Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2017114Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2049048Fold b.38: Sm-like fold [50181] (5 superfamilies)
    core: barrel, open; n*=4, S*=8; meander; SH3-like topology
  4. 2049049Superfamily b.38.1: Sm-like ribonucleoproteins [50182] (7 families) (S)
  5. 2049553Family b.38.1.3: Mechanosensitive channel protein MscS (YggB), middle domain [82090] (1 protein)
  6. 2049554Protein Mechanosensitive channel protein MscS (YggB), middle domain [82091] (1 species)
    forms homoheptameric ring structure very similar to those of the archaeal and eukaryotic Sm proteins
  7. 2049555Species Escherichia coli [TaxId:562] [82092] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:

  1. Domain(s) for 2oau:
    1. 2049563Domain d2oaua1: 2oau A:113-179 [138978]
      Other proteins in same PDB: d2oaua2, d2oaua3, d2oaub2, d2oaub3, d2oauc2, d2oauc3, d2oaud2, d2oaud3, d2oaue2, d2oaue3, d2oauf2, d2oauf3, d2oaug2, d2oaug3
      automatically matched to d1mxma1
    2. 2049564Domain d2oaub1: 2oau B:113-179 [138981]
      Other proteins in same PDB: d2oaua2, d2oaua3, d2oaub2, d2oaub3, d2oauc2, d2oauc3, d2oaud2, d2oaud3, d2oaue2, d2oaue3, d2oauf2, d2oauf3, d2oaug2, d2oaug3
      automatically matched to d1mxma1
    3. 2049565Domain d2oauc1: 2oau C:113-179 [138984]
      Other proteins in same PDB: d2oaua2, d2oaua3, d2oaub2, d2oaub3, d2oauc2, d2oauc3, d2oaud2, d2oaud3, d2oaue2, d2oaue3, d2oauf2, d2oauf3, d2oaug2, d2oaug3
      automatically matched to d1mxma1
    4. 2049566Domain d2oaud1: 2oau D:113-179 [138987]
      Other proteins in same PDB: d2oaua2, d2oaua3, d2oaub2, d2oaub3, d2oauc2, d2oauc3, d2oaud2, d2oaud3, d2oaue2, d2oaue3, d2oauf2, d2oauf3, d2oaug2, d2oaug3
      automatically matched to d1mxma1
    5. 2049567Domain d2oaue1: 2oau E:113-179 [138990]
      Other proteins in same PDB: d2oaua2, d2oaua3, d2oaub2, d2oaub3, d2oauc2, d2oauc3, d2oaud2, d2oaud3, d2oaue2, d2oaue3, d2oauf2, d2oauf3, d2oaug2, d2oaug3
      automatically matched to d1mxma1
    6. 2049568Domain d2oauf1: 2oau F:113-179 [138993]
      Other proteins in same PDB: d2oaua2, d2oaua3, d2oaub2, d2oaub3, d2oauc2, d2oauc3, d2oaud2, d2oaud3, d2oaue2, d2oaue3, d2oauf2, d2oauf3, d2oaug2, d2oaug3
      automatically matched to d1mxma1
    7. 2049569Domain d2oaug1: 2oau G:113-179 [138996]
      Other proteins in same PDB: d2oaua2, d2oaua3, d2oaub2, d2oaub3, d2oauc2, d2oauc3, d2oaud2, d2oaud3, d2oaue2, d2oaue3, d2oauf2, d2oauf3, d2oaug2, d2oaug3
      automatically matched to d1mxma1
  2. Domain(s) for 2vv5:
    1. 2049556Domain d2vv5a1: 2vv5 A:113-179 [153613]
      Other proteins in same PDB: d2vv5a2, d2vv5a3, d2vv5b2, d2vv5b3, d2vv5c2, d2vv5c3, d2vv5d2, d2vv5d3, d2vv5e2, d2vv5e3, d2vv5f2, d2vv5f3, d2vv5g2, d2vv5g3
      automatically matched to d2oaua1
    2. 2049557Domain d2vv5b1: 2vv5 B:113-179 [153616]
      Other proteins in same PDB: d2vv5a2, d2vv5a3, d2vv5b2, d2vv5b3, d2vv5c2, d2vv5c3, d2vv5d2, d2vv5d3, d2vv5e2, d2vv5e3, d2vv5f2, d2vv5f3, d2vv5g2, d2vv5g3
      automatically matched to d2oaua1
    3. 2049558Domain d2vv5c1: 2vv5 C:113-179 [153619]
      Other proteins in same PDB: d2vv5a2, d2vv5a3, d2vv5b2, d2vv5b3, d2vv5c2, d2vv5c3, d2vv5d2, d2vv5d3, d2vv5e2, d2vv5e3, d2vv5f2, d2vv5f3, d2vv5g2, d2vv5g3
      automatically matched to d2oaua1
    4. 2049559Domain d2vv5d1: 2vv5 D:113-179 [153622]
      Other proteins in same PDB: d2vv5a2, d2vv5a3, d2vv5b2, d2vv5b3, d2vv5c2, d2vv5c3, d2vv5d2, d2vv5d3, d2vv5e2, d2vv5e3, d2vv5f2, d2vv5f3, d2vv5g2, d2vv5g3
      automatically matched to d2oaua1
    5. 2049560Domain d2vv5e1: 2vv5 E:113-179 [153625]
      Other proteins in same PDB: d2vv5a2, d2vv5a3, d2vv5b2, d2vv5b3, d2vv5c2, d2vv5c3, d2vv5d2, d2vv5d3, d2vv5e2, d2vv5e3, d2vv5f2, d2vv5f3, d2vv5g2, d2vv5g3
      automatically matched to d2oaua1
    6. 2049561Domain d2vv5f1: 2vv5 F:113-179 [153628]
      Other proteins in same PDB: d2vv5a2, d2vv5a3, d2vv5b2, d2vv5b3, d2vv5c2, d2vv5c3, d2vv5d2, d2vv5d3, d2vv5e2, d2vv5e3, d2vv5f2, d2vv5f3, d2vv5g2, d2vv5g3
      automatically matched to d2oaua1
    7. 2049562Domain d2vv5g1: 2vv5 G:113-179 [153631]
      Other proteins in same PDB: d2vv5a2, d2vv5a3, d2vv5b2, d2vv5b3, d2vv5c2, d2vv5c3, d2vv5d2, d2vv5d3, d2vv5e2, d2vv5e3, d2vv5f2, d2vv5f3, d2vv5g2, d2vv5g3
      automatically matched to d2oaua1

More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from b.38.1.3 Mechanosensitive channel protein MscS (YggB), middle domain

Timeline for Species Escherichia coli [TaxId:562] from b.38.1.3 Mechanosensitive channel protein MscS (YggB), middle domain: