SCOPe 2.07: Protein: Decameric fructose-6-phosphate aldolase/transaldolase

Lineage for Protein: Decameric fructose-6-phosphate aldolase/transaldolase

Root: SCOPe 2.07
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)

Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites

Superfamily c.1.10: Aldolase [51569] (9 families)
Common fold covers whole protein structure

Family c.1.10.1: Class I aldolase [51570] (13 proteins)
the catalytic lysine forms schiff-base intermediate with substrate
possible link between the aldolase superfamily and the phosphate-binding beta/alpha barrels

Protein Decameric fructose-6-phosphate aldolase/transaldolase [75085] (3 species)
forms helix-swapped pentamers

Species:

Escherichia coli [TaxId:562] [75086] (1 PDB entry)
- Domains for 1l6w:
  1. Domain d1l6wa_: 1l6w A: [73632]
    complexed with gol
  2. Domain d1l6wb_: 1l6w B: [73633]
    complexed with gol
  3. Domain d1l6wc_: 1l6w C: [73634]
    complexed with gol
  4. Domain d1l6wd_: 1l6w D: [73635]
    complexed with gol
  5. Domain d1l6we_: 1l6w E: [73636]
    complexed with gol
  6. Domain d1l6wf_: 1l6w F: [73637]
    complexed with gol
  7. Domain d1l6wg_: 1l6w G: [73638]
    complexed with gol
  8. Domain d1l6wh_: 1l6w H: [73639]
    complexed with gol
  9. Domain d1l6wi_: 1l6w I: [73640]
    complexed with gol
  10. Domain d1l6wj_: 1l6w J: [73641]
    complexed with gol

Thermotoga maritima [TaxId:2336] [117379] (1 PDB entry)
Uniprot Q9WYD1

Domains for 1vpx:

Domain d1vpxa1: 1vpx A:1-216 [113977]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxb1: 1vpx B:1-207 [113978]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxc1: 1vpx C:1-207 [113979]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxd1: 1vpx D:1-208 [113980]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxe1: 1vpx E:1-215 [113981]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxf1: 1vpx F:1-216 [113982]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxg1: 1vpx G:1-214 [113983]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxh1: 1vpx H:1-208 [113984]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxi1: 1vpx I:1-214 [113985]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxj1: 1vpx J:1-211 [113986]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxk1: 1vpx K:1-215 [113987]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxl1: 1vpx L:1-208 [113988]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxm1: 1vpx M:1-204 [113989]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxn1: 1vpx N:1-206 [113990]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxo1: 1vpx O:1-208 [113991]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxp1: 1vpx P:1-207 [113992]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxq1: 1vpx Q:1-214 [113993]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxr1: 1vpx R:1-215 [113994]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxs1: 1vpx S:1-204 [113995]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Domain d1vpxt1: 1vpx T:1-215 [113996]
Other proteins in same PDB: d1vpxa2, d1vpxb2, d1vpxc2, d1vpxd2, d1vpxe2, d1vpxf2, d1vpxg2, d1vpxh2, d1vpxi2, d1vpxj2, d1vpxk2, d1vpxl2, d1vpxm2, d1vpxn2, d1vpxo2, d1vpxp2, d1vpxq2, d1vpxr2, d1vpxs2, d1vpxt2
Structural genomics target
complexed with gol, so4

Thermus thermophilus [TaxId:274] [141836] (1 PDB entry)
Uniprot Q5SJE8 1-211
clear orthologue of the E.coli protein; annotated as transaldolase in UniProt
- Domain for 1wx0:
  - Domain d1wx0a1: 1wx0 A:1-211 [121382]
    Other proteins in same PDB: d1wx0b_, d1wx0c_, d1wx0d_, d1wx0e_, d1wx0f_, d1wx0g_, d1wx0h_, d1wx0i_, d1wx0j_

More info for Protein Decameric fructose-6-phosphate aldolase/transaldolase from c.1.10.1: Class I aldolase

Timeline for Protein Decameric fructose-6-phosphate aldolase/transaldolase from c.1.10.1: Class I aldolase:

Protein Decameric fructose-6-phosphate aldolase/transaldolase from c.1.10.1: Class I aldolase first appeared in SCOP 1.61, called Protein Fructose-6-phosphate aldolase from c.1.10.1: Class I aldolase
Protein Decameric fructose-6-phosphate aldolase/transaldolase from c.1.10.1: Class I aldolase appears in SCOPe 2.06
Protein Decameric fructose-6-phosphate aldolase/transaldolase from c.1.10.1: Class I aldolase appears in the current release, SCOPe 2.08