Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2021373Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2056344Fold b.36: PDZ domain-like [50155] (1 superfamily)
    contains barrel, partly opened; n*=4, S*=8; meander; capped by alpha-helix
  4. 2056345Superfamily b.36.1: PDZ domain-like [50156] (7 families) (S)
    peptide-binding domain
  5. 2056808Family b.36.1.4: HtrA-like serine proteases [74933] (4 proteins)
  6. 2056812Protein Protease Do (DegP, HtrA), C-terminal domains [74934] (1 species)
    duplication: tandem repeat of two PDZ domains
  7. 2056813Species Escherichia coli [TaxId:562] [74935] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:

  1. Domain(s) for 1ky9:
    1. 2056816Domain d1ky9a1: 1ky9 A:260-353 [73198]
      Other proteins in same PDB: d1ky9a2, d1ky9b3
    2. 2056817Domain d1ky9b1: 1ky9 B:260-358 [73200]
      Other proteins in same PDB: d1ky9a2, d1ky9b3
    3. 2056818Domain d1ky9b2: 1ky9 B:359-446 [73201]
      Other proteins in same PDB: d1ky9a2, d1ky9b3
  2. Domain(s) for 2zle:
    1. 2056820Domain d2zlea1: 2zle A:215-313 [154632]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    2. 2056821Domain d2zlea2: 2zle A:314-396 [154633]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    3. 2056822Domain d2zleb1: 2zle B:611-709 [154635]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    4. 2056823Domain d2zleb2: 2zle B:710-792 [154636]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    5. 2056824Domain d2zlec1: 2zle C:1007-1105 [154638]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    6. 2056825Domain d2zlec2: 2zle C:1106-1188 [154639]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    7. 2056826Domain d2zlee1: 2zle E:1749-1847 [154641]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    8. 2056827Domain d2zlee2: 2zle E:1848-1930 [154642]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    9. 2056828Domain d2zlef1: 2zle F:2145-2243 [154644]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    10. 2056829Domain d2zlef2: 2zle F:2244-2326 [154645]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    11. 2056830Domain d2zleg1: 2zle G:2541-2639 [154647]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    12. 2056831Domain d2zleg2: 2zle G:2640-2722 [154648]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    13. 2056832Domain d2zleh1: 2zle H:2937-3035 [154650]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    14. 2056833Domain d2zleh2: 2zle H:3036-3118 [154651]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    15. 2056834Domain d2zlei1: 2zle I:3333-3431 [154653]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    16. 2056835Domain d2zlei2: 2zle I:3432-3514 [154654]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    17. 2056836Domain d2zlej1: 2zle J:3729-3827 [154656]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    18. 2056837Domain d2zlej2: 2zle J:3828-3910 [154657]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    19. 2056838Domain d2zlek1: 2zle K:4125-4223 [154659]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    20. 2056839Domain d2zlek2: 2zle K:4224-4306 [154660]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    21. 2056840Domain d2zlel1: 2zle L:4521-4619 [154662]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    22. 2056841Domain d2zlel2: 2zle L:4620-4702 [154663]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    23. 2056842Domain d2zlem1: 2zle M:4917-5015 [154665]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    24. 2056843Domain d2zlem2: 2zle M:5016-5098 [154666]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
  3. Domain(s) for 3cs0:
    1. 2056814Domain d3cs0a1: 3cs0 A:260-358 [156951]
      Other proteins in same PDB: d3cs0a3
      automatically matched to d1ky9b1
    2. 2056815Domain d3cs0a2: 3cs0 A:359-446 [156952]
      Other proteins in same PDB: d3cs0a3
      automatically matched to d1ky9b2
  4. Domain(s) for 3mh4:

More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from b.36.1.4 Protease Do (DegP, HtrA), C-terminal domains

Timeline for Species Escherichia coli [TaxId:562] from b.36.1.4 Protease Do (DegP, HtrA), C-terminal domains: