SCOPe 2.05: Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]

Lineage for Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]

Root: SCOPe 2.05
Class b: All beta proteins [48724] (176 folds)
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (31 superfamilies)
sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
some members of the fold have additional strands
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families)
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 proteins)
Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain [88618] (6 species)
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] [88621] (37 PDB entries)
Uniprot P01903 28-207
probably orthologous to the mouse I-E group

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]:

Domain(s) for 1a6a:
- Domain d1a6aa1: 1a6a A:82-180 [21615]
  Other proteins in same PDB: d1a6aa2, d1a6ab1, d1a6ab2
  complexed with nag
Domain(s) for 1aqd:
1. Domain d1aqda1: 1aqd A:82-181 [21585]
  Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
2. Domain d1aqdd1: 1aqd D:82-179 [21587]
  Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
3. Domain d1aqdg1: 1aqd G:82-179 [21589]
  Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
4. Domain d1aqdj1: 1aqd J:82-179 [21591]
  Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
Domain(s) for 1bx2:
1. Domain d1bx2a1: 1bx2 A:82-181 [21609]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b1, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e1, d1bx2e2
  complexed with nag
2. Domain d1bx2d1: 1bx2 D:82-181 [21611]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b1, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e1, d1bx2e2
  complexed with nag
Domain(s) for 1d5m:
- Domain d1d5ma1: 1d5m A:82-181 [21617]
  Other proteins in same PDB: d1d5ma2, d1d5mb1, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2
  complexed with nag
Domain(s) for 1d5x:
- Domain d1d5xa1: 1d5x A:82-181 [21623]
  Other proteins in same PDB: d1d5xa2, d1d5xb1, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2
Domain(s) for 1d5z:
- Domain d1d5za1: 1d5z A:82-180 [21619]
  Other proteins in same PDB: d1d5za2, d1d5zb1, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2
Domain(s) for 1d6e:
- Domain d1d6ea1: 1d6e A:82-180 [21621]
  Other proteins in same PDB: d1d6ea2, d1d6eb1, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2
Domain(s) for 1dlh:
1. Domain d1dlha1: 1dlh A:82-182 [21597]
  Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe1, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
2. Domain d1dlhd1: 1dlh D:82-182 [21599]
  Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe1, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
Domain(s) for 1fv1:
1. Domain d1fv1a1: 1fv1 A:82-181 [21605]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b1, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e1, d1fv1e2
  complexed with gol, so4
2. Domain d1fv1d1: 1fv1 D:82-181 [21607]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b1, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e1, d1fv1e2
  complexed with gol, so4
Domain(s) for 1fyt:
- Domain d1fyta1: 1fyt A:82-181 [21595]
  Other proteins in same PDB: d1fyta2, d1fytb1, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
  complexed with nag
Domain(s) for 1h15:
1. Domain d1h15a1: 1h15 A:82-182 [76454]
  Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e1, d1h15e2
  protein/DNA complex; complexed with nag
2. Domain d1h15d1: 1h15 D:82-182 [76458]
  Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e1, d1h15e2
  protein/DNA complex; complexed with nag
Domain(s) for 1hqr:
- Domain d1hqra1: 1hqr A:82-181 [21613]
  Other proteins in same PDB: d1hqra2, d1hqrb1, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2
  complexed with zn
Domain(s) for 1hxy:
- Domain d1hxya1: 1hxy A:82-182 [61386]
  Other proteins in same PDB: d1hxya2, d1hxyb1, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2
  complexed with zn
Domain(s) for 1j8h:
- Domain d1j8ha1: 1j8h A:82-181 [71602]
  Other proteins in same PDB: d1j8ha2, d1j8hb1, d1j8hb2, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
  complexed with nag, ndg
Domain(s) for 1jwm:
- Domain d1jwma1: 1jwm A:82-182 [84236]
  Other proteins in same PDB: d1jwma2, d1jwmb1, d1jwmb2, d1jwmd1, d1jwmd2
Domain(s) for 1jws:
- Domain d1jwsa1: 1jws A:82-182 [84242]
  Other proteins in same PDB: d1jwsa2, d1jwsb1, d1jwsb2, d1jwsd1, d1jwsd2
Domain(s) for 1jwu:
- Domain d1jwua1: 1jwu A:82-182 [84248]
  Other proteins in same PDB: d1jwua2, d1jwub1, d1jwub2, d1jwud1, d1jwud2
Domain(s) for 1kg0:
- Domain d1kg0a1: 1kg0 A:82-182 [72441]
  Other proteins in same PDB: d1kg0a2, d1kg0b1, d1kg0b2, d1kg0c_
Domain(s) for 1klg:
- Domain d1klga1: 1klg A:82-180 [72714]
  Other proteins in same PDB: d1klga2, d1klgb1, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2
  mutant
Domain(s) for 1klu:
- Domain d1klua1: 1klu A:82-182 [72724]
  Other proteins in same PDB: d1klua2, d1klub1, d1klub2, d1klud1, d1klud2
Domain(s) for 1lo5:
- Domain d1lo5a1: 1lo5 A:82-182 [78116]
  Other proteins in same PDB: d1lo5a2, d1lo5b1, d1lo5b2, d1lo5d1, d1lo5d2
Domain(s) for 1pyw:
- Domain d1pywa1: 1pyw A:82-182 [95377]
  Other proteins in same PDB: d1pywa2, d1pywb1, d1pywb2, d1pywd1, d1pywd2
Domain(s) for 1r5i:
1. Domain d1r5ia1: 1r5i A:82-181 [97087]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5ib2, d1r5id_, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5if2, d1r5ih_
  complexed with po4
2. Domain d1r5ie1: 1r5i E:82-181 [97092]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5ib2, d1r5id_, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5if2, d1r5ih_
  complexed with po4
Domain(s) for 1seb:
1. Domain d1seba1: 1seb A:82-181 [21601]
  Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
2. Domain d1sebe1: 1seb E:82-181 [21603]
  Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
Domain(s) for 1sje:
- Domain d1sjea1: 1sje A:82-181 [105640]
  Other proteins in same PDB: d1sjea2, d1sjeb1, d1sjeb2, d1sjed1, d1sjed2
Domain(s) for 1sjh:
- Domain d1sjha1: 1sjh A:82-181 [105648]
  Other proteins in same PDB: d1sjha2, d1sjhb1, d1sjhb2, d1sjhd1, d1sjhd2
Domain(s) for 1t5w:
1. Domain d1t5wa1: 1t5w A:82-181 [106481]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa2, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd2, d1t5we1, d1t5we2
2. Domain d1t5wd1: 1t5w D:82-181 [106485]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa2, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd2, d1t5we1, d1t5we2
Domain(s) for 1t5x:
- Domain d1t5xa1: 1t5x A:82-181 [106489]
  Other proteins in same PDB: d1t5xa2, d1t5xb1, d1t5xb2, d1t5xd1, d1t5xd2
Domain(s) for 2iam:
- Domain d2iama1: 2iam A:82-181 [137158]
  Other proteins in same PDB: d2iama2, d2iamb1, d2iamb2, d2iamc1, d2iamc2, d2iamd1, d2iamd2
  automated match to d1jwua1
  mutant

Domain(s) for 2ian:

Domain d2iana1: 2ian A:82-181 [137162]
Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1pywa1
mutant

Domain d2ianf1: 2ian F:82-181 [137166]
Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1jwua1
mutant

Domain d2iank1: 2ian K:82-181 [137170]
Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1jwua1
mutant

Domain d2ianp1: 2ian P:82-181 [137174]
Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1jwua1
mutant

Domain(s) for 2seb:
- Domain d2seba1: 2seb A:82-180 [21593]
  Other proteins in same PDB: d2seba2, d2sebb1, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
  complexed with nag
Domain(s) for 3c5j:
- Domain d3c5ja2: 3c5j A:82-180 [208794]
  Other proteins in same PDB: d3c5ja1, d3c5jb1, d3c5jb2
  automated match to d1fv1a1
  complexed with nag, so4
Domain(s) for 3o6f:
1. Domain d3o6fa2: 3o6f A:82-181 [214201]
  Other proteins in same PDB: d3o6fa1, d3o6fc1, d3o6fc2, d3o6fd1, d3o6fd2, d3o6fe1, d3o6fg1, d3o6fg2, d3o6fh1, d3o6fh2
  automated match to d1pywa1
2. Domain d3o6fe2: 3o6f E:82-180 [214207]
  Other proteins in same PDB: d3o6fa1, d3o6fc1, d3o6fc2, d3o6fd1, d3o6fd2, d3o6fe1, d3o6fg1, d3o6fg2, d3o6fh1, d3o6fh2
  automated match to d1jwua1

Domain(s) for 4e41:

Domain d4e41a2: 4e41 A:82-181 [220249]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41b1, d4e41b2, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41g1, d4e41g2, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1jwua1
complexed with na; mutant

Domain d4e41f2: 4e41 F:82-181 [220257]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41b1, d4e41b2, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41g1, d4e41g2, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1jwua1
complexed with na; mutant

Domain(s) for 4h25:
1. Domain d4h25a2: 4h25 A:82-182 [228335]
  Other proteins in same PDB: d4h25a1, d4h25b1, d4h25b2, d4h25d1, d4h25e1, d4h25e2
  automated match to d1kg0a1
  complexed with ipa
2. Domain d4h25d2: 4h25 D:82-182 [228337]
  Other proteins in same PDB: d4h25a1, d4h25b1, d4h25b2, d4h25d1, d4h25e1, d4h25e2
  automated match to d1kg0a1
  complexed with ipa
Domain(s) for 4h26:
1. Domain d4h26a2: 4h26 A:82-181 [228341]
  Other proteins in same PDB: d4h26a1, d4h26b1, d4h26b2, d4h26d1, d4h26e1, d4h26e2
  automated match to d1fv1a1
2. Domain d4h26d2: 4h26 D:82-181 [228340]
  Other proteins in same PDB: d4h26a1, d4h26b1, d4h26b2, d4h26d1, d4h26e1, d4h26e2
  automated match to d1fv1a1
Domain(s) for 4i5b:
1. Domain d4i5ba2: 4i5b A:82-181 [234811]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5bb1, d4i5bb2, d4i5bd1, d4i5be1, d4i5be2
  automated match to d4i5bd2
2. Domain d4i5bd2: 4i5b D:82-188 [229425]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5bb1, d4i5bb2, d4i5bd1, d4i5be1, d4i5be2
  automated match to d1fv1a1

More info for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain

Timeline for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain:

Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain first appeared in SCOP 1.65
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain appears in SCOPe 2.04
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain appears in SCOPe 2.06
Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08