Lineage for Protein: Nitrogenase iron-molybdenum protein, alpha chain

  1. Root: SCOP 1.65
  2. 305035Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (121 folds)
  3. 321573Fold c.92: Chelatase-like [53799] (2 superfamilies)
    duplication: tandem repeat of two domains; 3 layers (a/b/a); parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
  4. 321596Superfamily c.92.2: "Helical backbone" metal receptor [53807] (3 families) (S)
    contains a long alpha helical insertion in the interdomain linker
  5. 321621Family c.92.2.3: Nitrogenase iron-molybdenum protein [53816] (2 proteins)
    contains three domains of this fold; "Helical backbone" holds domains 2 and 3
    both chains are homologous; the interchain arrangment of domains 1 is similar to the intrachain arrangement of domains 2 and 3
  6. 321622Protein Nitrogenase iron-molybdenum protein, alpha chain [81402] (3 species)

Species:

  1. 321623Azotobacter vinelandii [TaxId:354] [81398] (10 PDB entries)
    1. Domains for 1fp4:
      1. 321638Domain d1fp4a_: 1fp4 A: [76187]
        Other proteins in same PDB: d1fp4b_, d1fp4d_
      2. 321639Domain d1fp4c_: 1fp4 C: [76189]
        Other proteins in same PDB: d1fp4b_, d1fp4d_
        complexed with ca, cfm, clp, hca; mutant
    2. Domains for 1g20:
      1. 321632Domain d1g20a_: 1g20 A: [35613]
        Other proteins in same PDB: d1g20b_, d1g20d_, d1g20e_, d1g20f_, d1g20g_, d1g20h_
      2. 321633Domain d1g20c_: 1g20 C: [35615]
        Other proteins in same PDB: d1g20b_, d1g20d_, d1g20e_, d1g20f_, d1g20g_, d1g20h_
        complexed with ca, cfm, clf, fs4, hca
    3. Domains for 1g21:
      1. 321643Domain d1g21a_: 1g21 A: [35621]
        Other proteins in same PDB: d1g21b_, d1g21d_, d1g21e_, d1g21f_, d1g21g_, d1g21h_
      2. 321644Domain d1g21c_: 1g21 C: [35623]
        Other proteins in same PDB: d1g21b_, d1g21d_, d1g21e_, d1g21f_, d1g21g_, d1g21h_
        complexed with atp, ca, cfm, clf, fs4, hca, mg
    4. Domain for 1l5h:
      • 321640Domain d1l5ha_: 1l5h A: [73590]
        Other proteins in same PDB: d1l5hb_
        FeMo-cofactor deficient
        complexed with ca, clf
    5. Domains for 1m1n:
      1. 321624Domain d1m1na_: 1m1n A: [78417]
        Other proteins in same PDB: d1m1nb_, d1m1nd_, d1m1nf_, d1m1nh_
      2. 321625Domain d1m1nc_: 1m1n C: [78419]
        Other proteins in same PDB: d1m1nb_, d1m1nd_, d1m1nf_, d1m1nh_
      3. 321626Domain d1m1ne_: 1m1n E: [78421]
        Other proteins in same PDB: d1m1nb_, d1m1nd_, d1m1nf_, d1m1nh_
      4. 321627Domain d1m1ng_: 1m1n G: [78423]
        Other proteins in same PDB: d1m1nb_, d1m1nd_, d1m1nf_, d1m1nh_
        complexed with ca, cfn, clf, hca
    6. Domains for 1m1y:
      1. 321645Domain d1m1ya_: 1m1y A: [78441]
        Other proteins in same PDB: d1m1yb_, d1m1yd_, d1m1ye_, d1m1yf_, d1m1yg_, d1m1yh_, d1m1yj_, d1m1yl_, d1m1ym_, d1m1yn_, d1m1yo_, d1m1yp_
      2. 321646Domain d1m1yc_: 1m1y C: [78443]
        Other proteins in same PDB: d1m1yb_, d1m1yd_, d1m1ye_, d1m1yf_, d1m1yg_, d1m1yh_, d1m1yj_, d1m1yl_, d1m1ym_, d1m1yn_, d1m1yo_, d1m1yp_
      3. 321647Domain d1m1yi_: 1m1y I: [78449]
        Other proteins in same PDB: d1m1yb_, d1m1yd_, d1m1ye_, d1m1yf_, d1m1yg_, d1m1yh_, d1m1yj_, d1m1yl_, d1m1ym_, d1m1yn_, d1m1yo_, d1m1yp_
      4. 321648Domain d1m1yk_: 1m1y K: [78451]
        Other proteins in same PDB: d1m1yb_, d1m1yd_, d1m1ye_, d1m1yf_, d1m1yg_, d1m1yh_, d1m1yj_, d1m1yl_, d1m1ym_, d1m1yn_, d1m1yo_, d1m1yp_
        chemically crosslinked structure
        complexed with ca, cfm, clf, fs4, hca
    7. Domains for 1m34:
      1. 321634Domain d1m34a_: 1m34 A: [78515]
        Other proteins in same PDB: d1m34b_, d1m34d_, d1m34e_, d1m34f_, d1m34g_, d1m34h_, d1m34j_, d1m34l_, d1m34m_, d1m34n_, d1m34o_, d1m34p_
      2. 321635Domain d1m34c_: 1m34 C: [78517]
        Other proteins in same PDB: d1m34b_, d1m34d_, d1m34e_, d1m34f_, d1m34g_, d1m34h_, d1m34j_, d1m34l_, d1m34m_, d1m34n_, d1m34o_, d1m34p_
      3. 321636Domain d1m34i_: 1m34 I: [78523]
        Other proteins in same PDB: d1m34b_, d1m34d_, d1m34e_, d1m34f_, d1m34g_, d1m34h_, d1m34j_, d1m34l_, d1m34m_, d1m34n_, d1m34o_, d1m34p_
      4. 321637Domain d1m34k_: 1m34 K: [78525]
        Other proteins in same PDB: d1m34b_, d1m34d_, d1m34e_, d1m34f_, d1m34g_, d1m34h_, d1m34j_, d1m34l_, d1m34m_, d1m34n_, d1m34o_, d1m34p_
        complexed with adp, alf, ca, cfm, clf, fs4, hca, mg
    8. Domains for 1n2c:
      1. 321641Domain d1n2ca_: 1n2c A: [35617]
        Other proteins in same PDB: d1n2cb_, d1n2cd_, d1n2ce_, d1n2cf_, d1n2cg_, d1n2ch_
      2. 321642Domain d1n2cc_: 1n2c C: [35619]
        Other proteins in same PDB: d1n2cb_, d1n2cd_, d1n2ce_, d1n2cf_, d1n2cg_, d1n2ch_
        complexed with adp, alf, ca, cfm, clf, fs4, hca, mg
    9. Domains for 2min:
      1. 321628Domain d2mina_: 2min A: [35609]
        Other proteins in same PDB: d2minb_, d2mind_
      2. 321629Domain d2minc_: 2min C: [35611]
        Other proteins in same PDB: d2minb_, d2mind_
        complexed with ca, cfm, clf, hca
    10. Domains for 3min:
      1. 321630Domain d3mina_: 3min A: [35605]
        Other proteins in same PDB: d3minb_, d3mind_
      2. 321631Domain d3minc_: 3min C: [35607]
        Other proteins in same PDB: d3minb_, d3mind_
        complexed with ca, cfm, clf, hca
  2. 321649Clostridium pasteurianum [TaxId:1501] [81396] (1 PDB entry)
  3. 321652Klebsiella pneumoniae [TaxId:573] [81400] (4 PDB entries)
    1. Domains for 1h1l:
      1. 321659Domain d1h1la_: 1h1l A: [70851]
        Other proteins in same PDB: d1h1lb_, d1h1ld_
      2. 321660Domain d1h1lc_: 1h1l C: [70853]
        Other proteins in same PDB: d1h1lb_, d1h1ld_
        complexed with cfm, cit, cl, clf, mg; mutant
    2. Domains for 1qgu:
      1. 321653Domain d1qgua_: 1qgu A: [35625]
        Other proteins in same PDB: d1qgub_, d1qgud_
      2. 321654Domain d1qguc_: 1qgu C: [35627]
        Other proteins in same PDB: d1qgub_, d1qgud_
    3. Domains for 1qh1:
      1. 321655Domain d1qh1a_: 1qh1 A: [35629]
        Other proteins in same PDB: d1qh1b_, d1qh1d_
      2. 321656Domain d1qh1c_: 1qh1 C: [35631]
        Other proteins in same PDB: d1qh1b_, d1qh1d_
    4. Domains for 1qh8:
      1. 321657Domain d1qh8a_: 1qh8 A: [35633]
        Other proteins in same PDB: d1qh8b_, d1qh8d_
      2. 321658Domain d1qh8c_: 1qh8 C: [35635]
        Other proteins in same PDB: d1qh8b_, d1qh8d_

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