Lineage for Protein: Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain

  1. Root: SCOPe 2.05
  2. 1955192Class f: Membrane and cell surface proteins and peptides [56835] (57 folds)
  3. 1957178Fold f.21: Heme-binding four-helical bundle [81344] (3 superfamilies)
    core: four transmembrane helices, up-and-down bundle, binds one or two heme groups in between the helices
  4. 1957179Superfamily f.21.1: Transmembrane di-heme cytochromes [81342] (2 families) (S)
    Three of the four heme-ligands are conserved between the two families; both heme groups bind similarly but not identically
  5. 1957185Family f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) [81642] (3 proteins)
    a part (domain) of a larger mitochondrial cytochrome b subunit, separate subunit in plants and cyanobacteria
  6. 1957196Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain [81641] (3 species)
    also includes extra transmembrane (linker) helix absent in plants and cyanobacteria subunits

Species:

  1. Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [81640] (5 PDB entries)
    1. Domain for 1ezv:
    2. Domain for 1kb9:
    3. Domains for 1kyo:
      1. 1957202Domain d1kyoc3: 1kyo C:1-261 [75905]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
        complexed with fes, hem, sma
      2. 1957203Domain d1kyon3: 1kyo N:1-261 [75907]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
        complexed with fes, hem, sma
    4. Domain for 1p84:
    5. Domain for 2ibz:
  2. 1957204Chicken (Gallus gallus) [TaxId:9031] [81639] (8 PDB entries)
    1. Domain for 1bcc:
    2. Domain for 2bcc:
    3. Domain for 3bcc:
    4. Domains for 3cwb:
      1. 1957215Domain d3cwbc2: 3cwb C:2-261 [157046]
        Other proteins in same PDB: d3cwbc1, d3cwbp1
        automatically matched to d1bccc3
        complexed with azi, bog, cdl, fes, hec, hem, icx, pee, unl, uq
      2. 1957216Domain d3cwbp2: 3cwb P:2-261 [157048]
        Other proteins in same PDB: d3cwbc1, d3cwbp1
        automatically matched to d1bccc3
        complexed with azi, bog, cdl, fes, hec, hem, icx, pee, unl, uq
    5. Domains for 3l70:
      1. 1957211Domain d3l70c1: 3l70 C:1-261 [199701]
        Other proteins in same PDB: d3l70a1, d3l70a2, d3l70b1, d3l70b2, d3l70c2, d3l70d1, d3l70d2, d3l70e1, d3l70e2, d3l70f_, d3l70g_, d3l70h_, d3l70j_, d3l70n1, d3l70o1, d3l70o2, d3l70p2, d3l70q1, d3l70q2, d3l70r1, d3l70r2, d3l70s_, d3l70t_, d3l70u_, d3l70w_
        automated match to d1bccc3
        complexed with bog, cdl, fes, gol, hec, hem, jzv, pee, uq
      2. 1957212Domain d3l70p1: 3l70 P:2-261 [199703]
        Other proteins in same PDB: d3l70a1, d3l70a2, d3l70b1, d3l70b2, d3l70c2, d3l70d1, d3l70d2, d3l70e1, d3l70e2, d3l70f_, d3l70g_, d3l70h_, d3l70j_, d3l70n1, d3l70o1, d3l70o2, d3l70p2, d3l70q1, d3l70q2, d3l70r1, d3l70r2, d3l70s_, d3l70t_, d3l70u_, d3l70w_
        automated match to d1bccc3
        complexed with bog, cdl, fes, gol, hec, hem, jzv, pee, uq
    6. Domains for 3l71:
      1. 1957209Domain d3l71c1: 3l71 C:1-261 [199705]
        Other proteins in same PDB: d3l71a1, d3l71a2, d3l71b1, d3l71b2, d3l71c2, d3l71d1, d3l71e1, d3l71e2, d3l71f_, d3l71g_, d3l71h_, d3l71j_, d3l71n1, d3l71n2, d3l71o1, d3l71o2, d3l71p2, d3l71q1, d3l71q2, d3l71r1, d3l71r2, d3l71s_, d3l71t_, d3l71u_, d3l71w_
        automated match to d1bccc3
        complexed with azo, bog, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, uq
      2. 1957210Domain d3l71p1: 3l71 P:2-261 [199707]
        Other proteins in same PDB: d3l71a1, d3l71a2, d3l71b1, d3l71b2, d3l71c2, d3l71d1, d3l71e1, d3l71e2, d3l71f_, d3l71g_, d3l71h_, d3l71j_, d3l71n1, d3l71n2, d3l71o1, d3l71o2, d3l71p2, d3l71q1, d3l71q2, d3l71r1, d3l71r2, d3l71s_, d3l71t_, d3l71u_, d3l71w_
        automated match to d1bccc3
        complexed with azo, bog, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, uq
    7. Domains for 3l74:
      1. 1957207Domain d3l74c1: 3l74 C:1-261 [199709]
        Other proteins in same PDB: d3l74a1, d3l74a2, d3l74b1, d3l74b2, d3l74c2, d3l74d1, d3l74d2, d3l74e1, d3l74e2, d3l74f_, d3l74g_, d3l74h_, d3l74j_, d3l74n1, d3l74n2, d3l74o1, d3l74o2, d3l74p2, d3l74q1, d3l74q2, d3l74r1, d3l74r2, d3l74s_, d3l74t_, d3l74u_, d3l74w_
        automated match to d1bccc3
        complexed with azi, bog, cdl, fes, fmx, hec, hem, pee, unl, uq
      2. 1957208Domain d3l74p1: 3l74 P:2-261 [199711]
        Other proteins in same PDB: d3l74a1, d3l74a2, d3l74b1, d3l74b2, d3l74c2, d3l74d1, d3l74d2, d3l74e1, d3l74e2, d3l74f_, d3l74g_, d3l74h_, d3l74j_, d3l74n1, d3l74n2, d3l74o1, d3l74o2, d3l74p2, d3l74q1, d3l74q2, d3l74r1, d3l74r2, d3l74s_, d3l74t_, d3l74u_, d3l74w_
        automated match to d1bccc3
        complexed with azi, bog, cdl, fes, fmx, hec, hem, pee, unl, uq
    8. Domains for 3l75:
      1. 1957205Domain d3l75c1: 3l75 C:1-261 [199713]
        Other proteins in same PDB: d3l75a1, d3l75a2, d3l75b1, d3l75b2, d3l75c2, d3l75d1, d3l75d2, d3l75e1, d3l75e2, d3l75f_, d3l75g_, d3l75h_, d3l75j_, d3l75n1, d3l75n2, d3l75o1, d3l75o2, d3l75p2, d3l75q1, d3l75q2, d3l75r1, d3l75r2, d3l75s_, d3l75t_, d3l75u_, d3l75w_
        automated match to d1bccc3
        complexed with azi, bog, cdl, fes, fnm, hec, hem, pee, unl, uq
      2. 1957206Domain d3l75p1: 3l75 P:2-261 [199715]
        Other proteins in same PDB: d3l75a1, d3l75a2, d3l75b1, d3l75b2, d3l75c2, d3l75d1, d3l75d2, d3l75e1, d3l75e2, d3l75f_, d3l75g_, d3l75h_, d3l75j_, d3l75n1, d3l75n2, d3l75o1, d3l75o2, d3l75p2, d3l75q1, d3l75q2, d3l75r1, d3l75r2, d3l75s_, d3l75t_, d3l75u_, d3l75w_
        automated match to d1bccc3
        complexed with azi, bog, cdl, fes, fnm, hec, hem, pee, unl, uq
  3. 1957218Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [81638] (17 PDB entries)
    Uniprot P00157
    1. Domain for 1be3:
    2. Domains for 1bgy:
      1. 1957237Domain d1bgyc3: 1bgy C:1-260 [75808]
        Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
        complexed with fes, hec, hem
      2. 1957238Domain d1bgyo3: 1bgy O:1-260 [75810]
        Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
        complexed with fes, hec, hem
    3. Domain for 1l0l:
    4. Domain for 1l0n:
    5. Domain for 1ntk:
    6. Domain for 1ntm:
    7. Domain for 1ntz:
    8. Domain for 1nu1:
    9. Domains for 1pp9:
      1. 1957224Domain d1pp9c2: 1pp9 C:15-260 [104227]
        Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
        complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, uq
      2. 1957225Domain d1pp9p2: 1pp9 P:15-260 [104242]
        Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
        complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, uq
    10. Domains for 1ppj:
      1. 1957221Domain d1ppjc2: 1ppj C:15-260 [104257]
        Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
        complexed with any, azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma
      2. 1957222Domain d1ppjp2: 1ppj P:15-260 [104272]
        Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
        complexed with any, azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma
    11. Domain for 1qcr:
    12. Domain for 1sqb:
    13. Domain for 1sqp:
    14. Domain for 1sqv:
    15. Domain for 1sqx:
    16. Domains for 2a06:
      1. 1957219Domain d2a06c1: 2a06 C:15-260 [197713]
        Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06b1, d2a06b2, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06o1, d2a06o2, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
        automated match to d1ppjc2
        complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq
      2. 1957220Domain d2a06p1: 2a06 P:10-260 [197718]
        Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06b1, d2a06b2, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06o1, d2a06o2, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
        automated match to d1ntmc2
        complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq
    17. Domain for 2fyu:

More info for Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase)

Timeline for Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase):

  • Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) first appeared in SCOP 1.63
  • Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) appears in SCOPe 2.04
  • Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) appears in SCOPe 2.06
  • Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain from f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) appears in the current release, SCOPe 2.07