Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2017114Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2048292Fold b.36: PDZ domain-like [50155] (1 superfamily)
    contains barrel, partly opened; n*=4, S*=8; meander; capped by alpha-helix
  4. 2048293Superfamily b.36.1: PDZ domain-like [50156] (7 families) (S)
    peptide-binding domain
  5. 2048739Family b.36.1.4: HtrA-like serine proteases [74933] (4 protein domains)
  6. 2048743Protein Protease Do (DegP, HtrA), C-terminal domains [74934] (1 species)
    duplication: tandem repeat of two PDZ domains
  7. 2048744Species Escherichia coli [TaxId:562] [74935] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:

  1. Domain(s) for 1ky9:
    1. 2048747Domain d1ky9a1: 1ky9 A:260-353 [73198]
      Other proteins in same PDB: d1ky9a2, d1ky9b3
    2. 2048748Domain d1ky9b1: 1ky9 B:260-358 [73200]
      Other proteins in same PDB: d1ky9a2, d1ky9b3
    3. 2048749Domain d1ky9b2: 1ky9 B:359-446 [73201]
      Other proteins in same PDB: d1ky9a2, d1ky9b3
  2. Domain(s) for 2zle:
    1. 2048751Domain d2zlea1: 2zle A:215-313 [154632]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    2. 2048752Domain d2zlea2: 2zle A:314-396 [154633]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    3. 2048753Domain d2zleb1: 2zle B:611-709 [154635]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    4. 2048754Domain d2zleb2: 2zle B:710-792 [154636]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    5. 2048755Domain d2zlec1: 2zle C:1007-1105 [154638]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    6. 2048756Domain d2zlec2: 2zle C:1106-1188 [154639]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    7. 2048757Domain d2zlee1: 2zle E:1749-1847 [154641]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    8. 2048758Domain d2zlee2: 2zle E:1848-1930 [154642]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    9. 2048759Domain d2zlef1: 2zle F:2145-2243 [154644]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    10. 2048760Domain d2zlef2: 2zle F:2244-2326 [154645]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    11. 2048761Domain d2zleg1: 2zle G:2541-2639 [154647]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    12. 2048762Domain d2zleg2: 2zle G:2640-2722 [154648]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    13. 2048763Domain d2zleh1: 2zle H:2937-3035 [154650]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    14. 2048764Domain d2zleh2: 2zle H:3036-3118 [154651]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    15. 2048765Domain d2zlei1: 2zle I:3333-3431 [154653]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    16. 2048766Domain d2zlei2: 2zle I:3432-3514 [154654]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    17. 2048767Domain d2zlej1: 2zle J:3729-3827 [154656]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    18. 2048768Domain d2zlej2: 2zle J:3828-3910 [154657]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    19. 2048769Domain d2zlek1: 2zle K:4125-4223 [154659]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    20. 2048770Domain d2zlek2: 2zle K:4224-4306 [154660]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    21. 2048771Domain d2zlel1: 2zle L:4521-4619 [154662]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    22. 2048772Domain d2zlel2: 2zle L:4620-4702 [154663]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
    23. 2048773Domain d2zlem1: 2zle M:4917-5015 [154665]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b1
    24. 2048774Domain d2zlem2: 2zle M:5016-5098 [154666]
      Other proteins in same PDB: d2zlea3, d2zleb3, d2zlec3, d2zlee3, d2zlef3, d2zleg3, d2zleh3, d2zlei3, d2zlej3, d2zlek3, d2zlel3, d2zlem3
      automatically matched to d1ky9b2
  3. Domain(s) for 3cs0:
    1. 2048745Domain d3cs0a1: 3cs0 A:260-358 [156951]
      Other proteins in same PDB: d3cs0a3
      automatically matched to d1ky9b1
    2. 2048746Domain d3cs0a2: 3cs0 A:359-446 [156952]
      Other proteins in same PDB: d3cs0a3
      automatically matched to d1ky9b2
  4. Domain(s) for 3mh4:

More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from b.36.1.4 Protease Do (DegP, HtrA), C-terminal domains

Timeline for Species Escherichia coli [TaxId:562] from b.36.1.4 Protease Do (DegP, HtrA), C-terminal domains: