Lineage for Protein: Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH

  1. Root: SCOP 1.67
  2. 362614Class b: All beta proteins [48724] (141 folds)
  3. 362615Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (22 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 362616Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 362617Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (24 proteins)
  6. 362751Protein Immunoglobulin heavy chain variable domain, VH [88543] (20 species)
    VH domains of human and mouse antibodies are clustered by the sequence similarity within the germline encoded segment and then by the size of the complementarity determining regions CDR1 and CDR2, so the clusters may correspond to putative germline families in the species genomes; VH domains with artificial or grafted exogenous CDRs are listed as engineered species

Species:

  1. 362752Engineered (including hybrid species) [88562] (28 PDB entries)
    1. Domains for 1ad0:
      1. 362773Domain d1ad0b1: 1ad0 B:1-113 [20125]
        Other proteins in same PDB: d1ad0a1, d1ad0a2, d1ad0b2, d1ad0c1, d1ad0c2, d1ad0d2
      2. 362774Domain d1ad0d1: 1ad0 D:1-113 [20127]
        Other proteins in same PDB: d1ad0a1, d1ad0a2, d1ad0b2, d1ad0c1, d1ad0c2, d1ad0d2
        part of humanized Fab A5B7
    2. Domains for 1ad9:
      1. 362780Domain d1ad9b1: 1ad9 B:1-113 [20215]
        Other proteins in same PDB: d1ad9a1, d1ad9a2, d1ad9b2, d1ad9h2, d1ad9l1, d1ad9l2
        part of humanized Fab CTM01
        complexed with so4
      2. 362781Domain d1ad9h1: 1ad9 H:1-113 [20213]
        Other proteins in same PDB: d1ad9a1, d1ad9a2, d1ad9b2, d1ad9h2, d1ad9l1, d1ad9l2
    3. Domain for 1b2w:
    4. Domains for 1bvk:
      1. 362784Domain d1bvkb_: 1bvk B: [20279]
        Other proteins in same PDB: d1bvka_, d1bvkc_, d1bvkd_, d1bvkf_
      2. 362785Domain d1bvke_: 1bvk E: [20281]
        Other proteins in same PDB: d1bvka_, d1bvkc_, d1bvkd_, d1bvkf_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
    5. Domains for 1bvl:
      1. 362787Domain d1bvla_: 1bvl A: [20282]
        Other proteins in same PDB: d1bvlb_, d1bvld_
      2. 362788Domain d1bvlc_: 1bvl C: [20284]
        Other proteins in same PDB: d1bvlb_, d1bvld_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
    6. Domain for 1fgv:
    7. Domains for 1fvc:
      1. 362766Domain d1fvcb_: 1fvc B: [19863]
        Other proteins in same PDB: d1fvca_, d1fvcc_
      2. 362767Domain d1fvcd_: 1fvc D: [19865]
        Other proteins in same PDB: d1fvca_, d1fvcc_
        part of humanized Fv 4D5, herceptin
    8. Domains for 1fvd:
      1. 362771Domain d1fvdb1: 1fvd B:1-120 [19867]
        Other proteins in same PDB: d1fvda1, d1fvda2, d1fvdb2, d1fvdc1, d1fvdc2, d1fvdd2
      2. 362772Domain d1fvdd1: 1fvd D:1-120 [19869]
        Other proteins in same PDB: d1fvda1, d1fvda2, d1fvdb2, d1fvdc1, d1fvdc2, d1fvdd2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
    9. Domains for 1fve:
      1. 362775Domain d1fveb1: 1fve B:1-120 [19871]
        Other proteins in same PDB: d1fvea1, d1fvea2, d1fveb2, d1fvec1, d1fvec2, d1fved2
      2. 362776Domain d1fved1: 1fve D:1-120 [19873]
        Other proteins in same PDB: d1fvea1, d1fvea2, d1fveb2, d1fvec1, d1fvec2, d1fved2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
    10. Domains for 1gpo:
      1. 362763Domain d1gpoh1: 1gpo H:1-113 [20225]
        Other proteins in same PDB: d1gpoh2, d1gpoi2, d1gpol1, d1gpol2, d1gpom1, d1gpom2
      2. 362764Domain d1gpoi1: 1gpo I:1-113 [20227]
        Other proteins in same PDB: d1gpoh2, d1gpoi2, d1gpol1, d1gpol2, d1gpom1, d1gpom2
        part of Fab M41 (artificial design)
        complexed with so4
    11. Domains for 1i9r:
      1. 362791Domain d1i9rh1: 1i9r H:1-118 [71151]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
      2. 362792Domain d1i9rk1: 1i9r K:1-118 [71153]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
      3. 362793Domain d1i9rx1: 1i9r X:1-118 [71159]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh2, d1i9rk2, d1i9rl1, d1i9rl2, d1i9rm1, d1i9rm2, d1i9rx2, d1i9ry1, d1i9ry2
        complexed with zn
    12. Domain for 1it9:
    13. Domain for 1jps:
    14. Domain for 1jpt:
    15. Domain for 1l7i:
    16. Domains for 1mhp:
      1. 362778Domain d1mhph1: 1mhp H:1-118 [84967]
        Other proteins in same PDB: d1mhpa_, d1mhpb_, d1mhph2, d1mhpl1, d1mhpl2, d1mhpy_
        part of humanized anti-alpha1 integrin I-domain Fab
        complexed with mn; mutant
      2. 362779Domain d1mhpx_: 1mhp X: [84971]
        Other proteins in same PDB: d1mhpa_, d1mhpb_, d1mhph2, d1mhpl1, d1mhpl2, d1mhpy_
        part of humanized anti-alpha1 integrin I-domain Fab; only V domain is ordered
        complexed with mn; mutant
    17. Domain for 1n8z:
    18. Domains for 1ohq:
      1. 362761Domain d1ohqa_: 1ohq A: [93027]
      2. 362762Domain d1ohqb_: 1ohq B: [93028]
        soluble VH Hel4, resistant to aggregation
    19. Domains for 1ol0:
      1. 362753Domain d1ol0a_: 1ol0 A: [93296]
      2. 362754Domain d1ol0b_: 1ol0 B: [93297]
        camelized human VH
        complexed with gol, so4
    20. Domains for 1om3:
      1. 362769Domain d1om3h1: 1om3 H:1-115 [87059]
        Other proteins in same PDB: d1om3h2, d1om3k2, d1om3l1, d1om3l2, d1om3m1, d1om3m2
      2. 362770Domain d1om3k1: 1om3 K:1-115 [87061]
        Other proteins in same PDB: d1om3h2, d1om3k2, d1om3l1, d1om3l2, d1om3m1, d1om3m2
        part of engineered Fab 2G12
    21. Domains for 1op3:
      1. 362759Domain d1op3h1: 1op3 H:1-115 [87208]
        Other proteins in same PDB: d1op3h2, d1op3k1, d1op3k2, d1op3l1, d1op3l2, d1op3m2
      2. 362760Domain d1op3m1: 1op3 M:1-115 [87214]
        Other proteins in same PDB: d1op3h2, d1op3k1, d1op3k2, d1op3l1, d1op3l2, d1op3m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with box, man
    22. Domains for 1op5:
      1. 362796Domain d1op5h1: 1op5 H:1-115 [87216]
        Other proteins in same PDB: d1op5h2, d1op5k1, d1op5k2, d1op5l1, d1op5l2, d1op5m2
      2. 362797Domain d1op5m1: 1op5 M:1-115 [87222]
        Other proteins in same PDB: d1op5h2, d1op5k1, d1op5k2, d1op5l1, d1op5l2, d1op5m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with man, nag
    23. Domains for 1pg7:
      1. 362789Domain d1pg7h1: 1pg7 H:1-117 [94674]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x1, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z1, d1pg7z2
      2. 362790Domain d1pg7i1: 1pg7 I:1-117 [94676]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h2, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x1, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z1, d1pg7z2
        part of humanized Fab D3H44 against human tissue factor
    24. Domains for 1s78:
      1. 362794Domain d1s78d1: 1s78 D:1-113 [98626]
        Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c1, d1s78c2, d1s78d2, d1s78e1, d1s78e2, d1s78f2
      2. 362795Domain d1s78f1: 1s78 F:1-113 [98630]
        Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c1, d1s78c2, d1s78d2, d1s78e1, d1s78e2, d1s78f2
        part of anti-ERBb2 Fab Pertuzumab
        complexed with man, nag
    25. Domain for 1vhp:
    26. Domain for 2f5a:
    27. Domain for 2f5b:
    28. Domain for 2fgw:
  2. 362799Hamster (Cricetulus griseus) [TaxId:10029] [88561] (1 PDB entry)
  3. 362802Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] [88544] (16 PDB entries)
    1. Domain for 1g9m:
    2. Domain for 1g9n:
    3. Domain for 1gc1:
    4. Domains for 1hzh:
      1. 362819Domain d1hzhh1: 1hzh H:1-113 [61437]
        Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2
      2. 362820Domain d1hzhk1: 1hzh K:1-113 [61441]
        Other proteins in same PDB: d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl1, d1hzhl2, d1hzhm1, d1hzhm2
        part of intact IgG B12 antibody
        complexed with fuc, gal, man, nag
    5. Domain for 1iqd:
    6. Domain for 1jv5:
    7. Domains for 1n0x:
      1. 362804Domain d1n0xh1: 1n0x H:1-113 [91528]
        Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2
      2. 362805Domain d1n0xk1: 1n0x K:1-113 [91530]
        Other proteins in same PDB: d1n0xh2, d1n0xk2, d1n0xl1, d1n0xl2, d1n0xm1, d1n0xm2
        part of an anti HIV-1 Fab
        complexed with cxs, gol, k, orn, so4
    8. Domains for 1rhh:
      1. 362811Domain d1rhhb1: 1rhh B:3-113 [97475]
        Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2
      2. 362812Domain d1rhhd1: 1rhh D:4-113 [97479]
        Other proteins in same PDB: d1rhha1, d1rhha2, d1rhhb2, d1rhhc1, d1rhhc2, d1rhhd2
        part of HIV-1 neutralizing Fab x5
    9. Domain for 1rz7:
    10. Domains for 1rz8:
      1. 362814Domain d1rz8b1: 1rz8 B:1-113 [98139]
        Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2
      2. 362815Domain d1rz8d1: 1rz8 D:1-113 [98143]
        Other proteins in same PDB: d1rz8a1, d1rz8a2, d1rz8b2, d1rz8c1, d1rz8c2, d1rz8d2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 17B
    11. Domain for 1rzf:
    12. Domains for 1rzg:
      1. 362807Domain d1rzga1: 1rzg A:1-113 [98154]
        Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2
      2. 362808Domain d1rzgc1: 1rzg C:2-113 [98158]
        Other proteins in same PDB: d1rzga2, d1rzgb1, d1rzgb2, d1rzgc2, d1rzgd1, d1rzgd2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D
        complexed with suc
    13. Domains for 1rzi:
      1. 362823Domain d1rzib1: 1rzi B:1-113 [98168]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
      2. 362824Domain d1rzid1: 1rzi D:1-113 [98172]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
      3. 362825Domain d1rzif1: 1rzi F:1-113 [98176]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
      4. 362826Domain d1rzih1: 1rzi H:1-113 [98180]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
      5. 362827Domain d1rzij1: 1rzi J:1-113 [98184]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
      6. 362828Domain d1rzil1: 1rzi L:1-113 [98188]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
      7. 362829Domain d1rzin1: 1rzi N:1-113 [98192]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
      8. 362830Domain d1rzip1: 1rzi P:1-113 [98196]
        Other proteins in same PDB: d1rzia1, d1rzia2, d1rzib2, d1rzic1, d1rzic2, d1rzid2, d1rzie1, d1rzie2, d1rzif2, d1rzig1, d1rzig2, d1rzih2, d1rzii1, d1rzii2, d1rzij2, d1rzik1, d1rzik2, d1rzil2, d1rzim1, d1rzim2, d1rzin2, d1rzio1, d1rzio2, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
    14. Domain for 1rzj:
    15. Domain for 1rzk:
    16. Domain for 1vge:
  4. 362831Human (Homo sapiens), cluster 2.1 [TaxId:9606] [88545] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1dn0:
      1. 362833Domain d1dn0b1: 1dn0 B:1-120 [19831]
        Other proteins in same PDB: d1dn0a1, d1dn0a2, d1dn0b2, d1dn0c1, d1dn0c2, d1dn0d2
      2. 362834Domain d1dn0d1: 1dn0 D:1-120 [19833]
        Other proteins in same PDB: d1dn0a1, d1dn0a2, d1dn0b2, d1dn0c1, d1dn0c2, d1dn0d2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
    2. Domains for 1qlr:
      1. 362835Domain d1qlrb1: 1qlr B:1-120 [19835]
        Other proteins in same PDB: d1qlra1, d1qlra2, d1qlrb2, d1qlrc1, d1qlrc2, d1qlrd2
      2. 362836Domain d1qlrd1: 1qlr D:1-120 [19837]
        Other proteins in same PDB: d1qlra1, d1qlra2, d1qlrb2, d1qlrc1, d1qlrc2, d1qlrd2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
        complexed with fuc, nag
    3. Domain for 7fab:
  5. 362837Human (Homo sapiens), cluster 2.2 [TaxId:9606] [88546] (1 PDB entry)
  6. 362839Human (Homo sapiens), cluster 3 [TaxId:9606] [88547] (11 PDB entries)
    1. Domain for 1adq:
    2. Domain for 1aqk:
    3. Domains for 1dee:
      1. 362848Domain d1deeb1: 1dee B:501-621 [20443]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
      2. 362849Domain d1deed1: 1dee D:1501-1621 [20445]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
      3. 362850Domain d1deef1: 1dee F:2501-2621 [20447]
        Other proteins in same PDB: d1deea1, d1deea2, d1deeb2, d1deec1, d1deec2, d1deed2, d1deee1, d1deee2, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
        part of IgM RF 2A2
    4. Domain for 1dfb:
    5. Domain for 1dql:
    6. Domains for 1hez:
      1. 362851Domain d1hezb1: 1hez B:1-121 [60985]
        Other proteins in same PDB: d1heza1, d1heza2, d1hezb2, d1hezc1, d1hezc2, d1hezd2, d1heze_
      2. 362852Domain d1hezd1: 1hez D:1-121 [60989]
        Other proteins in same PDB: d1heza1, d1heza2, d1hezb2, d1hezc1, d1hezc2, d1hezd2, d1heze_
        part of IgM RF 2A2
        complexed with imd
    7. Domain for 1igm:
    8. Domain for 1nl0:
    9. Domain for 2fb4:
    10. Domain for 2ig2:
    11. Domains for 8fab:
      1. 362840Domain d8fabb1: 8fab B:1-121 [19773]
        Other proteins in same PDB: d8faba1, d8faba2, d8fabb2, d8fabc1, d8fabc2, d8fabd2
      2. 362841Domain d8fabd1: 8fab D:1-121 [19775]
        Other proteins in same PDB: d8faba1, d8faba2, d8fabb2, d8fabc1, d8fabc2, d8fabd2
        part of Fab HIL
  7. 362855Human (Homo sapiens), cluster 4 [TaxId:9606] [101505] (1 PDB entry)
  8. 362858Mouse (Mus musculus), cluster 1 [TaxId:10090] [88548] (41 PDB entries)
    1. Domains for 1aif:
      1. 362908Domain d1aifb1: 1aif B:1-121 [20077]
        Other proteins in same PDB: d1aifa1, d1aifa2, d1aifb2, d1aifh2, d1aifl1, d1aifl2
      2. 362909Domain d1aifh1: 1aif H:1-121 [20079]
        Other proteins in same PDB: d1aifa1, d1aifa2, d1aifb2, d1aifh2, d1aifl1, d1aifl2
        part of Fab 409.5.3
    2. Domain for 1axt:
    3. Domain for 1cbv:
    4. Domain for 1ck0:
    5. Domain for 1clo:
    6. Domain for 1dlf:
    7. Domains for 1fl5:
      1. 362883Domain d1fl5b1: 1fl5 B:1-113 [65017]
        Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5a2, d1fl5b2, d1fl5h2, d1fl5l1, d1fl5l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with so4; mutant
      2. 362884Domain d1fl5h1: 1fl5 H:1-113 [65019]
        Other proteins in same PDB: d1fl5a1, d1fl5a2, d1fl5b2, d1fl5h2, d1fl5l1, d1fl5l2
    8. Domains for 1fl6:
      1. 362894Domain d1fl6b1: 1fl6 B:1-113 [65025]
        Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6a2, d1fl6b2, d1fl6h2, d1fl6l1, d1fl6l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with aah; mutant
      2. 362895Domain d1fl6h1: 1fl6 H:1-113 [65027]
        Other proteins in same PDB: d1fl6a1, d1fl6a2, d1fl6b2, d1fl6h2, d1fl6l1, d1fl6l2
    9. Domain for 1flr:
    10. Domain for 1iai:
    11. Domain for 1kel:
    12. Domain for 1kem:
    13. Domain for 1m71:
    14. Domain for 1m7d:
    15. Domain for 1m7i:
    16. Domain for 1mam:
    17. Domain for 1mcp:
    18. Domain for 1nbv:
    19. Domain for 1pz5:
    20. Domain for 1q72:
    21. Domain for 1q9k:
    22. Domains for 1q9l:
      1. 362886Domain d1q9lb1: 1q9l B:1-111 [96282]
        Other proteins in same PDB: d1q9la1, d1q9la2, d1q9lb2, d1q9lc1, d1q9lc2, d1q9ld2
      2. 362887Domain d1q9ld1: 1q9l D:1-111 [96286]
        Other proteins in same PDB: d1q9la1, d1q9la2, d1q9lb2, d1q9lc1, d1q9lc2, d1q9ld2
        part of Fab s25-2
        complexed with mg, zn
    23. Domains for 1q9o:
      1. 362870Domain d1q9ob1: 1q9o B:1-111 [96294]
        Other proteins in same PDB: d1q9oa1, d1q9oa2, d1q9ob2, d1q9oc1, d1q9oc2, d1q9od2
      2. 362871Domain d1q9od1: 1q9o D:1-111 [96298]
        Other proteins in same PDB: d1q9oa1, d1q9oa2, d1q9ob2, d1q9oc1, d1q9oc2, d1q9od2
        part of Fab s45-18
        complexed with mg
    24. Domain for 1q9q:
    25. Domain for 1q9r:
    26. Domain for 1q9t:
    27. Domain for 1q9v:
    28. Domains for 1q9w:
      1. 362867Domain d1q9wb1: 1q9w B:1-111 [96322]
        Other proteins in same PDB: d1q9wa1, d1q9wa2, d1q9wb2, d1q9wc1, d1q9wc2, d1q9wd2
      2. 362868Domain d1q9wd1: 1q9w D:1-111 [96326]
        Other proteins in same PDB: d1q9wa1, d1q9wa2, d1q9wb2, d1q9wc1, d1q9wc2, d1q9wd2
        part of Fab s45-18
        complexed with gp1, gp4, kdo, mg
    29. Domain for 1qyg:
    30. Domain for 1rfd:
    31. Domain for 1riu:
    32. Domain for 1riv:
    33. Domain for 1sbs:
    34. Domain for 1sm3:
    35. Domains for 1v7m:
      1. 362896Domain d1v7mh1: 1v7m H:1-116 [100450]
        Other proteins in same PDB: d1v7mh2, d1v7mi2, d1v7ml1, d1v7ml2, d1v7mm1, d1v7mm2, d1v7mv_, d1v7mx_
      2. 362897Domain d1v7mi1: 1v7m I:1-116 [100452]
        Other proteins in same PDB: d1v7mh2, d1v7mi2, d1v7ml1, d1v7ml2, d1v7mm1, d1v7mm2, d1v7mv_, d1v7mx_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
    36. Domains for 1v7n:
      1. 362904Domain d1v7nh1: 1v7n H:1-116 [100460]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
      2. 362905Domain d1v7ni1: 1v7n I:1-116 [100462]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
      3. 362906Domain d1v7nj1: 1v7n J:1-116 [100464]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
      4. 362907Domain d1v7nk1: 1v7n K:1-116 [100466]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh2, d1v7ni2, d1v7nj2, d1v7nk2, d1v7nl1, d1v7nl2, d1v7nm1, d1v7nm2, d1v7nn1, d1v7nn2, d1v7no1, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
        mutant
    37. Domain for 2ck0:
    38. Domain for 2dlf:
    39. Domain for 2mcp:
    40. Domain for 3ck0:
    41. Domain for 4fab:
  9. 362910Mouse (Mus musculus), cluster 2.1 [TaxId:10090] [88549] (16 PDB entries)
    1. Domains for 1fl3:
      1. 362928Domain d1fl3a1: 1fl3 A:2-116 [20486]
        Other proteins in same PDB: d1fl3a2, d1fl3b1, d1fl3b2, d1fl3h2, d1fl3l1, d1fl3l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        complexed with spb
      2. 362929Domain d1fl3h1: 1fl3 H:2-116 [20484]
        Other proteins in same PDB: d1fl3a2, d1fl3b1, d1fl3b2, d1fl3h2, d1fl3l1, d1fl3l2
    2. Domain for 1hyx:
    3. Domain for 1hyy:
    4. Domain for 1i9i:
    5. Domain for 1i9j:
    6. Domain for 1jgu:
    7. Domain for 1jgv:
    8. Domains for 1kfa:
      1. 362932Domain d1kfah1: 1kfa H:2-121 [77361]
        Other proteins in same PDB: d1kfah2, d1kfai2, d1kfal1, d1kfal2, d1kfam1, d1kfam2
      2. 362933Domain d1kfai1: 1kfa I:3-121 [77363]
        Other proteins in same PDB: d1kfah2, d1kfai2, d1kfal1, d1kfal2, d1kfam1, d1kfam2
        part of anti-gibberellin A4 Fab 4-B8(8)/E9; conflict: annotated in PDB as human protein
        complexed with ga4
    9. Domain for 1l7s:
    10. Domain for 1l7t:
    11. Domains for 1lo0:
      1. 362915Domain d1lo0h1: 1lo0 H:1-119 [74115]
        Other proteins in same PDB: d1lo0h2, d1lo0l1, d1lo0l2, d1lo0x1, d1lo0x2, d1lo0y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with bc1
      2. 362916Domain d1lo0y1: 1lo0 Y:1-119 [74121]
        Other proteins in same PDB: d1lo0h2, d1lo0l1, d1lo0l2, d1lo0x1, d1lo0x2, d1lo0y2
    12. Domains for 1lo2:
      1. 362917Domain d1lo2h1: 1lo2 H:1-119 [74123]
        Other proteins in same PDB: d1lo2h2, d1lo2l1, d1lo2l2, d1lo2x1, d1lo2x2, d1lo2y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with ox1
      2. 362918Domain d1lo2y1: 1lo2 Y:1-119 [74129]
        Other proteins in same PDB: d1lo2h2, d1lo2l1, d1lo2l2, d1lo2x1, d1lo2x2, d1lo2y2
    13. Domains for 1lo3:
      1. 362923Domain d1lo3h1: 1lo3 H:1-119 [74131]
        Other proteins in same PDB: d1lo3h2, d1lo3l1, d1lo3l2, d1lo3x1, d1lo3x2, d1lo3y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with an1
      2. 362924Domain d1lo3y1: 1lo3 Y:1-119 [74137]
        Other proteins in same PDB: d1lo3h2, d1lo3l1, d1lo3l2, d1lo3x1, d1lo3x2, d1lo3y2
    14. Domain for 1lo4:
    15. Domains for 1ub5:
      1. 362920Domain d1ub5a1: 1ub5 A:1-116 [99143]
        Other proteins in same PDB: d1ub5a2, d1ub5b1, d1ub5b2, d1ub5h2, d1ub5l1, d1ub5l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        complexed with spb
      2. 362921Domain d1ub5h1: 1ub5 H:1-116 [99147]
        Other proteins in same PDB: d1ub5a2, d1ub5b1, d1ub5b2, d1ub5h2, d1ub5l1, d1ub5l2
    16. Domains for 1ub6:
      1. 362926Domain d1ub6a1: 1ub6 A:2-116 [99151]
        Other proteins in same PDB: d1ub6a2, d1ub6b1, d1ub6b2, d1ub6h2, d1ub6l1, d1ub6l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
      2. 362927Domain d1ub6h1: 1ub6 H:2-116 [99155]
        Other proteins in same PDB: d1ub6a2, d1ub6b1, d1ub6b2, d1ub6h2, d1ub6l1, d1ub6l2
  10. 362934Mouse (Mus musculus), cluster 2.2 [TaxId:10090] [88550] (47 PDB entries)
    1. Domain for 1ar1:
    2. Domain for 1bfv:
    3. Domains for 1bln:
      1. 362979Domain d1blnb1: 1bln B:1-113 [20331]
        Other proteins in same PDB: d1blna1, d1blna2, d1blnb2, d1blnc1, d1blnc2, d1blnd2
      2. 362980Domain d1blnd1: 1bln D:1-113 [20333]
        Other proteins in same PDB: d1blna1, d1blna2, d1blnb2, d1blnc1, d1blnc2, d1blnd2
        part of anti-P-glycoprotein Fab MRK-16
    4. Domain for 1bm3:
    5. Domain for 1bz7:
    6. Domain for 1cfv:
    7. Domain for 1cly:
    8. Domain for 1clz:
    9. Domain for 1dsf:
      • 362946Domain d1dsfh_: 1dsf H: [20247]
        Other proteins in same PDB: d1dsfl_
        part of anticancer Fv B1; disulfide-stabilized
        mutant
    10. Domain for 1ejo:
    11. Domain for 1f4w:
    12. Domain for 1f4x:
    13. Domain for 1f4y:
    14. Domain for 1fh5:
    15. Domain for 1frg:
    16. Domain for 1h0d:
    17. Domain for 1h3p:
    18. Domains for 1hil:
      1. 362939Domain d1hilb1: 1hil B:1-112 [19787]
        Other proteins in same PDB: d1hila1, d1hila2, d1hilb2, d1hilc1, d1hilc2, d1hild2
      2. 362940Domain d1hild1: 1hil D:1-112 [19789]
        Other proteins in same PDB: d1hila1, d1hila2, d1hilb2, d1hilc1, d1hilc2, d1hild2
        part of Fab 17/9
    19. Domains for 1him:
      1. 362974Domain d1himl1: 1him L:1-112 [19792]
        Other proteins in same PDB: d1himh1, d1himh2, d1himj1, d1himj2, d1himl2, d1himm2
      2. 362975Domain d1himm1: 1him M:1-112 [19794]
        Other proteins in same PDB: d1himh1, d1himh2, d1himj1, d1himj2, d1himl2, d1himm2
        part of Fab 17/9; chain identifiers are mixed up
        complexed with nh2
    20. Domain for 1hin:
    21. Domain for 1i8i:
      • 362947Domain d1i8ib_: 1i8i B: [71129]
        Other proteins in same PDB: d1i8ia_
        part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
        mutant
    22. Domain for 1i8k:
      • 362936Domain d1i8kb_: 1i8k B: [71131]
        Other proteins in same PDB: d1i8ka_
        part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
        mutant
    23. Domain for 1ifh:
    24. Domain for 1igc:
    25. Domains for 1igf:
      1. 362967Domain d1igfh1: 1igf H:1-113 [19813]
        Other proteins in same PDB: d1igfh2, d1igfj2, d1igfl1, d1igfl2, d1igfm1, d1igfm2
      2. 362968Domain d1igfj1: 1igf J:1-113 [19815]
        Other proteins in same PDB: d1igfh2, d1igfj2, d1igfl1, d1igfl2, d1igfm1, d1igfm2
        part of Fab B13I2
        complexed with nag
    26. Domains for 1igt:
      1. 362971Domain d1igtb1: 1igt B:1-114 [19765]
        Other proteins in same PDB: d1igta1, d1igta2, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc1, d1igtc2, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
      2. 362972Domain d1igtd1: 1igt D:1-114 [19767]
        Other proteins in same PDB: d1igta1, d1igta2, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc1, d1igtc2, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
        part of intact IgG2a antibody Mab231
        complexed with fuc, gal, man, nag
    27. Domain for 1ikf:
    28. Domain for 1ind:
    29. Domain for 1ine:
    30. Domains for 1kno:
      1. 362984Domain d1knob1: 1kno B:1-119 [20009]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
      2. 362985Domain d1knod1: 1kno D:1-119 [20011]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
      3. 362986Domain d1knof1: 1kno F:1-119 [20013]
        Other proteins in same PDB: d1knoa1, d1knoa2, d1knob2, d1knoc1, d1knoc2, d1knod2, d1knoe1, d1knoe2, d1knof2
        part of Fab CNJ206
        complexed with pnp, zn
    31. Domains for 1mf2:
      1. 362959Domain d1mf2h1: 1mf2 H:1-113 [20175]
        Other proteins in same PDB: d1mf2h2, d1mf2l1, d1mf2l2, d1mf2m1, d1mf2m2, d1mf2n2
      2. 362960Domain d1mf2n1: 1mf2 N:1-113 [20177]
        Other proteins in same PDB: d1mf2h2, d1mf2l1, d1mf2l2, d1mf2m1, d1mf2m2, d1mf2n2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
    32. Domain for 1mqk:
      • 362935Domain d1mqkh_: 1mqk H: [85053]
        Other proteins in same PDB: d1mqkl_
        part of Fv against Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase
    33. Domain for 1opg:
    34. Domains for 1ots:
      1. 362976Domain d1otsc1: 1ots C:2-121 [87417]
        Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc2, d1otsd1, d1otsd2, d1otse2, d1otsf1, d1otsf2
      2. 362977Domain d1otse1: 1ots E:2-121 [87421]
        Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc2, d1otsd1, d1otsd2, d1otse2, d1otsf1, d1otsf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl
    35. Domains for 1ott:
      1. 362992Domain d1ottc1: 1ott C:2-121 [87427]
        Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc2, d1ottd1, d1ottd2, d1otte2, d1ottf1, d1ottf2
      2. 362993Domain d1otte1: 1ott E:2-121 [87431]
        Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc2, d1ottd1, d1ottd2, d1otte2, d1ottf1, d1ottf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
    36. Domains for 1otu:
      1. 362990Domain d1otuc1: 1otu C:2-121 [87437]
        Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc2, d1otud1, d1otud2, d1otue2, d1otuf1, d1otuf2
      2. 362991Domain d1otue1: 1otu E:2-121 [87441]
        Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc2, d1otud1, d1otud2, d1otue2, d1otuf1, d1otuf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
    37. Domain for 1qfw:
    38. Domain for 1qkz:
    39. Domain for 1qle:
    40. Domains for 1r24:
      1. 362988Domain d1r24b1: 1r24 B:1-122 [20405]
        Other proteins in same PDB: d1r24a1, d1r24a2, d1r24b2, d1r24c1, d1r24c2, d1r24d2
      2. 362989Domain d1r24d1: 1r24 D:1-122 [20407]
        Other proteins in same PDB: d1r24a1, d1r24a2, d1r24b2, d1r24c1, d1r24c2, d1r24d2
        part of humanized Fab R24 from murine ascites
    41. Domain for 1ucb:
    42. Domain for 2bfv:
    43. Domain for 2fbj:
    44. Domains for 2gfb:
      1. 362994Domain d2gfbb1: 2gfb B:1-119 [19993]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
      2. 362995Domain d2gfbd1: 2gfb D:1-119 [19995]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
      3. 362996Domain d2gfbf1: 2gfb F:1-119 [19997]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
      4. 362997Domain d2gfbh1: 2gfb H:1-119 [19999]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
      5. 362998Domain d2gfbj1: 2gfb J:1-119 [20001]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
      6. 362999Domain d2gfbl1: 2gfb L:1-119 [20003]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
      7. 363000Domain d2gfbn1: 2gfb N:1-119 [20005]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
      8. 363001Domain d2gfbp1: 2gfb P:1-119 [20007]
        Other proteins in same PDB: d2gfba1, d2gfba2, d2gfbb2, d2gfbc1, d2gfbc2, d2gfbd2, d2gfbe1, d2gfbe2, d2gfbf2, d2gfbg1, d2gfbg2, d2gfbh2, d2gfbi1, d2gfbi2, d2gfbj2, d2gfbk1, d2gfbk2, d2gfbl2, d2gfbm1, d2gfbm2, d2gfbn2, d2gfbo1, d2gfbo2, d2gfbp2
        part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    45. Domain for 2h1p:
    46. Domains for 2hrp:
      1. 362948Domain d2hrph1: 2hrp H:1-113 [20171]
        Other proteins in same PDB: d2hrph2, d2hrpl1, d2hrpl2, d2hrpm1, d2hrpm2, d2hrpn2
      2. 362949Domain d2hrpn1: 2hrp N:1-113 [20173]
        Other proteins in same PDB: d2hrph2, d2hrpl1, d2hrpl2, d2hrpm1, d2hrpm2, d2hrpn2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
    47. Domain for 2igf:
  11. 363002Mouse (Mus musculus), cluster 3.1 [TaxId:10090] [88551] (28 PDB entries)
    1. Domains for 12e8:
      1. 363007Domain d12e8h1: 12e8 H:1-114 [20269]
        Other proteins in same PDB: d12e8h2, d12e8l1, d12e8l2, d12e8m1, d12e8m2, d12e8p2
      2. 363008Domain d12e8p1: 12e8 P:1-114 [20271]
        Other proteins in same PDB: d12e8h2, d12e8l1, d12e8l2, d12e8m1, d12e8m2, d12e8p2
        part of Fab 2E8 specific to the low density lipoprotein receptor binding region of apolipoprotein E
    2. Domain for 15c8:
    3. Domain for 1a3r:
    4. Domain for 1a5f:
    5. Domains for 1ahw:
      1. 363035Domain d1ahwb1: 1ahw B:1-117 [20219]
        Other proteins in same PDB: d1ahwa1, d1ahwa2, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd1, d1ahwd2, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
      2. 363036Domain d1ahwe1: 1ahw E:1-117 [20221]
        Other proteins in same PDB: d1ahwa1, d1ahwa2, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd1, d1ahwd2, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
        part of anti-human tissue factor Fab 5G9
    6. Domain for 1aj7:
    7. Domains for 1ap2:
      1. 363027Domain d1ap2b_: 1ap2 B: [20183]
        Other proteins in same PDB: d1ap2a_, d1ap2c_
      2. 363028Domain d1ap2d_: 1ap2 D: [20185]
        Other proteins in same PDB: d1ap2a_, d1ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
    8. Domain for 1bbd:
    9. Domain for 1cr9:
    10. Domain for 1cu4:
    11. Domain for 1dvf:
      • 363006Domain d1dvfd_: 1dvf D: [20107]
        Other proteins in same PDB: d1dvfa_, d1dvfc_
        part of Fv E5.2, anti-idiotopic antibody to D1.3
        CASP1
        complexed with zn
    12. Domains for 1dzb:
      1. 363013Domain d1dzba1: 1dzb A:1-117 [20488]
        Other proteins in same PDB: d1dzba2, d1dzbb2, d1dzbx_, d1dzby_
      2. 363014Domain d1dzbb1: 1dzb B:1-117 [20490]
        Other proteins in same PDB: d1dzba2, d1dzbb2, d1dzbx_, d1dzby_
        part of anti-lysozyme scFv 1F9
    13. Domain for 1fgn:
    14. Domain for 1gaf:
    15. Domain for 1hkl:
    16. Domain for 1il1:
    17. Domain for 1jnl:
    18. Domain for 1jnn:
    19. Domain for 1k6q:
    20. Domains for 1moe:
      1. 363029Domain d1moea2: 1moe A:120-240 [85031]
        Other proteins in same PDB: d1moea1, d1moeb1
      2. 363030Domain d1moeb2: 1moe B:120-240 [85033]
        Other proteins in same PDB: d1moea1, d1moeb1
        part of anti-CEA scFv T84.66; VL to VH linkage: linker residues 112-119; assembles as a diabody
        complexed with so4
    21. Domain for 1qbl:
    22. Domain for 1qbm:
    23. Domain for 1qok:
    24. Domain for 1wej:
    25. Domain for 25c8:
    26. Domains for 2ap2:
      1. 363025Domain d2ap2b_: 2ap2 B: [20179]
        Other proteins in same PDB: d2ap2a_, d2ap2c_
      2. 363026Domain d2ap2d_: 2ap2 D: [20181]
        Other proteins in same PDB: d2ap2a_, d2ap2c_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
    27. Domain for 2rcs:
    28. Domain for 35c8:
  12. 363037Mouse (Mus musculus), cluster 3.2 [TaxId:10090] [88552] (141 PDB entries)
    1. Domain for 1a0q:
    2. Domain for 1a14:
      • 363130Domain d1a14h_: 1a14 H: [20061]
        Other proteins in same PDB: d1a14l_, d1a14n_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag
    3. Domain for 1a3l:
    4. Domains for 1a6t:
      1. 363123Domain d1a6tb1: 1a6t B:1-113 [20249]
        Other proteins in same PDB: d1a6ta1, d1a6ta2, d1a6tb2, d1a6tc1, d1a6tc2, d1a6td2
      2. 363124Domain d1a6td1: 1a6t D:1-113 [20251]
        Other proteins in same PDB: d1a6ta1, d1a6ta2, d1a6tb2, d1a6tc1, d1a6tc2, d1a6td2
        part of human rhinovirus 14 neutralizing Fab Mab1-IA
    5. Domain for 1a6u:
      • 363060Domain d1a6uh_: 1a6u H: [20255]
        Other proteins in same PDB: d1a6ul_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
    6. Domains for 1a6v:
      1. 363111Domain d1a6vh_: 1a6v H: [20257]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
      2. 363112Domain d1a6vi_: 1a6v I: [20259]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
      3. 363113Domain d1a6vj_: 1a6v J: [20261]
        Other proteins in same PDB: d1a6vl_, d1a6vm_, d1a6vn_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
        complexed with npc
    7. Domain for 1a6w:
      • 363047Domain d1a6wh_: 1a6w H: [20253]
        Other proteins in same PDB: d1a6wl_
        part of Fv B1-8; this domain is identical to the N-terminal domain of scFv 1NQB
        complexed with nip
    8. Domain for 1ae6:
    9. Domains for 1afv:
      1. 363209Domain d1afvh1: 1afv H:1-120 [20131]
        Other proteins in same PDB: d1afva_, d1afvb_, d1afvh2, d1afvk2, d1afvl1, d1afvl2, d1afvm1, d1afvm2
      2. 363210Domain d1afvk1: 1afv K:1-120 [20133]
        Other proteins in same PDB: d1afva_, d1afvb_, d1afvh2, d1afvk2, d1afvl1, d1afvl2, d1afvm1, d1afvm2
        part of Fab 25.3 against HIV-1 capsid protein (p24)
        complexed with pb
    10. Domains for 1axs:
      1. 363161Domain d1axsb1: 1axs B:1-113 [20201]
        Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsa2, d1axsb2, d1axsh2, d1axsl1, d1axsl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
        complexed with cd, hop
      2. 363162Domain d1axsh1: 1axs H:1-113 [20199]
        Other proteins in same PDB: d1axsa1, d1axsa2, d1axsb2, d1axsh2, d1axsl1, d1axsl2
    11. Domain for 1b4j:
    12. Domain for 1bbj:
    13. Domain for 1bog:
    14. Domain for 1bql:
    15. Domain for 1c5b:
    16. Domain for 1c5c:
    17. Domain for 1cfn:
    18. Domain for 1cfq:
    19. Domain for 1cfs:
    20. Domain for 1cft:
    21. Domain for 1cgs:
    22. Domain for 1cic:
    23. Domains for 1d5b:
      1. 363185Domain d1d5bb1: 1d5b B:1-113 [20205]
        Other proteins in same PDB: d1d5ba1, d1d5ba2, d1d5bb2, d1d5bh2, d1d5bl1, d1d5bl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
      2. 363186Domain d1d5bh1: 1d5b H:1-113 [20203]
        Other proteins in same PDB: d1d5ba1, d1d5ba2, d1d5bb2, d1d5bh2, d1d5bl1, d1d5bl2
    24. Domain for 1d5i:
    25. Domain for 1d6v:
    26. Domain for 1e4w:
    27. Domains for 1e4x:
      1. 363085Domain d1e4xh1: 1e4x H:1-110 [59236]
        Other proteins in same PDB: d1e4xh2, d1e4xi2, d1e4xl1, d1e4xl2, d1e4xm1, d1e4xm2
      2. 363086Domain d1e4xi1: 1e4x I:1-110 [59238]
        Other proteins in same PDB: d1e4xh2, d1e4xi2, d1e4xl1, d1e4xl2, d1e4xm1, d1e4xm2
        part of anti-TGFalpha Fab TAB2
    28. Domain for 1e6j:
    29. Domain for 1e6o:
    30. Domain for 1eap:
    31. Domain for 1egj:
    32. Domain for 1ehl:
    33. Domain for 1emt:
    34. Domain for 1eo8:
    35. Domains for 1f11:
      1. 363164Domain d1f11b1: 1f11 B:1-113 [20457]
        Other proteins in same PDB: d1f11a1, d1f11a2, d1f11b2, d1f11c1, d1f11c2, d1f11d2
      2. 363165Domain d1f11d1: 1f11 D:1-113 [20459]
        Other proteins in same PDB: d1f11a1, d1f11a2, d1f11b2, d1f11c1, d1f11c2, d1f11d2
        part of anti-Pres2 Fab F124
    36. Domains for 1f3d:
      1. 363051Domain d1f3dh1: 1f3d H:1-121 [20462]
        Other proteins in same PDB: d1f3dh2, d1f3dj1, d1f3dj2, d1f3dk2, d1f3dl1, d1f3dl2
      2. 363052Domain d1f3dk1: 1f3d K:1-121 [20463]
        Other proteins in same PDB: d1f3dh2, d1f3dj1, d1f3dj2, d1f3dk2, d1f3dl1, d1f3dl2
        part of catalytic Fab 4B2
        complexed with so4, tpm
    37. Domain for 1fai:
    38. Domains for 1fbi:
      1. 363181Domain d1fbih1: 1fbi H:1-121 [20025]
        Other proteins in same PDB: d1fbih2, d1fbil1, d1fbil2, d1fbip1, d1fbip2, d1fbiq2, d1fbix_, d1fbiy_
      2. 363182Domain d1fbiq1: 1fbi Q:1-121 [20027]
        Other proteins in same PDB: d1fbih2, d1fbil1, d1fbil2, d1fbip1, d1fbip2, d1fbiq2, d1fbix_, d1fbiy_
        part of Fab F9.13.7
    39. Domain for 1fig:
    40. Domain for 1for:
    41. Domain for 1fpt:
    42. Domains for 1fsk:
      1. 363203Domain d1fskc1: 1fsk C:1-118 [20467]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
      2. 363204Domain d1fskf1: 1fsk F:1-118 [20469]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
      3. 363205Domain d1fski1: 1fsk I:1-118 [20471]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
      4. 363206Domain d1fskl1: 1fsk L:1-118 [20473]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb1, d1fskb2, d1fskc2, d1fskd_, d1fske1, d1fske2, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh1, d1fskh2, d1fski2, d1fskj_, d1fskk1, d1fskk2, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
    43. Domain for 1h8n:
    44. Domains for 1h8o:
      1. 363138Domain d1h8oa2: 1h8o A:132-243 [60786]
        Other proteins in same PDB: d1h8oa1, d1h8ob1
      2. 363139Domain d1h8ob2: 1h8o B:133-243 [60788]
        Other proteins in same PDB: d1h8oa1, d1h8ob1
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with so4; mutant
    45. Domains for 1h8s:
      1. 363117Domain d1h8sa2: 1h8s A:132-243 [60790]
        Other proteins in same PDB: d1h8sa1, d1h8sb1
      2. 363118Domain d1h8sb2: 1h8s B:133-243 [60792]
        Other proteins in same PDB: d1h8sa1, d1h8sb1
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with aic, so4; mutant
    46. Domain for 1hh6:
    47. Domain for 1hh9:
    48. Domain for 1hi6:
    49. Domain for 1i3g:
      • 363101Domain d1i3gh_: 1i3g H: [66018]
        Other proteins in same PDB: d1i3gl_
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with mpd
    50. Domains for 1i8m:
      1. 363088Domain d1i8mb1: 1i8m B:1-113 [66084]
        Other proteins in same PDB: d1i8ma1, d1i8ma2, d1i8mb2, d1i8mh2, d1i8ml1, d1i8ml2
        part of anti-ssDNA Fab
        complexed with so4
      2. 363089Domain d1i8mh1: 1i8m H:1-113 [66086]
        Other proteins in same PDB: d1i8ma1, d1i8ma2, d1i8mb2, d1i8mh2, d1i8ml1, d1i8ml2
    51. Domain for 1igi:
    52. Domains for 1igj:
      1. 363126Domain d1igjb1: 1igj B:2-114 [19819]
        Other proteins in same PDB: d1igja1, d1igja2, d1igjb2, d1igjc1, d1igjc2, d1igjd2
      2. 363127Domain d1igjd1: 1igj D:2-114 [19821]
        Other proteins in same PDB: d1igja1, d1igja2, d1igjb2, d1igjc1, d1igjc2, d1igjd2
        part of Fab 26-10
        complexed with dgx
    53. Domains for 1igy:
      1. 363200Domain d1igyb1: 1igy B:2-113 [19769]
        Other proteins in same PDB: d1igya1, d1igya2, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc1, d1igyc2, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
      2. 363201Domain d1igyd1: 1igy D:2-113 [19771]
        Other proteins in same PDB: d1igya1, d1igya2, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc1, d1igyc2, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
        part of intact IgG1 antibody Mab61.1.3
        complexed with fuc, gal, man, nag
    54. Domain for 1iqw:
    55. Domains for 1j05:
      1. 363040Domain d1j05b_: 1j05 B: [90736]
        Other proteins in same PDB: d1j05a_, d1j05l_
      2. 363041Domain d1j05h_: 1j05 H: [90737]
        Other proteins in same PDB: d1j05a_, d1j05l_
        part of anti-CEA Fv T84.66
        complexed with gol, po4
    56. Domain for 1jfq:
    57. Domain for 1jhl:
    58. Domain for 1jn6:
    59. Domains for 1jnh:
      1. 363166Domain d1jnhb1: 1jnh B:1-117 [66941]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
      2. 363167Domain d1jnhd1: 1jnh D:1-117 [66945]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
      3. 363168Domain d1jnhf1: 1jnh F:1-117 [66949]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
      4. 363169Domain d1jnhh1: 1jnh H:1-117 [66953]
        Other proteins in same PDB: d1jnha1, d1jnha2, d1jnhb2, d1jnhc1, d1jnhc2, d1jnhd2, d1jnhe1, d1jnhe2, d1jnhf2, d1jnhg1, d1jnhg2, d1jnhh2
        part of anti-estradiol Fab 10G6D6
        complexed with eco
    60. Domain for 1k4c:
    61. Domain for 1k4d:
    62. Domain for 1kb5:
    63. Domain for 1keg:
    64. Domain for 1kn2:
    65. Domain for 1kn4:
    66. Domain for 1ktr:
    67. Domains for 1lmk:
      1. 363149Domain d1lmka1: 1lmk A:2-127 [20034]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
      2. 363150Domain d1lmkc1: 1lmk C:2-127 [20036]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
      3. 363151Domain d1lmke1: 1lmk E:2-127 [20038]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
      4. 363152Domain d1lmkg1: 1lmk G:2-127 [20040]
        Other proteins in same PDB: d1lmka2, d1lmkc2, d1lmke2, d1lmkg2
        part of scFv diabody L5MK16
    68. Domain for 1mex:
    69. Domain for 1mfa:
    70. Domain for 1mfb:
    71. Domain for 1mfc:
    72. Domain for 1mfd:
    73. Domain for 1mfe:
    74. Domains for 1mh5:
      1. 363091Domain d1mh5b1: 1mh5 B:2-113 [91268]
        Other proteins in same PDB: d1mh5a1, d1mh5a2, d1mh5b2, d1mh5h2, d1mh5l1, d1mh5l2
      2. 363092Domain d1mh5h1: 1mh5 H:2-113 [91270]
        Other proteins in same PDB: d1mh5a1, d1mh5a2, d1mh5b2, d1mh5h2, d1mh5l1, d1mh5l2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
    75. Domain for 1mie:
    76. Domain for 1mim:
    77. Domain for 1mj7:
    78. Domain for 1mj8:
    79. Domains for 1mjj:
      1. 363062Domain d1mjjb1: 1mjj B:1-113 [91296]
        Other proteins in same PDB: d1mjja1, d1mjja2, d1mjjb2, d1mjjh2, d1mjjl1, d1mjjl2
      2. 363063Domain d1mjjh1: 1mjj H:1-113 [91298]
        Other proteins in same PDB: d1mjja1, d1mjja2, d1mjjb2, d1mjjh2, d1mjjl1, d1mjjl2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
    80. Domain for 1mju:
    81. Domain for 1mlb:
    82. Domains for 1mlc:
      1. 363097Domain d1mlcb1: 1mlc B:1-118 [20053]
        Other proteins in same PDB: d1mlca1, d1mlca2, d1mlcb2, d1mlcc1, d1mlcc2, d1mlcd2, d1mlce_, d1mlcf_
      2. 363098Domain d1mlcd1: 1mlc D:1-118 [20055]
        Other proteins in same PDB: d1mlca1, d1mlca2, d1mlcb2, d1mlcc1, d1mlcc2, d1mlcd2, d1mlce_, d1mlcf_
        part of Fab D44.1
    83. Domain for 1mnu:
    84. Domain for 1mpa:
    85. Domain for 1mrc:
    86. Domain for 1mrd:
    87. Domain for 1mre:
    88. Domain for 1mrf:
    89. Domain for 1mvu:
      • 363048Domain d1mvub_: 1mvu B: [91475]
        Other proteins in same PDB: d1mvua_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219; complexed with synthetic epitope peptide, chain P
        complexed with so4; mutant
    90. Domain for 1n7m:
      • 363054Domain d1n7ml1: 1n7m L:1-114 [80254]
        Other proteins in same PDB: d1n7mh1, d1n7mh2, d1n7ml2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; germline antibody; chain identifiers are probably mixed up
        complexed with mmp
    91. Domain for 1ngp:
    92. Domain for 1ngq:
    93. Domains for 1ngw:
      1. 363220Domain d1ngwb1: 1ngw B:1-114 [80490]
        Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwa2, d1ngwb2, d1ngwh2, d1ngwl1, d1ngwl2
      2. 363221Domain d1ngwh1: 1ngw H:1-114 [80492]
        Other proteins in same PDB: d1ngwa1, d1ngwa2, d1ngwb2, d1ngwh2, d1ngwl1, d1ngwl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
        complexed with mmp
    94. Domains for 1ngx:
      1. 363216Domain d1ngxb1: 1ngx B:1-114 [85704]
        Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxa2, d1ngxb2, d1ngxh2, d1ngxl1, d1ngxl2
      2. 363217Domain d1ngxh1: 1ngx H:1-114 [85706]
        Other proteins in same PDB: d1ngxa1, d1ngxa2, d1ngxb2, d1ngxh2, d1ngxl1, d1ngxl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
        complexed with jef
    95. Domain for 1ngy:
    96. Domain for 1ngz:
    97. Domains for 1nj9:
      1. 363143Domain d1nj9b1: 1nj9 B:1-113 [91899]
        Other proteins in same PDB: d1nj9a1, d1nj9a2, d1nj9b2, d1nj9h2, d1nj9l1, d1nj9l2
      2. 363144Domain d1nj9h1: 1nj9 H:1-113 [91901]
        Other proteins in same PDB: d1nj9a1, d1nj9a2, d1nj9b2, d1nj9h2, d1nj9l1, d1nj9l2
        part of cocaine hydrolytic Fab 15a10
        complexed with na
    98. Domain for 1nma:
      • 363187Domain d1nmah_: 1nma H: [20065]
        Other proteins in same PDB: d1nmal_, d1nman_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with man, nag; mutant
    99. Domain for 1nmb:
      • 363145Domain d1nmbh_: 1nmb H: [20063]
        Other proteins in same PDB: d1nmbl_, d1nmbn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag; mutant
    100. Domains for 1nmc:
      1. 363146Domain d1nmcb_: 1nmc B: [20058]
        Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcc_, d1nmcl_, d1nmcn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag
      2. 363147Domain d1nmch_: 1nmc H: [20057]
        Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcc_, d1nmcl_, d1nmcn_
    101. Domains for 1nqb:
      1. 363057Domain d1nqba1: 1nqb A:2-120 [20042]
        Other proteins in same PDB: d1nqba2, d1nqbc2
      2. 363058Domain d1nqbc1: 1nqb C:2-120 [20044]
        Other proteins in same PDB: d1nqba2, d1nqbc2
        part of scFv trivalent antibody; N-terminal, VH domain is from B1-8 antibody (1A6U CH H); C-terminal, VL domain is from NQ11 antibody
    102. Domains for 1p2c:
      1. 363076Domain d1p2cb1: 1p2c B:301-413 [93917]
        Other proteins in same PDB: d1p2ca1, d1p2ca2, d1p2cb2, d1p2cc_, d1p2cd1, d1p2cd2, d1p2ce2, d1p2cf_
      2. 363077Domain d1p2ce1: 1p2c E:1201-1313 [93922]
        Other proteins in same PDB: d1p2ca1, d1p2ca2, d1p2cb2, d1p2cc_, d1p2cd1, d1p2cd2, d1p2ce2, d1p2cf_
        part of anti-lysozyme Fab F10.6.6
    103. Domains for 1p7k:
      1. 363049Domain d1p7kb1: 1p7k B:1-113 [94289]
        Other proteins in same PDB: d1p7ka1, d1p7ka2, d1p7kb2, d1p7kh2, d1p7kl1, d1p7kl2
        part of anti-ssDNA Fab
        complexed with 1pe, epe, gol, peg, so4
      2. 363050Domain d1p7kh1: 1p7k H:1-113 [94291]
        Other proteins in same PDB: d1p7ka1, d1p7ka2, d1p7kb2, d1p7kh2, d1p7kl1, d1p7kl2
    104. Domains for 1pkq:
      1. 363207Domain d1pkqb1: 1pkq B:1-113 [88150]
        Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqa2, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqf2, d1pkqg2, d1pkqj_
      2. 363208Domain d1pkqg1: 1pkq G:1-113 [88155]
        Other proteins in same PDB: d1pkqa1, d1pkqa2, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf1, d1pkqf2, d1pkqg2, d1pkqj_
        part of humanized Fab 8-18c5
    105. Domain for 1plg:
    106. Domain for 1psk:
    107. Domain for 1q0x:
    108. Domain for 1q0y:
    109. Domain for 1qfu:
    110. Domain for 1qfw:
    111. Domain for 1qnz:
    112. Domain for 1r3i:
    113. Domain for 1r3j:
    114. Domain for 1r3k:
    115. Domain for 1r3l:
    116. Domain for 1rih:
    117. Domain for 1rmf:
    118. Domain for 1ruq:
    119. Domain for 1rur:
    120. Domain for 1rvf:
    121. Domains for 1uwe:
      1. 363176Domain d1uweh1: 1uwe H:4-113 [100103]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
      2. 363177Domain d1uwev1: 1uwe V:4-113 [100109]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
      3. 363178Domain d1uwey1: 1uwe Y:4-113 [100113]
        Other proteins in same PDB: d1uweh2, d1uwel1, d1uwel2, d1uweu1, d1uweu2, d1uwev2, d1uwex1, d1uwex2, d1uwey2
        part of catalytic Fab 14d9
    122. Domains for 1uwg:
      1. 363171Domain d1uwgh1: 1uwg H:3-113 [100115]
        Other proteins in same PDB: d1uwgh2, d1uwgl1, d1uwgl2, d1uwgx1, d1uwgx2, d1uwgy2
      2. 363172Domain d1uwgy1: 1uwg Y:3-113 [100121]
        Other proteins in same PDB: d1uwgh2, d1uwgl1, d1uwgl2, d1uwgx1, d1uwgx2, d1uwgy2
        part of catalytic Fab 14d9
        complexed with kha, po4
    123. Domain for 1yec:
    124. Domains for 1yed:
      1. 363188Domain d1yedb1: 1yed B:1-113 [20151]
        Other proteins in same PDB: d1yeda1, d1yeda2, d1yedb2, d1yedh2, d1yedl1, d1yedl2
        part of Fab D2.4
        complexed with pnb
      2. 363189Domain d1yedh1: 1yed H:1-113 [20149]
        Other proteins in same PDB: d1yeda1, d1yeda2, d1yedb2, d1yedh2, d1yedl1, d1yedl2
    125. Domain for 1yee:
    126. Domain for 1yef:
    127. Domain for 1yeg:
    128. Domain for 1yeh:
    129. Domain for 1yei:
    130. Domain for 1yej:
    131. Domain for 1yek:
    132. Domains for 1yuh:
      1. 363195Domain d1yuhb1: 1yuh B:1-118 [20099]
        Other proteins in same PDB: d1yuha1, d1yuha2, d1yuhb2, d1yuhh2, d1yuhl1, d1yuhl2
        part of an anti-nitrophenol Fab
        complexed with np
      2. 363196Domain d1yuhh1: 1yuh H:1-118 [20097]
        Other proteins in same PDB: d1yuha1, d1yuha2, d1yuhb2, d1yuhh2, d1yuhl1, d1yuhl2
    133. Domain for 2cgr:
    134. Domain for 2f19:
    135. Domain for 2iff:
    136. Domain for 2jel:
    137. Domain for 2mpa:
    138. Domains for 2pcp:
      1. 363121Domain d2pcpb1: 2pcp B:1-113 [20371]
        Other proteins in same PDB: d2pcpa1, d2pcpa2, d2pcpb2, d2pcpc1, d2pcpc2, d2pcpd2
      2. 363122Domain d2pcpd1: 2pcp D:1-113 [20373]
        Other proteins in same PDB: d2pcpa1, d2pcpa2, d2pcpb2, d2pcpc1, d2pcpc2, d2pcpd2
        part of Fab 6B5
        complexed with 1pc
    139. Domains for 3fct:
      1. 363109Domain d3fctb1: 3fct B:1-114 [20375]
        Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fcta2, d3fctb2, d3fctc1, d3fctc2, d3fctd2
      2. 363110Domain d3fctd1: 3fct D:1-114 [20377]
        Other proteins in same PDB: d3fcta1, d3fcta2, d3fctb2, d3fctc1, d3fctc2, d3fctd2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody
        complexed with ca, cd, mg, mmp, na
    140. Domain for 3hfl:
    141. Domain for 6fab:
  13. 363222Mouse (Mus musculus), cluster 3.3 [TaxId:10090] [88553] (1 PDB entry)
  14. 363225Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId:10090] [88554] (29 PDB entries)
    1. Domains for 1a4j:
      1. 363247Domain d1a4jb1: 1a4j B:1-119 [20233]
        Other proteins in same PDB: d1a4ja1, d1a4ja2, d1a4jb2, d1a4jh2, d1a4jl1, d1a4jl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
      2. 363248Domain d1a4jh1: 1a4j H:1-119 [20231]
        Other proteins in same PDB: d1a4ja1, d1a4ja2, d1a4jb2, d1a4jh2, d1a4jl1, d1a4jl2
    2. Domains for 1a4k:
      1. 363240Domain d1a4kb1: 1a4k B:1-119 [20237]
        Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4ka2, d1a4kb2, d1a4kh2, d1a4kl1, d1a4kl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
        complexed with cd, fra
      2. 363241Domain d1a4kh1: 1a4k H:1-119 [20235]
        Other proteins in same PDB: d1a4ka1, d1a4ka2, d1a4kb2, d1a4kh2, d1a4kl1, d1a4kl2
    3. Domains for 1bj1:
      1. 363258Domain d1bj1h1: 1bj1 H:1-123 [20323]
        Other proteins in same PDB: d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1j2, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
      2. 363259Domain d1bj1k1: 1bj1 K:1-123 [20325]
        Other proteins in same PDB: d1bj1h2, d1bj1j1, d1bj1j2, d1bj1k2, d1bj1l1, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
        complexed with so4
    4. Domain for 1c1e:
    5. Domain for 1cl7:
    6. Domains for 1cz8:
      1. 363238Domain d1cz8h1: 1cz8 H:1-123 [20327]
        Other proteins in same PDB: d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8x2, d1cz8y2
      2. 363239Domain d1cz8y1: 1cz8 Y:1-123 [20329]
        Other proteins in same PDB: d1cz8h2, d1cz8l1, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x1, d1cz8x2, d1cz8y2
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
        complexed with so4; mutant
    7. Domain for 1dba:
    8. Domain for 1dbb:
    9. Domain for 1dbj:
    10. Domain for 1dbk:
    11. Domain for 1dbm:
    12. Domains for 1fj1:
      1. 363249Domain d1fj1b1: 1fj1 B:1-114 [20119]
        Other proteins in same PDB: d1fj1a1, d1fj1a2, d1fj1b2, d1fj1c1, d1fj1c2, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
      2. 363250Domain d1fj1d1: 1fj1 D:1-114 [20121]
        Other proteins in same PDB: d1fj1a1, d1fj1a2, d1fj1b2, d1fj1c1, d1fj1c2, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
        part of Fab LA-2 against OspA
    13. Domain for 1ghf:
    14. Domains for 1i7z:
      1. 363235Domain d1i7zb1: 1i7z B:1-113 [61921]
        Other proteins in same PDB: d1i7za1, d1i7za2, d1i7zb2, d1i7zc1, d1i7zc2, d1i7zd2
      2. 363236Domain d1i7zd1: 1i7z D:1-113 [61925]
        Other proteins in same PDB: d1i7za1, d1i7za2, d1i7zb2, d1i7zc1, d1i7zc2, d1i7zd2
        part of humanized Fab GNC92H2
        complexed with coc
    15. Domain for 1iai:
    16. Domain for 1jgl:
    17. Domain for 1jhk:
    18. Domains for 1jp5:
      1. 363245Domain d1jp5a2: 1jp5 A:128-247 [67002]
        Other proteins in same PDB: d1jp5a1, d1jp5b1
      2. 363246Domain d1jp5b2: 1jp5 B:128-247 [67004]
        Other proteins in same PDB: d1jp5a1, d1jp5b1
        part of scFv 1695; complexed with the epitope peptide from HIV-1 protease
    19. Domains for 1mhh:
      1. 363229Domain d1mhhb1: 1mhh B:1-113 [79121]
        Other proteins in same PDB: d1mhha1, d1mhha2, d1mhhb2, d1mhhc1, d1mhhc2, d1mhhd2, d1mhhe_, d1mhhf_
      2. 363230Domain d1mhhd1: 1mhh D:1-113 [79125]
        Other proteins in same PDB: d1mhha1, d1mhha2, d1mhhb2, d1mhhc1, d1mhhc2, d1mhhd2, d1mhhe_, d1mhhf_
        part of anti-HCV Fab 19D9D6
        complexed with aea, edo; mutant
    20. Domains for 1n4x:
      1. 363227Domain d1n4xh_: 1n4x H: [85324]
        Other proteins in same PDB: d1n4xl_, d1n4xm_
      2. 363228Domain d1n4xi_: 1n4x I: [85325]
        Other proteins in same PDB: d1n4xl_, d1n4xm_
        part of scFv 1695
        complexed with cl
    21. Domain for 1n64:
    22. Domain for 1nca:
    23. Domain for 1ncb:
    24. Domain for 1ncc:
    25. Domain for 1ncd:
    26. Domain for 1nlb:
    27. Domains for 1ob1:
      1. 363263Domain d1ob1b1: 1ob1 B:1-113 [86750]
        Other proteins in same PDB: d1ob1a1, d1ob1a2, d1ob1b2, d1ob1c1, d1ob1c2, d1ob1d1, d1ob1d2, d1ob1e2, d1ob1f1, d1ob1f2
      2. 363264Domain d1ob1e1: 1ob1 E:1-113 [86756]
        Other proteins in same PDB: d1ob1a1, d1ob1a2, d1ob1b2, d1ob1c1, d1ob1c2, d1ob1d1, d1ob1d2, d1ob1e2, d1ob1f1, d1ob1f2
        part of anti-Pf MSP1 Fab
        complexed with cac
    28. Domain for 1tet:
    29. Domain for 2dbl:
  15. 363265Mouse (Mus musculus), cluster 5 [TaxId:10090] [88555] (35 PDB entries)
    1. Domain for 1a2y:
    2. Domain for 1a7n:
    3. Domain for 1a7o:
    4. Domain for 1a7p:
    5. Domain for 1a7q:
    6. Domain for 1a7r:
    7. Domain for 1cic:
    8. Domain for 1dl7:
      • 363306Domain d1dl7h_: 1dl7 H: [20499]
        Other proteins in same PDB: d1dl7l_
        part of Fv M3C65; conflict: annotated in PDB as human protein
        complexed with nch
    9. Domain for 1dvf:
    10. Domain for 1fdl:
    11. Domains for 1fe8:
      1. 363284Domain d1fe8h1: 1fe8 H:1-115 [59786]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
      2. 363285Domain d1fe8i1: 1fe8 I:1-115 [59788]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
      3. 363286Domain d1fe8j1: 1fe8 J:1-115 [59790]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h2, d1fe8i2, d1fe8j2, d1fe8l1, d1fe8l2, d1fe8m1, d1fe8m2, d1fe8n1, d1fe8n2
        part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
        complexed with cac, fuc, nag
    12. Domain for 1fns:
    13. Domain for 1g7h:
    14. Domain for 1g7i:
    15. Domain for 1g7j:
    16. Domain for 1g7l:
    17. Domain for 1g7m:
    18. Domain for 1gig:
    19. Domain for 1ibg:
    20. Domain for 1kip:
    21. Domain for 1kiq:
    22. Domain for 1kir:
    23. Domains for 1nc2:
      1. 363287Domain d1nc2b1: 1nc2 B:1-120 [91783]
        Other proteins in same PDB: d1nc2a1, d1nc2a2, d1nc2b2, d1nc2c1, d1nc2c2, d1nc2d2
      2. 363288Domain d1nc2d1: 1nc2 D:1-120 [91787]
        Other proteins in same PDB: d1nc2a1, d1nc2a2, d1nc2b2, d1nc2c1, d1nc2c2, d1nc2d2
        part of Fab 2d12.5
        complexed with cl, doe, nag, yt3
    24. Domains for 1nc4:
      1. 363289Domain d1nc4b1: 1nc4 B:1-120 [91791]
        Other proteins in same PDB: d1nc4a1, d1nc4a2, d1nc4b2, d1nc4c1, d1nc4c2, d1nc4d2
      2. 363290Domain d1nc4d1: 1nc4 D:1-120 [91795]
        Other proteins in same PDB: d1nc4a1, d1nc4a2, d1nc4b2, d1nc4c1, d1nc4c2, d1nc4d2
        part of Fab 2d12.5
        complexed with cl, dof, gd3, nag
    25. Domain for 1nld:
    26. Domain for 1oak:
    27. Domain for 1p4b:
    28. Domain for 1p4i:
    29. Domain for 1vfa:
    30. Domain for 1vfb:
    31. Domain for 2vir:
    32. Domain for 2vis:
    33. Domain for 2vit:
    34. Domains for 43c9:
      1. 363292Domain d43c9b_: 43c9 B: [20387]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
      2. 363293Domain d43c9d_: 43c9 D: [20389]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
      3. 363294Domain d43c9f_: 43c9 F: [20391]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
      4. 363295Domain d43c9h_: 43c9 H: [20393]
        Other proteins in same PDB: d43c9a_, d43c9c_, d43c9e_, d43c9g_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
    35. Domains for 43ca:
      1. 363296Domain d43cab_: 43ca B: [20395]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
      2. 363297Domain d43cad_: 43ca D: [20397]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
      3. 363298Domain d43caf_: 43ca F: [20399]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
      4. 363299Domain d43cah_: 43ca H: [20401]
        Other proteins in same PDB: d43caa_, d43cac_, d43cae_, d43cag_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
        complexed with npo
  16. 363311Mouse (Mus musculus), cluster 6 [TaxId:10090] [88556] (11 PDB entries)
    1. Domains for 1etz:
      1. 363317Domain d1etzb1: 1etz B:1-126 [20481]
        Other proteins in same PDB: d1etza1, d1etza2, d1etzb2, d1etzh2, d1etzl1, d1etzl2
        part of anti-sweetener Fab NC10.14
        complexed with gas
      2. 363318Domain d1etzh1: 1etz H:1-126 [20479]
        Other proteins in same PDB: d1etza1, d1etza2, d1etzb2, d1etzh2, d1etzl1, d1etzl2
    2. Domain for 1ggb:
    3. Domain for 1ggc:
    4. Domains for 1ggi:
      1. 363314Domain d1ggih1: 1ggi H:1-112 [19877]
        Other proteins in same PDB: d1ggih2, d1ggij2, d1ggil1, d1ggil2, d1ggim1, d1ggim2
      2. 363315Domain d1ggij1: 1ggi J:1-112 [19879]
        Other proteins in same PDB: d1ggih2, d1ggij2, d1ggil1, d1ggil2, d1ggim1, d1ggim2
        part of Fab 50.1
    5. Domain for 1hys:
    6. Domain for 1j5o:
    7. Domain for 1jrh:
    8. Domain for 1n5y:
    9. Domain for 1n6q:
    10. Domain for 1t03:
    11. Domain for 2hmi:
  17. 363325Mouse (Mus musculus), cluster 7.1 [TaxId:10090] [88557] (33 PDB entries)
    1. Domain for 1ay1:
    2. Domain for 1baf:
    3. Domain for 1bgx:
    4. Domain for 1c12:
    5. Domain for 1cf8:
    6. Domain for 1ezv: