![]() | Class b: All beta proteins [48724] (144 folds) |
![]() | Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (23 superfamilies) sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key some members of the fold have additional strands |
![]() | Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) ![]() |
![]() | Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (27 proteins) |
![]() | Protein Immunoglobulin light chain kappa variable domain, VL-kappa [88519] (14 species) VL-kappa domains of human and mouse antibodies are clustered by the sequence similarity within the germline encoded segment and then by the size of the complementarity determining regions CDR1 and CDR2, so the clusters may correspond to putative germline families in the species genomes; VL-kappa domains with artificial or grafted exogenous CDRs are listed as engineered species |
![]() | Species Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] [88520] (19 PDB entries) |
![]() | Domain d1ar2__: 1ar2 - [20522] VL of Bence-Jones protein REI; disulfide-free mutant |
![]() | Domain d1b0wa_: 1b0w A: [20532] |
![]() | Domain d1b0wb_: 1b0w B: [20533] |
![]() | Domain d1b0wc_: 1b0w C: [20534] VL dimer of Bence-Jones protein BRE |
![]() | Domain d1b6da1: 1b6d A:1-107 [20603] Other proteins in same PDB: d1b6da2, d1b6db2 |
![]() | Domain d1b6db1: 1b6d B:1-107 [20604] Other proteins in same PDB: d1b6da2, d1b6db2 part of Bence-Jones protein DEL |
![]() | Domain d1brea_: 1bre A: [20538] |
![]() | Domain d1breb_: 1bre B: [20539] |
![]() | Domain d1brec_: 1bre C: [20540] |
![]() | Domain d1bred_: 1bre D: [20541] |
![]() | Domain d1bree_: 1bre E: [20542] |
![]() | Domain d1bref_: 1bre F: [20543] VL dimer of Bence-Jones protein BRE |
![]() | Domain d1bwwa_: 1bww A: [20518] |
![]() | Domain d1bwwb_: 1bww B: [20519] VL dimer of Bence-Jones protein REI |
![]() | Domain d1deea1: 1dee A:1-107 [20442] Other proteins in same PDB: d1deea2, d1deeb1, d1deeb2, d1deec2, d1deed1, d1deed2, d1deee2, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_ |
![]() | Domain d1deec1: 1dee C:1001-1107 [20444] Other proteins in same PDB: d1deea2, d1deeb1, d1deeb2, d1deec2, d1deed1, d1deed2, d1deee2, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_ |
![]() | Domain d1deee1: 1dee E:2001-2107 [20446] Other proteins in same PDB: d1deea2, d1deeb1, d1deeb2, d1deec2, d1deed1, d1deed2, d1deee2, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_ part of IgM RF 2A2 |
![]() | Domain d1dfbl1: 1dfb L:1-106 [19810] Other proteins in same PDB: d1dfbh1, d1dfbh2, d1dfbl2 part of Fab 3D6 |
![]() | Domain d1dqll_: 1dql L: [19828] Other proteins in same PDB: d1dqlh_ part of IgM Fv MEZ |
![]() | Domain d1f6ll_: 1f6l L: [76159] VL of anti-ferritin antibody |
![]() | Domain d1igml_: 1igm L: [19826] Other proteins in same PDB: d1igmh_ part of IgM Fv POT |
![]() | Domain d1jv5a_: 1jv5 A: [67344] Other proteins in same PDB: d1jv5b_ part of an anti-blood group A Fv |
![]() | Domain d1qp1a_: 1qp1 A: [20535] |
![]() | Domain d1qp1b_: 1qp1 B: [20536] |
![]() | Domain d1qp1c_: 1qp1 C: [20537] VL dimer of Bence-Jones protein BRE |
![]() | Domain d1reia_: 1rei A: [20520] |
![]() | Domain d1reib_: 1rei B: [20521] VL dimer of Bence-Jones protein REI |
![]() | Domain d1rz7l1: 1rz7 L:2-107 [98135] Other proteins in same PDB: d1rz7h1, d1rz7h2, d1rz7l2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 48D |
![]() | Domain d1rzia1: 1rzi A:2-107 [98166] Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2 |
![]() | Domain d1rzic1: 1rzi C:1-107 [98170] Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2 |
![]() | Domain d1rzie1: 1rzi E:2-107 [98174] Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2 |
![]() | Domain d1rzig1: 1rzi G:2-107 [98178] Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2 |
![]() | Domain d1rzii1: 1rzi I:2-107 [98182] Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2 |
![]() | Domain d1rzik1: 1rzi K:2-107 [98186] Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2 |
![]() | Domain d1rzim1: 1rzi M:2-107 [98190] Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2 |
![]() | Domain d1rzio1: 1rzi O:2-107 [98194] Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2 part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E |
![]() | Domain d1vgel1: 1vge L:1-107 [20094] Other proteins in same PDB: d1vgeh1, d1vgeh2, d1vgel2 part of humanized Fab TR1.9 |
![]() | Domain d1wtla_: 1wtl A: [20530] |
![]() | Domain d1wtlb_: 1wtl B: [20531] VL dimer of Bence-Jones protein WAT |
Timeline for Species Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] from b.1.1.1 Immunoglobulin light chain kappa variable domain, VL-kappa: