Lineage for Species: Human (Homo sapiens), cluster 1

  1. Root: SCOP 1.69
  2. 450777Class b: All beta proteins [48724] (144 folds)
  3. 450778Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (23 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 450779Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 450780Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (27 proteins)
  6. 450916Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH [88543] (20 species)
    VH domains of human and mouse antibodies are clustered by the sequence similarity within the germline encoded segment and then by the size of the complementarity determining regions CDR1 and CDR2, so the clusters may correspond to putative germline families in the species genomes; VH domains with artificial or grafted exogenous CDRs are listed as engineered species
  7. 450971Species Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] [88544] (16 PDB entries)

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens), cluster 1:

  1. Domain(s) for 1g9m:
  2. Domain(s) for 1g9n:
  3. Domain(s) for 1gc1:
  4. Domain(s) for 1hzh:
    1. 450988Domain d1hzhh1: 1hzh H:1-113 [61437]
      Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2
    2. 450989Domain d1hzhk1: 1hzh K:1-113 [61441]
      Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2
      part of intact IgG B12 antibody
  5. Domain(s) for 1iqd:
  6. Domain(s) for 1jv5:
  7. Domain(s) for 1n0x:
    1. 450973Domain d1n0xh1: 1n0x H:1-113 [91528]
      Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2
    2. 450974Domain d1n0xk1: 1n0x K:1-113 [91530]
      Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2
      part of an anti HIV-1 Fab
  8. Domain(s) for 1rhh:
    1. 450980Domain d1rhhb1: 1rhh B:3-113 [97475]
      Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2
    2. 450981Domain d1rhhd1: 1rhh D:4-113 [97479]
      Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2
      part of HIV-1 neutralizing Fab x5
  9. Domain(s) for 1rz7:
  10. Domain(s) for 1rz8:
    1. 450983Domain d1rz8b1: 1rz8 B:1-113 [98139]
      Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2
    2. 450984Domain d1rz8d1: 1rz8 D:1-113 [98143]
      Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2
      part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B
  11. Domain(s) for 1rzf:
  12. Domain(s) for 1rzg:
    1. 450976Domain d1rzga1: 1rzg A:1-113 [98154]
      Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2
    2. 450977Domain d1rzgc1: 1rzg C:2-113 [98158]
      Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2
      part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D
  13. Domain(s) for 1rzi:
    1. 450992Domain d1rzib1: 1rzi B:1-113 [98168]
      Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
    2. 450993Domain d1rzid1: 1rzi D:1-113 [98172]
      Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
    3. 450994Domain d1rzif1: 1rzi F:1-113 [98176]
      Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
    4. 450995Domain d1rzih1: 1rzi H:1-113 [98180]
      Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
    5. 450996Domain d1rzij1: 1rzi J:1-113 [98184]
      Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
    6. 450997Domain d1rzil1: 1rzi L:1-113 [98188]
      Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
    7. 450998Domain d1rzin1: 1rzi N:1-113 [98192]
      Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
    8. 450999Domain d1rzip1: 1rzi P:1-113 [98196]
      Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
      part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
  14. Domain(s) for 1rzj:
  15. Domain(s) for 1rzk:
  16. Domain(s) for 1vge:

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