Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId: 10090]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2344607Class b: All beta proteins [48724] (178 folds)
  3. 2344608Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (33 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 2344609Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families) (S)
  5. 2344610Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (33 protein domains)
  6. 2345800Protein Immunoglobulin light chain kappa variable domain, VL-kappa [88519] (16 species)
    VL-kappa domains of human and mouse antibodies are clustered by the sequence similarity within the germline encoded segment and then by the size of the complementarity determining regions CDR1 and CDR2, so the clusters may correspond to putative germline families in the species genomes; VL-kappa domains with artificial or grafted exogenous CDRs are listed as engineered species
  7. 2346399Species Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId:10090] [88531] (225 PDB entries)
    Uniprot P01645 1-106 # 95% sequense identity; KV5L_MOUSE Ig kappa chain V-V region HP 93G7 ! SQ NA # natural chimera; best hits are: Uniprot P01637 (Ig kappa chain V-V region T1) and Uniprot P01837 (Ig kappa chain C region) ! SQ NA # humanized antibody ! SQ NA # part of Fab 28 against HIV-1 RT ! Uniprot P01642 21-115 # ! KV5I_MOUSE Ig kappa chain V-V region L7 precursor

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId: 10090]:

  1. Domain(s) for 12e8:
    1. 2346451Domain d12e8l1: 12e8 L:1-107 [20268]
      Other proteins in same PDB: d12e8h1, d12e8h2, d12e8l2, d12e8m2, d12e8p1, d12e8p2
      part of Fab 2E8 specific to the low density lipoprotein receptor binding region of apolipoprotein E
    2. 2346452Domain d12e8m1: 12e8 M:1-107 [20270]
      Other proteins in same PDB: d12e8h1, d12e8h2, d12e8l2, d12e8m2, d12e8p1, d12e8p2
      part of Fab 2E8 specific to the low density lipoprotein receptor binding region of apolipoprotein E
  2. Domain(s) for 1a0q:
  3. Domain(s) for 1a14:
  4. Domain(s) for 1a2y:
  5. Domain(s) for 1a7n:
  6. Domain(s) for 1a7o:
  7. Domain(s) for 1a7p:
  8. Domain(s) for 1a7q:
  9. Domain(s) for 1a7r:
  10. Domain(s) for 1ahw:
    1. 2346622Domain d1ahwa1: 1ahw A:1-108 [20218]
      Other proteins in same PDB: d1ahwa2, d1ahwb1, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd2, d1ahwe1, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
      part of anti-human tissue factor Fab 5G9
    2. 2346623Domain d1ahwd1: 1ahw D:1-108 [20220]
      Other proteins in same PDB: d1ahwa2, d1ahwb1, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd2, d1ahwe1, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
      part of anti-human tissue factor Fab 5G9
  11. Domain(s) for 1aj7:
  12. Domain(s) for 1ar1:
  13. Domain(s) for 1axs:
    1. 2346567Domain d1axsa1: 1axs A:1-107 [20200]
      Other proteins in same PDB: d1axsa2, d1axsb1, d1axsb2, d1axsh1, d1axsh2, d1axsl2
      part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
      complexed with cd, hop
    2. 2346568Domain d1axsl1: 1axs L:1-107 [20198]
      Other proteins in same PDB: d1axsa2, d1axsb1, d1axsb2, d1axsh1, d1axsh2, d1axsl2
      part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
      complexed with cd, hop
  14. Domain(s) for 1b4j:
  15. Domain(s) for 1bbj:
    1. 2346624Domain d1bbja1: 1bbj A:1-109 [118418]
      Other proteins in same PDB: d1bbja2, d1bbjb1, d1bbjb2, d1bbjh1, d1bbjh2, d1bbjl2
      duplicate of 1BBJ L:1-109
    2. 2346625Domain d1bbjl1: 1bbj L:1-109 [19784]
      Other proteins in same PDB: d1bbja2, d1bbjb1, d1bbjb2, d1bbjh1, d1bbjh2, d1bbjl2
      part of humanized Fab B72.3
  16. Domain(s) for 1bj1:
    1. 2346501Domain d1bj1j1: 1bj1 J:1-107 [20324]
      Other proteins in same PDB: d1bj1h1, d1bj1h2, d1bj1j2, d1bj1k1, d1bj1k2, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
      part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
      complexed with so4
    2. 2346502Domain d1bj1l1: 1bj1 L:1-107 [20322]
      Other proteins in same PDB: d1bj1h1, d1bj1h2, d1bj1j2, d1bj1k1, d1bj1k2, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
      part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
      complexed with so4
  17. Domain(s) for 1bm3:
  18. Domain(s) for 1bog:
  19. Domain(s) for 1bz7:
  20. Domain(s) for 1c08:
  21. Domain(s) for 1c12:
  22. Domain(s) for 1c5b:
  23. Domain(s) for 1c5c:
  24. Domain(s) for 1cfn:
  25. Domain(s) for 1cfq:
  26. Domain(s) for 1cfs:
  27. Domain(s) for 1cft:
  28. Domain(s) for 1cic:
    1. 2346618Domain d1cica1: 1cic A:1-107 [19964]
      Other proteins in same PDB: d1cica2, d1cicb1, d1cicb2, d1cicc2, d1cicd1, d1cicd2
      part of D1.3 anti-idiotope Fab E225
    2. 2346619Domain d1cicc1: 1cic C:1-107 [19962]
      Other proteins in same PDB: d1cica2, d1cicb1, d1cicb2, d1cicc2, d1cicd1, d1cicd2
      part of Fab D1.3
  29. Domain(s) for 1ct8:
    1. 2346485Domain d1ct8a1: 1ct8 A:1-107 [20408]
      Other proteins in same PDB: d1ct8a2, d1ct8b1, d1ct8b2, d1ct8c2, d1ct8d1, d1ct8d2
      part of catalytic Fab 7C8
      complexed with so4, taa
    2. 2346486Domain d1ct8c1: 1ct8 C:1-107 [20410]
      Other proteins in same PDB: d1ct8a2, d1ct8b1, d1ct8b2, d1ct8c2, d1ct8d1, d1ct8d2
      part of catalytic Fab 7C8
      complexed with so4, taa
  30. Domain(s) for 1cz8:
    1. 2346601Domain d1cz8l1: 1cz8 L:1-107 [20326]
      Other proteins in same PDB: d1cz8h1, d1cz8h2, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x2, d1cz8y1, d1cz8y2
      part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
      complexed with so4
    2. 2346602Domain d1cz8x1: 1cz8 X:1-107 [20328]
      Other proteins in same PDB: d1cz8h1, d1cz8h2, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x2, d1cz8y1, d1cz8y2
      part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
      complexed with so4
  31. Domain(s) for 1d5b:
    1. 2346651Domain d1d5ba1: 1d5b A:1-107 [20204]
      Other proteins in same PDB: d1d5ba2, d1d5bb1, d1d5bb2, d1d5bb3, d1d5bh1, d1d5bh2, d1d5bh3, d1d5bl2
      part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
      complexed with cd
    2. 2346652Domain d1d5bl1: 1d5b L:1-107 [20202]
      Other proteins in same PDB: d1d5ba2, d1d5bb1, d1d5bb2, d1d5bb3, d1d5bh1, d1d5bh2, d1d5bh3, d1d5bl2
      part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
      complexed with cd
  32. Domain(s) for 1d5i:
  33. Domain(s) for 1d6v:
  34. Domain(s) for 1dqj:
  35. Domain(s) for 1dqm:
  36. Domain(s) for 1dqq:
    1. 2346422Domain d1dqqa1: 1dqq A:1-107 [20420]
      Other proteins in same PDB: d1dqqa2, d1dqqb1, d1dqqb2, d1dqqc2, d1dqqd1, d1dqqd2
      part of anti-lysozyme Fab HYHEL-63
    2. 2346423Domain d1dqqc1: 1dqq C:1-107 [20422]
      Other proteins in same PDB: d1dqqa2, d1dqqb1, d1dqqb2, d1dqqc2, d1dqqd1, d1dqqd2
      part of anti-lysozyme Fab HYHEL-63
  37. Domain(s) for 1dvf:
    1. 2346441Domain d1dvfa_: 1dvf A: [19952]
      Other proteins in same PDB: d1dvfb_, d1dvfd1, d1dvfd2
      part of Fv D1.3
      CASP1
      complexed with zn
    2. 2346442Domain d1dvfc_: 1dvf C: [20106]
      Other proteins in same PDB: d1dvfb_, d1dvfd1, d1dvfd2
      part of Fv E5.2, anti-idiotopic antibody to D1.3
      CASP1
      complexed with zn
  38. Domain(s) for 1dzb:
    1. 2346473Domain d1dzba2: 1dzb A:201-307 [20489]
      Other proteins in same PDB: d1dzba1, d1dzbb1, d1dzbx_, d1dzby_
      part of anti-lysozyme scFv 1F9
    2. 2346474Domain d1dzbb2: 1dzb B:201-307 [20491]
      Other proteins in same PDB: d1dzba1, d1dzbb1, d1dzbx_, d1dzby_
      part of anti-lysozyme scFv 1F9
  39. Domain(s) for 1e4w:
  40. Domain(s) for 1e4x:
    1. 2346510Domain d1e4xl1: 1e4x L:1-107 [59240]
      Other proteins in same PDB: d1e4xh1, d1e4xh2, d1e4xh3, d1e4xi1, d1e4xi2, d1e4xi3, d1e4xl2, d1e4xm2
      part of anti-TGFalpha Fab TAB2
    2. 2346511Domain d1e4xm1: 1e4x M:1-107 [59242]
      Other proteins in same PDB: d1e4xh1, d1e4xh2, d1e4xh3, d1e4xi1, d1e4xi2, d1e4xi3, d1e4xl2, d1e4xm2
      part of anti-TGFalpha Fab TAB2
  41. Domain(s) for 1eap:
  42. Domain(s) for 1emt:
  43. Domain(s) for 1ezv:
  44. Domain(s) for 1fai:
  45. Domain(s) for 1fbi:
    1. 2346590Domain d1fbil1: 1fbi L:1-107 [20024]
      Other proteins in same PDB: d1fbih1, d1fbih2, d1fbih3, d1fbil2, d1fbip2, d1fbiq1, d1fbiq2, d1fbiq3, d1fbix_, d1fbiy_
      part of Fab F9.13.7
    2. 2346591Domain d1fbip1: 1fbi P:1-107 [20026]
      Other proteins in same PDB: d1fbih1, d1fbih2, d1fbih3, d1fbil2, d1fbip2, d1fbiq1, d1fbiq2, d1fbiq3, d1fbix_, d1fbiy_
      part of Fab F9.13.7
  46. Domain(s) for 1fdl:
  47. Domain(s) for 1fe8:
    1. 2346467Domain d1fe8l1: 1fe8 L:1-107 [59792]
      Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h1, d1fe8h2, d1fe8i1, d1fe8i2, d1fe8j1, d1fe8j2, d1fe8l2, d1fe8m2, d1fe8n2
      part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
      complexed with cac, nag
    2. 2346468Domain d1fe8m1: 1fe8 M:1-107 [59794]
      Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h1, d1fe8h2, d1fe8i1, d1fe8i2, d1fe8j1, d1fe8j2, d1fe8l2, d1fe8m2, d1fe8n2
      part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
      complexed with cac, nag
    3. 2346469Domain d1fe8n1: 1fe8 N:1-107 [59796]
      Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h1, d1fe8h2, d1fe8i1, d1fe8i2, d1fe8j1, d1fe8j2, d1fe8l2, d1fe8m2, d1fe8n2
      part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
      complexed with cac, nag
  48. Domain(s) for 1fgn:
  49. Domain(s) for 1fh5:
  50. Domain(s) for 1fj1:
    1. 2346564Domain d1fj1a1: 1fj1 A:1-107 [20118]
      Other proteins in same PDB: d1fj1a2, d1fj1b1, d1fj1b2, d1fj1c2, d1fj1d1, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
      part of Fab LA-2 against OspA
    2. 2346565Domain d1fj1c1: 1fj1 C:1-107 [20120]
      Other proteins in same PDB: d1fj1a2, d1fj1b1, d1fj1b2, d1fj1c2, d1fj1d1, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
      part of Fab LA-2 against OspA
  51. Domain(s) for 1fns:
  52. Domain(s) for 1fsk:
    1. 2346632Domain d1fskb1: 1fsk B:1-107 [20466]
      Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb2, d1fskc1, d1fskc2, d1fskc3, d1fskd_, d1fske2, d1fskf1, d1fskf2, d1fskf3, d1fskg_, d1fskh2, d1fski1, d1fski2, d1fski3, d1fskj_, d1fskk2, d1fskl1, d1fskl2, d1fskl3
      part of anti-bet v1 Fab BV16
    2. 2346633Domain d1fske1: 1fsk E:1-107 [20468]
      Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb2, d1fskc1, d1fskc2, d1fskc3, d1fskd_, d1fske2, d1fskf1, d1fskf2, d1fskf3, d1fskg_, d1fskh2, d1fski1, d1fski2, d1fski3, d1fskj_, d1fskk2, d1fskl1, d1fskl2, d1fskl3
      part of anti-bet v1 Fab BV16
    3. 2346634Domain d1fskh1: 1fsk H:1-107 [20470]
      Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb2, d1fskc1, d1fskc2, d1fskc3, d1fskd_, d1fske2, d1fskf1, d1fskf2, d1fskf3, d1fskg_, d1fskh2, d1fski1, d1fski2, d1fski3, d1fskj_, d1fskk2, d1fskl1, d1fskl2, d1fskl3
      part of anti-bet v1 Fab BV16
    4. 2346635Domain d1fskk1: 1fsk K:1-107 [20472]
      Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb2, d1fskc1, d1fskc2, d1fskc3, d1fskd_, d1fske2, d1fskf1, d1fskf2, d1fskf3, d1fskg_, d1fskh2, d1fski1, d1fski2, d1fski3, d1fskj_, d1fskk2, d1fskl1, d1fskl2, d1fskl3
      part of anti-bet v1 Fab BV16
  53. Domain(s) for 1g7h:
  54. Domain(s) for 1g7i:
  55. Domain(s) for 1g7j:
  56. Domain(s) for 1g7l:
  57. Domain(s) for 1g7m:
  58. Domain(s) for 1gaf:
  59. Domain(s) for 1ghf:
  60. Domain(s) for 1h8n:
  61. Domain(s) for 1h8o:
    1. 2346643Domain d1h8oa1: 1h8o A:4-111 [60785]
      Other proteins in same PDB: d1h8oa2, d1h8ob2
      part of anti-ampicillin scFv
      complexed with so4; mutant
    2. 2346644Domain d1h8ob1: 1h8o B:4-112 [60787]
      Other proteins in same PDB: d1h8oa2, d1h8ob2
      part of anti-ampicillin scFv
      complexed with so4; mutant
  62. Domain(s) for 1h8s:
    1. 2346592Domain d1h8sa1: 1h8s A:4-111 [60789]
      Other proteins in same PDB: d1h8sa2, d1h8sb2
      part of anti-ampicillin scFv
      complexed with aic, so4; mutant
    2. 2346593Domain d1h8sb1: 1h8s B:4-112 [60791]
      Other proteins in same PDB: d1h8sa2, d1h8sb2
      part of anti-ampicillin scFv
      complexed with aic, so4; mutant
  63. Domain(s) for 1hh6:
  64. Domain(s) for 1hh9:
  65. Domain(s) for 1hi6:
  66. Domain(s) for 1hkl:
  67. Domain(s) for 1hys:
  68. Domain(s) for 1i3g:
  69. Domain(s) for 1i8i:
    • 2346477Domain d1i8ia_: 1i8i A: [71128]
      Other proteins in same PDB: d1i8ib_
      part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
      mutant
  70. Domain(s) for 1i8k:
    • 2346412Domain d1i8ka_: 1i8k A: [71130]
      Other proteins in same PDB: d1i8kb_
      part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
      mutant
  71. Domain(s) for 1i8m:
    1. 2346547Domain d1i8ma1: 1i8m A:1-107 [66082]
      Other proteins in same PDB: d1i8ma2, d1i8mb1, d1i8mb2, d1i8mb3, d1i8mh1, d1i8mh2, d1i8mh3, d1i8ml2
      part of anti-ssDNA Fab
      protein/DNA complex; complexed with so4
    2. 2346548Domain d1i8ml1: 1i8m L:1-107 [66088]
      Other proteins in same PDB: d1i8ma2, d1i8mb1, d1i8mb2, d1i8mb3, d1i8mh1, d1i8mh2, d1i8mh3, d1i8ml2
      part of anti-ssDNA Fab
      protein/DNA complex; complexed with so4
  72. Domain(s) for 1iai:
  73. Domain(s) for 1ic4:
  74. Domain(s) for 1ic5:
  75. Domain(s) for 1ic7:
  76. Domain(s) for 1igc:
  77. Domain(s) for 1igt:
    1. 2346570Domain d1igta1: 1igt A:1-108 [19764]
      Other proteins in same PDB: d1igta2, d1igtb1, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc2, d1igtd1, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
      part of intact IgG2a antibody Mab231
    2. 2346571Domain d1igtc1: 1igt C:1-108 [19766]
      Other proteins in same PDB: d1igta2, d1igtb1, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc2, d1igtd1, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
      part of intact IgG2a antibody Mab231
  78. Domain(s) for 1igy:
    1. 2346630Domain d1igya1: 1igy A:2-107 [19768]
      Other proteins in same PDB: d1igya2, d1igyb1, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc2, d1igyd1, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
      part of intact IgG1 antibody Mab61.1.3
    2. 2346631Domain d1igyc1: 1igy C:2-107 [19770]
      Other proteins in same PDB: d1igya2, d1igyb1, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc2, d1igyd1, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
      part of intact IgG1 antibody Mab61.1.3
  79. Domain(s) for 1ikf:
  80. Domain(s) for 1j1o:
  81. Domain(s) for 1j1p:
  82. Domain(s) for 1j1x:
  83. Domain(s) for 1j5o:
  84. Domain(s) for 1jfq:
  85. Domain(s) for 1jgl:
  86. Domain(s) for 1jhk:
  87. Domain(s) for 1jhl:
  88. Domain(s) for 1jnl:
  89. Domain(s) for 1jnn:
  90. Domain(s) for 1jrh:
  91. Domain(s) for 1k4c:
  92. Domain(s) for 1k4d:
  93. Domain(s) for 1k6q:
  94. Domain(s) for 1kb5:
  95. Domain(s) for 1kb9:
  96. Domain(s) for 1kc5:
  97. Domain(s) for 1kcr:
  98. Domain(s) for 1kcs:
  99. Domain(s) for 1kcu:
  100. Domain(s) for 1kcv:
  101. Domain(s) for 1kip:
  102. Domain(s) for 1kiq:
  103. Domain(s) for 1kir:
  104. Domain(s) for 1kno:
    1. 2346626Domain d1knoa1: 1kno A:1-108 [20008]
      Other proteins in same PDB: d1knoa2, d1knob1, d1knob2, d1knoc2, d1knod1, d1knod2, d1knoe2, d1knof1, d1knof2
      part of Fab CNJ206
      complexed with pnp, zn
    2. 2346627Domain d1knoc1: 1kno C:1-108 [20010]
      Other proteins in same PDB: d1knoa2, d1knob1, d1knob2, d1knoc2, d1knod1, d1knod2, d1knoe2, d1knof1, d1knof2
      part of Fab CNJ206
      complexed with pnp, zn
    3. 2346628Domain d1knoe1: 1kno E:1-108 [20012]
      Other proteins in same PDB: d1knoa2, d1knob1, d1knob2, d1knoc2, d1knod1, d1knod2, d1knoe2, d1knof1, d1knof2
      part of Fab CNJ206
      complexed with pnp, zn
  105. Domain(s) for 1kyo:
    1. 2346598Domain d1kyok_: 1kyo K: [73263]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyow_
      part of Fv against Rieske protein from the yeast cytochrome bc1 complex
      complexed with fes, hem, sma
    2. 2346599Domain d1kyov_: 1kyo V: [73278]
      Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyow_
      part of Fv against Rieske protein from the yeast cytochrome bc1 complex
      complexed with fes, hem, sma
  106. Domain(s) for 1mam:
  107. Domain(s) for 1mex:
  108. Domain(s) for 1mlb:
  109. Domain(s) for 1mlc:
    1. 2346545Domain d1mlca1: 1mlc A:1-108 [20052]
      Other proteins in same PDB: d1mlca2, d1mlcb1, d1mlcb2, d1mlcb3, d1mlcc2, d1mlcd1, d1mlcd2, d1mlcd3, d1mlce_, d1mlcf_
      part of Fab D44.1
    2. 2346546Domain d1mlcc1: 1mlc C:1-108 [20054]
      Other proteins in same PDB: d1mlca2, d1mlcb1, d1mlcb2, d1mlcb3, d1mlcc2, d1mlcd1, d1mlcd2, d1mlcd3, d1mlce_, d1mlcf_
      part of Fab D44.1
  110. Domain(s) for 1mqk:
    • 2346402Domain d1mqkl_: 1mqk L: [85054]
      Other proteins in same PDB: d1mqkh_
      part of Fv against Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase
  111. Domain(s) for 1n5y:
  112. Domain(s) for 1n6q:
  113. Domain(s) for 1n7m:
    • 2346425Domain d1n7mh1: 1n7m H:1-107 [80252]
      Other proteins in same PDB: d1n7mh2, d1n7ml1, d1n7ml2
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; germline antibody; chain identifiers are probably mixed up
      complexed with mmp
  114. Domain(s) for 1nby:
  115. Domain(s) for 1nbz:
  116. Domain(s) for 1nca:
  117. Domain(s) for 1ncb:
  118. Domain(s) for 1ncc:
  119. Domain(s) for 1ncd:
  120. Domain(s) for 1ndg:
  121. Domain(s) for 1ndm:
  122. Domain(s) for 1ngw:
    1. 2346676Domain d1ngwa1: 1ngw A:1-107 [80488]
      Other proteins in same PDB: d1ngwa2, d1ngwb1, d1ngwb2, d1ngwh1, d1ngwh2, d1ngwl2
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
      complexed with mmp
    2. 2346677Domain d1ngwl1: 1ngw L:1-107 [80494]
      Other proteins in same PDB: d1ngwa2, d1ngwb1, d1ngwb2, d1ngwh1, d1ngwh2, d1ngwl2
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
      complexed with mmp
  123. Domain(s) for 1ngx:
    1. 2346664Domain d1ngxa1: 1ngx A:1-107 [85702]
      Other proteins in same PDB: d1ngxa2, d1ngxb1, d1ngxb2, d1ngxh1, d1ngxh2, d1ngxl2
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
      complexed with jef
    2. 2346665Domain d1ngxl1: 1ngx L:1-107 [85708]
      Other proteins in same PDB: d1ngxa2, d1ngxb1, d1ngxb2, d1ngxh1, d1ngxh2, d1ngxl2
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
      complexed with jef
  124. Domain(s) for 1ngy:
  125. Domain(s) for 1ngz:
  126. Domain(s) for 1nma:
    • 2346596Domain d1nmal_: 1nma L: [20064]
      Other proteins in same PDB: d1nmah_, d1nman_
      part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
      complexed with nag; mutant
  127. Domain(s) for 1nmb:
  128. Domain(s) for 1nmc:
    1. 2346536Domain d1nmcc_: 1nmc C: [20059]
      Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcb1, d1nmcb2, d1nmch1, d1nmch2, d1nmcn_
      part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
      complexed with ca, man, nag
    2. 2346537Domain d1nmcl_: 1nmc L: [20056]
      Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcb1, d1nmcb2, d1nmch1, d1nmch2, d1nmcn_
      part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
      complexed with ca, man, nag
  129. Domain(s) for 1oak:
  130. Domain(s) for 1opg:
  131. Domain(s) for 1osp:
  132. Domain(s) for 1p2c:
    1. 2346447Domain d1p2ca1: 1p2c A:1-107 [93915]
      Other proteins in same PDB: d1p2ca2, d1p2cb1, d1p2cb2, d1p2cc_, d1p2cd2, d1p2ce1, d1p2ce2, d1p2cf_
      part of anti-lysozyme Fab F10.6.6
    2. 2346448Domain d1p2cd1: 1p2c D:901-1007 [93920]
      Other proteins in same PDB: d1p2ca2, d1p2cb1, d1p2cb2, d1p2cc_, d1p2cd2, d1p2ce1, d1p2ce2, d1p2cf_
      part of anti-lysozyme Fab F10.6.6
  133. Domain(s) for 1p7k:
    1. 2346407Domain d1p7ka1: 1p7k A:1-107 [94287]
      Other proteins in same PDB: d1p7ka2, d1p7kb1, d1p7kb2, d1p7kb3, d1p7kh1, d1p7kh2, d1p7kh3, d1p7kl2
      part of anti-ssDNA Fab
      complexed with 1pe, epe, gol, peg, so4
    2. 2346408Domain d1p7kl1: 1p7k L:1-107 [94293]
      Other proteins in same PDB: d1p7ka2, d1p7kb1, d1p7kb2, d1p7kb3, d1p7kh1, d1p7kh2, d1p7kh3, d1p7kl2
      part of anti-ssDNA Fab
      complexed with 1pe, epe, gol, peg, so4
  134. Domain(s) for 1p84:
  135. Domain(s) for 1qbl:
  136. Domain(s) for 1qbm:
  137. Domain(s) for 1qfw:
  138. Domain(s) for 1qle:
  139. Domain(s) for 1r0a:
  140. Domain(s) for 1r24:
    1. 2346657Domain d1r24a1: 1r24 A:1-107 [20404]
      Other proteins in same PDB: d1r24a2, d1r24b1, d1r24b2, d1r24c2, d1r24d1, d1r24d2
      part of Fab R24 from murine ascites
    2. 2346658Domain d1r24c1: 1r24 C:1-107 [20406]
      Other proteins in same PDB: d1r24a2, d1r24b1, d1r24b2, d1r24c2, d1r24d1, d1r24d2
      part of Fab R24 from murine ascites
  141. Domain(s) for 1r3i:
  142. Domain(s) for 1r3j:
  143. Domain(s) for 1r3k:
  144. Domain(s) for 1r3l:
  145. Domain(s) for 1rih:
  146. Domain(s) for 1s5h:
  147. Domain(s) for 1t03:
  148. Domain(s) for 1ua6:
  149. Domain(s) for 1uac:
  150. Domain(s) for 1um4:
  151. Domain(s) for 1um5:
  152. Domain(s) for 1um6:
  153. Domain(s) for 1uwe:
    1. 2346639Domain d1uwel1: 1uwe L:1-107 [100105]
      Other proteins in same PDB: d1uweh1, d1uweh2, d1uwel2, d1uweu2, d1uwev1, d1uwev2, d1uwex2, d1uwey1, d1uwey2
      part of catalytic Fab 14d9
    2. 2346640Domain d1uweu1: 1uwe U:1-107 [100107]
      Other proteins in same PDB: d1uweh1, d1uweh2, d1uwel2, d1uweu2, d1uwev1, d1uwev2, d1uwex2, d1uwey1, d1uwey2
      part of catalytic Fab 14d9
    3. 2346641Domain d1uwex1: 1uwe X:1-107 [100111]
      Other proteins in same PDB: d1uweh1, d1uweh2, d1uwel2, d1uweu2, d1uwev1, d1uwev2, d1uwex2, d1uwey1, d1uwey2
      part of catalytic Fab 14d9
  154. Domain(s) for 1uwg:
    1. 2346647Domain d1uwgl1: 1uwg L:1-107 [100117]
      Other proteins in same PDB: d1uwgh1, d1uwgh2, d1uwgl2, d1uwgx2, d1uwgy1, d1uwgy2
      part of catalytic Fab 14d9
      complexed with kha, po4
    2. 2346648Domain d1uwgx1: 1uwg X:1-107 [100119]
      Other proteins in same PDB: d1uwgh1, d1uwgh2, d1uwgl2, d1uwgx2, d1uwgy1, d1uwgy2
      part of catalytic Fab 14d9
      complexed with kha, po4
  155. Domain(s) for 1vfa:
  156. Domain(s) for 1vfb:
  157. Domain(s) for 1wej:
  158. Domain(s) for 1xf2:
    1. 2346578Domain d1xf2a1: 1xf2 A:1-107 [203143]
      Other proteins in same PDB: d1xf2a2, d1xf2l2
      automated match to d1p7kl1
      protein/DNA complex; complexed with so4
    2. 2346579Domain d1xf2l1: 1xf2 L:1-107 [203145]
      Other proteins in same PDB: d1xf2a2, d1xf2l2
      automated match to d1p7kl1
      protein/DNA complex; complexed with so4
  159. Domain(s) for 1xf3:
    1. 2346582Domain d1xf3a1: 1xf3 A:1-107 [203147]
      Other proteins in same PDB: d1xf3a2, d1xf3l2
      automated match to d1p7kl1
    2. 2346583Domain d1xf3l1: 1xf3 L:1-107 [203149]
      Other proteins in same PDB: d1xf3a2, d1xf3l2
      automated match to d1p7kl1
  160. Domain(s) for 1xf4:
    1. 2346613Domain d1xf4a1: 1xf4 A:1-107 [203151]
      Other proteins in same PDB: d1xf4a2, d1xf4l2
      automated match to d1p7kl1
      complexed with so4
    2. 2346614Domain d1xf4l1: 1xf4 L:1-107 [203153]
      Other proteins in same PDB: d1xf4a2, d1xf4l2
      automated match to d1p7kl1
      complexed with so4
  161. Domain(s) for 1xiw:
    1. 2346432Domain d1xiwc_: 1xiw C: [115369]
      Other proteins in same PDB: d1xiwa_, d1xiwb_, d1xiwd_, d1xiwe_, d1xiwf_, d1xiwh_
    2. 2346433Domain d1xiwg_: 1xiw G: [115373]
      Other proteins in same PDB: d1xiwa_, d1xiwb_, d1xiwd_, d1xiwe_, d1xiwf_, d1xiwh_
  162. Domain(s) for 1zwi:
  163. Domain(s) for 2atk:
  164. Domain(s) for 2bob:
  165. Domain(s) for 2dqc:
  166. Domain(s) for 2dqd:
  167. Domain(s) for 2dqe:
  168. Domain(s) for 2dqf:
    1. 2346553Domain d2dqfa_: 2dqf A: [131625]
      Other proteins in same PDB: d2dqfb1, d2dqfc_, d2dqfe_, d2dqff_
      automated match to d1c08a_
      mutant
    2. 2346554Domain d2dqfd_: 2dqf D: [131627]
      Other proteins in same PDB: d2dqfb1, d2dqfc_, d2dqfe_, d2dqff_
      automated match to d1c08a_
      mutant
  169. Domain(s) for 2dqg:
  170. Domain(s) for 2dqh:
  171. Domain(s) for 2dqi:
  172. Domain(s) for 2dqj:
  173. Domain(s) for 2dtg:
  174. Domain(s) for 2dwd:
  175. Domain(s) for 2dwe:
  176. Domain(s) for 2f19:
  177. Domain(s) for 2gfb:
    1. 2346667Domain d2gfba1: 2gfb A:1-108 [19992]
      Other proteins in same PDB: d2gfba2, d2gfbb1, d2gfbb2, d2gfbc2, d2gfbd1, d2gfbd2, d2gfbe2, d2gfbf1, d2gfbf2, d2gfbg2, d2gfbh1, d2gfbh2, d2gfbi2, d2gfbj1, d2gfbj2, d2gfbk2, d2gfbl1, d2gfbl2, d2gfbm2, d2gfbn1, d2gfbn2, d2gfbo2, d2gfbp1, d2gfbp2
      part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    2. 2346668Domain d2gfbc1: 2gfb C:1-108 [19994]
      Other proteins in same PDB: d2gfba2, d2gfbb1, d2gfbb2, d2gfbc2, d2gfbd1, d2gfbd2, d2gfbe2, d2gfbf1, d2gfbf2, d2gfbg2, d2gfbh1, d2gfbh2, d2gfbi2, d2gfbj1, d2gfbj2, d2gfbk2, d2gfbl1, d2gfbl2, d2gfbm2, d2gfbn1, d2gfbn2, d2gfbo2, d2gfbp1, d2gfbp2
      part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    3. 2346669Domain d2gfbe1: 2gfb E:1-108 [19996]
      Other proteins in same PDB: d2gfba2, d2gfbb1, d2gfbb2, d2gfbc2, d2gfbd1, d2gfbd2, d2gfbe2, d2gfbf1, d2gfbf2, d2gfbg2, d2gfbh1, d2gfbh2, d2gfbi2, d2gfbj1, d2gfbj2, d2gfbk2, d2gfbl1, d2gfbl2, d2gfbm2, d2gfbn1, d2gfbn2, d2gfbo2, d2gfbp1, d2gfbp2
      part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    4. 2346670Domain d2gfbg1: 2gfb G:1-108 [19998]
      Other proteins in same PDB: d2gfba2, d2gfbb1, d2gfbb2, d2gfbc2, d2gfbd1, d2gfbd2, d2gfbe2, d2gfbf1, d2gfbf2, d2gfbg2, d2gfbh1, d2gfbh2, d2gfbi2, d2gfbj1, d2gfbj2, d2gfbk2, d2gfbl1, d2gfbl2, d2gfbm2, d2gfbn1, d2gfbn2, d2gfbo2, d2gfbp1, d2gfbp2
      part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    5. 2346671Domain d2gfbi1: 2gfb I:1-108 [20000]
      Other proteins in same PDB: d2gfba2, d2gfbb1, d2gfbb2, d2gfbc2, d2gfbd1, d2gfbd2, d2gfbe2, d2gfbf1, d2gfbf2, d2gfbg2, d2gfbh1, d2gfbh2, d2gfbi2, d2gfbj1, d2gfbj2, d2gfbk2, d2gfbl1, d2gfbl2, d2gfbm2, d2gfbn1, d2gfbn2, d2gfbo2, d2gfbp1, d2gfbp2
      part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    6. 2346672Domain d2gfbk1: 2gfb K:1-108 [20002]
      Other proteins in same PDB: d2gfba2, d2gfbb1, d2gfbb2, d2gfbc2, d2gfbd1, d2gfbd2, d2gfbe2, d2gfbf1, d2gfbf2, d2gfbg2, d2gfbh1, d2gfbh2, d2gfbi2, d2gfbj1, d2gfbj2, d2gfbk2, d2gfbl1, d2gfbl2, d2gfbm2, d2gfbn1, d2gfbn2, d2gfbo2, d2gfbp1, d2gfbp2
      part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    7. 2346673Domain d2gfbm1: 2gfb M:1-108 [20004]
      Other proteins in same PDB: d2gfba2, d2gfbb1, d2gfbb2, d2gfbc2, d2gfbd1, d2gfbd2, d2gfbe2, d2gfbf1, d2gfbf2, d2gfbg2, d2gfbh1, d2gfbh2, d2gfbi2, d2gfbj1, d2gfbj2, d2gfbk2, d2gfbl1, d2gfbl2, d2gfbm2, d2gfbn1, d2gfbn2, d2gfbo2, d2gfbp1, d2gfbp2
      part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
    8. 2346674Domain d2gfbo1: 2gfb O:1-108 [20006]
      Other proteins in same PDB: d2gfba2, d2gfbb1, d2gfbb2, d2gfbc2, d2gfbd1, d2gfbd2, d2gfbe2, d2gfbf1, d2gfbf2, d2gfbg2, d2gfbh1, d2gfbh2, d2gfbi2, d2gfbj1, d2gfbj2, d2gfbk2, d2gfbl1, d2gfbl2, d2gfbm2, d2gfbn1, d2gfbn2, d2gfbo2, d2gfbp1, d2gfbp2
      part of Fab CNJ206; H-chains in this entry seem to be mistraced in VH region
  178. Domain(s) for 2hh0:
  179. Domain(s) for 2hjf:
  180. Domain(s) for 2hmi:
  181. Domain(s) for 2hvj:
  182. Domain(s) for 2hvk:
  183. Domain(s) for 2ibz:
  184. Domain(s) for 2ih1:
  185. Domain(s) for 2ih3:
  186. Domain(s) for 2itd:
  187. Domain(s) for 2j88:
  188. Domain(s) for 2jk5:
  189. Domain(s) for 2nlj:
  190. Domain(s) for 2p7t:
  191. Domain(s) for 2q76:
    1. 2346453Domain d2q76a1: 2q76 A:1-107 [198282]
      Other proteins in same PDB: d2q76a2, d2q76b1, d2q76c2, d2q76d1
      automated match to d1p2ca1
    2. 2346454Domain d2q76c1: 2q76 C:1-107 [198284]
      Other proteins in same PDB: d2q76a2, d2q76b1, d2q76c2, d2q76d1
      automated match to d1p2ca1
  192. Domain(s) for 2rcs:
  193. Domain(s) for 2w0f:
  194. Domain(s) for 3a67:
  195. Domain(s) for 3a6b:
  196. Domain(s) for 3a6c:
  197. Domain(s) for 3cx5:
    1. 2346465Domain d3cx5k_: 3cx5 K: [157091]
      Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f_, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q_, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5w_
      automated match to d1ezvy_
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    2. 2346466Domain d3cx5v_: 3cx5 V: [157107]
      Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d1, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f_, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o1, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q_, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5w_
      automated match to d1ezvy_
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
  198. Domain(s) for 3cxh:
    1. 2346538Domain d3cxhk_: 3cxh K: [157124]
      Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf_, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq_, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhw_
      automated match to d1ezvy_
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
    2. 2346539Domain d3cxhv_: 3cxh V: [157140]
      Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd1, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf_, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho1, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq_, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhw_
      automated match to d1ezvy_
      complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
  199. Domain(s) for 3fb5:
  200. Domain(s) for 3fct:
    1. 2346498Domain d3fcta1: 3fct A:1-107 [20374]
      Other proteins in same PDB: d3fcta2, d3fctb1, d3fctb2, d3fctc2, d3fctd1, d3fctd2
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody
      complexed with ca, cd, mg, mmp, na
    2. 2346499Domain d3fctc1: 3fct C:1-107 [20376]
      Other proteins in same PDB: d3fcta2, d3fctb1, d3fctb2, d3fctc2, d3fctd1, d3fctd2
      part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; mature antibody
      complexed with ca, cd, mg, mmp, na
  201. Domain(s) for 3gb7:
  202. Domain(s) for 3hfm:
  203. Domain(s) for 3iga:
  204. Domain(s) for 3or6:
  205. Domain(s) for 3or7:
  206. Domain(s) for 3qct:
  207. Domain(s) for 3qcu:
    1. 2346520Domain d3qcul1: 3qcu L:1-107 [215171]
      Other proteins in same PDB: d3qcul2, d3qcum2
      automated match to d1t66c1
      complexed with nkn
    2. 2346521Domain d3qcum1: 3qcu M:1-107 [215173]
      Other proteins in same PDB: d3qcul2, d3qcum2
      automated match to d1t66c1
      complexed with nkn
  208. Domain(s) for 3qcv:
    1. 2346607Domain d3qcvl1: 3qcv L:1-107 [215175]
      Other proteins in same PDB: d3qcvl2, d3qcvm2
      automated match to d1t66c1
      complexed with 18l
    2. 2346608Domain d3qcvm1: 3qcv M:1-107 [215177]
      Other proteins in same PDB: d3qcvl2, d3qcvm2
      automated match to d1t66c1
      complexed with 18l
  209. Domain(s) for 3stl:
  210. Domain(s) for 3stz:
  211. Domain(s) for 4lbe:
  212. Domain(s) for 4lcu:
  213. Domain(s) for 4msw:
  214. Domain(s) for 4pd4:
  215. Domain(s) for 4uuj:
  216. Domain(s) for 5ayu:
  217. Domain(s) for 5ebl:
  218. Domain(s) for 5ebm:
  219. Domain(s) for 5ec2:
  220. Domain(s) for 5vk6:
  221. Domain(s) for 5vke:
  222. Domain(s) for 5vkh:
  223. Domain(s) for 6by2:
  224. Domain(s) for 6by3:
  225. Domain(s) for 6fab:

More info for Species Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId:10090] from b.1.1.1 Immunoglobulin light chain kappa variable domain, VL-kappa

Timeline for Species Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId:10090] from b.1.1.1 Immunoglobulin light chain kappa variable domain, VL-kappa: