Lineage for Protein: Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH

  1. Root: SCOP 1.75
  2. 781541Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
  3. 781542Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 781543Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 781544Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (32 proteins)
  6. 781740Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH [88543] (22 species)
    VH domains of human and mouse antibodies are clustered by the sequence similarity within the germline encoded segment and then by the size of the complementarity determining regions CDR1 and CDR2, so the clusters may correspond to putative germline families in the species genomes; VH domains with artificial or grafted exogenous CDRs are listed as engineered species

Species:

  1. 781741Engineered (including hybrid species) [88562] (67 PDB entries)
    SQ NA # humanized antidoby; bactericidal Fab-h6831
    SQ NA # humanized antibody
    SQ NA # Humanized antibody
    SQ NA # engineered antibody
    SQ NA # humanized antidoby; bactericidal Fab-h6831 ! SQ NA # humanized antibody ! SQ NA # Humanized antibody ! SQ NA # engineered antibody
    1. Domains for 1ad0:
      1. 781771Domain d1ad0b1: 1ad0 B:1-113 [20125]
        Other proteins in same PDB: d1ad0a1, d1ad0a2, d1ad0b2, d1ad0c1, d1ad0c2, d1ad0d2
        part of humanized Fab A5B7
      2. 781772Domain d1ad0d1: 1ad0 D:1-113 [20127]
        Other proteins in same PDB: d1ad0a1, d1ad0a2, d1ad0b2, d1ad0c1, d1ad0c2, d1ad0d2
        part of humanized Fab A5B7
    2. Domains for 1ad9:
      1. 781793Domain d1ad9b1: 1ad9 B:1-113 [20215]
        Other proteins in same PDB: d1ad9a1, d1ad9a2, d1ad9b2, d1ad9h2, d1ad9l1, d1ad9l2
        part of humanized Fab CTM01
        complexed with so4
      2. 781794Domain d1ad9h1: 1ad9 H:1-113 [20213]
        Other proteins in same PDB: d1ad9a1, d1ad9a2, d1ad9b2, d1ad9h2, d1ad9l1, d1ad9l2
        part of humanized Fab CTM01
    3. Domain for 1b2w:
    4. Domains for 1bvk:
      1. 781825Domain d1bvkb_: 1bvk B: [20279]
        Other proteins in same PDB: d1bvka_, d1bvkc_, d1bvkd_, d1bvkf_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
      2. 781826Domain d1bvke_: 1bvk E: [20281]
        Other proteins in same PDB: d1bvka_, d1bvkc_, d1bvkd_, d1bvkf_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
    5. Domains for 1bvl:
      1. 781829Domain d1bvla_: 1bvl A: [20282]
        Other proteins in same PDB: d1bvlb_, d1bvld_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
      2. 781830Domain d1bvlc_: 1bvl C: [20284]
        Other proteins in same PDB: d1bvlb_, d1bvld_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
    6. Domain for 1fgv:
    7. Domains for 1fvc:
      1. 781766Domain d1fvcb_: 1fvc B: [19863]
        Other proteins in same PDB: d1fvca_, d1fvcc_
        part of humanized Fv 4D5, herceptin
      2. 781767Domain d1fvcd_: 1fvc D: [19865]
        Other proteins in same PDB: d1fvca_, d1fvcc_
        part of humanized Fv 4D5, herceptin
    8. Domains for 1fvd:
      1. 781786Domain d1fvdb1: 1fvd B:1-120 [19867]
        Other proteins in same PDB: d1fvda1, d1fvda2, d1fvdb2, d1fvdc1, d1fvdc2, d1fvdd2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
      2. 781787Domain d1fvdd1: 1fvd D:1-120 [19869]
        Other proteins in same PDB: d1fvda1, d1fvda2, d1fvdb2, d1fvdc1, d1fvdc2, d1fvdd2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
    9. Domains for 1fve:
      1. 781795Domain d1fveb1: 1fve B:1-120 [19871]
        Other proteins in same PDB: d1fvea1, d1fvea2, d1fveb2, d1fvec1, d1fvec2, d1fved2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
      2. 781796Domain d1fved1: 1fve D:1-120 [19873]
        Other proteins in same PDB: d1fvea1, d1fvea2, d1fveb2, d1fvec1, d1fvec2, d1fved2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
    10. Domains for 1gpo:
      1. 781758Domain d1gpoh1: 1gpo H:1-113 [20225]
        Other proteins in same PDB: d1gpoh2, d1gpoi2, d1gpol1, d1gpol2, d1gpom1, d1gpom2
        part of Fab M41 (artificial design)
      2. 781759Domain d1gpoi1: 1gpo I:1-113 [20227]
        Other proteins in same PDB: d1gpoh2, d1gpoi2, d1gpol1, d1gpol2, d1gpom1, d1gpom2
        part of Fab M41 (artificial design)
        complexed with so4
    11. Domains for 1i9r:
      1. 781833Domain d1i9rh1: 1i9r H:1-118 [71151]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
      2. 781834Domain d1i9rk1: 1i9r K:1-118 [71153]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
      3. 781835Domain d1i9rx1: 1i9r X:1-118 [71159]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
        complexed with zn
    12. Domain for 1it9:
    13. Domain for 1jps:
    14. Domain for 1jpt:
    15. Domain for 1jv5:
    16. Domain for 1l7i:
    17. Domains for 1mhp:
      1. 781801Domain d1mhph1: 1mhp H:1-118 [84967]
        Other proteins in same PDB: d1mhpa_, d1mhpb_, d1mhph2, d1mhpl1, d1mhpl2, d1mhpy_
        part of humanized anti-alpha1 integrin I-domain Fab
        complexed with mn; mutant
      2. 781802Domain d1mhpx_: 1mhp X: [84971]
        Other proteins in same PDB: d1mhpa_, d1mhpb_, d1mhph2, d1mhpl1, d1mhpl2, d1mhpy_
        part of humanized anti-alpha1 integrin I-domain Fab; only V domain is ordered
        complexed with mn; mutant
    18. Domain for 1n8z:
    19. Domains for 1ohq:
      1. 781755Domain d1ohqa_: 1ohq A: [93027]
        soluble VH Hel4, resistant to aggregation
      2. 781756Domain d1ohqb_: 1ohq B: [93028]
        soluble VH Hel4, resistant to aggregation
    20. Domains for 1ol0:
      1. 781742Domain d1ol0a_: 1ol0 A: [93296]
        camelized human VH
      2. 781743Domain d1ol0b_: 1ol0 B: [93297]
        camelized human VH
        complexed with gol, so4
    21. Domains for 1om3:
      1. 781773Domain d1om3h1: 1om3 H:1-115 [87059]
        Other proteins in same PDB: d1om3h2, d1om3k2, d1om3l1, d1om3l2, d1om3m1, d1om3m2
        part of engineered Fab 2G12
      2. 781774Domain d1om3k1: 1om3 K:1-115 [87061]
        Other proteins in same PDB: d1om3h2, d1om3k2, d1om3l1, d1om3l2, d1om3m1, d1om3m2
        part of engineered Fab 2G12
    22. Domains for 1op3:
      1. 781749Domain d1op3h1: 1op3 H:1-115 [87208]
        Other proteins in same PDB: d1op3h2, d1op3k1, d1op3k2, d1op3l1, d1op3l2, d1op3m2
        part of engineered Fab 2G12
      2. 781750Domain d1op3m1: 1op3 M:1-115 [87214]
        Other proteins in same PDB: d1op3h2, d1op3k1, d1op3k2, d1op3l1, d1op3l2, d1op3m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with box, man
    23. Domains for 1op5:
      1. 781836Domain d1op5h1: 1op5 H:1-115 [87216]
        Other proteins in same PDB: d1op5h2, d1op5k1, d1op5k2, d1op5l1, d1op5l2, d1op5m2
        part of engineered Fab 2G12
      2. 781837Domain d1op5m1: 1op5 M:1-115 [87222]
        Other proteins in same PDB: d1op5h2, d1op5k1, d1op5k2, d1op5l1, d1op5l2, d1op5m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with man, nag
    24. Domains for 1pg7:
      1. 781784Domain d1pg7h1: 1pg7 H:1-117 [94674]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z2
        part of humanized Fab D3H44 against human tissue factor
      2. 781785Domain d1pg7i1: 1pg7 I:1-117 [94676]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z2
        part of humanized Fab D3H44 against human tissue factor
    25. Domain for 1rjl:
    26. Domains for 1s78:
      1. 781839Domain d1s78d1: 1s78 D:1-113 [98626]
        Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c1, d1s78c2, d1s78d2, d1s78e1, d1s78e2, d1s78f2
        part of anti-ERBb2 Fab Pertuzumab
      2. 781840Domain d1s78f1: 1s78 F:1-113 [98630]
        Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c1, d1s78c2, d1s78d2, d1s78e1, d1s78e2, d1s78f2
        part of anti-ERBb2 Fab Pertuzumab
        complexed with man, nag
    27. Domains for 1t04:
      1. 781818Domain d1t04b1: 1t04 B:1-118 [112184]
        Other proteins in same PDB: d1t04a1, d1t04a2, d1t04b2, d1t04c1, d1t04c2, d1t04d2
      2. 781819Domain d1t04d1: 1t04 D:1-118 [112188]
        Other proteins in same PDB: d1t04a1, d1t04a2, d1t04b2, d1t04c1, d1t04c2, d1t04d2
    28. Domain for 1t3f:
    29. Domain for 1tjg:
    30. Domain for 1tjh:
    31. Domain for 1tji:
    32. Domains for 1tzh:
      1. 781797Domain d1tzhb1: 1tzh B:1-113 [107479]
        Other proteins in same PDB: d1tzha1, d1tzha2, d1tzhb2, d1tzhh2, d1tzhl1, d1tzhl2, d1tzhv_, d1tzhw_
      2. 781798Domain d1tzhh1: 1tzh H:1-113 [107481]
        Other proteins in same PDB: d1tzha1, d1tzha2, d1tzhb2, d1tzhh2, d1tzhl1, d1tzhl2, d1tzhv_, d1tzhw_
    33. Domain for 1tzi:
    34. Domain for 1u8h:
    35. Domain for 1u8i:
    36. Domain for 1u8j:
    37. Domain for 1u8k:
    38. Domain for 1u8l:
    39. Domain for 1u8m:
    40. Domain for 1u8n:
    41. Domain for 1u8o:
    42. Domain for 1u8p:
    43. Domain for 1u8q:
    44. Domain for 1u91:
    45. Domain for 1u92:
    46. Domain for 1u93:
    47. Domain for 1u95:
    48. Domain for 1uj3:
    49. Domain for 1vhp:
    50. Domain for 2agj:
    51. Domain for 2b0s:
    52. Domain for 2b1a:
    53. Domain for 2b1h:
    54. Domain for 2f5a:
    55. Domain for 2f5b:
    56. Domain for 2fgw:
    57. Domains for 2fjf:
      1. 781805Domain d2fjfb1: 2fjf B:1-120 [133579]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      2. 781806Domain d2fjfd1: 2fjf D:1-120 [133581]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      3. 781807Domain d2fjff1: 2fjf F:1-120 [133583]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      4. 781808Domain d2fjfh1: 2fjf H:1-120 [133585]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      5. 781809Domain d2fjfi1: 2fjf I:1-120 [133587]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      6. 781810Domain d2fjfk1: 2fjf K:1-120 [133589]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      7. 781811Domain d2fjfn1: 2fjf N:1-120 [133591]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      8. 781812Domain d2fjfp1: 2fjf P:1-120 [133593]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      9. 781813Domain d2fjfr1: 2fjf R:1-120 [133595]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      10. 781814Domain d2fjft1: 2fjf T:1-120 [133597]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      11. 781815Domain d2fjfv1: 2fjf V:1-120 [133599]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
      12. 781816Domain d2fjfx1: 2fjf X:1-120 [133601]
        Other proteins in same PDB: d2fjfb2, d2fjfd2, d2fjff2, d2fjfh2, d2fjfi2, d2fjfk2, d2fjfn2, d2fjfp2, d2fjfr2, d2fjft2, d2fjfv2, d2fjfx2
        automatically matched to d1fvcb_
    58. Domains for 2fjg:
      1. 781821Domain d2fjgb1: 2fjg B:1-120 [133603]
        Other proteins in same PDB: d2fjgb2, d2fjgh2, d2fjgv1, d2fjgw1
        automatically matched to d1fvcb_
        complexed with so4
      2. 781822Domain d2fjgh1: 2fjg H:1-120 [133605]
        Other proteins in same PDB: d2fjgb2, d2fjgh2, d2fjgv1, d2fjgw1
        automatically matched to d1fvcb_
        complexed with so4
    59. Domains for 2h9g:
      1. 781781Domain d2h9gb1: 2h9g B:1-113 [136257]
        Other proteins in same PDB: d2h9gb2, d2h9gh2, d2h9gr1, d2h9gr2, d2h9gr3
        automatically matched to d1fvcb_
      2. 781782Domain d2h9gh1: 2h9g H:1-113 [136259]
        Other proteins in same PDB: d2h9gb2, d2h9gh2, d2h9gr1, d2h9gr2, d2h9gr3
        automatically matched to d1fvcb_
    60. Domain for 2nyy:
    61. Domains for 2nz9:
      1. 781831Domain d2nz9d1: 2nz9 D:2-118 [138842]
        Other proteins in same PDB: d2nz9c1, d2nz9c2, d2nz9d2, d2nz9e1, d2nz9e2, d2nz9f2
        automatically matched to d1mhph1
        complexed with ca, zn
      2. 781832Domain d2nz9f1: 2nz9 F:2-118 [138846]
        Other proteins in same PDB: d2nz9c1, d2nz9c2, d2nz9d2, d2nz9e1, d2nz9e2, d2nz9f2
        automatically matched to d1mhph1
        complexed with ca, zn
    62. Domain for 2p8l:
    63. Domain for 2p8m:
    64. Domain for 2p8p:
    65. Domain for 2pr4:
    66. Domain for 2pw1:
    67. Domain for 2pw2:
  2. 781843Escherichia coli [TaxId:562] [158861] (1 PDB entry)
  3. 781847Hamster (Cricetulus griseus) [TaxId:10029] [88561] (1 PDB entry)
  4. 781850Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] [88544] (36 PDB entries)
    1. Domain for 1g9m:
    2. Domain for 1g9n:
    3. Domain for 1gc1:
    4. Domains for 1hzh:
      1. 781895Domain d1hzhh1: 1hzh H:1-113 [61437]
        Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2
        part of intact IgG B12 antibody
      2. 781896Domain d1hzhk1: 1hzh K:1-113 [61441]
        Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2
        part of intact IgG B12 antibody
        complexed with fuc, gal, man, nag
    5. Domain for 1iqd:
    6. Domains for 1n0x:
      1. 781853Domain d1n0xh1: 1n0x H:1-113 [91528]
        Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2
        part of an anti HIV-1 Fab
      2. 781854Domain d1n0xk1: 1n0x K:1-113 [91530]
        Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2
        part of an anti HIV-1 Fab
        complexed with cxs, gol, k, orn, so4
    7. Domains for 1rhh:
      1. 781863Domain d1rhhb1: 1rhh B:3-113 [97475]
        Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2
        part of HIV-1 neutralizing Fab x5
      2. 781864Domain d1rhhd1: 1rhh D:4-113 [97479]
        Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2
        part of HIV-1 neutralizing Fab x5
    8. Domain for 1rz7:
    9. Domains for 1rz8:
      1. 781885Domain d1rz8b1: 1rz8 B:1-113 [98139]
        Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B
      2. 781886Domain d1rz8d1: 1rz8 D:1-113 [98143]
        Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B
    10. Domain for 1rzf:
    11. Domains for 1rzg:
      1. 781859Domain d1rzga1: 1rzg A:1-113 [98154]
        Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D
      2. 781860Domain d1rzgc1: 1rzg C:2-113 [98158]
        Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D
        complexed with suc
    12. Domains for 1rzi:
      1. 781902Domain d1rzib1: 1rzi B:1-113 [98168]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      2. 781903Domain d1rzid1: 1rzi D:1-113 [98172]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      3. 781904Domain d1rzif1: 1rzi F:1-113 [98176]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      4. 781905Domain d1rzih1: 1rzi H:1-113 [98180]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      5. 781906Domain d1rzij1: 1rzi J:1-113 [98184]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      6. 781907Domain d1rzil1: 1rzi L:1-113 [98188]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      7. 781908Domain d1rzin1: 1rzi N:1-113 [98192]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
      8. 781909Domain d1rzip1: 1rzi P:1-113 [98196]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
    13. Domain for 1rzj:
    14. Domain for 1rzk:
    15. Domains for 1tzg:
      1. 781870Domain d1tzgh1: 1tzg H:1-113 [119396]
        Other proteins in same PDB: d1tzgh2, d1tzgi2, d1tzgl1, d1tzgl2, d1tzgm1, d1tzgm2
        automatically matched to d1hzhh1
        complexed with gol
      2. 781871Domain d1tzgi1: 1tzg I:1-113 [119398]
        Other proteins in same PDB: d1tzgh2, d1tzgi2, d1tzgl1, d1tzgl2, d1tzgm1, d1tzgm2
        automatically matched to d1hzhh1
        complexed with gol
    16. Domain for 1vge:
    17. Domains for 1yyl:
      1. 781892Domain d1yylh1: 1yyl H:1-113 [124223]
        Other proteins in same PDB: d1yylg1, d1yylh2, d1yyll1, d1yyll2, d1yylm1, d1yylp1, d1yylq1, d1yylq2, d1yylr2, d1yyls1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with bif, mpt, nag, ndg, vlm; mutant
      2. 781893Domain d1yylr1: 1yyl R:1001-1113 [124230]
        Other proteins in same PDB: d1yylg1, d1yylh2, d1yyll1, d1yyll2, d1yylm1, d1yylp1, d1yylq1, d1yylq2, d1yylr2, d1yyls1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with bif, mpt, nag, ndg, vlm; mutant
    18. Domains for 1yym:
      1. 781873Domain d1yymh1: 1yym H:1-113 [124233]
        Other proteins in same PDB: d1yymg1, d1yymh2, d1yyml1, d1yyml2, d1yymm1, d1yymp1, d1yymq1, d1yymq2, d1yymr2, d1yyms1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with edo, ipa, mpt, nag, ndg, vlm; mutant
      2. 781874Domain d1yymr1: 1yym R:1001-1113 [124240]
        Other proteins in same PDB: d1yymg1, d1yymh2, d1yyml1, d1yyml2, d1yymm1, d1yymp1, d1yymq1, d1yymq2, d1yymr2, d1yyms1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with edo, ipa, mpt, nag, ndg, vlm; mutant
    19. Domain for 2dd8:
    20. Domain for 2fx7:
    21. Domains for 2fx8:
      1. 781875Domain d2fx8h1: 2fx8 H:1-113 [134280]
        Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2
        automatically matched to d1hzhh1
        mutant
      2. 781876Domain d2fx8i1: 2fx8 I:1-113 [134282]
        Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2
        automatically matched to d1hzhh1
        mutant
      3. 781877Domain d2fx8j1: 2fx8 J:1-113 [134284]
        Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2
        automatically matched to d1hzhh1
        mutant
      4. 781878Domain d2fx8k1: 2fx8 K:1-113 [134286]
        Other proteins in same PDB: d2fx8h2, d2fx8i2, d2fx8j2, d2fx8k2, d2fx8l1, d2fx8l2, d2fx8m1, d2fx8m2, d2fx8n1, d2fx8n2, d2fx8o1, d2fx8o2
        automatically matched to d1hzhh1
        mutant
    22. Domains for 2fx9:
      1. 781868Domain d2fx9h1: 2fx9 H:1-113 [134296]
        Other proteins in same PDB: d2fx9h2, d2fx9i2, d2fx9l1, d2fx9l2, d2fx9m1, d2fx9m2
        automatically matched to d1hzhh1
        complexed with orq
      2. 781869Domain d2fx9i1: 2fx9 I:1-113 [134298]
        Other proteins in same PDB: d2fx9h2, d2fx9i2, d2fx9l1, d2fx9l2, d2fx9m1, d2fx9m2
        automatically matched to d1hzhh1
        complexed with orq
    23. Domains for 2g75:
      1. 781883Domain d2g75a1: 2g75 A:2-113 [147086]
        Other proteins in same PDB: d2g75a2, d2g75b1, d2g75b2, d2g75c2, d2g75d1, d2g75d2
        automatically matched to 2DD8 H:2-113
      2. 781884Domain d2g75c1: 2g75 C:2-113 [147090]
        Other proteins in same PDB: d2g75a2, d2g75b1, d2g75b2, d2g75c2, d2g75d1, d2g75d2
        automatically matched to 2DD8 H:2-113
    24. Domains for 2i5y:
      1. 781879Domain d2i5yh1: 2i5y H:1-113 [137072]
        Other proteins in same PDB: d2i5yg1, d2i5yh2, d2i5yl1, d2i5yl2, d2i5ym1, d2i5yp1, d2i5yq1, d2i5yq2, d2i5yr2, d2i5ys1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with bif, mpt, nag, ndg, vlm
      2. 781880Domain d2i5yr1: 2i5y R:1-113 [137079]
        Other proteins in same PDB: d2i5yg1, d2i5yh2, d2i5yl1, d2i5yl2, d2i5ym1, d2i5yp1, d2i5yq1, d2i5yq2, d2i5yr2, d2i5ys1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with bif, mpt, nag, ndg, vlm
    25. Domains for 2i60:
      1. 781887Domain d2i60h1: 2i60 H:2-113 [137082]
        Other proteins in same PDB: d2i60g1, d2i60h2, d2i60l1, d2i60l2, d2i60m1, d2i60p1, d2i60q1, d2i60q2, d2i60r2, d2i60s1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with ipa, mpt, nag, ndg, vlm
      2. 781888Domain d2i60r1: 2i60 R:1-113 [137089]
        Other proteins in same PDB: d2i60g1, d2i60h2, d2i60l1, d2i60l2, d2i60m1, d2i60p1, d2i60q1, d2i60q2, d2i60r2, d2i60s1
        automatically matched to d1rz8b1
        complexed with ipa, mpt, nag, ndg, vlm
    26. Domain for 2nxy:
    27. Domain for 2nxz:
    28. Domain for 2ny0:
    29. Domain for 2ny1:
    30. Domain for 2ny2:
    31. Domain for 2ny3:
    32. Domain for 2ny4:
    33. Domain for 2ny5:
    34. Domain for 2ny6:
    35. Domain for 2ny7:
    36. Domains for 2qad:
      1. 781900Domain d2qadd1: 2qad D:1-113 [150205]
        Other proteins in same PDB: d2qadb1, d2qadb2, d2qadd2, d2qadf1, d2qadf2, d2qadh2
        automatically matched to d1rzga1
        complexed with edo, mla, nag
      2. 781901Domain d2qadh1: 2qad H:1-113 [150209]
        Other proteins in same PDB: d2qadb1, d2qadb2, d2qadd2, d2qadf1, d2qadf2, d2qadh2
        automatically matched to d1rzga1
        complexed with edo, mla, nag
  5. 781910Human (Homo sapiens), cluster 2.1 [TaxId:9606] [88545] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1dn0:
      1. 781912Domain d1dn0b1: 1dn0 B:1-120 [19831]
        Other proteins in same PDB: d1dn0a1, d1dn0a2, d1dn0b2, d1dn0c1, d1dn0c2, d1dn0d2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
      2. 781913Domain d1dn0d1: 1dn0 D:1-120 [19833]
        Other proteins in same PDB: d1dn0a1, d1dn0a2, d1dn0b2, d1dn0c1, d1dn0c2, d1dn0d2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
    2. Domains for 1qlr:
      1. 781914Domain d1qlrb1: 1qlr B:1-120 [19835]
        Other proteins in same PDB: d1qlra1, d1qlra2, d1qlrb2, d1qlrc1, d1qlrc2, d1qlrd2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
      2. 781915Domain d1qlrd1: 1qlr D:1-120 [19837]
        Other proteins in same PDB: d1qlra1, d1qlra2, d1qlrb2, d1qlrc1, d1qlrc2, d1qlrd2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
        complexed with fuc, nag
    3. Domain for 7fab:
  6. 781916Human (Homo sapiens), cluster 2.2 [TaxId:9606] [88546] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1mco:
    2. Domains for 2j6e:
      1. 781917Domain d2j6eh1: 2j6e H:1-113 [145665]
        Other proteins in same PDB: d2j6ea1, d2j6ea2, d2j6eb1, d2j6eb2, d2j6eh2, d2j6ei2, d2j6el1, d2j6el2, d2j6em1, d2j6em2
        complexed with act, bma, cac, cd, ful, gal, man, mpd, nag, ndg, zn
      2. 781918Domain d2j6ei1: 2j6e I:1-113 [145667]
        Other proteins in same PDB: d2j6ea1, d2j6ea2, d2j6eb1, d2j6eb2, d2j6eh2, d2j6ei2, d2j6el1, d2j6el2, d2j6em1, d2j6em2
        automatically matched to 2J6E H:1-113
        complexed with act, bma, cac, cd, ful, gal, man, mpd, nag, ndg, zn
  7. 781920Human (Homo sapiens), cluster 3 [TaxId:9606] [88547] (33 PDB entries)
    Uniprot Q6N089 20-243 # 95% sequence identity; natural chimera: antibody heavy chain (Fab HYB3)
    1. Domain for 1adq:
    2. Domain for 1aqk:
    3. Domains for 1dee:
      1. 781952Domain d1deeb1: 1dee B:501-621 [20443]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
        part of IgM RF 2A2
      2. 781953Domain d1deed1: 1dee D:1501-1621 [20445]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
        part of IgM RF 2A2
      3. 781954Domain d1deef1: 1dee F:2501-2621 [20447]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
        part of IgM RF 2A2
    4. Domain for 1dfb:
    5. Domain for 1dql:
    6. Domains for 1hez:
      1. 781967Domain d1hezb1: 1hez B:1-121 [60985]
        Other proteins in same PDB: d1heza1, d1heza2, d1hezb2, d1hezc1, d1hezc2, d1hezd2, d1heze_
        part of IgM RF 2A2
      2. 781968Domain d1hezd1: 1hez D:1-121 [60989]
        Other proteins in same PDB: d1heza1, d1heza2, d1hezb2, d1hezc1, d1hezc2, d1hezd2, d1heze_
        part of IgM RF 2A2
        complexed with imd
    7. Domain for 1igm:
    8. Domain for 1nl0:
    9. Domain for 1u6a:
    10. Domains for 1w72:
      1. 781923Domain d1w72h1: 1w72 H:1-113 [114299]
        Other proteins in same PDB: d1w72a1, d1w72a2, d1w72b_, d1w72d1, d1w72d2, d1w72e_, d1w72h2, d1w72i2, d1w72l1, d1w72l2, d1w72m1, d1w72m2
      2. 781924Domain d1w72i1: 1w72 I:1-113 [114301]
        Other proteins in same PDB: d1w72a1, d1w72a2, d1w72b_, d1w72d1, d1w72d2, d1w72e_, d1w72h2, d1w72i2, d1w72l1, d1w72l2, d1w72m1, d1w72m2
        complexed with gol
    11. Domains for 1y0l:
      1. 781930Domain d1y0lb1: 1y0l B:1-113 [122488]
        Other proteins in same PDB: d1y0la1, d1y0la2, d1y0lb2, d1y0lc1, d1y0lc2, d1y0ld2, d1y0le1, d1y0le2, d1y0lf2, d1y0lh2, d1y0ll1, d1y0ll2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han
      2. 781931Domain d1y0ld1: 1y0l D:1-113 [122492]
        Other proteins in same PDB: d1y0la1, d1y0la2, d1y0lb2, d1y0lc1, d1y0lc2, d1y0ld2, d1y0le1, d1y0le2, d1y0lf2, d1y0lh2, d1y0ll1, d1y0ll2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han
      3. 781932Domain d1y0lf1: 1y0l F:1-113 [122496]
        Other proteins in same PDB: d1y0la1, d1y0la2, d1y0lb2, d1y0lc1, d1y0lc2, d1y0ld2, d1y0le1, d1y0le2, d1y0lf2, d1y0lh2, d1y0ll1, d1y0ll2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han
      4. 781933Domain d1y0lh1: 1y0l H:1-113 [122498]
        Other proteins in same PDB: d1y0la1, d1y0la2, d1y0lb2, d1y0lc1, d1y0lc2, d1y0ld2, d1y0le1, d1y0le2, d1y0lf2, d1y0lh2, d1y0ll1, d1y0ll2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han
    12. Domains for 1y18:
      1. 781971Domain d1y18b1: 1y18 B:1-113 [122523]
        Other proteins in same PDB: d1y18a1, d1y18a2, d1y18b2, d1y18c1, d1y18c2, d1y18d2, d1y18e1, d1y18e2, d1y18f2, d1y18h2, d1y18l1, d1y18l2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han; mutant
      2. 781972Domain d1y18d1: 1y18 D:1-113 [122527]
        Other proteins in same PDB: d1y18a1, d1y18a2, d1y18b2, d1y18c1, d1y18c2, d1y18d2, d1y18e1, d1y18e2, d1y18f2, d1y18h2, d1y18l1, d1y18l2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han; mutant
      3. 781973Domain d1y18f1: 1y18 F:1-113 [122531]
        Other proteins in same PDB: d1y18a1, d1y18a2, d1y18b2, d1y18c1, d1y18c2, d1y18d2, d1y18e1, d1y18e2, d1y18f2, d1y18h2, d1y18l1, d1y18l2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han; mutant
      4. 781974Domain d1y18h1: 1y18 H:1-113 [122533]
        Other proteins in same PDB: d1y18a1, d1y18a2, d1y18b2, d1y18c1, d1y18c2, d1y18d2, d1y18e1, d1y18e2, d1y18f2, d1y18h2, d1y18l1, d1y18l2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with cl, han; mutant
    13. Domain for 1zls:
    14. Domains for 1zlu:
      1. 781987Domain d1zluh1: 1zlu H:1-112 [125258]
        Other proteins in same PDB: d1zluh2, d1zlum2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with man
      2. 781988Domain d1zlum1: 1zlu M:1-112 [125260]
        Other proteins in same PDB: d1zluh2, d1zlum2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with man
    15. Domains for 1zlv:
      1. 781935Domain d1zlvh1: 1zlv H:1-112 [125262]
        Other proteins in same PDB: d1zlvh2, d1zlvm2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with man
      2. 781936Domain d1zlvm1: 1zlv M:1-112 [125264]
        Other proteins in same PDB: d1zlvh2, d1zlvm2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with man
    16. Domains for 1zlw:
      1. 781984Domain d1zlwh1: 1zlw H:1-112 [125266]
        Other proteins in same PDB: d1zlwh2, d1zlwm2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with bma, man
      2. 781985Domain d1zlwm1: 1zlw M:1-112 [125268]
        Other proteins in same PDB: d1zlwh2, d1zlwm2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with bma, man
    17. Domain for 2fb4:
    18. Domains for 2ghw:
      1. 781950Domain d2ghwb2: 2ghw B:1-117 [145199]
        Other proteins in same PDB: d2ghwa1, d2ghwb1, d2ghwc1, d2ghwd1
        complexed with cl
      2. 781951Domain d2ghwd2: 2ghw D:1-117 [145201]
        Other proteins in same PDB: d2ghwa1, d2ghwb1, d2ghwc1, d2ghwd1
        automatically matched to 2GHW B:1-117
        complexed with cl
    19. Domain for 2ig2:
    20. Domain for 2jb5:
    21. Domains for 2jb6:
      1. 781980Domain d2jb6b1: 2jb6 B:3-120 [147957]
        Other proteins in same PDB: d2jb6b2, d2jb6h2
        automatically matched to d1nl0h1
        complexed with t5c
      2. 781981Domain d2jb6h1: 2jb6 H:3-120 [147959]
        Other proteins in same PDB: d2jb6b2, d2jb6h2
        automatically matched to d1nl0h1
        complexed with t5c
    22. Domains for 2oqj:
      1. 781976Domain d2oqjb1: 2oqj B:1-112 [148984]
        Other proteins in same PDB: d2oqjb2, d2oqje2, d2oqjh2, d2oqjk2
        automatically matched to d1aqkh1
      2. 781977Domain d2oqje1: 2oqj E:1-112 [148986]
        Other proteins in same PDB: d2oqjb2, d2oqje2, d2oqjh2, d2oqjk2
        automatically matched to d1aqkh1
      3. 781978Domain d2oqjh1: 2oqj H:1-112 [148988]
        Other proteins in same PDB: d2oqjb2, d2oqje2, d2oqjh2, d2oqjk2
        automatically matched to d1aqkh1
      4. 781979Domain d2oqjk1: 2oqj K:1-112 [148990]
        Other proteins in same PDB: d2oqjb2, d2oqje2, d2oqjh2, d2oqjk2
        automatically matched to d1aqkh1
    23. Domain for 2qqn:
    24. Domains for 3b2u:
      1. 781956Domain d3b2uc1: 3b2u C:1-121 [154774]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with bma, man, nag, so4
      2. 781957Domain d3b2uf1: 3b2u F:1-121 [154778]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with bma, man, nag, so4
      3. 781958Domain d3b2uh1: 3b2u H:1-121 [154780]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with bma, man, nag, so4
      4. 781959Domain d3b2uj1: 3b2u J:1-121 [154784]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with bma, man, nag, so4
      5. 781960Domain d3b2un1: 3b2u N:1-121 [154788]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with bma, man, nag, so4
      6. 781961Domain d3b2uq1: 3b2u Q:1-121 [154792]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with bma, man, nag, so4
      7. 781962Domain d3b2ut1: 3b2u T:1-121 [154796]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with bma, man, nag, so4
      8. 781963Domain d3b2uw1: 3b2u W:1-121 [154800]
        Other proteins in same PDB: d3b2ua1, d3b2ua2, d3b2ub1, d3b2ub2, d3b2uc2, d3b2ue1, d3b2ue2, d3b2uf2, d3b2uh2, d3b2ui1, d3b2ui2, d3b2uj2, d3b2um1, d3b2um2, d3b2un2, d3b2up1, d3b2up2, d3b2uq2, d3b2us1, d3b2us2, d3b2ut2, d3b2uv1, d3b2uv2, d3b2uw2
        automatically matched to d1deeb1
        complexed with bma, man, nag, so4
    25. Domain for 3b2v:
    26. Domain for 3bky:
    27. Domain for 3c08:
    28. Domains for 3c09:
      1. 781989Domain d3c09c1: 3c09 C:2-121 [155813]
        Other proteins in same PDB: d3c09a1, d3c09a2, d3c09c2, d3c09d1, d3c09d2, d3c09h2
        automatically matched to d8fabb1
        complexed with bma, man, nag
      2. 781990Domain d3c09h1: 3c09 H:2-121 [155817]
        Other proteins in same PDB: d3c09a1, d3c09a2, d3c09c2, d3c09d1, d3c09d2, d3c09h2
        automatically matched to d8fabb1
        complexed with bma, man, nag
    29. Domains for 3cfj:
      1. 781945Domain d3cfjb1: 3cfj B:1-113 [156567]
        Other proteins in same PDB: d3cfja1, d3cfja2, d3cfjb2, d3cfjc1, d3cfjc2, d3cfjd2, d3cfje1, d3cfje2, d3cfjf2, d3cfjh2, d3cfjl1, d3cfjl2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with gol, so4; mutant
      2. 781946Domain d3cfjd1: 3cfj D:1-113 [156571]
        Other proteins in same PDB: d3cfja1, d3cfja2, d3cfjb2, d3cfjc1, d3cfjc2, d3cfjd2, d3cfje1, d3cfje2, d3cfjf2, d3cfjh2, d3cfjl1, d3cfjl2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with gol, so4; mutant
      3. 781947Domain d3cfjf1: 3cfj F:1-113 [156575]
        Other proteins in same PDB: d3cfja1, d3cfja2, d3cfjb2, d3cfjc1, d3cfjc2, d3cfjd2, d3cfje1, d3cfje2, d3cfjf2, d3cfjh2, d3cfjl1, d3cfjl2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with gol, so4; mutant
      4. 781948Domain d3cfjh1: 3cfj H:1-113 [156577]
        Other proteins in same PDB: d3cfja1, d3cfja2, d3cfjb2, d3cfjc1, d3cfjc2, d3cfjd2, d3cfje1, d3cfje2, d3cfjf2, d3cfjh2, d3cfjl1, d3cfjl2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with gol, so4; mutant
    30. Domains for 3cfk:
      1. 781937Domain d3cfkb1: 3cfk B:1-113 [156583]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol; mutant
      2. 781938Domain d3cfkd1: 3cfk D:1-113 [156587]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol; mutant
      3. 781939Domain d3cfkf1: 3cfk F:1-113 [156591]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol; mutant
      4. 781940Domain d3cfkh1: 3cfk H:1-113 [156595]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol; mutant
      5. 781941Domain d3cfki1: 3cfk I:1-113 [156597]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol; mutant
      6. 781942Domain d3cfkk1: 3cfk K:1-113 [156601]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol; mutant
      7. 781943Domain d3cfkn1: 3cfk N:1-113 [156607]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol; mutant
      8. 781944Domain d3cfkp1: 3cfk P:1-113 [156611]
        Other proteins in same PDB: d3cfka1, d3cfka2, d3cfkb2, d3cfkc1, d3cfkc2, d3cfkd2, d3cfke1, d3cfke2, d3cfkf2, d3cfkg1, d3cfkg2, d3cfkh2, d3cfki2, d3cfkj1, d3cfkj2, d3cfkk2, d3cfkl1, d3cfkl2, d3cfkm1, d3cfkm2, d3cfkn2, d3cfko1, d3cfko2, d3cfkp2
        automatically matched to d1aqkh1
        complexed with b3p, cd, gol; mutant
    31. Domain for 3dvg:
    32. Domains for 3dvn:
      1. 781965Domain d3dvnb1: 3dvn B:2-120 [157896]
        Other proteins in same PDB: d3dvna1, d3dvna2, d3dvnb2, d3dvnh2, d3dvnl1, d3dvnl2, d3dvnu1, d3dvnv1, d3dvnx1, d3dvny1
        automatically matched to d1nl0h1
        mutant
      2. 781966Domain d3dvnh1: 3dvn H:2-120 [157898]
        Other proteins in same PDB: d3dvna1, d3dvna2, d3dvnb2, d3dvnh2, d3dvnl1, d3dvnl2, d3dvnu1, d3dvnv1, d3dvnx1, d3dvny1
        automatically matched to d1nl0h1
        mutant
    33. Domains for 8fab:
      1. 781921Domain d8fabb1: 8fab B:1-121 [19773]
        Other proteins in same PDB: d8faba1, d8faba2, d8fabb2, d8fabc1, d8fabc2, d8fabd2
        part of Fab HIL
      2. 781922Domain d8fabd1: 8fab D:1-121 [19775]
        Other proteins in same PDB: d8faba1, d8faba2, d8fabb2, d8fabc1, d8fabc2, d8fabd2
        part of Fab HIL
  8. 781992Human (Homo sapiens), cluster 4 [TaxId:9606] [101505] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1q1j:
      1. 781995Domain d1q1jh1: 1q1j H:1-113 [95581]
        Other proteins in same PDB: d1q1jh2, d1q1ji2, d1q1jl1, d1q1jl2, d1q1jm1, d1q1jm2
        part of anti HIV-1 Fab 447-52d
      2. 781996Domain d1q1ji1: 1q1j I:1-113 [95583]
        Other proteins in same PDB: d1q1jh2, d1q1ji2, d1q1jl1, d1q1jl2, d1q1jm1, d1q1jm2
        part of anti HIV-1 Fab 447-52d
    2. Domain for 2b4c:
    3. Domains for 3c2a:
      1. 781993Domain d3c2ah1: 3c2a H:1-113 [155872]
        Other proteins in same PDB: d3c2ah2, d3c2ai2
        automatically matched to d1q1jh1
      2. 781994Domain d3c2ai1: 3c2a I:1-113 [155874]
        Other proteins in same PDB: d3c2ah2, d3c2ai2
        automatically matched to d1q1jh1
  9. 781998Mouse (Mus musculus), cluster 1 [TaxId:10090] [88548] (47 PDB entries)
    Uniprot P01796 #
    HV27_MOUSE Ig heavy chain V-III region A4
    Uniprot P01796 # ! HV27_MOUSE Ig heavy chain V-III region A4
    1. Domains for 1aif:
      1. 782055Domain d1aifb1: 1aif B:1-121 [20077]
        Other proteins in same PDB: d1aifa1, d1aifa2, d1aifb2, d1aifh2, d1aifl1, d1aifl2
        part of Fab 409.5.3
      2. 782056Domain d1aifh1: 1aif H:1-121 [20079]
        Other proteins in same PDB: d1aifa1, d1aifa2, d1aifb2, d1aifh2, d1aifl1, d1aifl2
        part of Fab 409.5.3
    2. Domain for 1axt:
    3. Domain for 1cbv:
    4. Domain for 1ck0:
    5. Domain for 1clo:
    6. Domain for 1dlf:
    7. Domains for 1fl5:
      1. 782020Domain d1fl5b1: 1fl5 B:1-113 [65017]
        Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5a2, d1fl5b2, d1fl5h2, d1fl5l1, d1fl5l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with so4; mutant
      2. 782021Domain d1fl5h1: 1fl5 H:1-113 [65019]
        Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5a2, d1fl5b2, d1fl5h2, d1fl5l1, d1fl5l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
    8. Domains for 1fl6:
      1. 782038Domain d1fl6b1: 1fl6 B:1-113 [65025]
        Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6a2, d1fl6b2, d1fl6h2, d1fl6l1, d1fl6l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with aah; mutant
      2. 782039Domain d1fl6h1: 1fl6 H:1-113 [65027]
        Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6a2, d1fl6b2, d1fl6h2, d1fl6l1, d1fl6l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
    9. Domain for 1flr:
    10. Domain for 1iai:
    11. Domain for 1kel:
    12. Domain for 1kem:
    13. Domain for 1m71:
    14. Domain for 1m7d:
    15. Domain for 1m7i:
    16. Domain for 1mam:
    17. Domain for 1mcp:
    18. Domain for 1nbv:
    19. Domain for 1pz5:
    20. Domain for 1q72:
    21. Domain for 1q9k:
    22. Domains for 1q9l:
      1. 782030Domain d1q9lb1: 1q9l B:1-111 [96282]
        Other proteins in same PDB: d1q9la1, d1q9la2, d1q9lb2, d1q9lc1, d1q9lc2, d1q9ld2
        part of Fab s25-2
      2. 782031Domain d1q9ld1: 1q9l D:1-111 [96286]
        Other proteins in same PDB: d1q9la1, d1q9la2, d1q9lb2, d1q9lc1, d1q9lc2, d1q9ld2
        part of Fab s25-2
        complexed with mg, zn
    23. Domains for 1q9o:
      1. 782010Domain d1q9ob1: 1q9o B:1-111 [96294]
        Other proteins in same PDB: d1q9oa1, d1q9oa2, d1q9ob2, d1q9oc1, d1q9oc2, d1q9od2
        part of Fab s45-18
      2. 782011Domain d1q9od1: 1q9o D:1-111 [96298]
        Other proteins in same PDB: d1q9oa1, d1q9oa2, d1q9ob2, d1q9oc1, d1q9oc2, d1q9od2
        part of Fab s45-18
        complexed with mg
    24. Domain for 1q9q:
    25. Domain for 1q9r:
    26. Domain for 1q9t:
    27. Domain for 1q9v:
    28. Domains for 1q9w:
      1. 782008Domain d1q9wb1: 1q9w B:1-111 [96322]
        Other proteins in same PDB: d1q9wa1, d1q9wa2, d1q9wb2, d1q9wc1, d1q9wc2, d1q9wd2
        part of Fab s45-18
      2. 782009Domain d1q9wd1: 1q9w D:1-111 [96326]
        Other proteins in same PDB: d1q9wa1, d1q9wa2, d1q9wb2, d1q9wc1, d1q9wc2, d1q9wd2
        part of Fab s45-18
        complexed with gp1, gp4, kdo, mg
    29. Domain for 1qyg:
    30. Domain for 1rfd:
    31. Domain for 1riu:
    32. Domain for 1riv:
    33. Domain for 1sbs:
    34. Domain for 1sm3:
    35. Domains for 1t66:
      1. 782032Domain d1t66d1: 1t66 D:1-118 [106547]
        Other proteins in same PDB: d1t66c1, d1t66c2, d1t66d2, d1t66h2, d1t66l1, d1t66l2
      2. 782033Domain d1t66h1: 1t66 H:1-118 [106549]
        Other proteins in same PDB: d1t66c1, d1t66c2, d1t66d2, d1t66h2, d1t66l1, d1t66l2
        complexed with flu
    36. Domains for 1v7m:
      1. 782044Domain d1v7mh1: 1v7m H:1-116 [100450]
        Other proteins in same PDB: d1v7mh2, d1v7mi2, d1v7ml1, d1v7ml2, d1v7mm1, d1v7mm2, d1v7mv_, d1v7mx_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
      2. 782045Domain d1v7mi1: 1v7m I:1-116 [100452]
        Other proteins in same PDB: d1v7mh2, d1v7mi2, d1v7ml1, d1v7ml2, d1v7mm1, d1v7mm2, d1v7mv_, d1v7mx_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
    37. Domains for 1v7n:
      1. 782057Domain d1v7nh1: 1v7n H:1-116 [100460]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
      2. 782058Domain d1v7ni1: 1v7n I:1-116 [100462]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
      3. 782059Domain d1v7nj1: 1v7n J:1-116 [100464]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
      4. 782060Domain d1v7nk1: 1v7n K:1-116 [100466]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
        mutant
    38. Domains for 1wc7:
      1. 782046Domain d1wc7b1: 1wc7 B:1-113 [144550]
        Other proteins in same PDB: d1wc7a1, d1wc7a2, d1wc7b2, d1wc7h2, d1wc7l1, d1wc7l2
        complexed with iod, pp3
      2. 782047Domain d1wc7h1: 1wc7 H:1-113 [144552]
        Other proteins in same PDB: d1wc7a1, d1wc7a2, d1wc7b2, d1wc7h2, d1wc7l1, d1wc7l2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pp3
    39. Domains for 1wcb:
      1. 782036Domain d1wcbb1: 1wcb B:1-113 [144554]
        Other proteins in same PDB: d1wcba1, d1wcba2, d1wcbb2, d1wcbh2, d1wcbl1, d1wcbl2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pe1
      2. 782037Domain d1wcbh1: 1wcb H:1-113 [144556]
        Other proteins in same PDB: d1wcba1, d1wcba2, d1wcbb2, d1wcbh2, d1wcbl1, d1wcbl2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pe1
    40. Domain for 1wz1:
    41. Domains for 2bmk:
      1. 782027Domain d2bmkb1: 2bmk B:1-113 [144992]
        Other proteins in same PDB: d2bmka1, d2bmka2, d2bmkb2, d2bmkh2, d2bmkl1, d2bmkl2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pdd
      2. 782028Domain d2bmkh1: 2bmk H:1-113 [144994]
        Other proteins in same PDB: d2bmka1, d2bmka2, d2bmkb2, d2bmkh2, d2bmkl1, d2bmkl2
        automatically matched to 1WC7 B:1-113
        complexed with iod, pdd
    42. Domain for 2ck0:
    43. Domain for 2dlf:
    44. Domain for 2mcp:
    45. Domains for 2uud:
      1. 782050Domain d2uudh1: 2uud H:1-113 [152181]
        complexed with phx
      2. 782051Domain d2uudj1: 2uud J:1-113 [152182]
        complexed with phx
    46. Domain for 3ck0:
    47. Domain for 4fab:
  10. 782061Mouse (Mus musculus), cluster 2.1 [TaxId:10090] [88549] (14 PDB entries)
    Uniprot P18527 # HV56_MOUSE Ig heavy chain V region 914; 90% sequence identity
    1. Domains for 1fl3:
      1. 782076Domain d1fl3a1: 1fl3 A:2-116 [20486]
        Other proteins in same PDB: d1fl3a2, d1fl3b1, d1fl3b2, d1fl3h2, d1fl3l1, d1fl3l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        complexed with spb
      2. 782077Domain d1fl3h1: 1fl3 H:2-116 [20484]
        Other proteins in same PDB: d1fl3a2, d1fl3b1, d1fl3b2, d1fl3h2, d1fl3l1, d1fl3l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
    2. Domain for 1i9i:
    3. Domain for 1i9j:
    4. Domain for 1jgu:
    5. Domain for 1jgv:
    6. Domains for 1kfa:
      1. 782079Domain d1kfah1: 1kfa H:2-121 [77361]
        Other proteins in same PDB: d1kfah2, d1kfai2, d1kfal1, d1kfal2, d1kfam1, d1kfam2
        part of anti-gibberellin A4 Fab 4-B8(8)/E9; conflict: annotated in PDB as human protein
      2. 782080Domain d1kfai1: 1kfa I:3-121 [77363]
        Other proteins in same PDB: d1kfah2, d1kfai2, d1kfal1, d1kfal2, d1kfam1, d1kfam2
        part of anti-gibberellin A4 Fab 4-B8(8)/E9; conflict: annotated in PDB as human protein
        complexed with ga4
    7. Domain for 1l7t:
    8. Domains for 1lo0:
      1. 782067Domain d1lo0h1: 1lo0 H:1-119 [74115]
        Other proteins in same PDB: d1lo0h2, d1lo0l1, d1lo0l2, d1lo0x1, d1lo0x2, d1lo0y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with bc1
      2. 782068Domain d1lo0y1: 1lo0 Y:1-119 [74121]
        Other proteins in same PDB: d1lo0h2, d1lo0l1, d1lo0l2, d1lo0x1, d1lo0x2, d1lo0y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
    9. Domains for 1lo2:
      1. 782069Domain d1lo2h1: 1lo2 H:1-119 [74123]
        Other proteins in same PDB: d1lo2h2, d1lo2l1, d1lo2l2, d1lo2x1, d1lo2x2, d1lo2y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with ox1
      2. 782070Domain d1lo2y1: 1lo2 Y:1-119 [74129]
        Other proteins in same PDB: d1lo2h2, d1lo2l1, d1lo2l2, d1lo2x1, d1lo2x2, d1lo2y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
    10. Domains for 1lo3:
      1. 782072Domain d1lo3h1: 1lo3 H:1-119 [74131]
        Other proteins in same PDB: d1lo3h2, d1lo3l1, d1lo3l2, d1lo3x1, d1lo3x2, d1lo3y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with an1
      2. 782073Domain d1lo3y1: 1lo3 Y:1-119 [74137]
        Other proteins in same PDB: d1lo3h2, d1lo3l1, d1lo3l2, d1lo3x1, d1lo3x2, d1lo3y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
    11. Domain for 1lo4:
    12. Domains for 1ub5:
      1. 782065Domain d1ub5a1: 1ub5 A:1-116 [99143]
        Other proteins in same PDB: d1ub5a2, d1ub5b1, d1ub5b2, d1ub5h2, d1ub5l1, d1ub5l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        part of anti-testosterone Fab 77
        complexed with spb
      2. 782066Domain d1ub5h1: 1ub5 H:1-116 [99147]
        Other proteins in same PDB: d1ub5a2, d1ub5b1, d1ub5b2, d1ub5h2, d1ub5l1, d1ub5l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        part of anti-testosterone Fab 77
    13. Domains for 1ub6:
      1. 782074Domain d1ub6a1: 1ub6 A:2-116 [99151]
        Other proteins in same PDB: d1ub6a2, d1ub6b1, d1ub6b2, d1ub6h2, d1ub6l1, d1ub6l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
      2. 782075Domain d1ub6h1: 1ub6 H:2-116 [99155]
        Other proteins in same PDB: d1ub6a2, d1ub6b1, d1ub6b2, d1ub6h2, d1ub6l1, d1ub6l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
    14. Domain for 1vpo:
  11. 782083Mouse (Mus musculus), cluster 2.2 [TaxId:10090] [88550] (54 PDB entries)
    Uniprot P01811 # HV41_MOUSE (P01811) Ig heavy chain V region UPC10
    1. Domain for 1ar1:
    2. Domain for 1bfv:
    3. Domains for 1bln:
      1. 782116Domain d1blnb1: 1bln B:1-113 [20331]
        Other proteins in same PDB: d1blna1, d1blna2, d1blnb2, d1blnc1, d1blnc2, d1blnd2
        part of anti-P-glycoprotein Fab MRK-16
      2. 782117Domain d1blnd1: 1bln D:1-113 [20333]
        Other proteins in same PDB: d1blna1, d1blna2, d1blnb2, d1blnc1, d1blnc2, d1blnd2
        part of anti-P-glycoprotein Fab MRK-16
    4. Domain for 1bm3:
    5. Domain for 1bz7:
    6. Domain for 1cfv:
    7. Domain for 1cly:
    8. Domain for 1clz:
    9. Domain for 1dsf:
      • 782088Domain d1dsfh_: 1dsf H: [20247]
        Other proteins in same PDB: d1dsfl_
        part of anticancer Fv B1; disulfide-stabilized
        mutant
    10. Domain for 1ejo:
    11. Domain for 1f4w:
    12. Domain for 1f4x:
    13. Domain for 1f4y:
    14. Domain for 1fh5:
    15. Domain for 1frg:
    16. Domain for 1h0d:
    17. Domain for 1h3p:
    18. Domains for 1hil:
      1. 782091Domain d1hilb1: 1hil B:1-112 [19787]
        Other proteins in same PDB: d1hila1, d1hila2, d1hilb2, d1hilc1, d1hilc2, d1hild2
        part of Fab 17/9
      2. 782092Domain d1hild1: 1hil D:1-112 [19789]
        Other proteins in same PDB: d1hila1, d1hila2, d1hilb2, d1hilc1, d1hilc2, d1hild2
        part of Fab 17/9
    19. Domains for 1him:
      1. 782132Domain d1himl1: 1him L:1-112 [19792]
        Other proteins in same PDB: d1himh1, d1himh2, d1himj1, d1himj2, d1himl2, d1himm2
        part of Fab 17/9; chain identifiers are mixed up
      2. 782133Domain d1himm1: 1him M:1-112 [19794]
        Other proteins in same PDB: d1himh1, d1himh2, d1himj1, d1himj2, d1himl2, d1himm2
        part of Fab 17/9; chain identifiers are mixed up
        complexed with nh2
    20. Domain for 1hin:
    21. Domain for 1i8i:
      • 782099Domain d1i8ib_: 1i8i B: [71129]
        Other proteins in same PDB: d1i8ia_
        part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
        mutant
    22. Domain for 1i8k:
      • 782085Domain d1i8kb_: 1i8k B: [71131]
        Other proteins in same PDB: d1i8ka_
        part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
        mutant
    23. Domain for 1ifh:
    24. Domain for 1igc:
    25. Domains for 1igf:
      1. 782126Domain d1igfh1: 1igf H:1-113 [19813]
        Other proteins in same PDB: d1igfh2, d1igfj2, d1igfl1, d1igfl2, d1igfm1, d1igfm2
        part of Fab B13I2
      2. 782127Domain d1igfj1: 1igf J:1-113 [19815]
        Other proteins in same PDB: d1igfh2, d1igfj2, d1igfl1, d1igfl2, d1igfm1, d1igfm2
        part of Fab B13I2
        complexed with nag
    26. Domains for 1igt:
      1. 782128Domain d1igtb1: 1igt B:1-114 [19765]
        Other proteins in same PDB: d1igta1, d1igta2, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc1, d1igtc2, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
        part of intact IgG2a antibody Mab231
      2. 782129Domain d1igtd1: 1igt D:1-114 [19767]
        Other proteins in same PDB: d1igta1, d1igta2, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc1, d1igtc2, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
        part of intact IgG2a antibody Mab231
        complexed with fuc, gal, man, nag
    27. Domain for 1ikf:
    28. Domain for 1ind:
    29. Domain for 1ine:
    30. Domains for 1kno:
      1. 782138Domain d1knob1: 1kno B:1-119 [20009]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
        part of Fab CNJ206
      2. 782139Domain d1knod1: 1kno D:1-119 [20011]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
        part of Fab CNJ206
      3. 782140Domain d1knof1: 1kno F:1-119 [20013]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
        part of Fab CNJ206
        complexed with pnp, zn
    31. Domains for 1mf2:
      1. 782111Domain d1mf2h1: 1mf2 H:1-113 [20175]
        Other proteins in same PDB: d1mf2h2, d1mf2l1, d1mf2l2, d1mf2m1, d1mf2m2, d1mf2n2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
      2. 782112Domain d1mf2n1: 1mf2 N:1-113 [20177]
        Other proteins in same PDB: d1mf2h2, d1mf2l1, d1mf2l2, d1mf2m1, d1mf2m2, d1mf2n2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
    32. Domain for 1mqk:
      • 782084Domain d1mqkh_: 1mqk H: [85053]
        Other proteins in same PDB: d1mqkl_
        part of Fv against Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase
    33. Domain for 1opg:
    34. Domains for 1ots:
      1. 782122Domain d1otsc1: 1ots C:2-121 [87417]
        Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc2, d1otsd1, d1otsd2, d1otse2, d1otsf1, d1otsf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
      2. 782123Domain d1otse1: 1ots E:2-121 [87421]
        Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc2, d1otsd1, d1otsd2, d1otse2, d1otsf1, d1otsf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl
    35. Domains for 1ott:
      1. 782142Domain d1ottc1: 1ott C:2-121 [87427]
        Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc2, d1ottd1, d1ottd2, d1otte2, d1ottf1, d1ottf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
      2. 782143Domain d1otte1: 1ott E:2-121 [87431]
        Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc2, d1ottd1, d1ottd2, d1otte2, d1ottf1, d1ottf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
    36. Domains for 1otu:
      1. 782145Domain d1otuc1: 1otu C:2-121 [87437]
        Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc2, d1otud1, d1otud2, d1otue2, d1otuf1, d1otuf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
      2. 782146Domain d1otue1: 1otu E:2-121 [87441]
        Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc2, d1otud1, d1otud2, d1otue2, d1otuf1, d1otuf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
    37. Domain for 1qfw:
    38. Domain for 1qkz:
    39. Domain for 1qle:
    40. Domains for 1r24:
      1. 782147Domain d1r24b1: 1r24 B:1-122 [20405]
        Other proteins in same PDB: d1r24a1, d1r24a2, d1r24b2, d1r24c1, d1r24c2, d1r24d2
        part of humanized Fab R24 from murine ascites
      2. 782148Domain d1r24d1: 1r24 D:1-122 [20407]
        Other proteins in same PDB: d1r24a1, d1r24a2, d1r24b2, d1r24c1, d1r24c2, d1r24d2
        part of humanized Fab R24 from murine ascites
    41. Domain for 1ucb:
    42. Domains for 1uz6:
      1. 782151Domain d1uz6f1: 1uz6 F:1-113 [108152]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e1, d1uz6e2, d1uz6f2, d1uz6h2, d1uz6l1, d1uz6l2, d1uz6m1, d1uz6m2, d1uz6p2, d1uz6v1, d1uz6v2, d1uz6w2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
      2. 782152Domain d1uz6h1: 1uz6 H:1-113 [108154]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e1, d1uz6e2, d1uz6f2, d1uz6h2, d1uz6l1, d1uz6l2, d1uz6m1, d1uz6m2, d1uz6p2, d1uz6v1, d1uz6v2, d1uz6w2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
      3. 782153Domain d1uz6p1: 1uz6 P:1-113 [108160]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e1, d1uz6e2, d1uz6f2, d1uz6h2, d1uz6l1, d1uz6l2, d1uz6m1, d1uz6m2, d1uz6p2, d1uz6v1, d1uz6v2, d1uz6w2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
      4. 782154Domain d1uz6w1: 1uz6 W:1-113 [108164]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e1, d1uz6e2, d1uz6f2, d1uz6h2, d1uz6l1, d1uz6l2, d1uz6m1, d1uz6m2, d1uz6p2, d1uz6v1, d1uz6v2, d1uz6w2
        MQ P01811 P22436 #
        natural chimera
        complexed with so4
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
    43. Domains for 1uz8:
      1. 782149Domain d1uz8b1: 1uz8 B:1-113 [108168]
        Other proteins in same PDB: d1uz8a1, d1uz8a2, d1uz8b2, d1uz8h2, d1uz8l1, d1uz8l2
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
      2. 782150Domain d1uz8h1: 1uz8 H:1-113 [108170]
        Other proteins in same PDB: d1uz8a1, d1uz8a2, d1uz8b2, d1uz8h2, d1uz8l1, d1uz8l2
        MQ P01811 P22436 #
        natural chimera
        complexed with fuc, gal, mag
        MQ P01811 P22436 # ! natural chimera
    44. Domain for 2bfv:
    45. Domain for 2fbj:
    46. Domains for 2gfb:
      1. 782155Domain d2gfbb1: 2gfb B:1-119 [19993]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      2. 782156Domain d2gfbd1: 2gfb D:1-119 [19995]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      3. 782157Domain d2gfbf1: 2gfb F:1-119 [19997]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      4. 782158Domain d2gfbh1: 2gfb H:1-119 [19999]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      5. 782159Domain d2gfbj1: 2gfb J:1-119 [20001]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      6. 782160Domain d2gfbl1: 2gfb L:1-119 [20003]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      7. 782161Domain d2gfbn1: 2gfb N:1-119 [20005]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
      8. 782162Domain d2gfbp1: 2gfb P:1-119 [20007]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    47. Domain for 2h1p:
    48. Domains for 2hff:
      1. 782086Domain d2hffb1: 2hff B:1-113 [136379]
        Other proteins in same PDB: d2hffb2, d2hffh2
        automatically matched to d1mf2h1
      2. 782087Domain d2hffh1: 2hff H:1-113 [136381]
        Other proteins in same PDB: d2hffb2, d2hffh2
        automatically matched to d1mf2h1
    49. Domain for 2hfg:
    50. Domains for 2hrp:
      1. 782097Domain d2hrph1: 2hrp H:1-113 [20171]
        Other proteins in same PDB: d2hrph2, d2hrpl1, d2hrpl2, d2hrpm1, d2hrpm2, d2hrpn2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
      2. 782098Domain d2hrpn1: 2hrp N:1-113 [20173]
        Other proteins in same PDB: d2hrph2, d2hrpl1, d2hrpl2, d2hrpm1, d2hrpm2, d2hrpn2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
    51. Domain for 2igf:
    52. Domain for 2j4w:
    53. Domain for 2j5l:
    54. Domain for 3ehb:
  12. 782163Mouse (Mus musculus), cluster 3.1 [TaxId:10090] [88551] (31 PDB entries)
    SQ NA # natural chimera; best hits are: Uniprot P01751 (Ig heavy chain V region B1-8/186-2) and Uniprot P01864 (Ig gamma-2A chain C region secreted form)
    1. Domains for 12e8:
      1. 782167Domain d12e8h1: 12e8 H:1-114 [20269]
        Other proteins in same PDB: d12e8h2, d12e8l1, d12e8l2, d12e8m1, d12e8m2, d12e8p2
        part of Fab 2E8 specific to the low density lipoprotein receptor binding region of apolipoprotein E
      2. 782168Domain d12e8p1: 12e8 P:1-114 [20271]
        Other proteins in same PDB: d12e8h2, d12e8l1, d12e8l2, d12e8m1, d12e8m2, d12e8p2
        part of Fab 2E8 specific to the low density lipoprotein receptor binding region of apolipoprotein E
    2. Domain for 15c8:
    3. Domain for 1a3r:
    4. Domain for 1a5f:
    5. Domains for 1ahw:
      1. 782201Domain d1ahwb1: 1ahw B:1-117 [20219]
        Other proteins in same PDB: d1ahwa1, d1ahwa2, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd1, d1ahwd2, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
        part of anti-human tissue factor Fab 5G9
      2. 782202Domain d1ahwe1: 1ahw E:1-117 [20221]
        Other proteins in same PDB: d1ahwa1, d1ahwa2, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd1, d1ahwd2, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
        part of anti-human tissue factor Fab 5G9
    6. Domain for 1aj7:
    7. Domains for 1ap2:
      1. 782191Domain d1ap2b_: 1ap2 B: [20183]
        Other proteins in same PDB: d1ap2a_, d1ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
      2. 782192Domain d1ap2d_: 1ap2 D: [20185]
        Other proteins in same PDB: d1ap2a_, d1ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
    8. Domain for 1bbd:
    9. Domain for 1cr9:
    10. Domain for 1cu4:
    11. Domain for 1dvf:
      • 782169Domain d1dvfd_: 1dvf D: [20107]
        Other proteins in same PDB: d1dvfa_, d1dvfc_
        part of Fv E5.2, anti-idiotopic antibody to D1.3
        CASP1
        complexed with zn
    12. Domains for 1dzb:
      1. 782175Domain d1dzba1: 1dzb A:1-117 [20488]
        Other proteins in same PDB: d1dzba2, d1dzbb2, d1dzbx_, d1dzby_
        part of anti-lysozyme scFv 1F9
      2. 782176Domain d1dzbb1: 1dzb B:1-117 [20490]
        Other proteins in same PDB: d1dzba2, d1dzbb2, d1dzbx_, d1dzby_
        part of anti-lysozyme scFv 1F9
    13. Domain for 1fgn:
    14. Domain for 1gaf:
    15. Domain for 1hkl:
    16. Domain for 1il1:
    17. Domain for 1jnl:
    18. Domain for 1jnn:
    19. Domain for 1k6q:
    20. Domains for 1moe:
      1. 782183Domain d1moea2: 1moe A:120-240 [85031]
        Other proteins in same PDB: d1moea1, d1moeb1
        part of anti-CEA scFv T84.66; VL to VH linkage: linker residues 112-119; assembles as a diabody
      2. 782184Domain d1moeb2: 1moe B:120-240 [85033]
        Other proteins in same PDB: d1moea1, d1moeb1
        part of anti-CEA scFv T84.66; VL to VH linkage: linker residues 112-119; assembles as a diabody
        complexed with so4
    21. Domain for 1qbl:
    22. Domain for 1qbm:
    23. Domain for 1qok:
    24. Domain for 1wej:
    25. Domain for 25c8:
    26. Domains for 2ap2:
      1. 782185Domain d2ap2b_: 2ap2 B: [20179]
        Other proteins in same PDB: d2ap2a_, d2ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
      2. 782186Domain d2ap2d_: 2ap2 D: [20181]
        Other proteins in same PDB: d2ap2a_, d2ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
    27. Domain for 2bdn:
    28. Domains for 2gsi:
      1. 782193Domain d2gsib1: 2gsi B:2-114 [145221]
        Other proteins in same PDB: d2gsia1, d2gsia2, d2gsib2, d2gsic1, d2gsic2, d2gsid2, d2gsie1, d2gsie2, d2gsif2, d2gsig1, d2gsig2, d2gsih2
        complexed with na
      2. 782194Domain d2gsid1: 2gsi D:2-114 [145223]
        Other proteins in same PDB: d2gsia1, d2gsia2, d2gsib2, d2gsic1, d2gsic2, d2gsid2, d2gsie1, d2gsie2, d2gsif2, d2gsig1, d2gsig2, d2gsih2
        automatically matched to 2GSI B:2-114
        complexed with na
      3. 782195Domain d2gsif1: 2gsi F:2-114 [145225]
        Other proteins in same PDB: d2gsia1, d2gsia2, d2gsib2, d2gsic1, d2gsic2, d2gsid2, d2gsie1, d2gsie2, d2gsif2, d2gsig1, d2gsig2, d2gsih2
        automatically matched to 2GSI B:2-114
        complexed with na
      4. 782196Domain d2gsih1: 2gsi H:2-114 [145227]
        Other proteins in same PDB: d2gsia1, d2gsia2, d2gsib2, d2gsic1, d2gsic2, d2gsid2, d2gsie1, d2gsie2, d2gsif2, d2gsig1, d2gsig2, d2gsih2
        automatically matched to 2GSI B:2-114
        complexed with na
    29. Domain for 2hh0:
    30. Domain for 2rcs:
    31. Domain for 35c8:
  13. 782204Mouse (Mus musculus), cluster 3.2 [TaxId:10090] [88552] (152 PDB entries)
    Uniprot P01756 1-117 # 78% sequense identity; HV12_MOUSE Ig heavy chain V region MOPC 104E
    SQ NA # humanized antibody
    Uniprot P01750 # HV06_MOUSE Ig heavy chain V region 102 precursor
    Uniprot P01750 20-116 #
    HV06_MOUSE Ig heavy chain V region 102 precursor
    Uniprot P01756 1-117 # 78% sequense identity; HV12_MOUSE Ig heavy chain V region MOPC 104E ! SQ NA # humanized antibody ! Uniprot P01750 # HV06_MOUSE Ig heavy chain V region 102 precursor ! Uniprot P01750 20-116 # ! HV06_MOUSE Ig heavy chain V region 102 precursor
    1. Domain for 1a0q:
    2. Domain for 1a14:
      • 782310Domain d1a14h_: 1a14 H: [20061]
        Other proteins in same PDB: d1a14l_, d1a14n_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag
    3. Domain for 1a3l:
    4. Domains for 1a6t:
      1. 782290Domain d1a6tb1: 1a6t B:1-113 [20249]
        Other proteins in same PDB: d1a6ta1, d1a6ta2, d1a6tb2, d1a6tc1, d1a6tc2, d1a6td2
        part of human rhinovirus 14 neutralizing Fab Mab1-IA
      2. 782291Domain d1a6td1: 1a6t D:1-113 [20251]
        Other proteins in same PDB: d1a6ta1, d1a6ta2, d1a6tb2, d1a6tc1, d1a6tc2, d1a6td2
        part of human rhinovirus 14 neutralizing Fab Mab1-IA
    5. Domain for 1a6u:
      • 782250Domain d1a6uh_: 1a6u H: [20255]
        Other proteins in same PDB: d1a6ul_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
    6. Domains for 1a6v:
      1. 782304Domain d1a6vh_: 1a6v H: [20257]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
      2. 782305Domain d1a6vi_: 1a6v I: [20259]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
      3. 782306Domain d1a6vj_: 1a6v J: [20261]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
        complexed with npc
    7. Domain for 1a6w:
      • 782218Domain d1a6wh_: 1a6w H: [20253]
        Other proteins in same PDB: d1a6wl_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
        complexed with nip
    8. Domain for 1ae6:
    9. Domains for 1afv:
      1. 782385Domain d1afvh1: 1afv H:1-120 [20131]
        Other proteins in same PDB: d1afva_, d1afvb_, d1afvh2, d1afvk2, d1afvl1, d1afvl2, d1afvm1, d1afvm2
        part of Fab 25.3 against HIV-1 capsid protein (p24)
      2. 782386Domain d1afvk1: 1afv K:1-120 [20133]
        Other proteins in same PDB: d1afva_, d1afvb_, d1afvh2, d1afvk2, d1afvl1, d1afvl2, d1afvm1, d1afvm2
        part of Fab 25.3 against HIV-1 capsid protein (p24)
        complexed with pb
    10. Domains for 1axs:
      1. 782350Domain d1axsb1: 1axs B:1-113 [20201]
        Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsa2, d1axsb2, d1axsh2, d1axsl1, d1axsl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
        complexed with cd, hop
      2. 782351Domain d1axsh1: 1axs H:1-113 [20199]
        Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsa2, d1axsb2, d1axsh2, d1axsl1, d1axsl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
    11. Domain for 1b4j:
    12. Domains for 1bbj:
      1. 782362Domain d1bbjb1: 1bbj B:1-115 [118420]
        Other proteins in same PDB: d1bbja1, d1bbja2, d1bbjb2, d1bbjh2, d1bbjl1, d1bbjl2
        duplicate of 1BBJ H:1-115
      2. 782363Domain d1bbjh1: 1bbj H:1-115 [19785]
        Other proteins in same PDB: d1bbja1, d1bbja2, d1bbjb2, d1bbjh2, d1bbjl1, d1bbjl2
        part of humanized Fab B72.3
    13. Domain for 1bog:
    14. Domain for 1bql:
    15. Domain for 1c5b:
    16. Domain for 1c5c:
    17. Domain for 1cfn:
    18. Domain for 1cfq:
    19. Domain for 1cfs:
    20. Domain for 1cft:
    21. Domain for 1cgs:
    22. Domain for 1cic:
    23. Domains for 1d5b:
      1. 782364Domain d1d5bb1: 1d5b B:1-113 [20205]
        Other proteins in same PDB: d1d5ba1, d1d5ba2, d1d5bb2, d1d5bh2, d1d5bl1, d1d5bl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
      2. 782365Domain d1d5bh1: 1d5b H:1-113 [20203]
        Other proteins in same PDB: d1d5ba1, d1d5ba2, d1d5bb2, d1d5bh2, d1d5bl1, d1d5bl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
    24. Domain for 1d5i:
    25. Domain for 1d6v:
    26. Domain for 1e4w:
    27. Domains for 1e4x:
      1. 782265Domain d1e4xh1: 1e4x H:1-110 [59236]
        Other proteins in same PDB: d1e4xh2, d1e4xi2, d1e4xl1, d1e4xl2, d1e4xm1, d1e4xm2
        part of anti-TGFalpha Fab TAB2
      2. 782266Domain d1e4xi1: 1e4x I:1-110 [59238]
        Other proteins in same PDB: d1e4xh2, d1e4xi2, d1e4xl1, d1e4xl2, d1e4xm1, d1e4xm2
        part of anti-TGFalpha Fab TAB2
    28. Domain for 1e6j:
    29. Domain for 1e6o:
    30. Domain for 1eap:
    31. Domain for 1egj:
    32. Domain for 1ehl:
    33. Domain for 1emt:
    34. Domain for 1eo8:
    35. Domains for 1f11:
      1. 782353Domain d1f11b1: 1f11 B:1-113 [20457]
        Other proteins in same PDB: d1f11a1, d1f11a2, d1f11b2, d1f11c1, d1f11c2, d1f11d2
        part of anti-Pres2 Fab F124
      2. 782354Domain d1f11d1: 1f11 D:1-113 [20459]
        Other proteins in same PDB: d1f11a1, d1f11a2, d1f11b2, d1f11c1, d1f11c2, d1f11d2
        part of anti-Pres2 Fab F124
    36. Domains for 1f3d:
      1. 782219Domain d1f3dh1: 1f3d H:1-121 [20462]
        Other proteins in same PDB: d1f3dh2, d1f3dj1, d1f3dj2, d1f3dk2, d1f3dl1, d1f3dl2
        part of catalytic Fab 4B2
      2. 782220Domain d1f3dk1: 1f3d K:1-121 [20463]
        Other proteins in same PDB: d1f3dh2, d1f3dj1, d1f3dj2, d1f3dk2, d1f3dl1, d1f3dl2
        part of catalytic Fab 4B2
        complexed with so4, tpm
    37. Domain for 1fai:
    38. Domains for 1fbi:
      1. 782367Domain d1fbih1: 1fbi H:1-121 [20025]
        Other proteins in same PDB: d1fbih2, d1fbil1, d1fbil2, d1fbip1, d1fbip2, d1fbiq2, d1fbix_, d1fbiy_
        part of Fab F9.13.7
      2. 782368Domain d1fbiq1: 1fbi Q:1-121 [20027]
        Other proteins in same PDB: d1fbih2, d1fbil1, d1fbil2, d1fbip1, d1fbip2, d1fbiq2, d1fbix_, d1fbiy_
        part of Fab F9.13.7
    39. Domain for 1fig:
    40. Domain for 1for:
    41. Domain for 1fpt:
    42. Domains for 1fsk:
      1. 782379Domain d1fskc1: 1fsk C:1-118 [20467]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
      2. 782380Domain d1fskf1: 1fsk F:1-118 [20469]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
      3. 782381Domain d1fski1: 1fsk I:1-118 [20471]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
      4. 782382Domain d1fskl1: 1fsk L:1-118 [20473]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
    43. Domain for 1h8n:
    44. Domains for 1h8o:
      1. 782299Domain d1h8oa2: 1h8o A:132-243 [60786]
        Other proteins in same PDB: d1h8oa1, d1h8ob1
        part of anti-ampicillin scFv
      2. 782300Domain d1h8ob2: 1h8o B:133-243 [60788]
        Other proteins in same PDB: d1h8oa1, d1h8ob1
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with so4; mutant
    45. Domains for 1h8s:
      1. 782277Domain d1h8sa2: 1h8s A:132-243 [60790]
        Other proteins in same PDB: d1h8sa1, d1h8sb1
        part of anti-ampicillin scFv
      2. 782278Domain d1h8sb2: 1h8s B:133-243 [60792]
        Other proteins in same PDB: d1h8sa1, d1h8sb1
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with aic, so4; mutant
    46. Domain for 1hh6:
    47. Domain for 1hh9:
    48. Domain for 1hi6:
    49. Domain for 1i3g:
      • 782268Domain d1i3gh_: 1i3g H: [66018]
        Other proteins in same PDB: d1i3gl_
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with mpd
    50. Domains for 1i8m:
      1. 782254Domain d1i8mb1: 1i8m B:1-113 [66084]
        Other proteins in same PDB: d1i8ma1, d1i8ma2, d1i8mb2, d1i8mh2, d1i8ml1, d1i8ml2
        part of anti-ssDNA Fab
        complexed with so4
      2. 782255Domain d1i8mh1: 1i8m H:1-113 [66086]
        Other proteins in same PDB: d1i8ma1, d1i8ma2, d1i8mb2, d1i8mh2, d1i8ml1, d1i8ml2
        part of anti-ssDNA Fab
    51. Domain for 1igi:
    52. Domains for 1igj:
      1. 782314Domain d1igjb1: 1igj B:2-114 [19819]
        Other proteins in same PDB: d1igja1, d1igja2, d1igjb2, d1igjc1, d1igjc2, d1igjd2
        part of Fab 26-10
      2. 782315Domain d1igjd1: 1igj D:2-114 [19821]
        Other proteins in same PDB: d1igja1, d1igja2, d1igjb2, d1igjc1, d1igjc2, d1igjd2
        part of Fab 26-10
        complexed with dgx
    53. Domains for 1igy:
      1. 782388Domain d1igyb1: 1igy B:2-113 [19769]
        Other proteins in same PDB: d1igya1, d1igya2, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc1, d1igyc2, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
        part of intact IgG1 antibody Mab61.1.3
      2. 782389Domain d1igyd1: 1igy D:2-113 [19771]
        Other proteins in same PDB: d1igya1, d1igya2, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc1, d1igyc2, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
        part of intact IgG1 antibody Mab61.1.3
        complexed with fuc, gal, man, nag
    54. Domain for 1iqw:
    55. Domains for 1j05:
      1. 782207Domain d1j05b_: 1j05 B: [90736]
        Other proteins in same PDB: d1j05a_, d1j05l_
        part of anti-CEA Fv T84.66
      2. 782208Domain d1j05h_: 1j05 H: [90737]
        Other proteins in same PDB: d1j05a_, d1j05l_
        part of anti-CEA Fv T84.66
        complexed with gol, po4
    56. Domain for 1jfq:
    57. Domain for 1jhl:
    58. Domain for 1jn6:
    59. Domains for 1jnh:
      1. 782336Domain d1jnhb1: 1jnh B:1-117 [66941]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
      2. 782337Domain d1jnhd1: 1jnh D:1-117 [66945]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
      3. 782338Domain d1jnhf1: 1jnh F:1-117 [66949]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
      4. 782339Domain d1jnhh1: 1jnh H:1-117 [66953]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
        complexed with eco
    60. Domain for 1k4c:
    61. Domain for 1k4d:
    62. Domain for 1kb5:
    63. Domain for 1keg:
    64. Domain for 1kn2:
    65. Domain for 1kn4:
    66. Domain for 1ktr:
    67. Domains for 1lmk:
      1. 782323Domain d1lmka1: 1lmk A:2-127 [20034]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
      2. 782324Domain d1lmkc1: 1lmk C:2-127 [20036]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
      3. 782325Domain d1lmke1: 1lmk E:2-127 [20038]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
      4. 782326Domain d1lmkg1: 1lmk G:2-127 [20040]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
    68. Domain for 1mex:
    69. Domain for 1mfa:
    70. Domain for 1mfb:
    71. Domain for 1mfc:
    72. Domain for 1mfd:
    73. Domain for 1mfe:
    74. Domains for 1mh5:
      1. 782269Domain d1mh5b1: 1mh5 B:2-113 [91268]
        Other proteins in same PDB: d1mh5a1, d1mh5a2, d1mh5b2, d1mh5h2, d1mh5l1, d1mh5l2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
      2. 782270Domain d1mh5h1: 1mh5 H:2-113 [91270]
        Other proteins in same PDB: d1mh5a1, d1mh5a2, d1mh5b2, d1mh5h2, d1mh5l1, d1mh5l2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
    75. Domain for 1mie:
    76. Domain for 1mim:
    77. Domain for 1mj7:
    78. Domain for 1mj8:
    79. Domains for 1mjj:
      1. 782233Domain d1mjjb1: 1mjj B:1-113 [91296]
        Other proteins in same PDB: d1mjja1, d1mjja2, d1mjjb2, d1mjjh2, d1mjjl1, d1mjjl2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
      2. 782234Domain d1mjjh1: 1mjj H:1-113 [91298]
        Other proteins in same PDB: d1mjja1, d1mjja2, d1mjjb2, d1mjjh2, d1mjjl1, d1mjjl2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
    80. Domain for 1mju:
    81. Domain for 1mlb:
    82. Domains for 1mlc:
      1. 782329Domain d1mlcb1: 1mlc B:1-118 [20053]
        Other proteins in same PDB: d1mlca1, d1mlca2, d1mlcb2, d1mlcc1, d1mlcc2, d1mlcd2, d1mlce_, d1mlcf_
        part of Fab D44.1
      2. 782330Domain d1mlcd1: 1mlc D:1-118 [20055]
        Other proteins in same PDB: d1mlca1, d1mlca2, d1mlcb2, d1mlcc1, d1mlcc2, d1mlcd2, d1mlce_, d1mlcf_
        part of Fab D44.1
    83. Domain for 1mnu:
    84. Domain for 1mpa:
    85. Domain for 1mrc:
    86. Domain for 1mrd:
    87. Domain for 1mre:
    88. Domain for 1mrf:
    89. Domain for 1mvu:
      • 782215Domain d1mvub_: 1mvu B: [91475]
        Other proteins in same PDB: d1mvua_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219; complexed with synthetic epitope peptide, chain P
        complexed with so4; mutant
    90. Domain for 1n7m:
      • 782221Domain d1n7ml1: 1n7m L:1-114 [80254]
        Other proteins in same PDB: d1n7mh1, d1n7mh2, d1n7ml2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; germline antibody; chain identifiers are probably mixed up
        complexed with mmp
    91. Domain for 1ngp:
    92. Domain for 1ngq:
    93. Domains for 1ngw:
      1. 782403Domain d1ngwb1: 1ngw B:1-114 [80490]
        Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwa2, d1ngwb2, d1ngwh2, d1ngwl1, d1ngwl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
      2. 782404Domain d1ngwh1: 1ngw H:1-114 [80492]
        Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwa2, d1ngwb2, d1ngwh2, d1ngwl1, d1ngwl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
        complexed with mmp
    94. Domains for 1ngx:
      1. 782399Domain d1ngxb1: 1ngx B:1-114 [85704]
        Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxa2, d1ngxb2, d1ngxh2, d1ngxl1, d1ngxl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
      2. 782400Domain d1ngxh1: 1ngx H:1-114 [85706]
        Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxa2, d1ngxb2, d1ngxh2, d1ngxl1, d1ngxl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
        complexed with jef
    95. Domain for 1ngy:
    96. Domain for 1ngz:
    97. Domains for 1nj9:
      1. 782331Domain d1nj9b1: 1nj9 B:1-113 [91899]
        Other proteins in same PDB: d1nj9a1, d1nj9a2, d1nj9b2, d1nj9h2, d1nj9l1, d1nj9l2
        part of cocaine hydrolytic Fab 15a10
      2. 782332Domain d1nj9h1: 1nj9 H:1-113 [91901]
        Other proteins in same PDB: d1nj9a1, d1nj9a2, d1nj9b2, d1nj9h2, d1nj9l1, d1nj9l2
        part of cocaine hydrolytic Fab 15a10
        complexed with na
    98. Domain for 1nma:
      • 782370Domain d1nmah_: 1nma H: [20065]
        Other proteins in same PDB: d1nmal_, d1nman_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with man, nag; mutant
    99. Domain for 1nmb:
      • 782287Domain d1nmbh_: 1nmb H: [20063]
        Other proteins in same PDB: d1nmbl_, d1nmbn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag; mutant
    100. Domains for 1nmc:
      1. 782302Domain d1nmcb_: 1nmc B: [20058]
        Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcc_, d1nmcl_, d1nmcn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag
      2. 782303Domain d1nmch_: 1nmc H: [20057]
        Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcc_, d1nmcl_, d1nmcn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
    101. Domains for 1nqb:
      1. 782224Domain d1nqba1: 1nqb A:2-120 [20042]
        Other proteins in same PDB: d1nqba2, d1nqbc2
        part of scFv trivalent antibody; N-terminal, VH domain is from B1-8 antibody (1A6U CH H); C-terminal, VL domain is from NQ11 antibody
      2. 782225Domain d1nqbc1: 1nqb C:2-120 [20044]
        Other proteins in same PDB: d1nqba2, d1nqbc2
        part of scFv trivalent antibody; N-terminal, VH domain is from B1-8 antibody (1A6U CH H); C-terminal, VL domain is from NQ11 antibody
    102. Domains for 1p2c:
      1. 782239Domain d1p2cb1: 1p2c B:301-413 [93917]
        Other proteins in same PDB: d1p2ca1, d1p2ca2, d1p2cb2, d1p2cc_, d1p2cd1, d1p2cd2, d1p2ce2, d1p2cf_
        part of anti-lysozyme Fab F10.6.6
      2. 782240Domain d1p2ce1: 1p2c E:1201-1313 [93922]
        Other proteins in same PDB: d1p2ca1, d1p2ca2, d1p2cb2, d1p2cc_, d1p2cd1, d1p2cd2, d1p2ce2, d1p2cf_
        part of anti-lysozyme Fab F10.6.6
    103. Domains for 1p7k:
      1. 782216Domain d1p7kb1: 1p7k B:1-113 [94289]
        Other proteins in same PDB: d1p7ka1, d1p7ka2, d1p7kb2, d1p7kh2, d1p7kl1, d1p7kl2
        part of anti-ssDNA Fab
        complexed with 1pe, epe, gol, peg, so4
      2. 782217Domain d1p7kh1: 1p7k H:1-113 [94291]
        Other proteins in same PDB: d1p7ka1, d1p7ka2, d1p7kb2, d1p7kh2, d1p7kl1, d1p7kl2
        part of anti-ssDNA Fab
    104. Domains for 1pg7:
      1. 782294Domain d1pg7x1: 1pg7 X:1-113 [94684]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z2
        part of Fab 6A6
      2. 782295Domain d1pg7z1: 1pg7 Z:1-113 [94688]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z2
        part of Fab 6A6
    105. Domains for 1pkq:
      1. 782383Domain d1pkqb1: 1pkq B:1-113 [88150]
        Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqa2, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqf2, d1pkqg2, d1pkqj_
        part of humanized Fab 8-18c5
      2. 782384Domain d1pkqg1: 1pkq G:1-113 [88155]
        Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqa2, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqf2, d1pkqg2, d1pkqj_
        part of humanized Fab 8-18c5
    106. Domain for 1plg:
    107. Domain for 1psk:
    108. Domain for 1q0x:
    109. Domain for 1q0y:
    110. Domain for 1qfu:
    111. Domain for 1qfw:
    112. Domain for 1qnz:
    113. Domain for 1r3i:
    114. Domain for 1r3j:
    115. Domain for 1r3k:
    116. Domain for 1r3l:
    117. Domain for 1rih:
    118. Domain for 1rmf:
    119. Domain for 1ruq:
    120. Domain for 1rur:
    121. Domain for 1rvf:
    122. Domain for 1s5h:
    123. Domain for 1sy6:
    124. Domain for 1um4:
    125. Domain for 1um5:
    126. Domain for 1um6:
    127. Domains for 1uwe:
      1. 782346Domain d1uweh1: 1uwe H:4-113 [100103]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
        part of catalytic Fab 14d9
      2. 782347Domain d1uwev1: 1uwe V:4-113 [100109]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
        part of catalytic Fab 14d9
      3. 782348Domain d1uwey1: 1uwe Y:4-113 [100113]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
        part of catalytic Fab 14d9
    128. Domains for 1uwg:
      1. 782360Domain d1uwgh1: 1uwg H:3-113 [100115]
        Other proteins in same PDB: d1uwgh2, d1uwgl1, d1uwgl2, d1uwgx1, d1uwgx2, d1uwgy2
        part of catalytic Fab 14d9
      2. 782361Domain d1uwgy1: 1uwg Y:3-113 [100121]
        Other proteins in same PDB: d1uwgh2, d1uwgl1, d1uwgl2, d1uwgx1, d1uwgx2, d1uwgy2
        part of catalytic Fab 14d9
        complexed with kha, po4
    129. Domains for 1xiw:
      1. 782228Domain d1xiwd_: 1xiw D: [115370]
        Other proteins in same PDB: d1xiwa_, d1xiwb_, d1xiwc_, d1xiwe_, d1xiwf_, d1xiwg_
      2. 782229Domain d1xiwh_: 1xiw H: [115374]
        Other proteins in same PDB: d1xiwa_, d1xiwb_, d1xiwc_, d1xiwe_, d1xiwf_, d1xiwg_
    130. Domain for 1yec:
    131. Domains for 1yed:
      1. 782356Domain d1yedb1: 1yed B:1-113 [20151]
        Other proteins in same PDB: d1yeda1, d1yeda2, d1yedb2, d1yedh2, d1yedl1, d1yedl2
        part of Fab D2.4
        complexed with pnb
      2. 782357Domain d1yedh1: 1yed H:1-113 [20149]
        Other proteins in same PDB: d1yeda1, d1yeda2, d1yedb2, d1yedh2, d1yedl1, d1yedl2
        part of Fab D2.4
    132. Domain for 1yee:
    133. Domain for 1yef:
    134. Domain for 1yeg:
    135. Domain for 1yeh:
    136. Domain for 1yei:
    137. Domain for 1yej:
    138. Domain for 1yek:
    139. Domains for 1yuh:
      1. 782391Domain d1yuhb1: 1yuh B:1-118 [20099]
        Other proteins in same PDB: d1yuha1, d1yuha2, d1yuhb2, d1yuhh2, d1yuhl1, d1yuhl2
        part of an anti-nitrophenol Fab
        complexed with np
      2. 782392Domain d1yuhh1: 1yuh H:1-118 [20097]
        Other proteins in same PDB: d1yuha1, d1yuha2, d1yuhb2, d1yuhh2, d1yuhl1, d1yuhl2
        part of an anti-nitrophenol Fab
    140. Domains for 1za6:
      1. 782372Domain d1za6b1: 1za6 B:2-115 [124806]
        Other proteins in same PDB: d1za6b2, d1za6b3, d1za6d2, d1za6d3, d1za6f2, d1za6f3, d1za6h2, d1za6h3
        automatically matched to d1igyb1
      2. 782373Domain d1za6d1: 1za6 D:2-115 [124809]
        Other proteins in same PDB: d1za6b2, d1za6b3, d1za6d2, d1za6d3, d1za6f2, d1za6f3, d1za6h2, d1za6h3
        automatically matched to d1igyb1
      3. 782374Domain d1za6f1: 1za6 F:2-115 [124812]
        Other proteins in same PDB: d1za6b2, d1za6b3, d1za6d2, d1za6d3, d1za6f2, d1za6f3, d1za6h2, d1za6h3
        automatically matched to d1igyb1
      4. 782375Domain d1za6h1: 1za6 H:2-115 [124815]
        Other proteins in same PDB: d1za6b2, d1za6b3, d1za6d2, d1za6d3, d1za6f2, d1za6f3, d1za6h2, d1za6h3
        automatically matched to d1igyb1
    141. Domain for 2cgr:
    142. Domain for 2dtg:
    143. Domain for 2f19:
    144. Domain for 2fat:
    145. Domain for 2fd6:
    146. Domain for 2iff:
    147. Domain for 2jel:
    148. Domain for 2mpa:
    149. Domains for 2pcp:
      1. 782320Domain d2pcpb1: 2pcp B:1-113 [20371]
        Other proteins in same PDB: d2pcpa1, d2pcpa2, d2pcpb2, d2pcpc1, d2pcpc2, d2pcpd2
        part of Fab 6B5
      2. 782321Domain d2pcpd1: 2pcp D:1-113 [20373]
        Other proteins in same PDB: d2pcpa1, d2pcpa2, d2pcpb2, d2pcpc1, d2pcpc2, d2pcpd2
        part of Fab 6B5
        complexed with 1pc
    150. Domain for 3bt2:
    151. Domains for 3fct:
      1. 782284Domain d3fctb1: 3fct B:1-114 [20375]
        Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fcta2, d3fctb2, d3fctc1, d3fctc2, d3fctd2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody
      2. 782285Domain d3fctd1: 3fct D:1-114 [20377]
        Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fcta2, d3fctb2, d3fctc1, d3fctc2, d3fctd2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody
        complexed with ca, cd, mg, mmp, na
    152. Domain for 6fab:
  14. 782406Mouse (Mus musculus), cluster 3.3 [TaxId:10090] [88553] (1 PDB entry)
  15. 782409Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId:10090] [88554] (32 PDB entries)
    Uniprot P06327 20-117 # HV52_MOUSE (P06327) Ig heavy chain V region VH558 A1/A4 precursor; 57% sequence identity
    Uniprot P01631 # KV2G_MOUSE (P01631) Ig kappa chain V-II region 26-10
    Uniprot P06327 20-117 # HV52_MOUSE (P06327) Ig heavy chain V region VH558 A1/A4 precursor; 57% sequence identity ! Uniprot P01631 # KV2G_MOUSE (P01631) Ig kappa chain V-II region 26-10
    1. Domains for 1a4j:
      1. 782426Domain d1a4jb1: 1a4j B:1-119 [20233]
        Other proteins in same PDB: d1a4ja1, d1a4ja2, d1a4jb2, d1a4jh2, d1a4jl1, d1a4jl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
      2. 782427Domain d1a4jh1: 1a4j H:1-119 [20231]
        Other proteins in same PDB: d1a4ja1, d1a4ja2, d1a4jb2, d1a4jh2, d1a4jl1, d1a4jl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
    2. Domains for 1a4k:
      1. 782432Domain d1a4kb1: 1a4k B:1-119 [20237]
        Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4ka2, d1a4kb2, d1a4kh2, d1a4kl1, d1a4kl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
        complexed with cd, fra
      2. 782433Domain d1a4kh1: 1a4k H:1-119 [20235]
        Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4ka2, d1a4kb2, d1a4kh2, d1a4kl1, d1a4kl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
    3. Domains for 1bj1:
      1. 782421Domain d1bj1h1: 1bj1 H:1-123 [20323]
        Other proteins in same PDB: d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1j2, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
      2. 782422Domain d1bj1k1: 1bj1 K:1-123 [20325]
        Other proteins in same PDB: d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1j2, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
        complexed with so4
    4. Domain for 1c1e:
    5. Domain for 1cl7:
    6. Domains for 1cz8:
      1. 782424Domain d1cz8h1: 1cz8 H:1-123 [20327]
        Other proteins in same PDB: d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8x2, d1cz8y2
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
      2. 782425Domain d1cz8y1: 1cz8 Y:1-123 [20329]
        Other proteins in same PDB: d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8x2, d1cz8y2
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
        complexed with so4; mutant
    7. Domain for 1dba:
    8. Domain for 1dbb:
    9. Domain for 1dbj:
    10. Domain for 1dbk:
    11. Domain for 1dbm:
    12. Domains for 1fj1:
      1. 782434Domain d1fj1b1: 1fj1 B:1-114 [20119]
        Other proteins in same PDB: d1fj1a1, d1fj1a2, d1fj1b2, d1fj1c1, d1fj1c2, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
        part of Fab LA-2 against OspA
      2. 782435Domain d1fj1d1: 1fj1 D:1-114 [20121]
        Other proteins in same PDB: d1fj1a1, d1fj1a2, d1fj1b2, d1fj1c1, d1fj1c2, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
        part of Fab LA-2 against OspA
    13. Domain for 1ghf:
    14. Domains for 1i7z:
      1. 782418Domain d1i7zb1: 1i7z B:1-113 [61921]
        Other proteins in same PDB: d1i7za1, d1i7za2, d1i7zb2, d1i7zc1, d1i7zc2, d1i7zd2
        part of humanized Fab GNC92H2
      2. 782419Domain d1i7zd1: 1i7z D:1-113 [61925]
        Other proteins in same PDB: d1i7za1, d1i7za2, d1i7zb2, d1i7zc1, d1i7zc2, d1i7zd2
        part of humanized Fab GNC92H2
        complexed with coc
    15. Domain for 1iai:
    16. Domain for 1jgl:
    17. Domain for 1jhk:
    18. Domains for 1jp5:
      1. 782429Domain d1jp5a2: 1jp5 A:128-247 [67002]
        Other proteins in same PDB: d1jp5a1, d1jp5b1
        part of scFv 1695; complexed with the epitope peptide from HIV-1 protease
      2. 782430Domain d1jp5b2: 1jp5 B:128-247 [67004]
        Other proteins in same PDB: d1jp5a1, d1jp5b1
        part of scFv 1695; complexed with the epitope peptide from HIV-1 protease
    19. Domains for 1mhh:
      1. 782413Domain d1mhhb1: 1mhh B:1-113 [79121]
        Other proteins in same PDB: d1mhha1, d1mhha2, d1mhhb2, d1mhhc1, d1mhhc2, d1mhhd2, d1mhhe_, d1mhhf_
        part of anti-HCV Fab 19D9D6
      2. 782414Domain d1mhhd1: 1mhh D:1-113 [79125]
        Other proteins in same PDB: d1mhha1, d1mhha2, d1mhhb2, d1mhhc1, d1mhhc2, d1mhhd2, d1mhhe_, d1mhhf_
        part of anti-HCV Fab 19D9D6
        complexed with aea, edo; mutant
    20. Domains for 1n4x:
      1. 782411Domain d1n4xh_: 1n4x H: [85324]
        Other proteins in same PDB: d1n4xl_, d1n4xm_
        part of scFv 1695
      2. 782412Domain d1n4xi_: 1n4x I: [85325]
        Other proteins in same PDB: d1n4xl_, d1n4xm_
        part of scFv 1695
        complexed with cl
    21. Domain for 1n64:
    22. Domain for 1nca:
    23. Domain for 1ncb:
    24. Domain for 1ncc:
    25. Domain for 1ncd:
    26. Domain for 1nlb:
    27. Domains for 1ob1:
      1. 782447Domain d1ob1b1: 1ob1 B:1-113 [86750]
        Other proteins in same PDB: d1ob1a1, d1ob1a2, d1ob1b2, d1ob1c1, d1ob1c2, d1ob1d1, d1ob1d2, d1ob1e2, d1ob1f1, d1ob1f2
        part of anti-Pf MSP1 Fab
      2. 782448Domain d1ob1e1: 1ob1 E:1-113 [86756]
        Other proteins in same PDB: d1ob1a1, d1ob1a2, d1ob1b2, d1ob1c1, d1ob1c2, d1ob1d1, d1ob1d2, d1ob1e2, d1ob1f1, d1ob1f2
        part of anti-Pf MSP1 Fab
        complexed with cac
    28. Domain for 1tet:
    29. Domains for 1tpx:
      1. 782451Domain d1tpxb1: 1tpx B:1-113 [107190]
        Other proteins in same PDB: d1tpxa_, d1tpxb2, d1tpxc2
        MQ P06327 P01864 #
        natural chimera
        MQ P06327 P01864 # ! natural chimera
      2. 782452Domain d1tpxc1: 1tpx C:1-107 [107192]
        Other proteins in same PDB: d1tpxa_, d1tpxb2, d1tpxc2
        MQ P01631 P01837 #
        natural chimera
        MQ P01631 P01837 # ! natural chimera
    30. Domains for 1tqb:
      1. 782449Domain d1tqbb1: 1tqb B:1-113 [107213]
        Other proteins in same PDB: d1tqba_, d1tqbb2, d1tqbc2
        MQ P06327 P01864 #
        natural chimera
        MQ P06327 P01864 # ! natural chimera
      2. 782450Domain d1tqbc1: 1tqb C:1-107 [107215]
        Other proteins in same PDB: d1tqba_, d1tqbb2, d1tqbc2
        MQ P01631 P01837 #
        natural chimera
        MQ P01631 P01837 # ! natural chimera
    31. Domains for 1tqc:
      1. 782453Domain d1tqcb1: 1tqc B:1-113 [107218]
        Other proteins in same PDB: d1tqca_, d1tqcb2, d1tqcc2
        MQ P06327 P01864 #
        natural chimera
        MQ P06327 P01864 # ! natural chimera
      2. 782454Domain d1tqcc1: 1tqc C:1-107 [107220]
        Other proteins in same PDB: d1tqca_, d1tqcb2, d1tqcc2
        MQ P01631 P01837 #
        natural chimera
        MQ P01631 P01837 # ! natural chimera
    32. Domain for 2dbl:
  16. 782455Mouse (Mus musculus), cluster 5 [TaxId:10090] [88555] (36 PDB entries)
    1. Domain for 1a2y:
    2. Domain for 1a7n:
    3. Domain for 1a7o:
    4. Domain for 1a7p:
    5. Domain for 1a7q:
    6. Domain for 1a7r:
    7. Domain for 1cic:
    8. Domain for 1dl7:
      • 782495Domain d1dl7h_: 1dl7 H: [20499]
        Other proteins in same PDB: d1dl7l_
        part of Fv M3C65; conflict: annotated in PDB as human protein
        complexed with nch
    9. Domain for 1dvf:
    10. Domain for 1fdl:
    11. Domains for 1fe8:
      1. 782474Domain d1fe8h1: 1fe8 H:1-115 [59786]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
        part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
      2. 782475Domain d1fe8i1: 1fe8 I:1-115 [59788]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
        part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
      3. 782476Domain d1fe8j1: 1fe8 J:1-115 [59790]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
        part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
        complexed with cac, fuc, nag
    12. Domain for 1fns:
    13. Domain for 1g7h:
    14. Domain for 1g7i:
    15. Domain for 1g7j:
    16. Domain for 1g7l:
    17. Domain for 1g7m:
    18. Domain for 1gig:
    19. Domain for 1ibg:
    20. Domain for 1kip:
    21. Domain for 1kiq:
    22. Domain for 1kir:
    23. Domains for 1nc2:
      1. 782477Domain d1nc2b1: 1nc2 B:1-120 [91783]
        Other proteins in same PDB: d1nc2a1, d1nc2a2, d1nc2b2, d1nc2c1, d1nc2c2, d1nc2d2
        part of Fab 2d12.5
      2. 782478Domain d1nc2d1: 1nc2 D:1-120 [91787]
        Other proteins in same PDB: d1nc2a1, d1nc2a2, d1nc2b2, d1nc2c1, d1nc2c2, d1nc2d2
        part of Fab 2d12.5
        complexed with cl, doe, nag, yt3
    24. Domains for 1nc4:
      1. 782479Domain d1nc4b1: 1nc4 B:1-120 [91791]
        Other proteins in same PDB: d1nc4a1, d1nc4a2, d1nc4b2, d1nc4c1, d1nc4c2, d1nc4d2
        part of Fab 2d12.5
      2. 782480Domain d1nc4d1: 1nc4 D:1-120 [91795]
        Other proteins in same PDB: d1nc4a1, d1nc4a2, d1nc4b2, d1nc4c1, d1nc4c2, d1nc4d2
        part of Fab 2d12.5
        complexed with cl, dof, gd3, nag
    25. Domain for 1nld:
    26. Domain for 1oak:
    27. Domain for 1p4b:
    28. Domain for 1p4i:
    29. Domains for 1t4k:
      1. 782501Domain d1t4kb1: 1t4k B:1-113 [112237]
        Other proteins in same PDB: d1t4ka1, d1t4ka2, d1t4kb2, d1t4kc1, d1t4kc2, d1t4kd2
        MQ P018119 P01868 # natural chimera; catalytic antibody with aldolase activity
      2. 782502Domain d1t4kd1: 1t4k D:1-113 [112241]
        Other proteins in same PDB: d1t4ka1, d1t4ka2, d1t4kb2, d1t4kc1, d1t4kc2, d1t4kd2
        MQ P018119 P01868 # natural chimera; catalytic antibody with aldolase activity
        complexed with zn
    30. Domain for 1vfa:
    31. Domain for 1vfb:
    32. Domain for 2vir:
    33. Domain for 2vis:
    34. Domain for 2vit:
    35. Domains for 43c9:
      1. 782481Domain d43c9b_: 43c9 B: [20387]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      2. 782482Domain d43c9d_: 43c9 D: [20389]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      3. 782483Domain d43c9f_: 43c9 F: [20391]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      4. 782484Domain d43c9h_: 43c9 H: [20393]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
    36. Domains for 43ca:
      1. 782486Domain d43cab_: 43ca B: [20395]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      2. 782487Domain d43cad_: 43ca D: [20397]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      3. 782488Domain d43caf_: 43ca F: [20399]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
      4. 782489Domain d43cah_: 43ca H: [20401]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
        complexed with npo
  17. 782503Mouse (Mus musculus), cluster 6 [TaxId:10090] [88556] (12 PDB entries)
    SQ NA # part of Fab 28 against HIV-1 RT
    1. Domains for 1etz:
      1. 782504Domain d1etzb1: 1etz B:1-126 [20481]
        Other proteins in same PDB: d1etza1, d1etza2, d1etzb2, d1etzh2, d1etzl1, d1etzl2
        part of anti-sweetener Fab NC10.14
        complexed with gas
      2. 782505Domain d1etzh1: 1etz H:1-126 [20479]
        Other proteins in same PDB: d1etza1, d1etza2, d1etzb2, d1etzh2, d1etzl1, d1etzl2
        part of anti-sweetener Fab NC10.14
    2. Domain for 1ggb:
    3. Domain for 1ggc:
    4. Domains for 1ggi:
      1. 782508Domain d1ggih1: 1ggi H:1-112 [19877]
        Other proteins in same PDB: d1ggih2, d1ggij2, d1ggil1, d1ggil2, d1ggim1, d1ggim2
        part of Fab 50.1
      2. 782509Domain d1ggij1: 1ggi J:1-112 [19879]
        Other proteins in same PDB: d1ggih2, d1ggij2, d1ggil1, d1ggil2, d1ggim1, d1ggim2
        part of Fab 50.1
    5. Domain for 1hys:
    6. Domain for 1j5o:
    7. Domain for 1jrh:
    8. Domain for 1n5y:
    9. Domain for 1n6q:
    10. Domain for 1r0a:
    11. Domain for 1t03:
    12. Domain for 2hmi:
  18. 782518Mouse (Mus musculus), cluster 7.1 [TaxId:10090] [88557] (38 PDB entries)
    Uniprot P18532 # HV61_MOUSE Ig heavy chain V region 1B43 precursor
    1. Domain for 1ay1:
    2. Domain for 1baf:
    3. Domain for 1bgx:
    4. Domain for 1c12:
    5. Domain for 1cf8:
    6. Domain for 1ezv:
    7. Domain for 1f58:
    8. Domain for 1f8t:
    9. Domain for 1f90:
    10. Domains for 1hq4:
      1. 782552Domain d1hq4b1: 1hq4 B:1-113 [83623]
        Other proteins in same PDB: d1hq4a1, d1hq4a2, d1hq4b2, d1hq4c1, d1hq4c2, d1hq4d2
        part of catalytic Fab HA-19A4 with a polyene cyclase activity
      2. 782553Domain d1hq4d1: 1hq4 D:1-113 [83627]
        Other proteins in same PDB: d1hq4a1, d1hq4a2, d1hq4b2, d1hq4c1, d1hq4c2, d1hq4d2
        part of catalytic Fab HA-19A4 with a polyene cyclase activity
        complexed with cd
    11. Domain for 1kb9:
    12. Domain for 1kc5:
    13. Domain for 1kcr:
    14. Domain for 1kcs:
    15. Domain for 1kcu:
    16. Domain for 1kcv:
    17. Domains for 1ken:
      1. 782561Domain d1kenh1: 1ken H:1-120 [72379]
        Other proteins in same PDB: d1kena_, d1kenb_, d1kenc_, d1kend_, d1kene_, d1kenf_, d1kenh2, d1kenl1, d1kenl2, d1kent2, d1kenu1, d1kenu2
        part of Fab against influenza virus hemagglutinin
      2. 782562Domain d1kent1: 1ken T:1-120 [72383]
        Other proteins in same PDB: d1kena_, d1kenb_, d1kenc_, d1kend_, d1kene_, d1kenf_, d1kenh2, d1kenl1, d1kenl2, d1kent2, d1kenu1, d1kenu2
        part of Fab against influenza virus hemagglutinin
        complexed with man, nag
    18. Domains for 1kyo:
      1. 782556Domain d1kyoj_: 1kyo J: [73262]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyov_, d1kyow_
        part of Fv against Rieske protein from the yeast cytochrome bc1 complex
      2. 782557Domain d1kyou_: 1kyo U: [73277]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyov_, d1kyow_
        part of Fv against Rieske protein from the yeast cytochrome bc1 complex
        complexed with fes, hem, m3l, sma
    19. Domain for 1ncw:
    20. Domains for 1nd0:
      1. 782543Domain d1nd0b1: 1nd0 B:1-113 [85561]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a1, d1nd0a2, d1nd0b2, d1nd0c1, d1nd0c2, d1nd0d2, d1nd0e1, d1nd0e2, d1nd0f2, d1nd0g1, d1nd0g2, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
      2. 782544Domain d1nd0d1: 1nd0 D:1-113 [85565]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a1, d1nd0a2, d1nd0b2, d1nd0c1, d1nd0c2, d1nd0d2, d1nd0e1, d1nd0e2, d1nd0f2, d1nd0g1, d1nd0g2, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
      3. 782545Domain d1nd0f1: 1nd0 F:1-113 [85569]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a1, d1nd0a2, d1nd0b2, d1nd0c1, d1nd0c2, d1nd0d2, d1nd0e1, d1nd0e2, d1nd0f2, d1nd0g1, d1nd0g2, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
      4. 782546Domain d1nd0h1: 1nd0 H:1-113 [85573]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a1, d1nd0a2, d1nd0b2, d1nd0c1, d1nd0c2, d1nd0d2, d1nd0e1, d1nd0e2, d1nd0f2, d1nd0g1, d1nd0g2, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
        complexed with dp4, so4
    21. Domain for 1nsn:
    22. Domain for 1orq:
    23. Domain for 1ors:
    24. Domain for 1p84:
    25. Domain for 1ru9:
    26. Domain for 1rua:
    27. Domain for 1ruk:
    28. Domain for 1rul:
    29. Domain for 1rum:
    30. Domain for 1rup:
    31. Domain for 1s5i:
    32. Domains for 2a0l:
      1. 782563Domain d2a0ld1: 2a0l D:1-116 [125957]
        Other proteins in same PDB: d2a0la1, d2a0lb1, d2a0lc1, d2a0le1
        automatically matched to d1orsb1
        complexed with k
      2. 782564Domain d2a0lf1: 2a0l F:1-116 [125959]
        Other proteins in same PDB: d2a0la1, d2a0lb1, d2a0lc1, d2a0le1
        automatically matched to d1orsb1
        complexed with k
    33. Domain for 2f58:
    34. Domain for 2ibz:
    35. Domain for 32c2:
    36. Domains for 3cx5:
      1. 782529Domain d3cx5j1: 3cx5 J:1-127 [157090]
        Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g1, d3cx5h1, d3cx5i1, d3cx5k1, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r1, d3cx5s1, d3cx5t1, d3cx5v1
        automatically matched to d1ezvx_
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, m3l, sma, suc, umq
      2. 782530Domain d3cx5u1: 3cx5 U:1-127 [157106]
        Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f1, d3cx5g1, d3cx5h1, d3cx5i1, d3cx5k1, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q1, d3cx5r1, d3cx5s1, d3cx5t1, d3cx5v1
        automatically matched to d1ezvx_
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, m3l, sma, suc, umq
    37. Domains for 3cxh:
      1. 782538Domain d3cxhj1: 3cxh J:1-127 [157123]
        Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg1, d3cxhh1, d3cxhi1, d3cxhk1, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr1, d3cxhs1, d3cxht1, d3cxhv1
        automatically matched to d1ezvx_
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, m3l, sma, suc, umq
      2. 782539Domain d3cxhu1: 3cxh U:1-127 [157139]
        Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf1, d3cxhg1, d3cxhh1, d3cxhi1, d3cxhk1, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq1, d3cxhr1, d3cxhs1, d3cxht1, d3cxhv1
        automatically matched to d1ezvx_
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, m3l, sma, suc, umq
    38. Domain for 3f58:
  19. 782566Mouse (Mus musculus), cluster 7.2 [TaxId:10090] [88558] (28 PDB entries)
    1. Domain for 1c08:
    2. Domain for 1dqd:
    3. Domain for 1dqj:
    4. Domain for 1dqm:
    5. Domains for 1dqq:
      1. 782576Domain d1dqqb1: 1dqq B:1-113 [20421]
        Other proteins in same PDB: d1dqqa1, d1dqqa2, d1dqqb2, d1dqqc1, d1dqqc2, d1dqqd2
        part of anti-lysozyme Fab HYHEL-63
      2. 782577Domain d1dqqd1: 1dqq D:1-113 [20423]
        Other proteins in same PDB: d1dqqa1, d1dqqa2, d1dqqb2, d1dqqc1, d1dqqc2, d1dqqd2
        part of anti-lysozyme Fab HYHEL-63
    6. Domain for 1ic4:
    7. Domain for 1ic5:
    8. Domain for 1ic7:
    9. Domain for 1j1o:
    10. Domain for 1j1p:
    11. Domain for 1j1x:
    12. Domains for 1nak:
      1. 782595Domain d1nakh1: 1nak H:1-113 [91753]
        Other proteins in same PDB: d1nakh2, d1naki2, d1nakl1, d1nakl2, d1nakm1, d1nakm2
        part of Fab 83.1 against HIV-1 gp120
      2. 782596Domain d1naki1: 1nak I:1-113 [91755]
        Other proteins in same PDB: d1nakh2, d1naki2, d1nakl1, d1nakl2, d1nakm1, d1nakm2
        part of Fab 83.1 against HIV-1 gp120
    13. Domain for 1nby:
    14. Domain for 1nbz:
    15. Domain for 1ndg:
    16. Domain for 1ndm:
    17. Domain for 1osp:
    18. Domain for 1ua6:
    19. Domain for 1uac:
    20. Domain for 2dqc:
    21. Domain for 2dqd:
    22. Domain for 2dqe:
    23. Domains for 2dqf:
      1. 782593Domain d2dqfb1: 2dqf B:1-114 [145083]
        Other proteins in same PDB: d2dqfa1, d2dqfc1, d2dqfd1, d2dqff1
        mutant
      2. 782594Domain d2dqfe1: 2dqf E:1-114 [145084]
        Other proteins in same PDB: d2dqfa1, d2dqfc1, d2dqfd1, d2dqff1
        automatically matched to 2DQF B:1-114
        mutant
    24. Domain for 2dqg:
    25. Domain for 2dqh:
    26. Domain for 2dqi:
    27. Domain for 2dqj:
    28. Domain for 3hfm:
  20. 782598Mouse (Mus musculus), cluster 7.3 [TaxId:10090] [88559] (2 PDB entries)
    1. Domain for 1acy:
    2. Domain for 1ai1:
  21. 782601Rat (Rattus norvegicus) [TaxId:10116] [88560] (16 PDB entries)
    1. Domain for 1bey:
    2. Domains for 1bfo:
      1. 782614Domain d1bfob1: 1bfo B:1-121 [20311]
        Other proteins in same PDB: d1bfoa1, d1bfoa2, d1bfob2, d1bfoc1, d1bfoc2, d1bfod2, d1bfoe1, d1bfoe2, d1bfof2, d1bfog1, d1bfog2, d1bfoh2
        part of therapeutic monoclonal antibody CAMPATH-1G
      2. 782615Domain d1bfod1: 1bfo D:1-121 [20313]
        Other proteins in same PDB: d1bfoa1, d1bfoa2, d1bfob2, d1bfoc1, d1bfoc2, d1bfod2, d1bfoe1, d1bfoe2, d1bfof2, d1bfog1, d1bfog2, d1bfoh2
        part of therapeutic monoclonal antibody CAMPATH-1G
      3. 782616Domain d1bfof1: 1bfo F:1-121 [20315]
        Other proteins in same PDB: d1bfoa1, d1bfoa2, d1bfob2, d1bfoc1, d1bfoc2, d1bfod2, d1bfoe1, d1bfoe2, d1bfof2, d1bfog1, d1bfog2, d1bfoh2
        part of therapeutic monoclonal antibody CAMPATH-1G
      4. 782617Domain d1bfoh1: 1bfo H:1-121 [20317]
        Other proteins in same PDB: d1bfoa1, d1bfoa2, d1bfob2, d1bfoc1, d1bfoc2, d1bfod2, d1bfoe1, d1bfoe2, d1bfof2, d1bfog1, d1bfog2, d1bfoh2
        part of therapeutic monoclonal antibody CAMPATH-1G
    3. Domains for 1c5d:
      1. 782623Domain d1c5db1: 1c5d B:1-117 [20415]
        Other proteins in same PDB: d1c5da1, d1c5da2, d1c5db2, d1c5dh2, d1c5dl1, d1c5dl2
        part of antibody against the main immunogenic region of the human muscle acetylcholine receptor
      2. 782624Domain d1c5dh1: 1c5d H:1-117 [20413]
        Other proteins in same PDB: d1c5da1, d1c5da2, d1c5db2, d1c5dh2, d1c5dl1, d1c5dl2
        part of antibody against the main immunogenic region of the human muscle acetylcholine receptor
    4. Domain for 1ce1:
    5. Domain for 1f3r:
      • 782630Domain d1f3rb1: 1f3r B:1-123 [20416]
        Other proteins in same PDB: d1f3rb2
        part of scFv MAB198 against the main immunogenic region of the human muscle acetylcholine receptor; order: VH-linker-VL
        mutant
    6. Domains for 1fn4:
      1. 782628Domain d1fn4b1: 1fn4 B:1-106 [59886]
        Other proteins in same PDB: d1fn4a1, d1fn4a2, d1fn4b2, d1fn4c1, d1fn4c2, d1fn4d2
        part of Fab 198 against acetylcholine receptor
      2. 782629Domain d1fn4d1: 1fn4 D:1-106 [59890]
        Other proteins in same PDB: d1fn4a1, d1fn4a2, d1fn4b2, d1fn4c1, d1fn4c2, d1fn4d2
        part of Fab 198 against acetylcholine receptor
    7. Domains for 1lk3:
      1. 782603Domain d1lk3h1: 1lk3 H:1-119 [73952]
        Other proteins in same PDB: d1lk3a_, d1lk3b_, d1lk3h2, d1lk3i2, d1lk3l1, d1lk3l2, d1lk3m1, d1lk3m2
        part of anti-IL-10 Fab 9D7
      2. 782604Domain d1lk3i1: 1lk3 I:1-119 [73954]
        Other proteins in same PDB: d1lk3a_, d1lk3b_, d1lk3h2, d1lk3i2, d1lk3l1, d1lk3l2, d1lk3m1, d1lk3m2
        part of anti-IL-10 Fab 9D7
    8. Domain for 1oaq:
    9. Domains for 1oar:
      1. 782610Domain d1oarh_: 1oar H: [92709]
        Other proteins in same PDB: d1oarl_, d1oarm_, d1oarn_, d1oaro_
        part of IgE Fv spe-7
      2. 782611Domain d1oari_: 1oar I: [92710]
        Other proteins in same PDB: d1oarl_, d1oarm_, d1oarn_, d1oaro_
        part of IgE Fv spe-7
      3. 782612Domain d1oarj_: 1oar J: [92711]
        Other proteins in same PDB: d1oarl_, d1oarm_, d1oarn_, d1oaro_
        part of IgE Fv spe-7
      4. 782613Domain d1oark_: 1oar K: [92712]
        Other proteins in same PDB: d1oarl_, d1oarm_, d1oarn_, d1oaro_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with azn, cac, cl, dms, edo, na
    10. Domains for 1oau:
      1. 782605Domain d1oauh_: 1oau H: [92717]
        Other proteins in same PDB: d1oaul_, d1oaum_, d1oaun_, d1oauo_
        part of IgE Fv spe-7
      2. 782606Domain d1oaui_: 1oau I: [92718]
        Other proteins in same PDB: d1oaul_, d1oaum_, d1oaun_, d1oauo_
        part of IgE Fv spe-7
      3. 782607Domain d1oauj_: 1oau J: [92719]
        Other proteins in same PDB: d1oaul_, d1oaum_, d1oaun_, d1oauo_
        part of IgE Fv spe-7
      4. 782608Domain d1oauk_: 1oau K: [92720]
        Other proteins in same PDB: d1oaul_, d1oaum_, d1oaun_, d1oauo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with dnf, imd, ser
    11. Domains for 1oax:
      1. 782618Domain d1oaxh_: 1oax H: [92725]
        Other proteins in same PDB: d1oaxl_, d1oaxm_, d1oaxn_, d1oaxo_
        part of IgE Fv spe-7
      2. 782619Domain d1oaxj_: 1oax J: [92727]
        Other proteins in same PDB: d1oaxl_, d1oaxm_, d1oaxn_, d1oaxo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with anq
    12. Domains for 1oay:
      1. 782620Domain d1oayh_: 1oay H: [92733]
        Other proteins in same PDB: d1oayl_, d1oaym_, d1oayn_, d1oayo_
        part of IgE Fv spe-7
      2. 782621Domain d1oayj_: 1oay J: [92735]
        Other proteins in same PDB: d1oayl_, d1oaym_, d1oayn_, d1oayo_
        part of IgE Fv spe-7
        complexed with fur
    13. Domains for 1oaz:
      1. 782632Domain d1oazh_: 1oaz H: [92743]
        Other proteins in same PDB: d1oaza_, d1oazb_, d1oazl_, d1oazn_
        part of IgE Fv spe-7
      2. 782633Domain d1oazj_: 1oaz J: [92744]
        Other proteins in same PDB: d1oaza_, d1oazb_, d1oazl_, d1oazn_
        part of IgE Fv spe-7
    14. Domain for 1ocw:
    15. Domains for 2arj:
      1. 782625Domain d2arjb1: 2arj B:1-113 [144831]
        Other proteins in same PDB: d2arja1, d2arja2, d2arjb2, d2arjh2, d2arjl1, d2arjl2, d2arjq1, d2arjr1
      2. 782626Domain d2arjh1: 2arj H:1-113 [144833]
        Other proteins in same PDB: d2arja1, d2arja2, d2arjb2, d2arjh2, d2arjl1, d2arjl2, d2arjq1, d2arjr1
        automatically matched to 2ARJ B:1-113
    16. Domain for 2bjm:
  22. 782634synthetic construct [TaxId:32630] [158862] (2 PDB entries)
    1. Domain for 2r0k:
    2. Domain for 2r0l:

More info for Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like)

Timeline for Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like):

  • Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) first appeared in SCOP 1.65
  • Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) appears in SCOP 1.73
  • Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) appears in SCOPe 2.01
  • Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH from b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) appears in the current release, SCOPe 2.08