SCOPe 2.05: Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]

Lineage for Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]

Root: SCOPe 2.05
Class f: Membrane and cell surface proteins and peptides [56835] (57 folds)
Fold f.21: Heme-binding four-helical bundle [81344] (3 superfamilies)
core: four transmembrane helices, up-and-down bundle, binds one or two heme groups in between the helices
Superfamily f.21.1: Transmembrane di-heme cytochromes [81342] (2 families)
Three of the four heme-ligands are conserved between the two families; both heme groups bind similarly but not identically

Family f.21.1.2: Cytochrome b of cytochrome bc1 complex (Ubiquinol-cytochrome c reductase) [81642] (3 proteins)
a part (domain) of a larger mitochondrial cytochrome b subunit, separate subunit in plants and cyanobacteria

Protein Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain [81641] (3 species)
also includes extra transmembrane (linker) helix absent in plants and cyanobacteria subunits
Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [81638] (17 PDB entries)
Uniprot P00157

PDB entries in Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]:

Domain(s) for 1be3:

Domain d1be3c3: 1be3 C:1-260 [75806]
Other proteins in same PDB: d1be3a1, d1be3a2, d1be3b1, d1be3b2, d1be3c2, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3i_, d1be3j_, d1be3k_
complexed with fes, hec, hem

Domain(s) for 1bgy:

Domain d1bgyc3: 1bgy C:1-260 [75808]
Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
complexed with fes, hec, hem

Domain d1bgyo3: 1bgy O:1-260 [75810]
Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
complexed with fes, hec, hem

Domain(s) for 1l0l:

Domain d1l0lc2: 1l0l C:3-260 [84487]
Other proteins in same PDB: d1l0la1, d1l0la2, d1l0lb1, d1l0lb2, d1l0lc1, d1l0ld1, d1l0ld2, d1l0le1, d1l0le2, d1l0lf_, d1l0lg_, d1l0lh_, d1l0li_, d1l0lj_, d1l0lk_
complexed with fes, fmx, hem

Domain(s) for 1l0n:

Domain d1l0nc2: 1l0n C:3-260 [84503]
Other proteins in same PDB: d1l0na1, d1l0na2, d1l0nb1, d1l0nb2, d1l0nc1, d1l0nd1, d1l0nd2, d1l0ne1, d1l0ne2, d1l0nf_, d1l0ng_, d1l0nh_, d1l0ni_, d1l0nj_, d1l0nk_
complexed with fes, hem

Domain(s) for 1ntk:

Domain d1ntkc2: 1ntk C:2-260 [92110]
Other proteins in same PDB: d1ntka1, d1ntka2, d1ntkb1, d1ntkb2, d1ntkc1, d1ntkd1, d1ntkd2, d1ntke1, d1ntke2, d1ntkf_, d1ntkg_, d1ntkh_, d1ntki_, d1ntkj_, d1ntkk_
complexed with ay1, fes, hem

Domain(s) for 1ntm:

Domain d1ntmc2: 1ntm C:2-260 [92126]
Other proteins in same PDB: d1ntma1, d1ntma2, d1ntmb1, d1ntmb2, d1ntmc1, d1ntmd1, d1ntmd2, d1ntme1, d1ntme2, d1ntmf_, d1ntmg_, d1ntmh_, d1ntmi_, d1ntmj_, d1ntmk_
complexed with fes, hem

Domain(s) for 1ntz:

Domain d1ntzc2: 1ntz C:2-260 [92154]
Other proteins in same PDB: d1ntza1, d1ntza2, d1ntzb1, d1ntzb2, d1ntzc1, d1ntzd1, d1ntzd2, d1ntze1, d1ntze2, d1ntzf_, d1ntzg_, d1ntzh_, d1ntzi_, d1ntzj_, d1ntzk_
complexed with fes, hem, uq2

Domain(s) for 1nu1:

Domain d1nu1c2: 1nu1 C:2-260 [92172]
Other proteins in same PDB: d1nu1a1, d1nu1a2, d1nu1b1, d1nu1b2, d1nu1c1, d1nu1d1, d1nu1d2, d1nu1e1, d1nu1e2, d1nu1f_, d1nu1g_, d1nu1h_, d1nu1i_, d1nu1j_, d1nu1k_
complexed with fes, hem, qno

Domain(s) for 1pp9:

Domain d1pp9c2: 1pp9 C:15-260 [104227]
Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, uq

Domain d1pp9p2: 1pp9 P:15-260 [104242]
Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, uq

Domain(s) for 1ppj:

Domain d1ppjc2: 1ppj C:15-260 [104257]
Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
complexed with any, azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma

Domain d1ppjp2: 1ppj P:15-260 [104272]
Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
complexed with any, azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma

Domain(s) for 1qcr:

Domain d1qcrc3: 1qcr C:2-260 [75932]
Other proteins in same PDB: d1qcra1, d1qcra2, d1qcrb1, d1qcrb2, d1qcrc2, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
complexed with hem

Domain(s) for 1sqb:

Domain d1sqbc2: 1sqb C:2-260 [105895]
Other proteins in same PDB: d1sqba1, d1sqba2, d1sqbb1, d1sqbb2, d1sqbc1, d1sqbd1, d1sqbd2, d1sqbe1, d1sqbe2, d1sqbf_, d1sqbg_, d1sqbh_, d1sqbi_, d1sqbj_, d1sqbk_
complexed with azo, fes, hem

Domain(s) for 1sqp:

Domain d1sqpc2: 1sqp C:2-260 [119000]
Other proteins in same PDB: d1sqpa1, d1sqpa2, d1sqpb1, d1sqpb2, d1sqpc1, d1sqpd1, d1sqpd2, d1sqpe1, d1sqpe2, d1sqpf1, d1sqpg_, d1sqph_, d1sqpi_, d1sqpj_, d1sqpk1
automated match to d1ntmc2
complexed with cdl, fes, hem, myx, pee, plx

Domain(s) for 1sqv:

Domain d1sqvc2: 1sqv C:2-260 [119025]
Other proteins in same PDB: d1sqva1, d1sqva2, d1sqvb1, d1sqvb2, d1sqvc1, d1sqvd1, d1sqvd2, d1sqve1, d1sqve2, d1sqvf_, d1sqvg_, d1sqvh_, d1sqvi_, d1sqvj_, d1sqvk_
automated match to d1ntmc2
complexed with fes, hem, uhd, uq2

Domain(s) for 1sqx:

Domain d1sqxc2: 1sqx C:2-260 [119040]
Other proteins in same PDB: d1sqxa1, d1sqxa2, d1sqxb1, d1sqxb2, d1sqxc1, d1sqxd1, d1sqxd2, d1sqxe1, d1sqxe2, d1sqxf_, d1sqxg_, d1sqxh_, d1sqxi_, d1sqxj_, d1sqxk_
automated match to d1ntmc2
complexed with fes, hem, sma, uq2

Domain(s) for 2a06:

Domain d2a06c1: 2a06 C:15-260 [197713]
Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06b1, d2a06b2, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06o1, d2a06o2, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
automated match to d1ppjc2
complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq

Domain d2a06p1: 2a06 P:10-260 [197718]
Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06b1, d2a06b2, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06o1, d2a06o2, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
automated match to d1ntmc2
complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq

Domain(s) for 2fyu:

Domain d2fyuc2: 2fyu C:2-260 [134397]
Other proteins in same PDB: d2fyua1, d2fyua2, d2fyub1, d2fyub2, d2fyuc1, d2fyud1, d2fyud2, d2fyue1, d2fyue2, d2fyuf_, d2fyug_, d2fyuh_, d2fyui_, d2fyuj_, d2fyuk_
automated match to d1ntmc2
complexed with fdn, fes, hem

More info for Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from f.21.1.2 Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain

Timeline for Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from f.21.1.2 Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain:

Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from f.21.1.2 Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain first appeared in SCOP 1.63
Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from f.21.1.2 Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain appears in SCOPe 2.04
Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from f.21.1.2 Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain appears in SCOPe 2.06
Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from f.21.1.2 Mitochondrial cytochrome b subunit, N-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08