SCOPe 2.08: Species: Escherichia coli, PepA [TaxId: 562]

Lineage for Species: Escherichia coli, PepA [TaxId: 562]

Root: SCOPe 2.08
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
Fold c.56: Phosphorylase/hydrolase-like [53162] (8 superfamilies)
core: 3 layers, a/b/a ; mixed sheet of 5 strands: order 21354; strand 4 is antiparallel to the rest; contains crossover loops
Superfamily c.56.5: Zn-dependent exopeptidases [53187] (10 families)
core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 12435867; strands 2, 6 & 7 are antiparallel to the rest
Family c.56.5.3: Leucine aminopeptidase, C-terminal domain [53201] (2 proteins)
automatically mapped to Pfam PF00883
Protein Leucine aminopeptidase, C-terminal domain [53202] (2 species)
Species Escherichia coli, PepA [TaxId:562] [75249] (1 PDB entry)

PDB entry in Species: Escherichia coli, PepA [TaxId: 562]:

Domain(s) for 1gyt:
1. Domain d1gyta2: 1gyt A:179-503 [70766]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
2. Domain d1gytb2: 1gyt B:179-503 [70768]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
3. Domain d1gytc2: 1gyt C:179-503 [70770]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
4. Domain d1gytd2: 1gyt D:179-503 [70772]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
5. Domain d1gyte2: 1gyt E:179-503 [70774]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
6. Domain d1gytf2: 1gyt F:179-503 [70776]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
7. Domain d1gytg2: 1gyt G:179-503 [70778]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
8. Domain d1gyth2: 1gyt H:179-503 [70780]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
9. Domain d1gyti2: 1gyt I:179-503 [70782]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
10. Domain d1gytj2: 1gyt J:179-503 [70784]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
11. Domain d1gytk2: 1gyt K:179-503 [70786]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn
12. Domain d1gytl2: 1gyt L:179-503 [70788]
  Other proteins in same PDB: d1gyta1, d1gytb1, d1gytc1, d1gytd1, d1gyte1, d1gytf1, d1gytg1, d1gyth1, d1gyti1, d1gytj1, d1gytk1, d1gytl1
  complexed with cl, co3, zn

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Timeline for Species Escherichia coli, PepA [TaxId:562] from c.56.5.3 Leucine aminopeptidase, C-terminal domain:

Species Escherichia coli, PepA [TaxId:562] from c.56.5.3 Leucine aminopeptidase, C-terminal domain first appeared in SCOP 1.61
Species Escherichia coli, PepA [TaxId:562] from c.56.5.3 Leucine aminopeptidase, C-terminal domain appears in SCOPe 2.07