Lineage for Species: Mouse (Mus musculus)

  1. Root: SCOP 1.69
  2. 450777Class b: All beta proteins [48724] (144 folds)
  3. 450778Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (23 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 450779Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 450780Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (27 proteins)
  6. 452262Protein Immunoglobulin light chain lambda variable domain, VL-lambda [88534] (9 species)
    VL-lambda domains of human antibodies are clustered by the sequence similarity within the germline encoded segment and then by the size of the complementarity determining regions CDR1 and CDR2, so the clusters may correspond to putative germline families in the human genome; mouse VL-lambda domains belong to a single germline family
  7. 452345Species Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] [88541] (33 PDB entries)

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus):

  1. Domain(s) for 1a6u:
  2. Domain(s) for 1a6v:
    1. 452362Domain d1a6vl_: 1a6v L: [20256]
      Other proteins in same PDB: d1a6vh_, d1a6vi_, d1a6vj_
    2. 452363Domain d1a6vm_: 1a6v M: [20258]
      Other proteins in same PDB: d1a6vh_, d1a6vi_, d1a6vj_
    3. 452364Domain d1a6vn_: 1a6v N: [20260]
      Other proteins in same PDB: d1a6vh_, d1a6vi_, d1a6vj_
      part of Fv B1-8
  3. Domain(s) for 1a6w:
  4. Domain(s) for 1dl7:
    • 452373Domain d1dl7l_: 1dl7 L: [20498]
      Other proteins in same PDB: d1dl7h_
      part of Fv M3C65; conflict: annotated in PDB as human protein
  5. Domain(s) for 1etz:
    1. 452382Domain d1etza1: 1etz A:1-110 [20480]
      Other proteins in same PDB: d1etza2, d1etzb1, d1etzb2, d1etzh1, d1etzh2, d1etzl2
      part of anti-sweetener Fab NC10.14
    2. 452383Domain d1etzl1: 1etz L:1-110 [20478]
      Other proteins in same PDB: d1etza2, d1etzb1, d1etzb2, d1etzh1, d1etzh2, d1etzl2
  6. Domain(s) for 1f4w:
  7. Domain(s) for 1f4x:
  8. Domain(s) for 1f4y:
  9. Domain(s) for 1gig:
  10. Domain(s) for 1ind:
  11. Domain(s) for 1ine:
  12. Domain(s) for 1jn6:
  13. Domain(s) for 1jnh:
    1. 452374Domain d1jnha1: 1jnh A:1-108 [66939]
      Other proteins in same PDB: d1jnha2, d1jnhb1, d1jnhb2, d1jnhc2, d1jnhd1, d1jnhd2, d1jnhe2, d1jnhf1, d1jnhf2, d1jnhg2, d1jnhh1, d1jnhh2
    2. 452375Domain d1jnhc1: 1jnh C:1-108 [66943]
      Other proteins in same PDB: d1jnha2, d1jnhb1, d1jnhb2, d1jnhc2, d1jnhd1, d1jnhd2, d1jnhe2, d1jnhf1, d1jnhf2, d1jnhg2, d1jnhh1, d1jnhh2
    3. 452376Domain d1jnhe1: 1jnh E:1-108 [66947]
      Other proteins in same PDB: d1jnha2, d1jnhb1, d1jnhb2, d1jnhc2, d1jnhd1, d1jnhd2, d1jnhe2, d1jnhf1, d1jnhf2, d1jnhg2, d1jnhh1, d1jnhh2
    4. 452377Domain d1jnhg1: 1jnh G:1-108 [66951]
      Other proteins in same PDB: d1jnha2, d1jnhb1, d1jnhb2, d1jnhc2, d1jnhd1, d1jnhd2, d1jnhe2, d1jnhf1, d1jnhf2, d1jnhg2, d1jnhh1, d1jnhh2
      part of anti-estradiol Fab 10G6D6
  14. Domain(s) for 1mfa:
  15. Domain(s) for 1mfb:
  16. Domain(s) for 1mfc:
  17. Domain(s) for 1mfd:
  18. Domain(s) for 1mfe:
  19. Domain(s) for 1nc2:
    1. 452356Domain d1nc2a1: 1nc2 A:1-110 [91781]
      Other proteins in same PDB: d1nc2a2, d1nc2b1, d1nc2b2, d1nc2c2, d1nc2d1, d1nc2d2
    2. 452357Domain d1nc2c1: 1nc2 C:1-110 [91785]
      Other proteins in same PDB: d1nc2a2, d1nc2b1, d1nc2b2, d1nc2c2, d1nc2d1, d1nc2d2
      part of Fab 2d12.5
  20. Domain(s) for 1nc4:
    1. 452359Domain d1nc4a1: 1nc4 A:1-110 [91789]
      Other proteins in same PDB: d1nc4a2, d1nc4b1, d1nc4b2, d1nc4c2, d1nc4d1, d1nc4d2
    2. 452360Domain d1nc4c1: 1nc4 C:1-110 [91793]
      Other proteins in same PDB: d1nc4a2, d1nc4b1, d1nc4b2, d1nc4c2, d1nc4d1, d1nc4d2
      part of Fab 2d12.5
  21. Domain(s) for 1ngp:
  22. Domain(s) for 1ngq:
  23. Domain(s) for 1nj9:
    1. 452370Domain d1nj9a1: 1nj9 A:1-108 [91897]
      Other proteins in same PDB: d1nj9a2, d1nj9b1, d1nj9b2, d1nj9h1, d1nj9h2, d1nj9l2
    2. 452371Domain d1nj9l1: 1nj9 L:1-108 [91903]
      Other proteins in same PDB: d1nj9a2, d1nj9b1, d1nj9b2, d1nj9h1, d1nj9h2, d1nj9l2
      part of cocaine hydrolytic Fab 15a10
  24. Domain(s) for 1p4b:
  25. Domain(s) for 1p4i:
  26. Domain(s) for 1pg7:
    1. 452387Domain d1pg7w1: 1pg7 W:1-108 [94682]
      Other proteins in same PDB: d1pg7h1, d1pg7h2, d1pg7i1, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w2, d1pg7x1, d1pg7x2, d1pg7y2, d1pg7z1, d1pg7z2
    2. 452388Domain d1pg7y1: 1pg7 Y:1-108 [94686]
      Other proteins in same PDB: d1pg7h1, d1pg7h2, d1pg7i1, d1pg7i2, d1pg7l1, d1pg7l2, d1pg7m1, d1pg7m2, d1pg7w2, d1pg7x1, d1pg7x2, d1pg7y2, d1pg7z1, d1pg7z2
      part of Fab 6A6
  27. Domain(s) for 1q0x:
  28. Domain(s) for 1q0y:
  29. Domain(s) for 1sm3:
  30. Domain(s) for 1yuh:
    1. 452385Domain d1yuha1: 1yuh A:2-109 [20098]
      Other proteins in same PDB: d1yuha2, d1yuhb1, d1yuhb2, d1yuhh1, d1yuhh2, d1yuhl2
      part of an anti-nitrophenol Fab
    2. 452386Domain d1yuhl1: 1yuh L:2-109 [20096]
      Other proteins in same PDB: d1yuha2, d1yuhb1, d1yuhb2, d1yuhh1, d1yuhh2, d1yuhl2
  31. Domain(s) for 2vir:
  32. Domain(s) for 2vis:
  33. Domain(s) for 2vit:

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