 3cup:
  25. Domain(s) for 4p46:

More info for Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain

Timeline for Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain: