Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 713694Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (334 folds)
  3. 723373Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (55 superfamilies)
    alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
  4. 724976Superfamily d.58.11: EF-G C-terminal domain-like [54980] (3 families) (S)
  5. 724977Family d.58.11.1: EF-G/eEF-2 domains III and V [54981] (2 proteins)
    domain III structure is lacking some of the superfamily characters and is often disordered in crystals
  6. 724978Protein Elongation factor 2 (eEF-2) [82677] (1 species)
  7. 724979Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [82678] (13 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 1n0u:
    1. 724980Domain d1n0ua4: 1n0u A:482-560 [79760]
      Other proteins in same PDB: d1n0ua1, d1n0ua2, d1n0ua3
    2. 724981Domain d1n0ua5: 1n0u A:726-842 [79761]
      Other proteins in same PDB: d1n0ua1, d1n0ua2, d1n0ua3
      complexed with so1
  2. Domain(s) for 1n0v:
    1. 724982Domain d1n0vc4: 1n0v C:482-560 [79765]
      Other proteins in same PDB: d1n0vc1, d1n0vc2, d1n0vc3, d1n0vd1, d1n0vd2, d1n0vd3
    2. 724983Domain d1n0vc5: 1n0v C:726-842 [79766]
      Other proteins in same PDB: d1n0vc1, d1n0vc2, d1n0vc3, d1n0vd1, d1n0vd2, d1n0vd3
    3. 724984Domain d1n0vd4: 1n0v D:482-560 [79770]
      Other proteins in same PDB: d1n0vc1, d1n0vc2, d1n0vc3, d1n0vd1, d1n0vd2, d1n0vd3
    4. 724985Domain d1n0vd5: 1n0v D:726-842 [79771]
      Other proteins in same PDB: d1n0vc1, d1n0vc2, d1n0vc3, d1n0vd1, d1n0vd2, d1n0vd3
  3. Domain(s) for 1u2r:
    1. 725004Domain d1u2ra4: 1u2r A:482-560 [107620]
      Other proteins in same PDB: d1u2ra1, d1u2ra2, d1u2ra3
    2. 725005Domain d1u2ra5: 1u2r A:726-842 [107621]
      Other proteins in same PDB: d1u2ra1, d1u2ra2, d1u2ra3
      complexed with apr, dde, gdp, mg, so1
  4. Domain(s) for 1zm2:
    1. 725012Domain d1zm2a4: 1zm2 A:482-560 [125283]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with apr, dde
    2. 725013Domain d1zm2a5: 1zm2 A:726-842 [125284]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with apr, dde
    3. 725014Domain d1zm2c4: 1zm2 C:482-560 [125289]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with apr, dde
    4. 725015Domain d1zm2c5: 1zm2 C:726-842 [125290]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with apr, dde
    5. 725016Domain d1zm2e4: 1zm2 E:482-560 [125295]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with apr, dde
    6. 725017Domain d1zm2e5: 1zm2 E:726-842 [125296]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b1, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d1, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with apr, dde
  5. Domain(s) for 1zm3:
    1. 724998Domain d1zm3a4: 1zm3 A:482-560 [125301]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde
    2. 724999Domain d1zm3a5: 1zm3 A:726-842 [125302]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde
    3. 725000Domain d1zm3c4: 1zm3 C:482-560 [125307]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde
    4. 725001Domain d1zm3c5: 1zm3 C:726-842 [125308]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde
    5. 725002Domain d1zm3e4: 1zm3 E:482-560 [125313]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde
    6. 725003Domain d1zm3e5: 1zm3 E:726-842 [125314]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b1, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d1, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde
  6. Domain(s) for 1zm4:
    1. 725006Domain d1zm4a4: 1zm4 A:482-560 [125319]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a3, d1zm4b1, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c3, d1zm4d1, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e3, d1zm4f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde, tad
    2. 725007Domain d1zm4a5: 1zm4 A:726-842 [125320]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a3, d1zm4b1, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c3, d1zm4d1, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e3, d1zm4f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde, tad
    3. 725008Domain d1zm4c4: 1zm4 C:482-560 [125325]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a3, d1zm4b1, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c3, d1zm4d1, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e3, d1zm4f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde, tad
    4. 725009Domain d1zm4c5: 1zm4 C:726-842 [125326]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a3, d1zm4b1, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c3, d1zm4d1, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e3, d1zm4f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde, tad
    5. 725010Domain d1zm4e4: 1zm4 E:482-560 [125331]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a3, d1zm4b1, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c3, d1zm4d1, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e3, d1zm4f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde, tad
    6. 725011Domain d1zm4e5: 1zm4 E:726-842 [125332]
      Other proteins in same PDB: d1zm4a1, d1zm4a2, d1zm4a3, d1zm4b1, d1zm4c1, d1zm4c2, d1zm4c3, d1zm4d1, d1zm4e1, d1zm4e2, d1zm4e3, d1zm4f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde, tad
  7. Domain(s) for 1zm9:
    1. 724990Domain d1zm9a4: 1zm9 A:482-560 [125339]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a3, d1zm9b1, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c3, d1zm9d1, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e3, d1zm9f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde, p34
    2. 724991Domain d1zm9a5: 1zm9 A:726-842 [125340]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a3, d1zm9b1, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c3, d1zm9d1, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e3, d1zm9f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde, p34
    3. 724992Domain d1zm9c4: 1zm9 C:482-560 [125345]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a3, d1zm9b1, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c3, d1zm9d1, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e3, d1zm9f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde, p34
    4. 724993Domain d1zm9c5: 1zm9 C:726-842 [125346]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a3, d1zm9b1, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c3, d1zm9d1, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e3, d1zm9f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde, p34
    5. 724994Domain d1zm9e4: 1zm9 E:482-560 [125351]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a3, d1zm9b1, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c3, d1zm9d1, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e3, d1zm9f1
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with dde, p34
    6. 724995Domain d1zm9e5: 1zm9 E:726-842 [125352]
      Other proteins in same PDB: d1zm9a1, d1zm9a2, d1zm9a3, d1zm9b1, d1zm9c1, d1zm9c2, d1zm9c3, d1zm9d1, d1zm9e1, d1zm9e2, d1zm9e3, d1zm9f1
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with dde, p34
  8. Domain(s) for 2e1r:
    1. 724996Domain d2e1ra4: 2e1r A:482-560 [131969]
      Other proteins in same PDB: d2e1ra1, d2e1ra2, d2e1ra3
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with gdp, sod
    2. 724997Domain d2e1ra5: 2e1r A:726-842 [131970]
      Other proteins in same PDB: d2e1ra1, d2e1ra2, d2e1ra3
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with gdp, sod
  9. Domain(s) for 2npf:
    1. 724986Domain d2npfa4: 2npf A:482-560 [138435]
      Other proteins in same PDB: d2npfa1, d2npfa2, d2npfa3, d2npfb1, d2npfb2, d2npfb3
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with gdp, mou
    2. 724987Domain d2npfa5: 2npf A:726-842 [138436]
      Other proteins in same PDB: d2npfa1, d2npfa2, d2npfa3, d2npfb1, d2npfb2, d2npfb3
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with gdp, mou
    3. 724988Domain d2npfb4: 2npf B:482-560 [138440]
      Other proteins in same PDB: d2npfa1, d2npfa2, d2npfa3, d2npfb1, d2npfb2, d2npfb3
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with gdp, mou
    4. 724989Domain d2npfb5: 2npf B:726-842 [138441]
      Other proteins in same PDB: d2npfa1, d2npfa2, d2npfa3, d2npfb1, d2npfb2, d2npfb3
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with gdp, mou
  10. Domain(s) for 2p8w:
    1. 725022Domain d2p8wt4: 2p8w T:482-560 [139539]
      Other proteins in same PDB: d2p8wt1, d2p8wt2, d2p8wt3
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with gnp
    2. 725023Domain d2p8wt5: 2p8w T:730-842 [139540]
      Other proteins in same PDB: d2p8wt1, d2p8wt2, d2p8wt3
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with gnp
  11. Domain(s) for 2p8x:
    1. 725020Domain d2p8xt4: 2p8x T:482-560 [139544]
      Other proteins in same PDB: d2p8xt1, d2p8xt2, d2p8xt3
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with apr, dde, gnp
    2. 725021Domain d2p8xt5: 2p8x T:730-842 [139545]
      Other proteins in same PDB: d2p8xt1, d2p8xt2, d2p8xt3
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with apr, dde, gnp
  12. Domain(s) for 2p8y:
    1. 725024Domain d2p8yt4: 2p8y T:482-560 [139549]
      Other proteins in same PDB: d2p8yt1, d2p8yt2, d2p8yt3
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with apr, dde, gdp, so1
    2. 725025Domain d2p8yt5: 2p8y T:730-842 [139550]
      Other proteins in same PDB: d2p8yt1, d2p8yt2, d2p8yt3
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with apr, dde, gdp, so1
  13. Domain(s) for 2p8z:
    1. 725018Domain d2p8zt4: 2p8z T:482-560 [139554]
      Other proteins in same PDB: d2p8zt1, d2p8zt2, d2p8zt3
      automatically matched to d1n0ua4
      complexed with apr, dde, gnp, so1
    2. 725019Domain d2p8zt5: 2p8z T:730-842 [139555]
      Other proteins in same PDB: d2p8zt1, d2p8zt2, d2p8zt3
      automatically matched to d1n0ua5
      complexed with apr, dde, gnp, so1

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