Lineage for Species: Azotobacter vinelandii

  1. Root: SCOP 1.67
  2. 383641Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (130 folds)
  3. 403170Fold c.92: Chelatase-like [53799] (2 superfamilies)
    duplication: tandem repeat of two domains; 3 layers (a/b/a); parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
  4. 403193Superfamily c.92.2: "Helical backbone" metal receptor [53807] (3 families) (S)
    contains a long alpha helical insertion in the interdomain linker
  5. 403222Family c.92.2.3: Nitrogenase iron-molybdenum protein [53816] (2 proteins)
    contains three domains of this fold; "Helical backbone" holds domains 2 and 3
    both chains are homologous; the inter-chain arrangement of domains 1 is similar to the intra-chain arrangement of domains 2 and 3
  6. 403262Protein Nitrogenase iron-molybdenum protein, beta chain [81401] (3 species)
    both chains are homologous; the inter-chain arrangement of domains 1 is similar to the intra-chain arrangement of domains 2 and 3
  7. 403263Species Azotobacter vinelandii [TaxId:354] [81397] (10 PDB entries)

PDB entries in Species: Azotobacter vinelandii:

  1. Domain(s) for 1fp4:
    1. 403272Domain d1fp4b_: 1fp4 B: [76188]
      Other proteins in same PDB: d1fp4a_, d1fp4c_
    2. 403273Domain d1fp4d_: 1fp4 D: [76190]
      Other proteins in same PDB: d1fp4a_, d1fp4c_
      complexed with ca, cfm, clp, hca; mutant
  2. Domain(s) for 1g20:
    1. 403275Domain d1g20b_: 1g20 B: [35614]
      Other proteins in same PDB: d1g20a_, d1g20c_, d1g20e_, d1g20f_, d1g20g_, d1g20h_
    2. 403276Domain d1g20d_: 1g20 D: [35616]
      Other proteins in same PDB: d1g20a_, d1g20c_, d1g20e_, d1g20f_, d1g20g_, d1g20h_
      complexed with ca, cfm, clf, fs4, hca
  3. Domain(s) for 1g21:
    1. 403283Domain d1g21b_: 1g21 B: [35622]
      Other proteins in same PDB: d1g21a_, d1g21c_, d1g21e_, d1g21f_, d1g21g_, d1g21h_
    2. 403284Domain d1g21d_: 1g21 D: [35624]
      Other proteins in same PDB: d1g21a_, d1g21c_, d1g21e_, d1g21f_, d1g21g_, d1g21h_
      complexed with atp, ca, cfm, clf, fs4, hca, mg
  4. Domain(s) for 1l5h:
    • 403274Domain d1l5hb_: 1l5h B: [73591]
      Other proteins in same PDB: d1l5ha_
      FeMo-cofactor deficient
      complexed with ca, clf
  5. Domain(s) for 1m1n:
    1. 403264Domain d1m1nb_: 1m1n B: [78418]
      Other proteins in same PDB: d1m1na_, d1m1nc_, d1m1ne_, d1m1ng_
    2. 403265Domain d1m1nd_: 1m1n D: [78420]
      Other proteins in same PDB: d1m1na_, d1m1nc_, d1m1ne_, d1m1ng_
    3. 403266Domain d1m1nf_: 1m1n F: [78422]
      Other proteins in same PDB: d1m1na_, d1m1nc_, d1m1ne_, d1m1ng_
    4. 403267Domain d1m1nh_: 1m1n H: [78424]
      Other proteins in same PDB: d1m1na_, d1m1nc_, d1m1ne_, d1m1ng_
      complexed with ca, cfn, clf, hca
  6. Domain(s) for 1m1y:
    1. 403285Domain d1m1yb_: 1m1y B: [78442]
      Other proteins in same PDB: d1m1ya_, d1m1yc_, d1m1ye_, d1m1yf_, d1m1yg_, d1m1yh_, d1m1yi_, d1m1yk_, d1m1ym_, d1m1yn_, d1m1yo_, d1m1yp_
    2. 403286Domain d1m1yd_: 1m1y D: [78444]
      Other proteins in same PDB: d1m1ya_, d1m1yc_, d1m1ye_, d1m1yf_, d1m1yg_, d1m1yh_, d1m1yi_, d1m1yk_, d1m1ym_, d1m1yn_, d1m1yo_, d1m1yp_
    3. 403287Domain d1m1yj_: 1m1y J: [78450]
      Other proteins in same PDB: d1m1ya_, d1m1yc_, d1m1ye_, d1m1yf_, d1m1yg_, d1m1yh_, d1m1yi_, d1m1yk_, d1m1ym_, d1m1yn_, d1m1yo_, d1m1yp_
    4. 403288Domain d1m1yl_: 1m1y L: [78452]
      Other proteins in same PDB: d1m1ya_, d1m1yc_, d1m1ye_, d1m1yf_, d1m1yg_, d1m1yh_, d1m1yi_, d1m1yk_, d1m1ym_, d1m1yn_, d1m1yo_, d1m1yp_
      chemically crosslinked structure
      complexed with ca, cfm, clf, fs4, hca
  7. Domain(s) for 1m34:
    1. 403279Domain d1m34b_: 1m34 B: [78516]
      Other proteins in same PDB: d1m34a_, d1m34c_, d1m34e_, d1m34f_, d1m34g_, d1m34h_, d1m34i_, d1m34k_, d1m34m_, d1m34n_, d1m34o_, d1m34p_
    2. 403280Domain d1m34d_: 1m34 D: [78518]
      Other proteins in same PDB: d1m34a_, d1m34c_, d1m34e_, d1m34f_, d1m34g_, d1m34h_, d1m34i_, d1m34k_, d1m34m_, d1m34n_, d1m34o_, d1m34p_
    3. 403281Domain d1m34j_: 1m34 J: [78524]
      Other proteins in same PDB: d1m34a_, d1m34c_, d1m34e_, d1m34f_, d1m34g_, d1m34h_, d1m34i_, d1m34k_, d1m34m_, d1m34n_, d1m34o_, d1m34p_
    4. 403282Domain d1m34l_: 1m34 L: [78526]
      Other proteins in same PDB: d1m34a_, d1m34c_, d1m34e_, d1m34f_, d1m34g_, d1m34h_, d1m34i_, d1m34k_, d1m34m_, d1m34n_, d1m34o_, d1m34p_
      complexed with adp, alf, ca, cfm, clf, fs4, hca, mg
  8. Domain(s) for 1n2c:
    1. 403277Domain d1n2cb_: 1n2c B: [35618]
      Other proteins in same PDB: d1n2ca_, d1n2cc_, d1n2ce_, d1n2cf_, d1n2cg_, d1n2ch_
    2. 403278Domain d1n2cd_: 1n2c D: [35620]
      Other proteins in same PDB: d1n2ca_, d1n2cc_, d1n2ce_, d1n2cf_, d1n2cg_, d1n2ch_
      complexed with adp, alf, ca, cfm, clf, fs4, hca, mg
  9. Domain(s) for 2min:
    1. 403268Domain d2minb_: 2min B: [35610]
      Other proteins in same PDB: d2mina_, d2minc_
    2. 403269Domain d2mind_: 2min D: [35612]
      Other proteins in same PDB: d2mina_, d2minc_
      complexed with ca, cfm, clf, hca
  10. Domain(s) for 3min:
    1. 403270Domain d3minb_: 3min B: [35606]
      Other proteins in same PDB: d3mina_, d3minc_
    2. 403271Domain d3mind_: 3min D: [35608]
      Other proteins in same PDB: d3mina_, d3minc_
      complexed with ca, cfm, clf, hca

More info for Species Azotobacter vinelandii [TaxId:354] from c.92.2.3 Nitrogenase iron-molybdenum protein, beta chain

Timeline for Species Azotobacter vinelandii [TaxId:354] from c.92.2.3 Nitrogenase iron-molybdenum protein, beta chain: